【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学育种，涉及一种与猪乳头数性状相关的snp标记引物对及其应用。
技术介绍
1、乳头数作为衡量母猪哺乳能力的重要指标，是生产中非常重要的繁殖性状之一。母猪通过乳头分泌乳汁哺乳仔猪，为仔猪生长发育提供营养物质，同时传递抗体，保障仔猪免受感染、健康成长。具有较多有效乳头数的母猪可以哺乳更多的仔猪，提供更多的断奶猪；而有效乳头数少于产仔数会严重影响仔猪的成活率。同时，乳头数与产仔数也有一定程度的相关，多乳头数和高产仔数的有效结合是实现母猪高生产效率的重要基础。因此，选择足够的乳头数量以确保母猪能够哺育所有的仔猪，在生猪生产中越来越受到重视。此外猪乳头数性状还和猪体长、初生重等生长发育性状具备较强的遗传相关，因此针对猪乳头数的选育提升具备较高的经济价值。乳头数性状作为数量性状，利用传统育种技术很难在短期内获得较为明显的遗传进展，而分子育种技术能够提高育种效率。与传统育种相比，利用与性状相关的标记进行分子选择可以有效加快育种进程。研究猪乳头数的遗传分子机制，鉴别影响猪乳头数的有关分子标记应用于育种中，对选育多乳头群体或新品系具有重要的经济效益。同时如果本专利技术能够得到广泛应用，可以大大提高我国母猪年生产力，尤其是每头能繁母猪年育成断奶仔猪数(psy)与最终上市肉猪数及产肉量(msy)，这就意味着可以减少能繁母猪的饲养量，达到稳产稳供的目的，所以本专利技术的社会效益相当可观。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于针对传统猪乳头数选育耗时费力，选育进展缓慢的问题，提供与猪
2、本专利技术的另一个目的在于提供用于检测上述snp标记的引物对和检测方法。
3、本专利技术的另一个目的在于提供上述snp标记、分子标记、引物的用途。
4、本专利技术的目的可通过以下技术方案实现：
5、猪1号染色体上与猪乳头数性状相关的分子标记，国际猪基因组11.1版本参考序列猪1号染色体rs325188308核苷酸位点存在c/t多态性，该位点tt型个体的乳头数显著多余cc型个体的乳头数；以含有国际猪基因组11.1版本参考序列猪1号染色体rs325188308核苷酸位点的核苷酸序列为基础序列，设计引物对，以猪基因组dna为模板进行pcr扩增，使国际猪基因组11.1版本参考序列猪1号染色体rs325188308核苷酸位点转化为分子标记。
6、作为本专利技术的一种优选，所述的分子标记如下所示：
7、ctgacagctc tagatgctag tatacaaggt atctcatgta aattaaactg cttgttggca60atggtacact gaagtagata cattcttcta aaaatctatc ctcccagaat aagctaaaag120aaagcacaag atggtttggg cggtattgct gtaacagtga gaaagtaaaa actacaaaaa180tgtccaacaa tgaaaaacaa yaggctgtca tatagctatt aaaagtttta aataaattaa240tgttgagtta gaaaagtttg taacatgagg aaaaagttta aaattaaata aaaagcataa300aacataatgg tatactgtat gatcgcaata agcaaaaaca aggatttgaa gaaagtctag360aagaaaagat aaaatgctaa tgaaagttgt ttggaggcaa g 401其中第201bp的y代表c或t。
8、一种用于检测猪1号染色体上与猪乳头数性状相关的snp标记的引物对，上游引物为：seq id no：2，下游引物为：seq id no：3。
9、所述的引物对在检测猪乳头数性状和猪育种中的应用。
10、一种检测所述的猪1号染色体上与猪乳头数性状相关的snp标记的方法，包含pcr扩增国际猪基因组11.1版本参考序列中猪1号染色体rs325188308核苷酸位点的一段序列，对扩增产物进行测序，判读该位点的c/t多态性。
11、作为本专利技术的进一步优选，所述的方法包括以下步骤：
12、(1)取猪组织样品提取总dna；
13、(2)用已提取的猪基因组dna为模板，使用权利要求5所述的引物对进行pcr扩增；
14、(3)扩增产物进行测序，分析测序结果，判读在seq id no：1第201位的c/t多态性。
15、本专利技术所述的分子标记在筛选多乳头猪群体或新品系中的应用。
16、本专利技术所述的引物对在筛选多乳头猪群体或新品系中的应用。
17、一种筛选多乳头猪群体的方法，包括检测国际猪基因组11.1版本参考序列中猪1号染色体rs325188308核苷酸位点的基因型，该位点tt型个体的乳头数显著多余cc型个体的乳头数，选育rs325188308核苷酸位点的tt型个体优先作为后备种猪留种。
18、作为本专利技术的一种优选，检测国际猪基因组11.1版本参考序列中猪1号染色体rs325188308核苷酸位点的基因型的方法选自pcr或基因测序。
19、有益效果
20、本专利技术提供的猪1号染色体上与乳头数性状相关的snp标记，基于该snp开发的分子标记及引物可用于snp的检测。因此，可以通过鉴定该snp标记来筛选多乳头猪个体，所得的多乳头猪群体或品系具有重要的经济效益与社会价值。
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1.一种开发与猪乳头数性状相关的分子标记的方法，其特征在于国际猪基因组11.1版本参考序列猪1号染色体rs325188308核苷酸位点存在C/T多态性，该位点TT型个体的乳头数显著多余CC型个体的乳头数；以含有国际猪基因组11.1版本参考序列猪1号染色体rs325188308核苷酸位点的核苷酸序列为基础序列，设计引物对，以猪基因组DNA为模板进行PCR扩增，使国际猪基因组11.1版本参考序列猪1号染色体rs325188308核苷酸位点转化为分子标记。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于所述的引物对序列为上游引物：SEQ ID NO：2，下游引物：SEQ ID NO：3。
3.按照权利要求1或2所述的方法得到的分子标记。
4.根据权利要求3所述分子标记，其特征在于所述的分子标记序列如SEQ ID NO：1所示，所述的国际猪基因组11.1版本参考序列猪1号染色体rs325188308核苷酸位点在SEQ IDNO：1中位于第201位，存在C/T多态性。
5.一种用于检测与猪乳头数性状相关的SNP标记的引物对，其特征在于上游引物为：S
6.一种检测权利要求5中所述的与猪乳头数性状相关的SNP标记的方法，其特征在于PCR扩增包含猪国际猪基因组11.1版本参考序列猪1号染色体rs325188308核苷酸位点的一段序列，对扩增产物进行测序，判读该位点的C/T多态性。
7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于包括以下步骤：
8.权利要求5所述的引物对在筛选高乳头数猪群体中的应用。
9.一种筛选多乳头猪个体，建立多乳头猪群体或品系的方法，其特征在于包括检测猪国际猪基因组11.1版本参考序列猪1号染色体rs325188308核苷酸位点的基因型，该位点TT型个体的乳头数显著多余CC型个体的乳头数，选育rs325188308核苷酸位点的TT型个体优先作为种猪。
10.根据权利要求9所述的方法，检测国际猪基因组11.1版本参考序列中猪1号染色体rs325188308核苷酸位点的基因型的方法选自PCR或基因测序。
...【技术特征摘要】
1.一种开发与猪乳头数性状相关的分子标记的方法，其特征在于国际猪基因组11.1版本参考序列猪1号染色体rs325188308核苷酸位点存在c/t多态性，该位点tt型个体的乳头数显著多余cc型个体的乳头数；以含有国际猪基因组11.1版本参考序列猪1号染色体rs325188308核苷酸位点的核苷酸序列为基础序列，设计引物对，以猪基因组dna为模板进行pcr扩增，使国际猪基因组11.1版本参考序列猪1号染色体rs325188308核苷酸位点转化为分子标记。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于所述的引物对序列为上游引物：seq id no：2，下游引物：seq id no：3。
3.按照权利要求1或2所述的方法得到的分子标记。
4.根据权利要求3所述分子标记，其特征在于所述的分子标记序列如seq id no：1所示，所述的国际猪基因组11.1版本参考序列猪1号染色体rs325188308核苷酸位点在seq idno：1中位于第201位，存在c/t多态性。
5.一种用于检测与猪乳头数性状相关的snp标记的引物对，其特征在于上游引物为：seq id no：2，下游引物为：seq id no...
【专利技术属性】
技术研发人员：黄瑞华，蔡文武，李平华，刘晨曦，赵清波，周五朵，刘倩，马金凤，曾韬，艾新洁，
申请(专利权)人：南京农业大学，
类型：发明
国别省市：
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