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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及一种用于肺腺癌诊断、治疗和预后评估的标志物及其应用,属于生物医学。
技术介绍
1、肺腺癌(lung adenocarcinoma,luad)是最常见的组织学肺癌,是全球癌症相关死亡的主要原因。luad的治疗包括手术和放疗、化疗、免疫、靶向和姑息治疗。大多数luad患者的治疗效果仍然不理想。因此,迫切需要新兴的生物标志物来指导治疗方案并改善luad患者的临床结果。
2、泛素和泛素样(ub/ubl)修饰受泛素活化酶(e1)、泛素结合酶(e2)、泛素蛋白连接酶(e3)、去泛素化酶(dub)、泛素/泛素样结合域(ubd)和泛素样结构域(uld)的调控。泛素通路在不同类型的免疫细胞和癌细胞中发挥各种生理功能。现有技术公开了泛素通路在癌症中的部分功能:首先,泛素通路与癌症的肿瘤发生和发展有关,包括细胞周期、p53激活、dna损伤修复和细胞凋亡。其次,靶向泛素通路已成为癌症患者的一种有前途的治疗策略。yang等人确定了一组泛素相关基因作为对分子亚型进行分类和对患者风险进行分层的标准。美国食品药品监督管理局(food and drug administration,fda)已批准几种靶向泛素相关通路的药物用于癌症治疗。
3、既往研究表明,几种泛素相关基因(ubiquitin-related gene,ubrgs)参与了肺腺癌的发生和发展。泛素结合酶e2(ubiquitin binding enzyme e2,ube13)h促进转移,与luad的预后呈负相关,ube14s在肿瘤样本中的表达增强,并与luad的
4、因此,通过对大规模基因组或转录组数据的生物信息学分析,可以筛选出与肺腺癌发生、发展和预后相关的分子标记物,为精准医学提供可靠的治疗靶点,在个性化治疗和预后预测方面具有优势,前景广阔。
技术实现思路
1、针对现有技术的不足,本专利技术提供一种用于肺腺癌诊断、治疗和预后评估的标志物及其应用,所述标志物为泛素化相关基因。本专利技术通过筛选泛素化生物标志物,获得1个预测肺腺癌预后和治疗的标志物dtl。
2、本专利技术的技术方案如下:
3、第一方面,本专利技术提供一种用于肺腺癌诊断、治疗和预后评估的标志物,所述标志物为泛素化基因dtl,其ncbi gene id为51514。
4、第二方面,本专利技术提供了检测泛素化基因dtl表达水平的试剂在制备用于肺腺癌辅助诊断和/或预后评估的产品中的应用
5、根据本专利技术优选的,所述检测泛素化基因dtl表达水平的试剂包括特异性识别泛素化基因dtl的正向引物和反向引物;
6、所述正向引物和反向引物的核苷酸序列如下所示:
7、正向引物:5'-attgctacctgttctgatga3';
8、反向引物:5'-ctggctactcgttactgtt-3'。
9、根据本专利技术优选的,所述检测泛素化基因dtl表达水平的试剂的检测样本选自细胞、组织、血浆或血清。
10、第三方面,本专利技术提供了一种用于肺腺癌辅助诊断和/或预后评估的试剂盒,所述试剂盒包括特异性识别泛素化基因dtl的正向引物和反向引物;
11、所述正向引物和反向引物的核苷酸序列如下所示:
12、正向引物:5'-attgctacctgttctgatga3';
13、反向引物:5'-ctggctactcgttactgtt-3'。
14、根据本专利技术优选的,所述用于肺腺癌辅助诊断和/或预后评估的试剂盒还包括实时荧光定量pcr的检测试剂。
15、第四方面,本专利技术提供了特异性降低泛素化基因dtl表达水平的物质在制备治疗肺腺癌的药物中的应用。
16、根据本专利技术优选的,所述特异性降低泛素化基因dtl表达水平的物质为sirna、shrna、microrna或泛素化基因dtl化学抑制剂。
17、进一步优选的,所述sirna为si-dtl,si-dtl含有两条单链,其核苷酸序列如seqid no.1和seq id no.2所示。
18、第五方面,本专利技术提供了一种治疗肺腺癌的药物,所述治疗肺腺癌的药物包含特异性降低泛素化基因dtl表达水平的物质。
19、根据本专利技术优选的,所述特异性降低泛素化基因dtl表达水平的物质为si-dtl,si-dtl含有两条单链,其核苷酸序列如seq id no.1和seq id no.2所示。
20、与现有技术相比,本专利技术具有以下有益效果:
21、1、本专利技术从geo数据库中获取肺腺癌(luad)的微阵列数据集,通过差异表达基因(degs)分析、加权基因共表达网络分析(wgcna)和泛素化基因筛选,并联合了机器学习分析,筛选得到了一种与肺腺癌进展相关的泛素化基因dtl。然后通过肿瘤免疫微环境分析、富集分析、免疫相关性分析和单细胞分析,发现泛素化基因dtl的高表达与肺腺癌患者的不良预后显著相关,说明泛素化基因dtl可以作为肺腺癌诊断和/或预后评估的标志物,用于制备肺腺癌辅助诊断和/或预后评估的试剂盒。
22、2、本专利技术首次发现通过降低泛素化基因dtl的表达水平,可以显著抑制肺腺癌细胞系的细胞活力和细胞周期。本专利技术还设计了特异性敲低泛素化基因dtl表达水平的si-dtl,通过敲低泛素化基因dtl的表达水平,成功抑制了肺腺癌细胞增殖,并在体外阻滞细胞周期,因此可以将泛素化基因dtl作为治疗靶点,用于制备靶向治疗肺腺癌的药物。
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1.一种用于肺腺癌诊断、治疗和预后评估的标志物,其特征在于,所述标志物为泛素化基因DTL,其NCBI Gene ID为51514。
2.检测泛素化基因DTL表达水平的试剂在制备用于肺腺癌辅助诊断和/或预后评估的产品中的应用。
3.如权利要求2所述的应用,其特征在于,所述检测泛素化基因DTL表达水平的试剂包括特异性识别泛素化基因DTL的正向引物和反向引物;
4.一种用于肺腺癌辅助诊断和/或预后评估的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括特异性识别泛素化基因DTL的正向引物和反向引物;
5.如权利要求4所述的用于肺腺癌辅助诊断和/或预后评估的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括实时荧光定量PCR的检测试剂;所述试剂盒的检测样本选自细胞、组织、血浆或血清。
6.特异性降低泛素化基因DTL表达水平的物质在制备治疗肺腺癌的药物中的应用。
7.如权利要求7所述的应用,其特征在于,所述特异性降低泛素化基因DTL表达水平的物质为siRNA、shRNA、microRNA或泛素化基因DTL化学抑制剂。
8.如权利要求8所
9.一种治疗肺腺癌的药物,其特征在于,所述治疗肺腺癌的药物包含特异性降低泛素化基因DTL表达水平的物质。
10.如权利要求9所述的治疗肺腺癌的药物,其特征在于,所述特异性降低泛素化基因DTL表达水平的物质为si-DTL,si-DTL含有两条单链,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQID NO.2所示。
...【技术特征摘要】
1.一种用于肺腺癌诊断、治疗和预后评估的标志物,其特征在于,所述标志物为泛素化基因dtl,其ncbi gene id为51514。
2.检测泛素化基因dtl表达水平的试剂在制备用于肺腺癌辅助诊断和/或预后评估的产品中的应用。
3.如权利要求2所述的应用,其特征在于,所述检测泛素化基因dtl表达水平的试剂包括特异性识别泛素化基因dtl的正向引物和反向引物;
4.一种用于肺腺癌辅助诊断和/或预后评估的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括特异性识别泛素化基因dtl的正向引物和反向引物;
5.如权利要求4所述的用于肺腺癌辅助诊断和/或预后评估的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括实时荧光定量pcr的检测试剂;所述试剂盒的检测样本选自细胞、组织、血浆或血清。
6.特异性降低泛素化基...
【专利技术属性】
技术研发人员:刘锋,卜昌元,
申请(专利权)人:北京斐然智达科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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