【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
技术介绍
技术实现思路
【技术保护点】
1.一种在核酸链中引入多于一个锁核酸(LNA)修饰的方法，包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述核酸链的二级结构包括由所述核酸链形成的内部二级结构、由两条相互作用的核酸链形成的自双链体二级结构或两者。
3.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述核酸链的所述二级结构具有最小自由能。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法，其中获得所述核酸链的二级结构包括计算所述核酸链的多于一个二级结构中的每一个的自由能，并识别具有最小自由能的所述核酸链的二级结构；并且任选地计算所述核酸链的多于一个二级结构中的每一个的自由能包括使用最近邻模型。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法，其中分析所述核酸链的二级结构包括：确定所述核酸链的每个核苷酸的碱基对评分，所述碱基对评分与核苷酸与所述核酸链的一个或更多个核苷酸形成的碱基对的数量成比例；并且任选地，所述碱基对在单个核酸链的核苷酸之间或两个相互作用的核酸链的核苷酸之间形成。
6.根据权利要求5所述的方法，其中所述核苷酸与所述核酸链的一个或更多个核苷酸形成的碱基对的数量为至多三个。<...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种在核酸链中引入多于一个锁核酸(lna)修饰的方法，包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述核酸链的二级结构包括由所述核酸链形成的内部二级结构、由两条相互作用的核酸链形成的自双链体二级结构或两者。
3.根据权利要求1或2所述的方法，其中所述核酸链的所述二级结构具有最小自由能。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法，其中获得所述核酸链的二级结构包括计算所述核酸链的多于一个二级结构中的每一个的自由能，并识别具有最小自由能的所述核酸链的二级结构；并且任选地计算所述核酸链的多于一个二级结构中的每一个的自由能包括使用最近邻模型。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法，其中分析所述核酸链的二级结构包括：确定所述核酸链的每个核苷酸的碱基对评分，所述碱基对评分与核苷酸与所述核酸链的一个或更多个核苷酸形成的碱基对的数量成比例；并且任选地，所述碱基对在单个核酸链的核苷酸之间或两个相互作用的核酸链的核苷酸之间形成。
6.根据权利要求5所述的方法，其中所述核苷酸与所述核酸链的一个或更多个核苷酸形成的碱基对的数量为至多三个。
7.根据权利要求5-6中任一项所述的方法，其中识别各自具有起始位置和结束位置并且各自包含与所述二级结构中的另一个核苷酸形成至多一个碱基对的核苷酸的所述多于一个序列区域包括：对于每个序列区域，识别至少一个具有最低碱基对评分的核苷酸。
8.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，包括消除其中序列区域的每个核苷酸能够与所述核酸链中的两个或更多个其它核苷酸进行碱基配对的任何序列区域。
9.根据权利要求1-8中任一项所述的方法，其中所述多于一个序列区域各自具有2-20个核苷酸的长度。
10.根据权利要求1-9中任一项所述的方法，其中引入所述第一lna修饰处的所述序列区域的第一核苷酸不是g。
11.根据权利要求1-10中任一项所述的方法，包括：
12.根据权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述序列区域的所述第二核苷酸与所述核酸链的其它核苷酸形成最小数量的碱基对。
13.根据权利要求1-12中任一项所述的方法，其中在与所述核酸链的其它核苷酸形成最小数量的碱基对的所述序列区域的第一核苷酸处引入所述第一lna修饰包括：
14.根据权利要求1-13中任一项所述的方法，包括：
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