【技术实现步骤摘要】
技术介绍
1、所公开的技术整体涉及对分析样品进行成像和评估的领域。更具体地讲，所公开的技术涉及用于匹配与对多表面支撑结构的不同表面进行成像相关联的像差的技术。
2、对支撑结构上的分析样品进行成像的应用越来越多。这些支撑结构可以包括其上存在生物样品的板。例如，这些板可以包括脱氧核糖核酸(dna)和核糖核酸(rna)探针，这些探针对存在于人和其他生物体中的基因中的核苷酸序列是特异性的。单个dna或rna探针可以附着在支撑结构上的小几何网格或阵列中的特定位置处。取决于所采用的技术，样品可以附着在支撑结构上的随机、半随机或预定位置处。可以将测试样品(诸如来自已知的人或生物体)暴露于阵列或网格，使得互补基因或片段与板表面上的各个位点处的探针杂交。在诸如测序的某些应用中，可以将遗传材料的模板或片段定位在位点处，并且可以使核苷酸或其他分子与模板杂交以确定模板的性质或序列。然后可以通过在位点上扫描特定频率的光来检查这些位点，以通过基因或片段杂交的位点的荧光来鉴定样品中存在哪些基因或片段。
3、这些板有时被称为微阵列、基因或基因组芯片、dna芯片、基因阵列等，并且可以用于表达谱分析、监测表达水平、基因分型、测序等。例如，诊断用途可以包括评估特定患者的遗传组成，以确定是否存在疾病状态或是否存在针对特定病状的易感性。此类板的读取和评估是其效用的重要方面。尽管微阵列允许呈现单独的生物组分用于大量处理和单个检测，但是在单个实验中可以检测的组分的数量受到系统分辨率的限制。此外，在一些方法中使用的大量试剂可能是昂贵的，使得期望减少体
技术实现思路
1、所公开的技术提供了一种分析样品成像和评估的新颖方法，该方法降低了具有支撑样品的多个表面的成像和评估子系统的复杂性。支撑结构可以例如是流通池，试剂流体被允许流过该流通池并且与生物样品相互作用。来自至少一个辐射源的激发辐射可以用于激发多个表面上的生物样品。以这种方式，荧光辐射可以从该生物样品发射并且随后被检测光学器件和至少一个检测器捕获并检测。所返回的辐射然后可以用于生成图像数据。多个表面的这种成像可以顺序地或同时地完成。另外，本文中所述的技术可以与多种类型的成像系统中的任一类型一起使用。例如，落射荧光(epifluorescent)和全内反射(tir)方法两者均可受益于所公开的技术。另外，成像的生物样品可以以随机位置或图案存在于支撑结构的表面上。
2、一种具体实施涉及包括透镜、流通池和控制器的机器。在此类具体实施中，该透镜可以具有视场并且被浸没在具有第一折射率的第一流体中。类似地，在此类具体实施中，该流通池可以包括由具有第二折射率的第二流体分开的第一表面和第二表面。另外，该控制器可以用于将该透镜从与该流通池具有第一距离的第一位置移动到与该流通池具有第二距离的第二位置。该控制器还可以用于，当该透镜与该流通池分开该第一距离时，使用该透镜捕获从设置在该流通池的该第一表面上的核酸发射的光。该控制器还可以用于，当该透镜与该流通池分开该第二距离时，使用该透镜捕获从设置在该流通池的该第二表面上的核酸发射的光。该控制器还可以用于基于所发射的光来确定用于生物样品的核酸序列。在此类具体实施中，当该透镜与该流通池分开该第一距离时该透镜的该视场中的边缘光线与轴向光线之间的光程差可以基本上等于当该透镜与该流通池分开该第二距离时该透镜的该视场中的边缘光线与轴向光线之间的光程差。
3、在诸如前一段落中所述的机器的一些具体实施中，该第一折射率和该第二折射率可以基本上相等。
4、在诸如前一段落中所述的机器的一些具体实施中，该透镜可以包括光学器件，该光学器件适于捕获从设置在该流通池的该第一表面上的核酸序列发射的光，并且允许该生物样品以衍射受限的成像质量在检测器上成像。在一些此类具体实施中，该第一折射率和该第二折射率基本上相等，意味着由该第一折射率和该第二折射率之间的任何差异引起的球面像差足够低而不阻止该生物样品的衍射受限成像，该衍射受限成像基于：从设置在该流通池的该第一表面上的核酸序列发射的光；以及从设置在该流通池的该第二表面上的核酸序列发射的光。
5、在诸如本
技术实现思路
的第三段落中所述的机器的一些具体实施中，该第一流体和该第二流体可以是相同的流体。
6、在诸如本
技术实现思路
的第三段落中所述的机器的一些具体实施中，该第一流体和该第二流体可以是不同的流体。
7、在诸如本
技术实现思路
的第二段落中所述的机器的一些具体实施中，该流通池的该第一表面是该流通池的顶部表面，并且该流通池的该第二表面是该流通池的底部表面。
8、在诸如本
技术实现思路
的第二段落中所述的机器的一些具体实施中，该透镜可以包括光学器件，该光学器件适于捕获从设置在该流通池的该第一表面上的核酸序列发射的光，并且允许该生物样品以衍射受限的成像质量在检测器上成像。在一些此类具体实施中，当该透镜与该流通池分开该第一距离时该透镜的该视场中的边缘光线与轴向光线之间的该光程差基本上等于当该透镜与该流通池分开该第二距离时该透镜的该视场中的边缘光线与轴向光线之间的该光程差，意味着球面像差足够低而不阻止该生物样品的衍射受限成像，该衍射受限成像基于：从设置在该流通池的该第一表面上的核酸序列发射的光；以及从设置在该流通池的该第二表面上的核酸序列发射的光。
9、另一具体实施涉及一种方法，该方法包括使用透镜捕获从设置在流通池的第一表面上的核酸发射的光，该透镜与流通池相距第一距离并且被浸没在具有第一折射率的第一流体中。此类方法还可以包括将该透镜移动到距该流通池第二距离的位置。此类方法还可以包括当该透镜位于距该流通池该第二距离处时，使用浸没在具有该第一折射率的该第一流体中的该透镜捕获从设置在该流通池的第二表面上的核酸发射的光，其中该流通池的该第一表面由具有第二折射率的第二流体与该流通池的该第二表面分开。此类方法还可以包括基于从设置在该流通池的该第一表面上的核酸发射的该光和从设置在该流通池的该第二表面上的该核酸发射的该光确定生物样品的核酸序列。在此类方法中，当该透镜位于距该流通池该第一距离处时该透镜的该视场中的边缘光线与轴向光线之间的光程差基本上等于当该透镜位于距该流通池该第二距离处时该透镜的该视场中的边缘光线与轴向光线之间的光程差。
10、在诸如前一段落中所述的方法的一些具体实施中，该第一折射率和该第二折射率可以基本上相等。
11、在诸如前一段落中所述的方法的一些具体实施中，该透镜可以包括光学器件，该光学器件适于捕获从设置在该流通池的该第一表面上的核酸序列发射的光，并且允许该生物样品以衍射受限的成像质量在检测器上成像。在一些此类具体实施中，该第一折射率和本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种机器，所述机器包括：
2.根据权利要求1所述的机器，其中所述第一折射率和所述第二折射率基本上相等。
3.根据权利要求2所述的机器，其中：
4.根据权利要求2所述的机器，其中所述第一流体和所述第二流体是相同的流体。
5.根据权利要求2所述的机器，其中所述第一流体和所述第二流体是不同的流体。
6.根据权利要求1所述的机器，其中所述流通池的所述第一表面是所述流通池的顶部表面，并且所述流通池的所述第二表面是所述流通池的底部表面。
7.根据权利要求1所述的机器，其中：
8.一种方法，所述方法包括：
9.根据权利要求8所述的方法，其中所述第一折射率和所述第二折射率基本上相等。
10.根据权利要求9所述的方法，其中：
11.根据权利要求9所述的方法，其中所述第一流体和所述第二流体是相同的流体。
12.根据权利要求9所述的方法，其中所述第一流体和所述第二流体是不同的流体。
13.根据权利要求8所述的方法，其中所述流通池的所述第一表面是所述流通池的
14.根据权利要求8所述的方法，其中：
15.一种存储指令的非暂态计算机可读介质，所述指令在由处理器执行时，使生物样品成像系统执行动作，该动作包括：
16.根据权利要求15所述的非暂态计算机可读介质，其中所述第一折射率和所述第二折射率基本上相等。
17.根据权利要求16所述的非暂态计算机可读介质，其中：
18.根据权利要求15所述的非暂态计算机可读介质，其中所述流通池的所述第一表面是所述流通池的顶部表面，并且所述流通池的所述第二表面是所述流通池的底部表面。
19.根据权利要求15所述的非暂态计算机可读介质，其中：
20.根据权利要求15所述的非暂态计算机可读介质，其中所述第一流体和所述第二流体是相同的流体。
...【技术特征摘要】
1.一种机器，所述机器包括：
2.根据权利要求1所述的机器，其中所述第一折射率和所述第二折射率基本上相等。
3.根据权利要求2所述的机器，其中：
4.根据权利要求2所述的机器，其中所述第一流体和所述第二流体是相同的流体。
5.根据权利要求2所述的机器，其中所述第一流体和所述第二流体是不同的流体。
6.根据权利要求1所述的机器，其中所述流通池的所述第一表面是所述流通池的顶部表面，并且所述流通池的所述第二表面是所述流通池的底部表面。
7.根据权利要求1所述的机器，其中：
8.一种方法，所述方法包括：
9.根据权利要求8所述的方法，其中所述第一折射率和所述第二折射率基本上相等。
10.根据权利要求9所述的方法，其中：
11.根据权利要求9所述的方法，其中所述第一流体和所述第二流体是相同的流体。
12.根据权利要求9所述的方法，其中所述第一流体...
【专利技术属性】
技术研发人员：吕少平，M·克伦布格尔，S·洪，G·纳多夫，
申请(专利权)人：伊鲁米纳公司，
类型：发明
国别省市：
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