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【技术实现步骤摘要】
本公开总体上涉及用于产生阵列例如细胞阵列或液滴阵列的高密度沉积领域。
技术介绍
已经开发了如流式细胞术等用于将细胞沉积到96孔微量滴定板中的方法和技术。已经开发了如低浓度样本的重力沉积等用于以15%的占用率将单一细胞沉积到微孔(microwell)中的方法和技术。然而,仍然需要能够产生具有高特异性、准确度和占用率的高密度微孔阵列的方法和系统。
技术介绍
0、专利技术背景
技术实现思路
1、本公开提供了用于产生细胞阵列的方法。在一些实施例中,所述方法包括:提供包括多个细胞的样本;以及将所述样本中的所述多个细胞引入到微孔阵列的微孔中以产生所述细胞阵列,其中,所述微孔阵列包括每平方英寸500个或更多个微孔,并且其中,所述细胞阵列的所述微孔中的25%或更多包括单个细胞。将所述样本中的所述多个细胞引入到所述微孔阵列的所述微孔中包括:将所述样本中的所述多个细胞引入到所述微孔阵列的所述微孔中在多个第一期望位置处。将所述样本中的所述多个细胞引入到所述微孔阵列的所述微孔中在所述多个第一期望位置处包括:将来自所述多个细胞的兴趣细胞引入到所述多个第一期望位置之一处。
2、在一些实施例中,所述细胞阵列的所述微孔中的50%或更多包括单个细胞。在一些实施例中,所述微孔阵列包括每平方英寸1000个或更多个微孔。所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过1000纳升或不超过400纳升的体积。所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过1000微米或不超过400微米的直径。所述微孔阵列的所述微孔中的至少两
3、在一些实施例中,将所述多个细胞引入到所述微孔阵列的所述微孔中包括:将所述多个细胞流式细胞术地沉积到所述微孔阵列的所述微孔中。将所述多个细胞流式细胞术地沉积到所述微孔阵列的所述微孔中包括:使用流式细胞仪将单个细胞一次性沉积到所述微孔阵列的所述微孔中。
4、在一些实施例中,所述方法进一步包括:在将所述多个细胞引入到所述微孔阵列的所述微孔中之前,将试剂引入到所述微孔阵列的所述微孔中的一个或更多个中。在一些实施例中,所述方法进一步包括:将试剂引入到所述细胞阵列的所述微孔中的一个或更多个中。所述试剂包括一个或更多个合成颗粒。引入所述试剂包括:将所述试剂流式细胞术地沉积到所述微孔中。所述一个或更多个合成颗粒包括珠粒。
5、在一些实施例中,所述方法进一步包括:将合成颗粒引入到所述微孔阵列的所述微孔中在多个第二期望位置处。在一些实施例中,所述方法进一步包括:将兴趣合成颗粒引入到所述微孔阵列的所述微孔中在所述多个第二期望位置之一处,其中,所述合成颗粒中的一个不同于所述合成颗粒中的其他合成颗粒,其中,将合成颗粒引入到所述微孔阵列的所述微孔中的一个或更多个中包括:将所述合成颗粒中的所述一个引入到所述微孔阵列的微孔中在第二期望位置处。将合成颗粒引入到所述微孔阵列的所述微孔中包括:将所述合成颗粒流式细胞术地沉积到所述微孔阵列的所述微孔中。所述一个或更多个合成颗粒包括附有寡核苷酸条形码的磁性珠粒。
6、在一些实施例中,所述方法进一步包括:将流式细胞仪的分选部件与微孔阵列对齐。
7、本文公开了用于产生液滴阵列的方法。在一些实施例中,所述方法包括:将多个第一液滴引入到微孔阵列的微孔中以产生第一液滴阵列,其中,所述微孔阵列包括每平方英寸500个或更多个微孔,其中,所述第一液滴阵列的所述微孔中的25%或更多仅包括单个第一液滴。
8、在一些实施例中,所述第一液滴阵列的所述微孔中的50%或更多仅包括单个第一液滴。在一些实施例中,所述微孔阵列包括每平方英寸1000个或更多个微孔。所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过1000纳升或不超过400纳升的体积。所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过1000微米或不超过200微米的直径。
9、在一些实施例中,所述方法进一步包括:将多个第二液滴引入到所述第一液滴阵列的所述微孔中以产生第二液滴阵列,其中,所述第二液滴阵列的所述微孔中的25%或更多包括单个第一液滴和单个第二液滴。在一些实施例中,所述方法进一步包括:在将所述多个第一液滴引入到所述微孔阵列的所述微孔中之前,将多个第二液滴引入到所述微孔阵列的所述微孔中以产生第二液滴阵列,其中,所述第二液滴阵列中的所述微孔中的25%或更多包括单个第一液滴和单个第二液滴。
10、在一些实施例中,所述多个第一液滴和所述多个第二液滴中的每一个都分别包括单个细胞或合成颗粒。所述合成颗粒包括附有多个寡核苷酸条形码的珠粒。所述多个寡核苷酸条形码中的每一个都与所述多个寡核苷酸条形码中的至少另一个相同或不同。所述多个第二液滴中的第二液滴进一步包括试剂。引入所述多个第一液滴包括:将所述多个第一液滴流式细胞术地沉积到所述微孔阵列的所述微孔中。将所述多个第一液滴流式细胞术地沉积到所述微孔阵列的所述微孔中包括:使用流式细胞仪将单个第一液滴一次性沉积到所述微孔阵列的所述微孔中。
11、本文公开了细胞阵列。在一些实施例中,细胞阵列包括微孔阵列,所述微孔阵列包括每平方英寸500个或更多个微孔,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的25%或更多包括单个细胞。
12、在一些实施例中,所述微孔中的50%或更多包括单个细胞。所述微孔阵列包括每平方英寸1000个或更多个微孔。所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过1000纳升或不超过400纳升的体积。所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过1000微米或不超过400微米的直径。所述微孔阵列的所述微孔中的至少两个彼此间隔开不超过200微米或不超过80微米。
13、在一些实施例中,所述微孔阵列的所述微孔中的25%或更多包括单个细胞和合成颗粒。所述合成颗粒包括附有多个寡核苷酸条形码的珠粒。
14、本文公开了用于对齐第一对齐微孔阵列以产生样本微孔阵列的方法。在一些实施例中,所述方法包括:(a)使用第一成像传感器确定第一参数并且使用第二成像传感器确定第二参数,其中,所述第一成像传感器和所述第二成像传感器大致彼此正交并且被定位在废液接收器皿与第一对齐微孔阵列之间;(b)提供所述第一对齐微孔阵列上、在x方向和y方向上的期望位置;(c)基于所述第一参数和所述第二参数将第一对齐液滴沉积到所述第一对齐微孔阵列的微孔中,其中,所述第一参数与所述x方向上的所述期望位置相关,并且其中,所述第二参数与所述y方向上的所述期望位置相关;(d)确定所述第一对齐液滴在所述第一对齐微孔阵列上的位置与所述期望位置之间的距离;(e)如果所述距离大于预定阈值,则基于所述第一对齐液滴在所述第一对齐微孔阵列上的位置与所述期望位置之间的所述距离调整所述第一参数和所述第二参数;以及(f)重复步骤(b)至(e),直到所述第一对齐液滴在所述第一对齐微孔阵列上的位置与所述期望位置之间的所述距离不大于所述预定阈值。
15、确定所述第一对齐液滴在所述第一对齐微孔阵列上的位置与所述期望位置之间的所述距离包括:使用所述第一成像传感器对本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种产生细胞阵列的方法,所述方法包括:
2.如权利要求1所述的方法,其中,将所述样本中的所述多个细胞引入到所述微孔阵列的所述微孔中包括:将所述样本中的所述多个细胞引入到所述微孔阵列的所述微孔中在多个第一期望位置处。
3.如权利要求2所述的方法,其中,将所述样本中的所述多个细胞引入到所述微孔阵列的所述微孔中在所述多个第一期望位置处包括:将来自所述多个细胞的兴趣细胞引入在所述多个第一期望位置之一处。
4.如权利要求1至3中任一项所述的方法,其中,所述细胞阵列的所述微孔中的50%或更多包括单个细胞。
5.如权利要求1至4中任一项所述的方法,其中,所述微孔阵列包括每平方英寸1000个或更多个微孔。
6.如权利要求1至5中任一项所述的方法,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过1000纳升的体积。
7.如权利要求6所述的方法,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过400纳升的体积。
8.如权利要求1至7中任一项所述的方法,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过1000
9.如权利要求8所述的方法,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过400微米的直径。
10.如权利要求1至9中任一项所述的方法,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的至少两个彼此分离不超过200微米。
11.如权利要求10所述的方法,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的至少两个彼此分离不超过80微米。
12.如权利要求1所述的方法,其中,将所述多个细胞流式细胞术地沉积到所述微孔阵列的所述微孔中包括:使用流式细胞仪将单个细胞一次性沉积到所述微孔阵列的所述微孔中。
13.如权利要求1至12中任一项所述的方法,进一步包括:在将所述多个细胞引入到所述微孔阵列的所述微孔中之前,将试剂引入到所述微孔阵列的所述微孔中的一个或更多个中。
14.如权利要求1至12中任一项所述的方法,进一步包括:将试剂引入到所述细胞阵列的所述微孔中的一个或更多个中。
15.如权利要求13或14所述的方法,其中,所述试剂包括一个或更多个合成颗粒。
16.如权利要求13至15中任一项所述的方法,其中,引入所述试剂包括:将所述试剂流式细胞术地沉积到所述微孔中。
17.如权利要求15和16中任一项所述的方法,其中,所述一个或更多个合成颗粒包括珠粒。
18.如权利要求1至12中任一项所述的方法,进一步包括:将合成颗粒引入到所述微孔阵列的所述微孔中在多个第二期望位置处。
19.如权利要求1至12中任一项所述的方法,进一步包括:将兴趣合成颗粒引入到所述微孔阵列的所述微孔中在所述多个期望位置之一处。
20.如权利要求18和19中任一项所述的方法,其中,将合成颗粒引入到所述微孔阵列的所述微孔中包括:将所述合成颗粒流式细胞术地沉积到所述微孔阵列的所述微孔中。
21.如权利要求15至20中任一项所述的方法,其中,所述一个或更多个合成颗粒包括附有寡核苷酸条形码的磁性珠粒。
22.一种产生液滴阵列的方法,所述方法包括:
23.如权利要求22所述的方法,其中,所述第一液滴阵列的所述微孔中的50%或更多仅包括单个第一液滴。
24.如权利要求22和23中任一项所述的方法,其中,所述微孔阵列包括每平方英寸1000个或更多个微孔。
25.如权利要求22至24中任一项所述的方法,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过1000纳升的体积。
26.如权利要求25所述的方法,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过400纳升的体积。
27.如权利要求22至26中任一项所述的方法,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过1000微米的直径。
28.如权利要求22至27中任一项所述的方法,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的至少两个彼此分离不超过200微米。
29.如权利要求22至28中任一项所述的方法,进一步包括:
30.如权利要求22至28中任一项所述的方法,进一步包括:
31.如权利要求29和30中任一项所述的方法,其中,所述多个第一液滴和所述多个第二液滴中的每一个都分别包括单个细胞或合成颗粒。
32.如权利要求31所述的方法,其中,所述合成颗粒包括附有多个寡核苷酸条形码的珠粒。
33.如权利要求32所述的方法,其中,所述多个寡核苷酸条形码中的每一个都与所述多个寡核苷酸条形码中的至少另...
【技术特征摘要】
1.一种产生细胞阵列的方法,所述方法包括:
2.如权利要求1所述的方法,其中,将所述样本中的所述多个细胞引入到所述微孔阵列的所述微孔中包括:将所述样本中的所述多个细胞引入到所述微孔阵列的所述微孔中在多个第一期望位置处。
3.如权利要求2所述的方法,其中,将所述样本中的所述多个细胞引入到所述微孔阵列的所述微孔中在所述多个第一期望位置处包括:将来自所述多个细胞的兴趣细胞引入在所述多个第一期望位置之一处。
4.如权利要求1至3中任一项所述的方法,其中,所述细胞阵列的所述微孔中的50%或更多包括单个细胞。
5.如权利要求1至4中任一项所述的方法,其中,所述微孔阵列包括每平方英寸1000个或更多个微孔。
6.如权利要求1至5中任一项所述的方法,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过1000纳升的体积。
7.如权利要求6所述的方法,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过400纳升的体积。
8.如权利要求1至7中任一项所述的方法,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过1000微米的直径。
9.如权利要求8所述的方法,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的每一个都具有不超过400微米的直径。
10.如权利要求1至9中任一项所述的方法,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的至少两个彼此分离不超过200微米。
11.如权利要求10所述的方法,其中,所述微孔阵列的所述微孔中的至少两个彼此分离不超过80微米。
12.如权利要求1所述的方法,其中,将所述多个细胞流式细胞术地沉积到所述微孔阵列的所述微孔中包括:使用流式细胞仪将单个细胞一次性沉积到所述微孔阵列的所述微孔中。
13.如权利要求1至12中任一项所述的方法,进一步包括:在将所述多个细胞引入到所述微孔阵列的所述微孔中之前,将试剂引入到所述微孔阵列的所述微孔中的一个或更多个中。
14.如权利要求1至12中任一项所述的方法,进一步包括:将试剂引入到所述细胞阵列的所述微孔中的一个或更多个中。
15.如权利要求13或14所述的方法,其中,所述试剂包括一个或更多个合成颗粒。
16.如权利要求13至15中任一项所述的方法,其中,引入所述试剂包括:将所述试剂流式细胞术地沉积到所述微孔中。
17.如权利要求15和16中任一项所述的方法,其中,所述一个或更多个合成颗粒包括珠粒。
18.如权利要求1至12中任一项所述的方法,进一步包括:将合成颗粒引入到所述微孔阵列的所述微孔中在多个第二期望位置处。
19.如权利要求1至12中任一项所述的方法,进一步包括:将兴趣合成颗粒引入到所述微孔阵列的所述微孔中在所述多个期望位置之一处。
20.如权利要求18和19中任一项所述的方法,其中,将合成颗粒引入到所述微孔阵列的所述微孔中包括:将所述合成颗粒流式细胞术地沉积到所述微孔阵列的所述微孔中。
21.如权利要求15至20中任一项所述的方法,其中,所述一个或更多个合成颗粒包括附有寡核苷酸条形码的磁性珠粒。
22.一种产生液滴阵列的方法,所述方法包括:
23.如权利要求22所述的方法,其中,所述第...
【专利技术属性】
技术研发人员:克拉克·梅森,蒂莫西·W·彼得森,弗拉基米尔·阿泽斯基,克里斯多佛·J·沃尔夫,
申请(专利权)人:贝克顿迪金森公司,
类型:发明
国别省市:
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