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用于调节NLRP3或NLRP1表达的组合物和方法技术

技术编号:41657782 阅读:2 留言:0更新日期:2024-06-14 15:19
本文描述了用于调节基因表达的能够结合至含NACHT、LRR和PYD结构域的蛋白3(NLRP3)或NLRP1mRNA的反义寡核苷酸的组合物。本文还描述了使用本文所述的组合物调节基因表达或治疗炎症小体相关疾病的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】


技术介绍

1、某些疾病或疾患是由炎症或与炎症相关的途径的一种或多种基因的过表达或表达不足引起的。为了治疗此类疾病或疾患,最受欢迎的治疗选择之一涉及直接编辑与炎症相关的基因或使用基因沉默工具或方法进行转录/翻译调控。rna诱导的基因沉默在多个方面控制靶基因的rna表达,包括转录失活、mrna降解、转录减弱。因此,仍然需要用于在rna水平上有效编辑基因表达的组合物和方法。


技术实现思路

1、在一些方面中,本文描述了一种组合物,所述组合物包含能够结合至含nacht、lrr和pyd结构域的蛋白3(nlrp3)或nlrp1mrna的反义寡核苷酸。在一些方面中,反义寡核苷酸特异性地结合至nlrp3 mrna。在一些方面中,反义寡核苷酸包含与编码nlrp3mrna的核酸序列互补的核酸序列。在一些方面中,反义寡核苷酸包含与由seq id no:1-7编码的mrna至少80%、至少90%或至少95%互补的核酸序列。在一些方面中,反义寡核苷酸特异性地结合至nlrp1 mrna。在一些方面中,反义寡核苷酸包含与编码nlrp1mrna的核酸序列互补的核酸序列。在一些方面中,反义寡核苷酸包含与由seq id no:8-13编码的mrna至少80%、至少90%或至少95%互补的核酸序列。在一些方面中,反义寡核苷酸特异性地结合至nlrp3 mrna和nlrp1 mrna。在一些方面中,反义寡核苷酸包含与编码nlrp3 mrna和nlrp1 mrna的核酸序列互补的核酸序列。在一些方面中,反义寡核苷酸包含与由seq id no:1和seq id no:8编码的mrna互补的核酸序列。在一些方面中,反义寡核苷酸包含与以下序列之一具有至少80%、85%、90%、95%或99%序列相似性的核酸序列:seq id no:21-38。在一些方面中,反义寡核苷酸包含12-30个核酸碱基的长度。在一些方面中,反义寡核苷酸包含间隙区段和翼区段。在一些方面中,反义寡核苷酸包含5’-翼区段和3’-翼区段。在一些方面中,5’-翼区段和3’-翼区段中的每一者包含3个核酸碱基的长度。在一些方面中,反义寡核苷酸包含至少一个2'-修饰的核苷、至少一个修饰的核苷酸间连键或至少一个反向无碱基部分。在一些方面中,至少一个2'修饰的核苷酸包含2'-o-甲基、2'-o-甲氧基乙基(2'-o-moe)、2'-o-氨基丙基、2'-脱氧、2'-脱氧-2'-氟、2'-o-氨基丙基(2'-o-ap)、2'-o-二甲氨基乙基(2'-o-dmaoe)、2'-o-二甲氨基丙基(2'-o-dmap)、2'-o-二甲氨基乙氧基乙基(2'-o-dmaeoe)或2'-o-n-甲基乙酰胺基(2'-o-nma)修饰的核苷酸、锁定核酸(lna)、限制性乙基(cet)糖、硫代吗啉代、乙烯核酸(ena)或其组合。在一些方面中,至少一个修饰的核苷酸间连键包含硫代磷酸酯连键或二硫代磷酸酯连键。在一些方面中,反义寡核苷酸包含磷酰二胺吗啉代寡聚物(pmo)、硫代吗啉代、锁定核酸(lna)或限制性乙基(cet)糖。在一些方面中,反义寡核苷酸与肽、抗体、脂质、碳水化合物或聚合物缀合。在一些方面中,反义寡核苷酸通过接头与肽、抗体、脂质、碳水化合物或聚合物缀合。在一些方面中,组合物包含特异性地结合至nlrp3mrna的反义寡核苷酸和特异性地结合至nlrp1 mrna的反义寡核苷酸的组合。在一些方面中,组合物包含能够结合至nlrp3 mrna和nlrp1 mrna两者的反义寡核苷酸。在一些方面中,组合物还包含赋形剂。在一些方面中,组合物被配制用于肠胃外或经鼻施用。在一些实施方案中,反义寡核苷酸包含与seq id no:95、96、97、98、99、100、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189或646中的任一个至少80%、85%、90%、95%或99%同一的核酸序列。在一些实施方案中,反义寡核苷酸包含与seq id no:95、121、139、144、146、147或172中的任一个至少80%、85%、90%、95%或99%同一的核酸序列。在一些实施方案中,反义寡核苷酸包含与seq id no:95至少80%、85%、90%、95%或99%同一的核酸序列。在一些实施方案中,反义寡核苷酸包含与seq id no:121至少80%、85%、90%、95%或99%同一的核酸序列。在一些实施方案中,反义寡核苷酸包含与seq id no:139至少80%、85%、90%、95%或99%同一的核酸序列。在一些实施方案中,反义寡核苷酸包含与seq id no:144至少80%、85%、90%、95%或99%同一的核酸序列。在一些实施方案中,反义寡核苷酸包含与seq id no:146至少80%、85%、90%、95%或99%同一的核酸序列。在一些实施方案中,反义寡核苷酸包含与seq id no:147至少80%、85%、90%、95%或99%同一的核酸序列。在一些实施方案中,反义寡核苷酸包含与seq id no:172至少80%、85%、90%、95%或99%同一的核酸序列。在一些实施方案中,反义寡核苷酸为seq id no:95、121、139、144、146、147或172中的任一个。在一些实施方案中,反义寡核苷酸为seq id no:95。在一些实施方案中,反义寡核苷酸为seq id no:121。在一些实施方案中,反义寡核苷酸为seq id no:139。在一些实施方案中,反义寡核苷酸为seq id no:144。在一些实施方案中,反义寡核苷酸为seq id no:146。在一些实施方案中,反义寡核苷酸为seq id no:147。在一些实施方案中,反义寡核苷酸为seq id no:172。

2、在一些方面中,本文描述了一种调节细胞中的炎症小体途径的方法,所述方法包括:用包含能够结合至nlrp3或nlrp1 mrna的反义寡核苷酸的组合物处理所述细胞,从而降低所述细胞中nlrp3、nlrp1或炎症小体的表达。在一些方面中,细胞与炎症小体疾病或疾患相关。在一些方面中,反义寡核苷酸包含至少一个2'-修饰的核苷酸、至少一个修饰的核苷酸间连键或至少一个反向无碱基部分。在一些方面中,至少一个2'修饰的核苷酸:包含2'-o-甲基、2'-o-甲氧基乙基(2'-o-moe)、2'-o-氨基丙基、2'-脱氧、2'本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种组合物,所述组合物包含能够结合至含NACHT、LRR和PYD结构域的蛋白3(NLRP3)或NLRP1 mRNA的反义寡核苷酸。

2.如权利要求1所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸特异性结合至所述NLRP3 mRNA。

3.如权利要求1或2所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含与编码NLRP3 mRNA的核酸序列互补的核酸序列。

4.如权利要求1或2所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含与由SEQ ID NO:1-7编码的mRNA至少80%、至少90%或至少95%互补的核酸序列。

5.如权利要求1所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸特异性结合至所述NLRP1 mRNA。

6.如权利要求1或5所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含与编码NLRP1 mRNA的核酸序列互补的核酸序列。

7.如权利要求1或5所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含与由SEQ ID NO:8-13编码的mRNA至少80%、至少90%或至少95%互补的核酸序列。

8.如权利要求1所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸特异性结合至所述NLRP3 mRNA和NLRP1 mRNA。

9.如权利要求1或8所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含与编码NLRP3 mRNA和NLRP1 mRNA的核酸序列互补的核酸序列。

10.如权利要求1或8所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含与由SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:8编码的mRNA互补的核酸序列。

11.如权利要求1或8-10所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含与以下序列之一具有至少80%、85%、90%、95%或99%序列相似性的核酸序列:SEQ ID NO:21-38。

12.如权利要求1-11中任一项所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含12-30个核苷酸的长度。

13.如权利要求1-12中任一项所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含间隙区段和翼区段。

14.如权利要求13所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含5’-翼区段和3’-翼区段。

15.如权利要求14所述的组合物,其中所述5’-翼区段和所述3’-翼区段中的每一个包含三个核苷酸的长度。

16.如权利要求1-15中任一项所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含至少一个2'-修饰的核苷、至少一个修饰的核苷酸间连键或至少一个反向无碱基部分。

17.如权利要求16所述的组合物,其中所述至少一个2'修饰的核苷酸包含2'-O-甲基、2'-O-甲氧基乙基(2'-O-MOE)、2'-O-氨基丙基、2'-脱氧、2'-脱氧-2'-氟、2'-O-氨基丙基(2'-O-AP)、2'-O-二甲氨基乙基(2'-O-DMAOE)、2'-O-二甲氨基丙基(2'-O-DMAP)、2'-O-二甲氨基乙氧基乙基(2'-O-DMAEOE)、2'-O-N-甲基乙酰胺基(2'-O-NMA)修饰的核苷酸、锁定核酸(LNA)、限制性乙基(cEt)糖、硫代吗啉代、乙烯核酸(ENA)或其组合。

18.如权利要求17所述的组合物,其中所述至少一个修饰的核苷酸间连键包含硫代磷酸酯连键或二硫代磷酸酯连键。

19.如权利要求1-18中任一项所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含磷酰二胺吗啉代寡聚物(PMO)、硫代吗啉代、锁定核酸(LNA)或限制性乙基(cEt)糖。

20.如权利要求1-19中任一项所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸与肽、抗体、脂质、碳水化合物或聚合物缀合。

21.如权利要求20所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸通过接头与肽、抗体、脂质、碳水化合物或聚合物缀合。

22.如权利要求1-21中任一项所述的组合物,其中所述组合物包含特异性结合至所述NLRP3 mRNA的反义寡核苷酸和特异性结合至所述NLRP1 mRNA的反义寡核苷酸的组合。

23.如权利要求1-22中任一项所述的组合物,其中所述组合物包含能够结合至NLRP3mRNA和NLRP1 mRNA两者的反义寡核苷酸。

24.如权利要求1-23中任一项所述的组合物,其中所述组合物还包含赋形剂。

25.如权利要求1-24中任一项所述的组合物,其中所述组合物被配制用于肠胃外或经鼻施用。

26.如权利要求1-25中任一项所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含与SEQ IDNO:95、96、97、98、99、100、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种组合物,所述组合物包含能够结合至含nacht、lrr和pyd结构域的蛋白3(nlrp3)或nlrp1 mrna的反义寡核苷酸。

2.如权利要求1所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸特异性结合至所述nlrp3 mrna。

3.如权利要求1或2所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含与编码nlrp3 mrna的核酸序列互补的核酸序列。

4.如权利要求1或2所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含与由seq id no:1-7编码的mrna至少80%、至少90%或至少95%互补的核酸序列。

5.如权利要求1所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸特异性结合至所述nlrp1 mrna。

6.如权利要求1或5所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含与编码nlrp1 mrna的核酸序列互补的核酸序列。

7.如权利要求1或5所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含与由seq id no:8-13编码的mrna至少80%、至少90%或至少95%互补的核酸序列。

8.如权利要求1所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸特异性结合至所述nlrp3 mrna和nlrp1 mrna。

9.如权利要求1或8所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含与编码nlrp3 mrna和nlrp1 mrna的核酸序列互补的核酸序列。

10.如权利要求1或8所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含与由seq id no:1和seq id no:8编码的mrna互补的核酸序列。

11.如权利要求1或8-10所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含与以下序列之一具有至少80%、85%、90%、95%或99%序列相似性的核酸序列:seq id no:21-38。

12.如权利要求1-11中任一项所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含12-30个核苷酸的长度。

13.如权利要求1-12中任一项所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含间隙区段和翼区段。

14.如权利要求13所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含5’-翼区段和3’-翼区段。

15.如权利要求14所述的组合物,其中所述5’-翼区段和所述3’-翼区段中的每一个包含三个核苷酸的长度。

16.如权利要求1-15中任一项所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含至少一个2'-修饰的核苷、至少一个修饰的核苷酸间连键或至少一个反向无碱基部分。

17.如权利要求16所述的组合物,其中所述至少一个2'修饰的核苷酸包含2'-o-甲基、2'-o-甲氧基乙基(2'-o-moe)、2'-o-氨基丙基、2'-脱氧、2'-脱氧-2'-氟、2'-o-氨基丙基(2'-o-ap)、2'-o-二甲氨基乙基(2'-o-dmaoe)、2'-o-二甲氨基丙基(2'-o-dmap)、2'-o-二甲氨基乙氧基乙基(2'-o-dmaeoe)、2'-o-n-甲基乙酰胺基(2'-o-nma)修饰的核苷酸、锁定核酸(lna)、限制性乙基(cet)糖、硫代吗啉代、乙烯核酸(ena)或其组合。

18.如权利要求17所述的组合物,其中所述至少一个修饰的核苷酸间连键包含硫代磷酸酯连键或二硫代磷酸酯连键。

19.如权利要求1-18中任一项所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸包含磷酰二胺吗啉代寡聚物(pmo)、硫代吗啉代、锁定核酸(lna)或限制性乙基(cet)糖。

20.如权利要求1-19中任一项所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸与肽、抗体、脂质、碳水化合物或聚合物缀合。

21.如权利要求20所述的组合物,其中所述反义寡核苷酸通过接头与肽、抗体、脂质、碳水化合物或聚合物缀合。

22.如权利要求1-21中任一项所述的组合物,其中所述组合物包含特异性结合至所述nlrp3 mrna的反义寡核苷酸和特异性结合至所述nlrp1 mrna的反义寡核苷酸的组合。

23.如权利要求1-22中任一项所述的组合物,其中所述组合物包含能够结合至nlrp3mrna和nlrp1 mrna两者的反义寡核苷酸。

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【专利技术属性】
技术研发人员:陈力山靳博涵蒂莫西·普雷斯顿·王
申请(专利权)人:美国微哲默理有限责任公司
类型:发明
国别省市:

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