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用于改变植物确定性的组合物和方法技术

技术编号:41716295 阅读:2 留言:0更新日期:2024-06-19 12:43
提供了用于改变大豆植物中的TFL1水平的组合物和方法。还提供了用于通过抑制、诱变和/或编辑TFL1基因来改变与茎尖终末分化时间相关的基因的表达的方法和组合物。还提供了具有降低TFL1基因的表达或活性的抑制元件或突变的经修饰的植物细胞和植物,其具有降低的TFL1水平和改善的特征,诸如降低的植物高度和增加的抗倒伏性。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

本公开涉及农业生物,并且更具体地涉及用于植物中的基因组编辑的方法和组合物。


技术介绍

1、精确的基因组编辑技术是工程改造基因表达和功能的强大工具,并且有可能改善重要的农业性状。本领域一直需要开发新的组合物和方法来有效并高效地编辑各种作物的植物基因组,以改变确定性(determinacy)、增加产量、减少倒伏并获得其他有益结果。


技术实现思路

1、本文提供了经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其包含修饰,与在其他方面相同但缺乏所述修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞中的tfl1或其同源物的表达或活性相比,所述修饰降低tfl1或其同源物的表达或活性。在一些实施方案中,所述修饰存在于内源性tfl1基因或其同源物的至少一个等位基因中。所述tfl1基因可以是tfl1b基因。在特定实施方案中,所述tfl1基因或其同源物编码与seq id no:2具有至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、至少99.5%或100%序列同一性的蛋白质。在其他实施方案中,所述修饰位于tfl1基因或其同源物的非编码区中,其非限制性实例包括启动子、内含子、5’-非翻译区、3’-非翻译区以及它们的任何组合。本文提供的植物可以是或植物种子、植物部分或植物细胞可来自例如豆科植物、棉花植物、油菜植物、玉米植物、高粱植物、水稻植物、小麦植物、大麦植物、番茄植物或胡椒植物,或其他作物、观赏植物或其他类型的植物物种。在进一步的实施方案中,豆科植物是大豆植物、豆类植物、豌豆植物、鹰嘴豆植物、苜蓿植物、花生植物、角豆植物、扁豆植物或甘草植物。在具体实施方案中,豆科植物是大豆植物。在一些实施方案中,植物、植物种子、植物部分或植物细胞对于修饰是杂合的,而在其他实施方案中,植物、植物种子、植物部分或植物细胞对于修饰是纯合的。在某些实施方案中,植物、植物种子、植物部分或植物细胞被定义为包含tfl1基因的第一等位基因中的第一修饰和tfl1基因的第二等位基因中的第二修饰,第一修饰和第二修饰彼此不同。

2、在某些实施方案中,本文提供的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞可包含降低tfl1或其同源物的表达或活性的修饰,其中所述修饰包含缺失、插入、取代、倒位或它们的任何组合。在一些实施方案中,例如,修饰位于距选自由seq id no:4、67-77、79和81组成的组的序列的3’末端约100个、125个、150个、175个、200个、225个、250个、275个或300个或更多个核苷酸处。在其他实施方案中,tfl1b基因的至少一个等位基因的启动子中的修饰包含在参考序列seq id no:4的核苷酸位置1237与1570之间的基因组区域内。在一些实施方案中,所述修饰包含至少约10个、至少约15个、至少约20个、至少约25个、至少约30个、至少约35个、至少约40个、至少约45个、至少约50个、至少约55个、至少约60个、至少约65个、至少约70个、至少约75个、至少约80个、至少约85个、至少约90个、至少约95个、至少约100个、至少约125个或至少约150个连续核苷酸的缺失。植物、植物种子、植物部分或植物细胞还可包含例如tfl1b基因的启动子的至少一个等位基因中的修饰,其中所述修饰选自由以下组成的组:与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1539至核苷酸1568的30个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1217至核苷酸1604的388个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1518至核苷酸1629的112个碱基对缺失;与参考序列seqid no:4相比,从核苷酸951至核苷酸1222的272个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1364至核苷酸1407的44个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1367至核苷酸1516的150个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸754至核苷酸1806的1053个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1216至核苷酸1319的104个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1159至核苷酸1965的807个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸760至核苷酸1214的455个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸939至核苷酸1028的90个碱基对缺失;37个碱基对倒位,其中seq id no:4的核苷酸1029至核苷酸1065的序列已经缺失、倒位并在同一位置处被重新插入;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1066至核苷酸1664的599个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸952至核苷酸1552的601个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1677至核苷酸1808的132个碱基对缺失;与参考序列seqid no:4相比,从核苷酸1524至核苷酸1558的35个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸476至核苷酸1405的930个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1365至核苷酸1559的195个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸928至核苷酸1560的633个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸593至核苷酸1813的1221个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1552至核苷酸1556的5个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1537至核苷酸1565的29个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1209至核苷酸1246的38个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1552至核苷酸1600的49个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1553至核苷酸1601的49个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1368至核苷酸1378的11个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1368至核苷酸1395的28个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1344至核苷酸1384的41个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1219至核苷酸1453的235个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1215至核苷酸1227的13个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1370至核苷酸1376的7个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1220至核苷酸1556的337个碱基对缺失;与参考序列seq idno:4相比,从核苷酸1216至核苷酸1376的161个碱基对缺失;与参考序列seq id no:4相比,从核苷酸1368至核苷酸1384的17个碱基对缺失;与参考序列seq id n本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其包含修饰,与在其他方面相同但缺乏所述修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞中的TFL1或其同源物的表达或活性相比,所述修饰降低TFL1或其同源物的表达或活性。

2.如权利要求1所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述修饰存在于内源性TFL1基因或其同源物的至少一个等位基因中。

3.如权利要求2所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述TFL1基因或其同源物编码与SEQ ID NO:2具有至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、至少99.5%或100%序列同一性的蛋白质。

4.如权利要求2或3所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述修饰位于所述TFL1基因或其同源物的非编码区中。

5.如权利要求4所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述非编码区选自由以下组成的组:启动子、内含子、5’-非翻译区、3’-非翻译区以及它们的任何组合。p>

6.如权利要求5所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述修饰位于所述TFL1基因或其同源物的启动子中。

7.如权利要求1至6中任一项所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述植物是豆科植物、棉花植物或油菜植物;或其中所述植物种子、所述植物部分或所述植物细胞是豆科植物、棉花植物、油菜植物、玉米植物、高粱植物、水稻植物、小麦植物、大麦植物、番茄植物或胡椒植物的植物种子、植物部分或植物细胞。

8.如权利要求7所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述植物是豆科植物,或其中所述植物种子、所述植物部分或所述植物细胞是豆科植物的植物种子、植物部分或植物细胞。

9.如权利要求8所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述豆科植物是大豆植物、豆类植物、豌豆植物、鹰嘴豆植物、苜蓿植物、花生植物、角豆植物、扁豆植物或甘草植物。

10.如权利要求9所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述豆科植物是大豆植物。

11.如权利要求10所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述TFL1基因是TFL1b基因。

12.如权利要求1至11中任一项所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述植物、所述植物种子、所述植物部分或所述植物细胞对于所述修饰是杂合的。

13.如权利要求1至11中任一项所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述植物、所述植物种子、所述植物部分或所述植物细胞对于所述修饰是纯合的。

14.如权利要求1至11中任一项所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述植物、所述植物种子、所述植物部分或所述植物细胞包含所述TFL1基因的第一等位基因中的第一修饰和所述TFL1基因的第二等位基因中的第二修饰,所述第一修饰和所述第二修饰彼此不同。

15.如权利要求1至14中任一项所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述修饰包含缺失、插入、取代、倒位或它们的任何组合。

16.如权利要求15所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述修饰位于距选自由SEQ ID NO:4、67-77、79和81组成的组的序列的3’末端约200个或更多个核苷酸处。

17.如权利要求16所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述修饰包含缺失。

18.如权利要求11至16中任一项所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述植物、所述植物种子、所述植物部分或所述植物细胞包含所述TFL1b基因的启动子的至少一个等位基因中的修饰,其中所述修饰选自由以下组成的组:

19.如权利要求11至16中任一项所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述植物、所述植物种子、所述植物部分或所述植物细胞包含所述TFL1b基因的至少一个等位基因的启动子中的修饰,其中所述修饰被包含在参考序列SEQ ID NO:4的核苷酸位置1237与1570之间的基因组区域内。

20.如权利要求19的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述修饰包含至少10个、至少15个、至少20个、至少25个、至少30个、至少35个、至少40个、至少45个、至少50个、至少55个、至少60个、至少65个、至少70个、至少75个、至少80个、至少85个、至少90个、至少...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其包含修饰,与在其他方面相同但缺乏所述修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞中的tfl1或其同源物的表达或活性相比,所述修饰降低tfl1或其同源物的表达或活性。

2.如权利要求1所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述修饰存在于内源性tfl1基因或其同源物的至少一个等位基因中。

3.如权利要求2所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述tfl1基因或其同源物编码与seq id no:2具有至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、至少99.5%或100%序列同一性的蛋白质。

4.如权利要求2或3所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述修饰位于所述tfl1基因或其同源物的非编码区中。

5.如权利要求4所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述非编码区选自由以下组成的组:启动子、内含子、5’-非翻译区、3’-非翻译区以及它们的任何组合。

6.如权利要求5所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述修饰位于所述tfl1基因或其同源物的启动子中。

7.如权利要求1至6中任一项所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述植物是豆科植物、棉花植物或油菜植物;或其中所述植物种子、所述植物部分或所述植物细胞是豆科植物、棉花植物、油菜植物、玉米植物、高粱植物、水稻植物、小麦植物、大麦植物、番茄植物或胡椒植物的植物种子、植物部分或植物细胞。

8.如权利要求7所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述植物是豆科植物,或其中所述植物种子、所述植物部分或所述植物细胞是豆科植物的植物种子、植物部分或植物细胞。

9.如权利要求8所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述豆科植物是大豆植物、豆类植物、豌豆植物、鹰嘴豆植物、苜蓿植物、花生植物、角豆植物、扁豆植物或甘草植物。

10.如权利要求9所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述豆科植物是大豆植物。

11.如权利要求10所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述tfl1基因是tfl1b基因。

12.如权利要求1至11中任一项所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述植物、所述植物种子、所述植物部分或所述植物细胞对于所述修饰是杂合的。

13.如权利要求1至11中任一项所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述植物、所述植物种子、所述植物部分或所述植物细胞对于所述修饰是纯合的。

14.如权利要求1至11中任一项所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述植物、所述植物种子、所述植物部分或所述植物细胞包含所述tfl1基因的第一等位基因中的第一修饰和所述tfl1基因的第二等位基因中的第二修饰,所述第一修饰和所述第二修饰彼此不同。

15.如权利要求1至14中任一项所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述修饰包含缺失、插入、取代、倒位或它们的任何组合。

16.如权利要求15所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述修饰位于距选自由seq id no:4、67-77、79和81组成的组的序列的3’末端约200个或更多个核苷酸处。

17.如权利要求16所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述修饰包含缺失。

18.如权利要求11至16中任一项所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述植物、所述植物种子、所述植物部分或所述植物细胞包含所述tfl1b基因的启动子的至少一个等位基因中的修饰,其中所述修饰选自由以下组成的组:

19.如权利要求11至16中任一项所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述植物、所述植物种子、所述植物部分或所述植物细胞包含所述tfl1b基因的至少一个等位基因的启动子中的修饰,其中所述修饰被包含在参考序列seq id no:4的核苷酸位置1237与1570之间的基因组区域内。

20.如权利要求19的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述修饰包含至少10个、至少15个、至少20个、至少25个、至少30个、至少35个、至少40个、至少45个、至少50个、至少55个、至少60个、至少65个、至少70个、至少75个、至少80个、至少85个、至少90个、至少95个、至少100个、至少125个或至少150个连续核苷酸的缺失。

21.如权利要求15至20中任一项所述的经修饰的植物、植物种子、植物部分或植物细胞,其中所述植物、所述植物种子、所述植物部分或所述植物细胞包含所述tfl1b基因中的染色体序列,所述染色体序列在所述缺失、所述插入、所述取代或所述倒位之外的区域中与seq id no:4具有至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、至少99.5%或...

【专利技术属性】
技术研发人员:B·布罗沃托兰德J·金K·默利尔L·赖默奎斯T·L·斯勒温斯基D·R·小伍滕
申请(专利权)人:孟山都技术公司
类型:发明
国别省市:

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