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用于敲除C5的CRISPR/Cas相关方法及组合物技术

技术编号:41836723 阅读:12 留言:0更新日期:2024-06-27 18:19
提供了靶向C5基因座或基因的向导RNA和CRISPR/Cas系统、包含此类向导RNA或CRISPR/Cas系统的脂质纳米颗粒或病毒载体,以及包含此类向导RNA或系统的细胞或动物。还提供了使用这些CRISPR/Cas系统修饰或敲低或敲除C5基因座的方法,以及这些CRISPR/Cas系统在用于治疗和/或预防与C5相关的疾病、病症或病状和/或用于改善与此类疾病、病症或病状相关的至少一种症状的预防性和治疗性应用中的用途。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】


技术介绍

1、补体系统是一组血浆蛋白质,当其激活时导致靶细胞裂解并通过调理作用促进吞噬作用。补体通过以下三种主要途径由一系列蛋白水解步骤激活:经典激活途径,该途径通常由免疫复合物激活;可由未受保护的细胞表面诱导的替代途径;和甘露糖结合凝集素途径。补体级联的所有三种途径都集中于补体成分5(c5)蛋白的蛋白水解切割。补体成分5(c5)的切割导致片段c5a和c5b的产生,这是在补体级联激活期间起关键作用的过程。c5a可以通过与其受体结合而产生多效性生理反应。c5a是有效的促炎介质,其诱导趋化性迁移,增强细胞粘附,刺激氧化爆发,并诱导各种炎性介质(诸如组胺或细胞因子)的释放。c5b介导了膜攻击复合物(mac或c5b-9)的形成,在补体依赖性细胞毒性(cdc)的晚期导致细胞裂解。此外,在耐受由c5b-9引起的细胞溶解的有核细胞中,c5b-9的亚溶解量可引起细胞激活,这导致细胞增殖、促炎介质的产生以及细胞外基质的产生。

2、仍然需要靶向c5基因的治疗剂来预防和治疗c5相关疾病。


技术实现思路

1、提供了包含向导rna或编码该向导rna的dna的组合物,包含这些组合物的细胞,修饰细胞中的c5基因的方法,修饰c5基因或降低c5基因表达或降低受试者中的补体c5蛋白活性的方法,以及预防、治疗或改善与c5相关的疾病或病症的至少一种症状或适应症的方法。

2、在一个方面,提供了一种包含向导rna或编码该向导rna的dna的组合物,其中该向导rna包含靶向c5基因中的向导rna靶序列的dna靶向区段,并且其中该向导rna与cas蛋白结合并且将该cas蛋白靶向到该c5基因中的该向导rna靶序列。

3、在一些此类组合物中,该向导rna靶序列位于该c5基因的编码外显子27、22、21、15、12或1中,或者其中该向导rna靶序列位于该c5基因的编码外显子15或12中。在一些此类组合物中,该c5基因是人c5基因。

4、在一些此类组合物中,该dna靶向区段包含seq id no:33-120中任一项、seq idno:60、65、67、82、85、87、97和119中任一项或seq id no:85和97中任一项所示的序列的至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核苷酸。在一些此类组合物中,该向导rna靶序列包含seq id no:209-296中任一项、seq id no:236、241、243、258、261、263、273和295中任一项或seq id no:261和273中任一项所示的序列的至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核苷酸。在一些此类组合物中,该dna靶向区段与seq id no:33-120中任一项、seq id no:60、65、67、82、85、87、97和119中任一项或seq id no:85和97中任一项所示的序列至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%相同。

5、在一些此类组合物中,该dna靶向区段包含seq id no:33-120中任一项、seq idno:60、65、67、82、85、87、97和119中任一项或seq id no:85和97中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成。在一些此类组合物中,该向导rna靶序列包含seq id no:209-296中任一项、seq id no:236、241、243、258、261、263、273和295中任一项或seq id no:261和273中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成。

6、在一些此类组合物中,该组合物包含rna形式的向导rna。在一些此类组合物中,该组合物包含编码向导rna的dna。在一些此类组合物中,该向导rna包含至少一种修饰。在一些此类组合物中,该至少一种修饰包括经2′-o-甲基修饰的核苷酸。在一些此类组合物中,该至少一种修饰包括核苷酸之间的硫代磷酸酯键。在一些此类组合物中,该至少一种修饰包括向导rna的5′末端处的前五个核苷酸中的一个或多个核苷酸处的修饰。在一些此类组合物中,该至少一种修饰包括向导rna的3′末端处的最后五个核苷酸中的一个或多个核苷酸处的修饰。在一些此类组合物中,该至少一种修饰包括向导rna的5′末端处的前四个核苷酸之间的硫代磷酸酯键。在一些此类组合物中,该至少一种修饰包括向导rna的3′末端处的最后四个核苷酸之间的硫代磷酸酯键。在一些此类组合物中,该至少一种修饰包括向导rna的5′末端处的前三个核苷酸处的经2′-o-甲基修饰的核苷酸。在一些此类组合物中,该至少一种修饰包括向导rna的3′末端处的最后三个核苷酸处的经2′-o-甲基修饰的核苷酸。在一些此类组合物中,该至少一种修饰包括:(i)向导rna的5′末端处的前四个核苷酸之间的硫代磷酸酯键;(ii)向导rna的3′末端处的最后四个核苷酸之间的硫代磷酸酯键;(iii)向导rna的5′末端处的前三个核苷酸处的经2′-o-甲基-修饰的核苷酸;和(iv)向导rna的3′末端处的最后三个核苷酸处的经2′-o-甲基-修饰的核苷酸。在一些此类组合物中,该向导rna包括seq id no:29的经修饰的核苷酸。

7、在一些此类组合物中,该向导rna是单向导rna(sgrna)。在一些此类组合物中,该向导rna包含seq id no:21-29中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成,其中该向导rna包含seq id no:297-312和316-331中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成,其中该向导rna包含seq id no:297-304和316-323中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成,或者其中该向导rna包含seq id no:299、301、318和320中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成。

8、在一些此类组合物中,该向导rna是包含两个单独的rna分子的双向导rna(dgrna),这些rna分子包括crispr rna(crrna)和反式激活crrna(tracrrna)。在一些此类组合物中,该crrna包含seq id no:16-17中任一项所示的序列。在一些此类组合物中,该tracrrna包含seq id no:18-20中任一项所示的序列。

9、在一些此类组合物中,该组合物与脂质纳米颗粒缔合。在一些此类组合物中,该脂质纳米颗粒包括阳离子脂质、中性脂质、辅助脂质和隐形脂质。在一些此类组合物中,该阳离子脂质是脂质a。在一些此类组合物中,该中性脂质是dspc。在一些此类组合物中,该辅助脂质是胆固醇。在一些此类组合物中,该隐形脂质是peg2k-dmg。在一些此类组合物中,该阳离子脂质是脂质a,该中性脂质是dspc,该辅助脂质是胆固醇,并且该隐形脂质是peg2k-dmg。

10、在一些此类组合物中,该组合物是包含药学上可接受的载体的药物组合物。

11、在一些此类组合物中,该组合物进一步包含cas蛋白或编本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种组合物,所述组合物包含向导RNA或编码所述向导RNA的DNA,其中所述向导RNA包含靶向C5基因中的向导RNA靶序列的DNA靶向区段,并且其中所述向导RNA与Cas蛋白结合并且将所述Cas蛋白靶向到所述C5基因中的所述向导RNA靶序列。

2.根据权利要求1所述的组合物,其中所述向导RNA靶序列位于所述C5基因的编码外显子27、22、21、15、12或1中,或者其中所述向导RNA靶序列位于所述C5基因的编码外显子15或12中。

3.根据权利要求1或2所述的组合物,其中所述C5基因是人C5基因。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的组合物,其中所述DNA靶向区段包含SEQ ID NO:33-120中任一项、SEQ ID NO:60、65、67、82、

5.根据任一前述权利要求所述的组合物,其中所述DNA靶向区段包含SEQ ID NO:33-120中任一项、SEQ ID NO:60、65、67、82、85、87、97和119中任一项或SEQ ID NO:85和97中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成,或者

6.根据任一前述权利要求所述的组合物,其中所述组合物包含RNA形式的所述向导RNA。

7.根据权利要求1至5中任一项所述的组合物,其中所述组合物包含编码所述向导RNA的所述DNA。

8.根据权利要求1至6中任一项所述的组合物,其中所述向导RNA包含至少一种修饰。

9.根据权利要求8所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括经2′-O-甲基修饰的核苷酸。

10.根据权利要求8或9所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括核苷酸之间的硫代磷酸酯键。

11.根据权利要求8至10中任一项所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括所述向导RNA的5′末端处的前五个核苷酸中的一个或多个核苷酸处的修饰。

12.根据权利要求8至11中任一项所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括所述向导RNA的3′末端处的最后五个核苷酸中的一个或多个核苷酸处的修饰。

13.根据权利要求8至12中任一项所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括所述向导RNA的所述5′末端处的前四个核苷酸之间的硫代磷酸酯键。

14.根据权利要求8至13中任一项所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括所述向导RNA的所述3′末端处的最后四个核苷酸之间的硫代磷酸酯键。

15.根据权利要求8至14中任一项所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括所述向导RNA的所述5′末端处的前三个核苷酸处的经2′-O-甲基修饰的核苷酸。

16.根据权利要求8至15中任一项所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括所述向导RNA的所述3′末端处的最后三个核苷酸处的经2′-O-甲基修饰的核苷酸。

17.根据权利要求8至16中任一项所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括:(i)所述向导RNA的所述5′末端处的所述前四个核苷酸之间的硫代磷酸酯键;(ii)所述向导RNA的所述3′末端处的所述最后四个核苷酸之间的硫代磷酸酯键;(iii)所述向导RNA的所述5′末端处的所述前三个核苷酸处的经2′-O-甲基-修饰的核苷酸;以及(iv)所述向导RNA的所述3′末端处的所述最后三个核苷酸处的经2′-O-甲基-修饰的核苷酸。

18.根据权利要求8至17中任一项所述的组合物,其中所述向导RNA包含SEQ ID NO:29的经修饰的核苷酸。

19.根据任一前述权利要求所述的组合物,其中所述向导RNA是单向导RNA(sgRNA)。

20.根据权利要求19所述的组合物,其中所述向导RNA包含SEQ ID NO:21-29中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成,其中所述向导RNA包含SEQ ID NO:297-312和316-331中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成,其中所述向导RNA包含SEQ IDNO:297-304和316-323中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成,或者其中所述向导RNA包含SEQ ID NO:299、301、318和320中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成。

21.根据权利要求1至17中任一项所述的组合物,其中所述向导RNA是包含两个单独的RNA分子的双向导RNA(dgRNA),所述RNA分子包括CRISPR RNA(crRNA)和反式激活crRNA(tracrRNA)。

22.根据权利要求21所述的组合物,其中所述crRNA包含SEQ ID NO:16-17中任一项所示的序列。

23.根据权利要求21或22所述的组合物...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种组合物,所述组合物包含向导rna或编码所述向导rna的dna,其中所述向导rna包含靶向c5基因中的向导rna靶序列的dna靶向区段,并且其中所述向导rna与cas蛋白结合并且将所述cas蛋白靶向到所述c5基因中的所述向导rna靶序列。

2.根据权利要求1所述的组合物,其中所述向导rna靶序列位于所述c5基因的编码外显子27、22、21、15、12或1中,或者其中所述向导rna靶序列位于所述c5基因的编码外显子15或12中。

3.根据权利要求1或2所述的组合物,其中所述c5基因是人c5基因。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的组合物,其中所述dna靶向区段包含seq id no:33-120中任一项、seq id no:60、65、67、82、

5.根据任一前述权利要求所述的组合物,其中所述dna靶向区段包含seq id no:33-120中任一项、seq id no:60、65、67、82、85、87、97和119中任一项或seq id no:85和97中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成,或者

6.根据任一前述权利要求所述的组合物,其中所述组合物包含rna形式的所述向导rna。

7.根据权利要求1至5中任一项所述的组合物,其中所述组合物包含编码所述向导rna的所述dna。

8.根据权利要求1至6中任一项所述的组合物,其中所述向导rna包含至少一种修饰。

9.根据权利要求8所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括经2′-o-甲基修饰的核苷酸。

10.根据权利要求8或9所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括核苷酸之间的硫代磷酸酯键。

11.根据权利要求8至10中任一项所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括所述向导rna的5′末端处的前五个核苷酸中的一个或多个核苷酸处的修饰。

12.根据权利要求8至11中任一项所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括所述向导rna的3′末端处的最后五个核苷酸中的一个或多个核苷酸处的修饰。

13.根据权利要求8至12中任一项所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括所述向导rna的所述5′末端处的前四个核苷酸之间的硫代磷酸酯键。

14.根据权利要求8至13中任一项所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括所述向导rna的所述3′末端处的最后四个核苷酸之间的硫代磷酸酯键。

15.根据权利要求8至14中任一项所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括所述向导rna的所述5′末端处的前三个核苷酸处的经2′-o-甲基修饰的核苷酸。

16.根据权利要求8至15中任一项所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括所述向导rna的所述3′末端处的最后三个核苷酸处的经2′-o-甲基修饰的核苷酸。

17.根据权利要求8至16中任一项所述的组合物,其中所述至少一种修饰包括:(i)所述向导rna的所述5′末端处的所述前四个核苷酸之间的硫代磷酸酯键;(ii)所述向导rna的所述3′末端处的所述最后四个核苷酸之间的硫代磷酸酯键;(iii)所述向导rna的所述5′末端处的所述前三个核苷酸处的经2′-o-甲基-修饰的核苷酸;以及(iv)所述向导rna的所述3′末端处的所述最后三个核苷酸处的经2′-o-甲基-修饰的核苷酸。

18.根据权利要求8至17中任一项所述的组合物,其中所述向导rna包含seq id no:29的经修饰的核苷酸。

19.根据任一前述权利要求所述的组合物,其中所述向导rna是单向导rna(sgrna)。

20.根据权利要求19所述的组合物,其中所述向导rna包含seq id no:21-29中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成,其中所述向导rna包含seq id no:297-312和316-331中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成,其中所述向导rna包含seq idno:297-304和316-323中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成,或者其中所述向导rna包含seq id no:299、301、318和320中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成。

21.根据权利要求1至17中任一项所述的组合物,其中所述向导rna是包含两个单独的rna分子的双向导rna(dgrna),所述rna分子包括crispr rna(crrna)和反式激活crrna(tracrrna)。

22.根据权利要求21所述的组合物,其中所述crrna包含seq id no:16-17中任一项所示的序列。

23.根据权利要求21或22所述的组合物,其中所述tracrrna包含seq id no:18-20中任一项所示的序列。

24.根据任一前述权利要求所述的组合物,其中所述组合物与脂质纳米颗粒缔合。

25.根据权利要求24所述的组合物,其中所述脂质纳米颗粒包括阳离子脂质、中性脂质、辅助脂质和隐形脂质。

26.根据权利要求25所述的组合物,其中所述阳离子脂质是脂质a。

27.根据权利要求25或26所述的组合物,其中所述中性脂质是dspc。

28.根据权利要求25至27中任一项所述的组合物,其中所述辅助脂质是胆固醇。

29.根据权利要求25至28中任一项所述的组合物,其中所述隐形脂质是peg2k-dmg。

30.根据权利要求25至29中任一项所述的组合物,其中所述阳离子脂质是脂质a,所述中性脂质是dspc,所述辅助脂质是胆固醇,并且所述隐形脂质是peg2k-dmg。

31.根据任一前述权利要求所述的组合物,其中所述组合物是包含药学上可接受的载体的药物组合物。

32.根据任一前述权利要求所述的组合物,所述组合物进一步包含所述cas蛋白或编码所述cas蛋白的核酸。

33.根据权利要求32所述的组合物,其中所述cas蛋白是cas9蛋白。

34.根据权利要求33所述的组合物,其中所述cas蛋白源自酿脓链球菌cas9蛋白。

35.根据权利要求32至34中任一项所述的组合物,其中所述组合物包含蛋白质形式的所述cas蛋白。

36.根据权利要求32至34中任一项所述的组合物,其中所述组合物包含编码所述cas蛋白的所述核酸,其中所述核酸包括编码所述cas蛋白的dna,任选地其中所述组合物包含编码所述向导rna的所述dna。

37.根据权利要求32至34中任一项所述的组合物,其中所述组合物包含编码所述cas蛋白的所述核酸,其中所述核酸包括编码所述cas蛋白的mrna,任选地其中所述组合物包含rna形式的所述向导rna。

38.根据权利要求37所述的组合物,其中编码所述cas蛋白的所述mrna包含至少一种修饰。

39.根据权利要求38所述的组合物,其中编码所述cas蛋白的所述mrna经修饰以在一个或多个或所有尿苷位置处包含经修饰的尿苷。

40.根据权利要求39所述的组合物,其中所述经修饰的尿苷是n1-甲基-假尿苷。

41.根据权利要求39或40所述的组合物,其中编码所述cas蛋白的所述mrna被n1-甲基-假尿苷完全取代。

42.根据权利要求38至41中任一项所述的组合物,其中编码所述cas蛋白的所述mrna包含5′帽。

43.根据权利要求38至42中任一项所述的组合物,其中编码所述cas蛋白的所述mrna包含poly(a)尾部。

44.根据权利要求37至43中任一项所述的组合物,其中编码所述cas蛋白的所述mrna包含seq id no:339、338或12所示的序列。

45.根据权利要求32至44中任一项所述的组合物,其中编码所述cas蛋白的所述核酸经密码子优化以在哺乳动物细胞或人细胞中表达。

46.根据权利要求32至45中任一项所述的组合物,其中所述cas蛋白包含seq id no:11或8所示的序列。

47.根据任一前述权利要求所述的组合物,所述组合物进一步包含第二向导rna或编码所述第二向导rna的dna,其中所述第二向导rna包含靶向所述c5基因中的第二向导rna靶序列的dna靶向区段,并且其中所述第二向导rna与所述cas蛋白结合并且将所述cas蛋白靶向到所述c5基因中的所述第二向导rna靶序列。

48.根据任一前述权利要求所述的组合物,所述组合物与特异性结合c5的抗原结合蛋白缔合。

49.根据权利要求48所述的组合物,其中特异性结合c5的所述抗原结合蛋白是抗体或其抗原结合片段。

50.根据权利要求48或49所述的组合物,其中特异性结合c5的所述抗原结合蛋白包含:

51.根据权利要求48至50中任一项所述的组合物,其中特异性结合c5的所述抗原结合蛋白是包含免疫球蛋白重链或其可变区或其hcdr1、hcdr2和hcdr3以及免疫球蛋白轻链或其可变区或其lcdr1、lcdr2和lcdr3的单克隆抗体,所述免疫球蛋白重链包含seq id no:697所示的氨基酸序列,所述免疫球蛋白轻链包含seq id no:698所示的氨基酸序列,

52.根据权利要求48至50中任一项所述的组合物,其中特异性结合c5的所述抗原结合蛋白是帕泽利单抗。

53.一种细胞,所述细胞包含根据任一前述权利要求所述的组合物。

54.一种修饰细胞中的c5基因的方法,所述方法包括将根据权利要求32至52中任一项所述的组合物引入到所述细胞中,其中所述向导rna与所述cas蛋白形成复合物并且靶向所述c5基因中的所述向导rna靶序列,并且所述cas蛋白切割所述向导rna靶序列以在所述c5基因中产生靶向遗传修饰。

55.根据权利要求54所述的方法,其中所述cas蛋白的切割在所述c5基因中产生双链断裂。

56.根据权利要求54所述的方法,其中所述cas蛋白的切割在所述c5基因中产生单链断裂。

57.根据权利要求54至56中任一项所述的方法,其中通过非同源末端连接修复所切割的向导rna靶序列来产生所述靶向遗传修饰。

58.根据权利要求54至57中任一项所述的方法,其中所述方法导致所述细胞中所述c5基因的表达或活性降低,或者其中所述方法导致所述细胞中所述c5基因的功能丧失或失活。

59.根据权利要求54至58中任一项所述的方法,其中所述细胞是肝细胞。

60.根据权利要求54至59中任一项所述的方法,其中所述细胞是哺乳动物细胞,并且所述c5基因是哺乳动物c5基因。

61.根据权利要求54至60中任一项所述的方法,其中所述细胞是人细胞,并且所述c5基因是人c5基因。

62.根据权利要求54至61中任一项所述的方法,其中所述细胞是体外或离体的。

63.根据权利要求54至61中任一项所述的方法,其中所述细胞在动物体内。

64.根据权利要求63所述的方法,其中:

65.根据权利要求63或64所述的方法,其中所述方法导致所述动物中补体c5蛋白的血清水平降低,任选地其中补体c5蛋白的血清水平降低至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%。

66.根据权利要求63至65中任一项所述的方法,其中所述方法导致所述动物中的补体c5蛋白活性降低,任选地其中所述方法导致至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%百分比的经典激活途径溶血抑制,如使用致敏的绵羊红细胞离体测量的。

67.一种修饰细胞中的c5基因的方法,所述方法包括使所述细胞的基因组与以下物质接触:

68.根据权利要求67所述的方法,其中所述向导rna靶序列位于所述c5基因的编码外显子27、22、21、15、12或1中,或者其中所述向导rna靶序列位于所述c5基因的编码外显子15或12中。

69.根据权利要求67或68所述的方法,其中所述向导rna包含靶向所述向导rna靶序列的dna靶向区段,其中所述dna靶向区段包含seq id no:33-120中任一项、seq id no:60、65、67、82、85、87、97和119中任一项或seq id no:85和97中任一项所示的序列的至少17个、至少18个、至少19个或至少20个连续核苷酸、基本上由其组成或由其组成,或者

70.根据权利要求67至69中任一项所述的方法,其中所述向导rna包含靶向所述向导rna靶序列的dna靶向区段,其中所述dna靶向区段包含seq id no:33-120中任一项、seq idno:60、65、67、82、85、87、97和119中任一项或seq id no:85和97中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成,或者

71.根据权利要求67至70中任一项所述的方法,其中所述方法包括向所述细胞中引入:

72.根据权利要求71所述的方法,其中所述cas蛋白或编码所述cas蛋白的所述核酸和/或所述向导rna或编码所述向导rna的所述dna经由脂质纳米颗粒介导的递送引入到所述细胞中。

73.根据权利要求72所述的方法,其中rna形式的所述向导rna和编码所述cas蛋白的所述核酸经由脂质纳米颗粒介导的递送引入到所述细胞中,其中编码所述cas蛋白的所述核酸是mrna。

74.根据权利要求72或73所述的方法,其中所述脂质纳米颗粒包括阳离子脂质、中性脂质、辅助脂质和隐形脂质。

75.根据权利要求74所述的方法,其中所述阳离子脂质是脂质a。

76.根据权利要求74或75所述的方法,其中所述中性脂质是dspc。

77.根据权利要求74至76中任一项所述的方法,其中所述辅助脂质是胆固醇。

78.根据权利要求74至77中任一项所述的方法,其中所述隐形脂质是peg2k-dmg。

79.根据权利要求74至78中任一项所述的方法,其中所述阳离子脂质是脂质a,所述中性脂质是dspc,所述辅助脂质是胆固醇,并且所述隐形脂质是peg2k-dmg。

80.根据权利要求71所述的方法,其中所述cas蛋白或编码所述cas蛋白的所述核酸和/或所述向导rna或编码所述向导rna的所述dna经由腺相关病毒引入到所述细胞中。

81.根据权利要求71至80中任一项所述的方法,其中所述方法包括将编码所述cas蛋白的所述核酸引入到所述细胞中。

82.根据权利要求71至81中任一项所述的组合物,其中编码所述cas蛋白的所述核酸经密码子优化以在哺乳动物细胞或人细胞中表达。

83.根据权利要求71至82中任一项所述的方法,其中编码所述cas蛋白的所述核酸包括dna,任选地其中所述方法包括将编码所述向导rna的所述dna引入到所述细胞中。

84.根据权利要求71至82中任一项所述的方法,其中编码所述cas蛋白的所述核酸包括rna,任选地其中所述方法包括将所述向导rna以rna的形式引入到所述细胞中。

85.根据权利要求84所述的方法,其中编码所述cas蛋白的所述rna包含至少一种修饰。

86.根据权利要求85所述的方法,其中编码所述cas蛋白的所述rna经修饰以在一个或多个或所有尿苷位置处包含经修饰的尿苷。

87.根据权利要求86所述的方法,其中所述经修饰的尿苷是n1-甲基-假尿苷。

88.根据权利要求86或87所述的方法,其中编码所述cas蛋白的所述rna被n1-甲基-假尿苷完全取代。

89.根据权利要求85至88中任一项所述的方法,其中编码所述cas蛋白的所述rna包含5′帽。

90.根据权利要求85至89中任一项所述的方法,其中编码所述cas蛋白的所述rna包含poly(a)尾部。

91.根据权利要求84至90中任一项所述的方法,其中编码所述cas蛋白的所述rna包含seq id no:339、338或12所示的序列。

92.根据权利要求71至91中任一项所述的方法,其中所述方法包括将所述向导rna以rna的形式引入到所述细胞中。

93.根据权利要求71至91中任一项所述的方法,其中所述方法包括将编码所述向导rna的所述dna引入到所述细胞中。

94.根据权利要求71至92中任一项所述的方法,其中所述向导rna包含至少一种修饰。

95.根据权利要求94所述的方法,其中所述至少一种修饰包括经2′-o-甲基修饰的核苷酸。

96.根据权利要求94或95所述的方法,其中所述至少一种修饰包括核苷酸之间的硫代磷酸酯键。

97.根据权利要求94至96中任一项所述的方法,其中所述至少一种修饰包括所述向导rna的5′末端处的前五个核苷酸中的一个或多个核苷酸处的修饰。

98.根据权利要求94至97中任一项所述的方法,其中所述至少一种修饰包括所述向导rna的3′末端处的最后五个核苷酸中的一个或多个核苷酸处的修饰。

99.根据权利要求94至98中任一项所述的方法,其中所述至少一种修饰包括所述向导rna的所述5′末端处的前四个核苷酸之间的硫代磷酸酯键。

100.根据权利要求94至99中任一项所述的方法,其中所述至少一种修饰包括所述向导rna的所述3′末端处的最后四个核苷酸之间的硫代磷酸酯键。

101.根据权利要求94至100中任一项所述的方法,其中所述至少一种修饰包括所述向导rna的所述5′末端处的前三个核苷酸处的经2′-o-甲基修饰的核苷酸。

102.根据权利要求94至101中任一项所述的方法,其中所述至少一种修饰包括所述向导rna的所述3′末端处的最后三个核苷酸处的经2′-o-甲基修饰的核苷酸。

103.根据权利要求94至102中任一项所述的方法,其中所述至少一种修饰包括:(i)所述向导rna的所述5′末端处的所述前四个核苷酸之间的硫代磷酸酯键;(ii)所述向导rna的所述3′末端处的所述最后四个核苷酸之间的硫代磷酸酯键;(iii)所述向导rna的所述5′末端处的所述前三个核苷酸处的经2′-o-甲基-修饰的核苷酸;和(iv)所述向导rna的所述3′末端处的所述最后三个核苷酸处的经2′-o-甲基-修饰的核苷酸。

104.根据权利要求94至103中任一项所述的方法,其中所述向导rna包含seq id no:29的经修饰的核苷酸。

105.根据权利要求67至104中任一项所述的方法,其中所述向导rna是单向导rna(sgrna)。

106.根据权利要求105所述的方法,其中所述向导rna包含seq id no:21-29中任一项所示的序列,其中所述向导rna包含seq id no:297-312和316-331中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成,其中所述向导rna包含seq id no:297-304和316-323中任一项所示的序列、基本上由其组成或由其组成,或者其中所述向导rna包含seq id no:299、301、318和320中任一项所示的序列。

107.根据权利要求67至103中任一项所述的方法,其中所述向导rna是包含两个单独的rna分子的双向导rna(dgrna),所述rna分子包括crispr rna(crrna)和反式激活crrna(tracrrna)。

108.根据权利要求107所述的方法,其中所述crrna包含seq id no:16-17中任一项所示的序列。

109.根据权利要求107或108所述的方法,其中所述tracrrna包含seq id no:18-20中任一项所示的序列。

110.根据权利要求67至109中任一项所述的方法,其中所述cas蛋白是cas9蛋白。

111.根据权利要求110所述的方法,其中所述cas蛋白源自酿脓链球菌cas9蛋白。

112.根据权利要求67至111中任一项所述的方法,其中所述cas蛋白包含seq id no:11或8所示的序列。

113.根据权利要求67至112中任一项所述的方法,所述方法进一步包括将第二向导rna或编码所述第二向导rna的dna引入到所述细胞中,其中所述第二向导rna与所述cas蛋白形成复合物并且将所述cas蛋白靶向到所述c5基因中的第二向导rna靶序列,并且其中所述cas蛋白切割所述第二向导rna靶序列以在所述c5基因中产生靶向遗传修饰。

114.根据权利要求67至113中任一项所述的方法,其中所述cas蛋白的切割在所述c5基因中产生双链断裂。

115.根据权利要求67至113中任一项所述的方法,其中所述cas蛋白的切割在所述c5基因中产生单链断裂。

116.根据权利要求67至115中任一项所述的方法,其中通过非同源末端连接修复所切割的向导rna靶序列来产生所述靶向遗传修饰。

117.根据权利要求67至116中任一项所述的方法,其中所述方法导致所述细胞中所述c5基因的表达或活性降低,或者其中所述方法导致所述细胞中所述c5基因的功能丧失或失活。

118.根据权利要求67至117中任一项所述的方法,其中所述细胞是肝细胞。

119.根据权利要求67至118中任一项所述的方法,其中所述细胞是哺乳动物细胞,并且所述c5基因是哺乳动物c5基因。

120.根据权利要求67至119中任一项所述的方法,其中所述细胞是人细胞,并且所述c5基因是人c5基因。

121.根据权利要求67至120中任一项所述的方法,其中所述细胞是体外或离体的。

122.根据权利要求67至120中任一项所述的方法,其中所述细胞在动物体内。

123.根据权利要求122所述的...

【专利技术属性】
技术研发人员:基肖尔·德瓦拉拉贾纳拉什姆哈洛里·莫顿埃万盖洛斯·普凡尼斯苏珊娜·哈特福德阿蒂马亨德拉普拉卡什·坎乔利亚萨拉·黑塞
申请(专利权)人:瑞泽恩制药公司
类型:发明
国别省市:

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