【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物检测，尤其涉及一种伴bcor遗传学异常肉瘤检测引物组、试剂盒及其应用。
技术介绍
1、伴bcor遗传学异常肉瘤是2020版who骨与软组织肿瘤分类中新增的肿瘤类型，是一种罕见的缺乏分化特征的圆形和梭形细胞肉瘤，具有多种bcor变异，导致原癌基因激活和bcor过度表达。根据变异类型，又分为bcor融合肉瘤和具有bcor内部串联重复（itd）的软组织肿瘤两种。bcor融合肉瘤最常见的是bcor-ccnb3融合；偶尔，它们可能含有变异融合伙伴，如bcor-maml3融合，好发于儿童和青少年的骨和软组织部位。软组织bcor itd肿瘤（婴幼儿原始黏液样间叶性肉瘤和婴儿未分化圆细胞肉瘤）通常发生在婴幼儿，最常见的受累部位包括躯干、头颈部和腹膜后。这类肿瘤具有明显的形态学重叠，包括细小分支毛细血管和黏液样基质，肿瘤常表达bcor、bcl6、cyclind1、tle1和satb2；然而，这些都不是特异的诊断标志物。临床上，此类肿瘤与尤文肉瘤、cic重排肉瘤、滑膜肉瘤等多种肿瘤存在广泛的形态学和免疫表型重叠，单纯依靠组织形态学和免疫组化表达鉴别诊断困难，亟需灵敏高效的遗传学变异检测方法。
2、临床检测此类基因变异手段主要有荧光原位杂交（fish）法、聚合酶链式反应（pcr）法、二代测序等。荧光原位杂交法适合单个融合基因的检测，但不能检测itd，也不适合多个变异筛查。基于rna/dna的二代测序成本高，工序复杂，检测周期长，临床落地困难。
3、中国专利cn109576367a公开了一种检测bcor基因突变
4、但是现有技术中未见到能够用于准确检测伴bcor遗传学改变肉瘤特征变异基因的产品。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提供一种伴bcor遗传学异常肉瘤检测引物组、试剂盒及其应用，能够准确快速地检测样本中是否存在伴bcor遗传学异常肉瘤特征性基因变异。
2、为了实现上述专利技术目的，本专利技术提供以下技术方案：
3、本专利技术提供了一种伴bcor遗传学异常肉瘤检测引物组，所述伴bcor遗传学异常肉瘤检测引物组包括如下引物：
4、核苷酸序列如seq id no.1所示的上游嵌合引物；
5、核苷酸序列如seq id no.2所示的下游引物1；
6、核苷酸序列如seq id no.3所示的下游引物2；
7、核苷酸序列如seq id no.4所示的下游引物3；
8、核苷酸序列如seq id no.5所示的通用引物。
9、优选的，所述通用引物的5’端标记有荧光基团；
10、所述荧光基团选自fam、vic、rox、hex、tet、joe、ned、cy5、cy3中的一种或几种。
11、优选的，还包括如下质控引物：
12、核苷酸序列如seq id no.6所示的上游质控引物；
13、核苷酸序列如seq id no.7所示的下游嵌合质控引物；
14、核苷酸序列如seq id no.8所示的通用质控引物。
15、本专利技术还提供了上述伴bcor遗传学异常肉瘤检测引物组在制备检测伴bcor遗传学异常肉瘤的试剂或试剂盒中的应用。
16、本专利技术还提供了一种试剂盒，包括上述伴bcor遗传学异常肉瘤检测引物组。
17、优选的，所述试剂盒还包括阳性对照，所述阳性对照包括如下基因：
18、核苷酸序列如seq id no.9所示的bcor-ccnb3融合基因；
19、核苷酸序列如seq id no.10所示的bcor-maml3融合基因。
20、优选的，所述上游嵌合引物、下游引物1、下游引物2、下游引物3、通用引物、上游质控引物、下游嵌合质控引物或通用质控引物的终浓度独立的为5~15μmol/l。
21、优选的，所述试剂盒还包括缓冲液。
22、优选的，所述缓冲液含有taq酶、mg2+、pcr缓冲液和dntps。
23、本专利技术还提供了上述引物组或者试剂盒在制备诊断或辅助诊断伴bcor遗传学异常肉瘤的产品中的应用。
24、本专利技术的有益效果：
25、本专利技术提供的包括特定上游嵌合引物、下游引物1、下游引物2、下游引物3和通用引物的伴bcor遗传学异常肉瘤检测引物组，能同时检测3种伴bcor遗传学异常肉瘤特征性基因变异，成功实现覆盖多种变异类型，具有高特异性，目标产物片段大小固定，结果易判读；还具有高灵敏度，针对融合基因的可检测下限为10个拷贝，针对bcor itd的可检测下限可达1 ng基因组dna。
26、采用本专利技术提供的试剂盒进行伴bcor遗传学异常肉瘤检测，最短检测时间为240分钟。在一些形态学特征不典型的病例中，应用本专利技术提供的试剂盒可检测是否存在bcoritd或bcor基因融合，用于辅助判断患者的组织学类型。
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1.一种伴BCOR遗传学异常肉瘤检测引物组，其特征在于，所述伴BCOR遗传学异常肉瘤检测引物组包括如下引物：
2.根据权利要求1所述的伴BCOR遗传学异常肉瘤检测引物组，其特征在于，所述通用引物的5’端标记有荧光基团；
3.根据权利要求1所述的伴BCOR遗传学异常肉瘤检测引物组，其特征在于，还包括如下质控引物：
4.权利要求1~3任一项所述的伴BCOR遗传学异常肉瘤检测引物组在制备检测伴BCOR遗传学异常肉瘤的试剂或试剂盒中的应用。
5.一种试剂盒，其特征在于，包括权利要求1~3任一项所述的伴BCOR遗传学异常肉瘤检测引物组。
6.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括阳性对照，所述阳性对照包括如下基因：
7.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于，所述上游嵌合引物、下游引物1、下游引物2、下游引物3、通用引物、上游质控引物、下游嵌合质控引物或通用质控引物的终浓度独立的为5~15μmol/L。
8.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括缓冲液。
9.
10.权利要求1~3任一项所述的引物组或者权利要求5~9任一项所述的试剂盒在制备诊断或辅助诊断伴BCOR遗传学异常肉瘤的产品中的应用。
...【技术特征摘要】
1.一种伴bcor遗传学异常肉瘤检测引物组，其特征在于，所述伴bcor遗传学异常肉瘤检测引物组包括如下引物：
2.根据权利要求1所述的伴bcor遗传学异常肉瘤检测引物组，其特征在于，所述通用引物的5’端标记有荧光基团；
3.根据权利要求1所述的伴bcor遗传学异常肉瘤检测引物组，其特征在于，还包括如下质控引物：
4.权利要求1~3任一项所述的伴bcor遗传学异常肉瘤检测引物组在制备检测伴bcor遗传学异常肉瘤的试剂或试剂盒中的应用。
5.一种试剂盒，其特征在于，包括权利要求1~3任一项所述的伴bcor遗传学异常肉瘤检测引物组。
6.根据权利要求5所述的试剂...
【专利技术属性】
技术研发人员：张朦，倪鑫，姚兴凤，张楠，何乐建，贾超，管晓星，王建文，徐文剑，
申请(专利权)人：首都医科大学附属北京儿童医院，
类型：发明
国别省市：
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