【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及猪分子标记，具体涉及一种与猪肉质性状基因mcee相关的snp分子标记、引物对及其应用。
技术介绍
1、中国是猪生产大国，无论是生猪养殖规模还是猪肉消费量均居世界第一。肉质性状是生猪育种产业的重要经济性状，猪肉品质的高低直接影响猪场的生产和经济效益。肉质遗传力在0.25～0.42之间，大多为中遗传力性状。目前能够利用并阐明肌内脂肪含量对肉质性状影响机制的关键基因仍然不足。因此，寻找控制猪肉质性状的关键分子遗传标记，并将其用于分子标记辅助育种，对提高猪的肉质性状，增加经济效益具有重要意义。
2、mcee基因是丙酸代谢通路基因，编码丙二酰辅酶a表位异构酶。mcee由细胞外信号调节激酶2驱动的转录因子sp1/早期生长反应蛋白1转录开关介导，由其启动子水平的转移信号驱动，调控丙酸代谢，从而调节细胞增殖、迁移等多种生物过程。
3、研究表明mcee参与线粒体钴胺素依赖性途径产生琥珀酰辅酶a的过程。琥珀酰辅酶a是机体为各种代谢过程进行能量储备的关键酶之一，甲基丙二酸(mma)是丙酸代谢的副产物，甲基丙二酸与细胞增值、侵袭密切相关。也有研究表明，mma诱导sox4基因表达并因此引发转录重编程。
4、然而，关于mcee基因能否提高猪肉品质，这一分子机制尚未见报道。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于克服上述技术不足，提供了一种与猪肉质性状基因mcee相关的snp分子标记、引物对及其应用，本专利技术发掘了第1号染色体mcee基因中的一个snp与猪肉质
2、第一方面，本专利技术提供了一种与猪肉质性状基因mcee相关的snp分子标记，所述肉质性状为肌内脂肪含量性状；所述mcee基因分子标记位于猪第1号染色体mcee基因第1内含子中，其核苷酸序列如序列表seq id no.1所示，在该序列的第301bp处存在一处g.301a>g碱基突变。
3、进一步的，序列seq id no.1中第301bp处的a或g碱基多态性位点，表现为aa、ag或gg三种基因型，其中a等位基因为优势等位基因。
4、第二方面，本专利技术提供了一种如第一方面所述的snp分子标记在猪肉质性状筛选和/或猪育种中的应用。
5、第三方面，本专利技术提供了一种用于扩增如第一方面所述的分子标记的引物对，所述引物对包括：上游引物的核苷酸序列如seq id no.2所示，下游引物的核苷酸序列如seqid no.3所示。
6、第四方面，本专利技术提供了一种如第三方面所述的引物对在猪肉质性状筛选和/或猪育种中的应用。
7、第五方面，本专利技术提供了一种利用如第一方面所述的snp分子标记进行快速选育的试剂盒，包含如第三方面所述的引物对。
8、第六方面，本专利技术提供了一种猪肉质性状筛选和/或猪选育的方法，包括以下步骤：
9、s1、提取猪的基因组dna；
10、s2、以步骤s1得到的基因组dna作为模板，采用如权利要求4所述的引物对进行pcr扩增，得到如权利要求1所述的分子标记并纯化；
11、s3、对步骤s2纯化后的分子标记进行测序分析，保留该序列第301bp处携带有a等位基因的个体，淘汰携带有g等位基因的个体。
12、进一步的，步骤s1中，从待测猪的耳缘组织中提取基因组dna。
13、进一步的，步骤s2中，pcr反应体系50μl，体系中各组分为：基因组dna100ng、pcrmix 25μl、上述上下游引物各1μl、加ddh2o补至总体积50μl；pcr的运行程序为：98℃预变性45s；98℃变性10s，59℃退火30s，72℃延伸30s，35个循环；72℃延伸5min；4℃保存。
14、与现有技术相比，本专利技术的有益效果包括：本专利技术首次发掘了猪mcee基因相关的snp分子标记与猪的肉质性状，具体为肌内脂肪含量性状相关，因此可将该分子标记用于筛选猪肉质性状和选育，即提供了猪mcee基因相关的snp分子标记在猪肉质性状的标记辅助育种的新用途，实现了对猪肉质性状的早期筛选，筛选方法简单快速。
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1.一种与猪肉质性状基因MCEE相关的SNP分子标记，其特征在于，所述肉质性状为肌内脂肪含量性状；所述MCEE基因分子标记位于猪第1号染色体MCEE基因第1内含子中，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，在该序列的第301bp处存在一处g.301A>G碱基突变。
2.根据权利要求1所述的与猪肉质性状基因MCEE相关的SNP分子标记，其特征在于，序列SEQ ID NO.1中第301bp处的A或G碱基多态性位点，表现为AA、AG或GG三种基因型，其中A等位基因为优势等位基因。
3.如权利要求1或2任一项所述的SNP分子标记在猪肉质性状筛选和/或猪育种中的应用。
4.一种用于扩增如权利要求1所述的分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对包括：上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
5.如权利要求4所述的引物对在猪肉质性状筛选和/或猪育种中的应用。
6.一种利用如权利要求1所述的SNP分子标记进行快速选育的试剂盒，其特征在于，包含如权利要求4所述的引物
7.一种猪肉质性状筛选和/或猪选育的方法，其特征在于，包括以下步骤：
8.根据权利要求7所述的猪肉质性状筛选和/或猪选育的方法，其特征在于，步骤S1中，从待测猪的耳缘组织中提取基因组DNA。
9.根据权利要求7所述的猪肉质性状筛选和/或猪选育的方法，其特征在于，步骤S2中，PCR反应体系50μL，体系中各组分为：基因组DNA 100ng、PCR mix 25μL、上述上下游引物各1μL、加ddH2O补至总体积50μL；PCR的运行程序为：98℃预变性45s；98℃变性10s，59℃退火30s，72℃延伸30s，35个循环；72℃延伸5min；4℃保存。
...【技术特征摘要】
1.一种与猪肉质性状基因mcee相关的snp分子标记，其特征在于，所述肉质性状为肌内脂肪含量性状；所述mcee基因分子标记位于猪第1号染色体mcee基因第1内含子中，其核苷酸序列如序列表seq id no.1所示，在该序列的第301bp处存在一处g.301a>g碱基突变。
2.根据权利要求1所述的与猪肉质性状基因mcee相关的snp分子标记，其特征在于，序列seq id no.1中第301bp处的a或g碱基多态性位点，表现为aa、ag或gg三种基因型，其中a等位基因为优势等位基因。
3.如权利要求1或2任一项所述的snp分子标记在猪肉质性状筛选和/或猪育种中的应用。
4.一种用于扩增如权利要求1所述的分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对包括：上游引物的核苷酸序列如seq id no.2所示，下游引物的核苷酸序列如seq id no.3所示。<...
【专利技术属性】
技术研发人员：张宇，李亚赛，徐忠，梅书棋，彭先文，吴俊静，乔木，周佳伟，冯越，李梓芃，孙华，李良华，赵海忠，宋忠旭，
申请(专利权)人：湖北省农业科学院畜牧兽医研究所，
类型：发明
国别省市：
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