【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于艾滋病诊疗，尤其涉及hiv-1感染的肠道菌群标志物及其应用。
技术介绍
1、艾滋病的全称为获得性免疫缺陷综合征(acquired immune deficiencysyndrome,aids)，是由人免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus，hiv)感染引发的传染性疾病。hiv攻击人体免疫系统，不断破坏患者体内的cd4+t淋巴细胞，免疫能力极其低下的患者易患各种并发疾病，最后导致死亡，已成为世界范围内的一个健康问题。尽管hiv已被发现三十多年，人们对其感染和致病的机制进行了大量的研究，但目前仍未找到可靠治愈药物和疫苗。提示除病毒复制外，其他因素如宿主免疫、营养状况、环境因素、微生物及精神因素等也可能对hiv的疾病进展起作用。
2、近年来，由hiv感染引起的肠道菌群失衡逐渐受到人们重视，多项基于高通量测序技术的研究显示hiv阳性者的肠道菌群多样性及组成较hiv阴性者存在显著差异。
技术实现思路
1、本专利技术要解决的技术问题是提供hiv-1感染的肠道菌群标志物及其应用，以期为hiv-1感染诊治提供多样化的技术选择。
2、为解决上述技术问题，本专利技术采用以下技术方案：
3、hiv-1感染的肠道菌群标志物，为brevundimonas_intermedia或者brevundimonas_intermedia与其他肠道菌群的组合。
4、hiv-1感染的肠道菌群标志物或其丰度检测试剂在制备hiv-1
5、丰度检测试剂为提取微生物基因组dna、微生物蛋白或菌体成分的试剂。
6、丰度检测试剂为针对肠道菌群标志物的特异性的引物、探针、反义寡核苷酸、适配体或抗体。
7、特异性的引物为16s rrna的引物。
8、hiv-1感染的肠道菌群标志物在构建预测hiv-1感染的计算模型中的应用。
9、hiv-1诊断检测产品，包括hiv-1感染的肠道菌群标志物丰度检测试剂，肠道菌群标志物为brevundimonas_intermedia或者brevundimonas_intermedia与其他肠道菌群的组合。
10、利用hiv-1感染的肠道菌群标志物预测hiv-1感染的系统，由以下单元组成：
11、核酸样本分离单元，用于从检测对象中分离肠道菌群核酸样本；
12、测序单元，用于对分离的肠道菌群核酸样本进行测序，以获得测序结果；
13、数据处理单元，用于根据测序结果，对肠道菌群中的标志物的相对丰度进行检测，将所得到的相对丰度值进行分析，得出上述微生物标志物的临界值；
14、结果判定单元，用于将数据处理单元得到的标志物的临界值与设定诊断值进行比较。
15、其他肠道菌群为faecalibacterium_prausnitzii、rhodococcus_erythropolis、anaerostipes_hadrus、bifidobacterium_pseudocatenulatum_dsm_20438_jcm_1200_lmg_10505、acinetobacter_johnsonii、clostridium_perfringens、ruminococcus_callidus、enterococcus_faecium或aeromonas_caviae。
16、针对hiv-1感染诊断存在的问题，专利技术人经深入研究发现，brevundimonas_intermedia及其他九种肠道菌群与hiv-1感染相关，其丰度在hiv-1感染者和健康人群中呈现显著性差异，roc曲线分析其作为检测变量具有较高的曲线下面积、特异性和敏感性，这提示肠道菌群可能是hiv-1感染的指标之一，有可能在hiv-1感染诊断中发挥作用，对多样化hiv-1感染诊治技术具重要意义。因此，brevundimonas_intermedia或者brevundimonas_intermedia与其他肠道菌群的组合可以作为检测标志物应用于hiv-1感染者的诊断。通过提取粪便样本中的肠道菌群的dna基因组并测序从而得到肠道菌群的种类和丰度特征，基于上述特定肠道菌群的丰度特征可以对hiv-1感染进行诊断。据此，还可制备相应hiv-1诊断检测产品或预测hiv-1感染的系统，利用该产品或系统，可以通过检测得到相对丰度值，并与预定的临界值进行比较，从而提高确定对象个体为hiv-1感染个体或者为健康个体的概率。综上，应用本专利技术诊断hiv-1感染，可以实现完全无创，准确性高。
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1.HIV-1感染的肠道菌群标志物，其特征在于为Brevundimonas_intermedia或者Brevundimonas_intermedia与其他肠道菌群的组合。
2.HIV-1感染的肠道菌群标志物或其丰度检测试剂在制备HIV-1诊断检测产品中的应用，其特征在于：所述肠道菌群标志物为Brevundimonas_intermedia或者Brevundimonas_intermedia与其他肠道菌群的组合。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于：所述丰度检测试剂为提取微生物基因组DNA、微生物蛋白或菌体成分的试剂。
4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于：所述丰度检测试剂为针对肠道菌群标志物的特异性的引物、探针、反义寡核苷酸、适配体或抗体。
5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于：所述特异性的引物为16S rRNA的引物。
6.HIV-1感染的肠道菌群标志物在构建预测HIV-1感染的计算模型中的应用。
7.一种HIV-1诊断检测产品，其特征在于包括HIV-1感染的肠道菌群标志物丰度检测试剂，所述肠
8.一种利用HIV-1感染的肠道菌群标志物预测HIV-1感染的系统，其特征在于由以下单元组成：
9.根据权利要求1所述HIV-1感染的肠道菌群标志物、权利要求2或6所述应用或权利要求7所述HIV-1诊断检测产品或权利要求8所述系统，其特征在于：所述其他肠道菌群为Faecalibacterium_prausnitzii、Rhodococcus_erythropolis、Anaerostipes_hadrus、Bifidobacterium_pseudocatenulatum_DSM_20438_JCM_1200_LMG_10505、Acinetobacter_johnsonii、Clostridium_perfringens、Ruminococcus_callidus、Enterococcus_faecium或Aeromonas_caviae。
...【技术特征摘要】
1.hiv-1感染的肠道菌群标志物，其特征在于为brevundimonas_intermedia或者brevundimonas_intermedia与其他肠道菌群的组合。
2.hiv-1感染的肠道菌群标志物或其丰度检测试剂在制备hiv-1诊断检测产品中的应用，其特征在于：所述肠道菌群标志物为brevundimonas_intermedia或者brevundimonas_intermedia与其他肠道菌群的组合。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于：所述丰度检测试剂为提取微生物基因组dna、微生物蛋白或菌体成分的试剂。
4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于：所述丰度检测试剂为针对肠道菌群标志物的特异性的引物、探针、反义寡核苷酸、适配体或抗体。
5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于：所述特异性的引物为16s rrna的引物。
6.hiv-1感染的肠道菌群标志物在构建预测hiv-1感染的计算模型中的应用。
7.一种hiv-1诊断检测产品，其特征在于包括hiv-1...
【专利技术属性】
技术研发人员：黄颉刚，梁浩，崔萍，叶力，周杰，张毓，杨静，宁焕，黄倩倩，
申请(专利权)人：广西医科大学，
类型：发明
国别省市：
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