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增强的对生物分子的检测和定量制造技术

技术编号:41761995 阅读:1 留言:0更新日期:2024-06-21 21:42
本文描述了用于筛选疾病状态的方法。该方法可以包括获得多个数据集,以及基于所述数据集的组合鉴定所述疾病状态。所述数据集可以包括通过多种方法,诸如通过使用颗粒和参考生物分子获得的生物分子测量结果。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】


技术介绍

1、需要诸如在疾病或病况的早期阶段准确检测疾病或病况的方法。准确检测疾病或病况可以在对象的有效治疗和改善的预后中使用。


技术实现思路

1、在一些方面,本文公开了方法,其包括:使对象的生物样品与颗粒接触,从而将生物样品的内源性生物分子吸附至颗粒;以及将生物样品或吸附的内源性生物分子与生物分子的内标组合。内标可以包括标记。一些方面包括测量内源性生物分子和内标以获得内源性生物分子测量结果和内标测量结果。一些方面包括基于内标测量结果鉴定内源性生物分子的浓度。一些方面包括基于内标测量结果的测量结果确定内源性生物分子测量结果的质量控制方面。在一些方面,生物样品包括生物样品组,测量内源性生物分子包括测量生物样品组的内源生物分子,并且质量控制方面与生物样品组的内源性生物分子有关。在一些方面,质量控制方面包括质量准确度、定量精度、定量准确度、与标准样品的相关性、色谱性能、冠形成质量、消化质量或污染物生物分子测量结果。在一些方面,测量结果通过质谱仪获得。一些方面包括基于内标测量结果或基于质量控制方面执行对质谱仪的实时控制。在一些方面,执行对质谱仪的实时控制包括:调整内电压以提供特异性的变化;调整样品体积;调整技术条件以提高测量质量;暂停或停止数据收集;重新安排测量;或通知用户质量控制问题。一些方面包括基于内标测量结果归一化或调整内源性生物分子测量结果。在一些方面,内源性生物分子测量结果包括生物样品中内源性生物分子的量。一些方面包括相对于生物样品中内源性生物分子的量确定吸附至颗粒的内源性生物分子的量。一些方面包括基于内标测量结果鉴定内源性生物分子测量结果的变异性来源。一些方面包括使用内标测量结果来鉴定或获得另外的内源性生物分子测量结果。一些方面包括基于内源性生物分子测量结果鉴定对象的生物状态。一些方面包括输出或传输包括关于鉴定的生物状态的信息的报告。一些方面包括基于鉴定的生物状态传输或输出对对象的治疗的建议。在一些方面,怀疑对象具有生物状态。在一些方面,生物状态包括疾病状态。在一些方面,疾病状态包括癌症。在一些方面,癌症包括1期或2期癌症。在一些方面,癌症包括肺癌。在一些方面,肺癌包括非小细胞肺癌。在一些方面,生物分子包括蛋白质、脂质、代谢物、糖或核酸。在一些方面,生物分子包括蛋白质。在一些方面,内标包括同位素标记、质量标签、条形码、翻译后修饰或来自与对象的物种不同物种的生物分子。在一些方面,颗粒包括纳米颗粒。在一些方面,颗粒包括金属、聚合物或脂质。在一些方面,颗粒包括物理化学上不同的颗粒组。在一些方面,第一生物样品或第二生物样品包含生物流体。在一些方面,生物流体包括血液、血清或血浆。在一些方面,对象是动物。在一些方面,对象是脊椎动物。在一些方面,对象是哺乳动物。在一些方面,对象是人。

2、在一些方面,本文公开了分类方法,其包括:获得第一数据集,第一数据集包括来自对象的第一生物样品的吸附至颗粒的生物分子的第一测量结果;获得第二数据集,第二数据集包括第一生物样品或对象的第二生物样品的生物分子的第二测量结果,其中第二测量结果包括基于标记的参考生物分子与第一生物样品的组合或其与第二生物样品的组合的测量结果归一化或调整的个别内源性生物分子的测量结果;应用第一分类器以将对应于生物状态的第一标记分配给第一数据集;应用第二分类器以将对应于生物状态的第二标记分配给第二数据集;以及将第一标记和第二标记组合以获得对应于生物状态的组合标记。在一些方面,本文公开了方法,其包括:获得来自对象的生物样品的吸附至颗粒的内源性生物分子的测量结果;获得标记的参考生物分子与生物样品的组合或其与吸附至颗粒的内源性生物分子的组合的测量结果,其中标记的参考生物分子与内源性生物分子相同,但还包含标记;以及基于标记的参考生物分子的测量结果归一化或调整内源性生物分子的测量结果。一些方面包括将分类器应用于归一化或调整的测量结果以将对应于生物状态的标记分配给归一化或调整的测量结果。在一些方面,本文公开了方法,其包括:使对象的生物样品与颗粒接触,从而将生物样品的内源性生物分子吸附至颗粒;以及将生物样品或吸附的内源性生物分子与标记的参考生物分子组合,其中标记的参考生物分子与内源性生物分子相同,但还包含标记。一些方面包括测量内源性生物分子和标记的参考生物分子。一些方面包括获得第一数据集,第一数据集包括来自对象的第一生物样品的吸附至颗粒的生物分子的第一测量结果。一些方面包括获得第二数据集,第二数据集包括第一样品或对象的第二生物样品的生物分子的第二测量结果。在一些方面,将标记的参考生物分子与第一样品或第二样品组合,与生物分子一起测量,并且用于获得第二测量结果。一些方面包括使用第一分类器以将对应于疾病状态或生物状态存在、不存在或可能性的第一标记分配给第一数据集。一些方面包括使用第二分类器以将对应于疾病状态或生物状态存在、不存在或可能性的第二标记分配给第二数据集。一些方面包括基于第一标记和第二标记的组合将数据集鉴定为指示或不指示疾病状态或生物状态。在一些方面,生物分子包括蛋白质、脂质、代谢物、糖或核酸。在一些方面,生物分子包括蛋白质。在一些方面,第一测量结果或第二测量结果包括至少约500个生物分子的测量结果。在一些方面,第一测量结果或第二测量结果使用质谱法、色谱法、侧流测定、免疫测定或其组合来获得。在一些方面,第一测量结果或第二测量结果使用质谱法获得。在一些方面,第一测量结果或第二测量结果通过测量指示生物分子存在、不存在或量的读出来获得。在一些方面,该方法包括使第一样品与颗粒接触以将生物分子吸附至颗粒,以及测量吸附的生物分子。在一些方面,在获得第一测量结果之前将吸附的生物分子与颗粒分开。在一些方面,颗粒包括纳米颗粒。在一些方面,颗粒包括金属、聚合物或脂质。在一些方面,颗粒包括物理化学上不同的颗粒组。在一些方面,该方法包括:将第一样品或第二样品与参考生物分子组合;测量参考生物分子与生物分子;以及使用参考生物分子获得第二测量结果。在一些方面,参考生物分子是同位素标记的。在一些方面,将参考生物分子以预定量与第一样品或第二样品组合。在一些方面,使用参考生物分子鉴定生物分子的质谱,并且从生物分子的质谱获得第二测量结果。在一些方面,使用参考生物分子归一化或调整生物分子的测量结果,以获得第二测量结果。在一些方面,第二测量结果从第一样品获得。在一些方面,将参考生物分子与第一样品组合,并且在使第一样品与颗粒接触以将生物分子吸附至颗粒并且获得第一测量结果之后获得第二测量结果。在一些方面,将参考生物分子与第一样品组合,并且在使第一样品与颗粒接触以将生物分子吸附至颗粒并且获得第一测量结果之前获得第二测量结果。在一些方面,第二测量结果在第一样品的等分试样或非等分试样(aliquant)中与第一测量结果分别获得。在一些方面,第二测量结果从第二样品获得。一些方面包括使生物分子与亲和试剂接触以富集生物分子。在一些方面,亲和试剂包括抗体。在一些方面,第一标记和第二标记包括疾病状态的可能性。一些方面包括对可能性求平均。在一些方面,将数据集鉴定为指示或不指示疾病状态包括基于第一标记和第二标记生成多数投票分数。本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种方法,包括:

2.如权利要求1所述的方法,其还包括测量所述内源性生物分子和所述内标,以获得内源性生物分子测量结果和内标测量结果。

3.如权利要求2所述的方法,其还包括基于所述内标测量结果鉴定所述内源性生物分子的浓度。

4.如权利要求2所述的方法,其还包括基于所述内标测量结果的测量结果确定所述内源性生物分子测量结果的质量控制方面。

5.如权利要求4所述的方法,其中所述生物样品包括生物样品组,测量所述内源性生物分子包括测量所述生物样品组的所述内源性生物分子,并且所述质量控制方面与所述生物样品组的所述内源性生物分子有关。

6.如权利要求4所述的方法,其中所述质量控制方面包括质量准确度、定量精度、定量准确度、与标准样品的相关性、色谱性能、冠形成质量、消化质量或污染物生物分子测量结果。

7.如权利要求2或4-6中任一项所述的方法,其中所述测量结果通过质谱仪获得。

8.如权利要求7所述的方法,其还包括基于所述内标测量结果或基于所述质量控制方面执行对所述质谱仪的实时控制。

9.如权利要求8所述的方法,其中执行对所述质谱仪的实时控制包括:调整内电压以提供特异性的变化;调整样品体积;调整技术条件以提高测量质量;暂停或停止数据收集;重新安排测量;或通知用户质量控制问题。

10.如权利要求2所述的方法,其还包括基于所述内标测量结果归一化或调整所述内源性生物分子测量结果。

11.如权利要求2所述的方法,其中所述内源性生物分子测量结果包括所述生物样品中所述内源性生物分子的量。

12.如权利要求11所述的方法,其还包括相对于所述生物样品中所述内源性生物分子的所述量确定吸附至所述颗粒的所述内源性生物分子的量。

13.如权利要求2所述的方法,其还包括基于所述内标测量结果鉴定所述内源性生物分子测量结果的变异性来源。

14.如权利要求2所述的方法,其还包括使用所述内标测量结果来鉴定或获得另外的内源性生物分子测量结果。

15.如权利要求1所述的方法,其还包括基于所述内源性生物分子测量结果鉴定被取得所述生物样品的对象的生物状态。

16.一种分类方法,包括:

17.如权利要求16所述的方法,其中所述第一测量结果或所述第二测量结果包括至少10个生物分子的测量结果。

18.如权利要求16所述的方法,其中所述第一测量结果或所述第二测量结果使用质谱法、色谱法、侧流测定、免疫测定或其组合来获得。

19.如权利要求16所述的方法,其中所述第一测量结果或所述第二测量结果使用质谱法获得。

20.如权利要求16所述的方法,其中所述第一测量结果或所述第二测量结果通过测量指示所述生物分子的量的读出来获得。

21.如权利要求16所述的方法,其中(a)包括使所述第一生物样品与所述颗粒接触以将所述生物分子吸附至所述颗粒,以及测量所述吸附的生物分子。

22.如权利要求16所述的方法,其中在获得所述第一测量结果之前将所述吸附的生物分子与所述颗粒分开。

23.如权利要求16所述的方法,其中(b)包括将所述第一生物样品或所述第二生物样品与所述内标组合,测量所述内标与所述生物分子,以及使用所述内标获得所述第二测量结果。

24.如权利要求16所述的方法,其中将所述内标以预定量与所述第一生物样品或所述第二生物样品组合。

25.如权利要求16所述的方法,其中所述第二测量结果通过使用所述内标的质谱鉴定内源性生物分子的质谱来获得。

26.如权利要求16所述的方法,其中所述第二测量结果从所述第一生物样品获得。

27.如权利要求16所述的方法,其中将所述内标与所述第一生物样品组合,并且在使所述第一生物样品与所述颗粒接触以将生物分子吸附至所述颗粒并且获得所述第一测量结果之后获得所述第二测量结果。

28.如权利要求16所述的方法,其中将所述内标与所述第一生物样品组合,并且在使所述第一生物样品与所述颗粒接触以将生物分子吸附至所述颗粒并且获得所述第一测量结果之前获得所述第二测量结果。

29.如权利要求16所述的方法,其中所述第二测量结果在所述第一生物样品的等分试样或非等分试样中与所述第一测量结果分别获得。

30.如权利要求16所述的方法,其中所述第二测量结果从所述第二生物样品获得。

31.如权利要求16所述的方法,其中所述第一测量结果或所述第二测量结果通过使(a)或(b)的所述生物分子与亲和试剂接触来获得。

32.如权利要求31所述的方法,其中所述...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种方法,包括:

2.如权利要求1所述的方法,其还包括测量所述内源性生物分子和所述内标,以获得内源性生物分子测量结果和内标测量结果。

3.如权利要求2所述的方法,其还包括基于所述内标测量结果鉴定所述内源性生物分子的浓度。

4.如权利要求2所述的方法,其还包括基于所述内标测量结果的测量结果确定所述内源性生物分子测量结果的质量控制方面。

5.如权利要求4所述的方法,其中所述生物样品包括生物样品组,测量所述内源性生物分子包括测量所述生物样品组的所述内源性生物分子,并且所述质量控制方面与所述生物样品组的所述内源性生物分子有关。

6.如权利要求4所述的方法,其中所述质量控制方面包括质量准确度、定量精度、定量准确度、与标准样品的相关性、色谱性能、冠形成质量、消化质量或污染物生物分子测量结果。

7.如权利要求2或4-6中任一项所述的方法,其中所述测量结果通过质谱仪获得。

8.如权利要求7所述的方法,其还包括基于所述内标测量结果或基于所述质量控制方面执行对所述质谱仪的实时控制。

9.如权利要求8所述的方法,其中执行对所述质谱仪的实时控制包括:调整内电压以提供特异性的变化;调整样品体积;调整技术条件以提高测量质量;暂停或停止数据收集;重新安排测量;或通知用户质量控制问题。

10.如权利要求2所述的方法,其还包括基于所述内标测量结果归一化或调整所述内源性生物分子测量结果。

11.如权利要求2所述的方法,其中所述内源性生物分子测量结果包括所述生物样品中所述内源性生物分子的量。

12.如权利要求11所述的方法,其还包括相对于所述生物样品中所述内源性生物分子的所述量确定吸附至所述颗粒的所述内源性生物分子的量。

13.如权利要求2所述的方法,其还包括基于所述内标测量结果鉴定所述内源性生物分子测量结果的变异性来源。

14.如权利要求2所述的方法,其还包括使用所述内标测量结果来鉴定或获得另外的内源性生物分子测量结果。

15.如权利要求1所述的方法,其还包括基于所述内源性生物分子测量结果鉴定被取得所述生物样品的对象的生物状态。

16.一种分类方法,包括:

17.如权利要求16所述的方法,其中所述第一测量结果或所述第二测量结果包括至少10个生物分子的测量结果。

18.如权利要求16所述的方法,其中所述第一测量结果或所述第二测量结果使用质谱法、色谱法、侧流测定、免疫测定或其组合来获得。

19.如权利要求16所述的方法,其中所述第一测量结果或所述第二测量结果使用质谱法获得。

20.如权利要求16所述的方法,其中所述第一测量结果或所述第二测量结果通过测量指示所述生物分子的量的读出来获得。

21.如权利要求16所述的方法,其中(a)包括使所述第一生物样品与所述颗粒接触以将所述生物分子吸附至所述颗粒,以及测量所述吸附的生物分子。

22.如权利要求16所述的方法,其中在获得所述第一测量结果之前将所述吸附的生物分子与所述颗粒分开。

23.如权利要求16所述的方法,其中(b)包括将所述第一生物样品或所述第二生物样品与所述内标组合,测量所述内标与所述生物分子,以及使用所述内标获得所述第二测量结果。

24.如权利要求16所述的方法,其中将所述内标以预定量与所述第一生物样品或所述第二生物样品组合。

25.如权利要求16所述的方法,其中所述第二测量结果通过使用所述内标的质谱鉴定内源性生物分子的质谱来获得。

26.如权利要求16所述的方法,其中所述第二测量结果从所述第一生物样品获得。

27.如权利要求16所述的方法,其中将所述内标与所述第一生物样品组合,并且在使所述第一生物样品与所述颗粒接触以将生物分子吸附至所述颗粒并且获得所述第一测量结果之后获得所述第二测量结果。

28.如权利要求16所述的方法,其中将所述内标与所述第一生物样品组合,并且在使所述第一生物样品与所述颗粒接触以将生物分子吸附至所述颗粒并且获得所述第一测量结果之前获得所述第二测量结果。

29.如权利要求16所述的方法,其中所述第二测量结果在所述第一生物样品的等分试样或非等分试样中与所述第一测量结果分别获得。

30.如权利要求16所述的...

【专利技术属性】
技术研发人员:布鲁斯·威尔考克斯卡维亚·斯瓦米纳坦普雷斯顿·B·威廉姆斯贾瑞德·德亚明杨觅
申请(专利权)人:普罗科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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