【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及分子标记遗传育种，特别是涉及一种黄颡鱼生长性状相关的微卫星分子标记及其应用。
技术介绍
1、在水产育种目标的选择上，以生长速度为目标性状的选择占比达到47.85％。动物生长是一个复杂的生物代谢过程，gh/igf1轴是下丘脑-垂体-肝脏轴的主要调控部分，通过各种生长因子和激素的分泌，调控脊椎动物的生长和发育。gh/igf1轴主要由生长激素(gh)、生长激素受体(ghr)、胰岛素样生长因子1/2(igf1/igf2)、胰岛素样生长因子受体(igf1r/igf2r)和胰岛素样生长因子结合蛋白(igfbps)组成。这些基因成功应用于提高鱼类的生长相关性状，如类igf基因是影响肌肉生长速度的主效基因，它在沟鲶(ictaluruspunctatus)品种选育中的效果得到验证，比如，在快速生长品系肌肉中的mrna表达量是慢生长品系肌肉中的两倍以上。目前黄颡鱼的育种中，通过杂交提高黄颡鱼的抗逆性能(“黄优1号”)和通过性别控制提高黄颡鱼的生长速度(“全雄1号”)是主要的育种方向。而将分子标记辅助育种的方法运用到黄颡鱼生长性状选育过程的报道很少。
2、微卫星携带的遗传信息可以在育种过程中对生长性状进行改良。微卫星是基因组中的短片段重复序列，由1～6个碱基组成，微卫星广泛分布在真核生物的基因组中，大约每隔10～550kb就存在一个微卫星。微卫星由于具有特异性的pcr扩增、多态信息容量(pic)高、引物通用性好、突变率高、共显性、dna用量少、反应速度快、操作简易以及结果重复性好等特点，已成为分子育种中运用最有效的分子遗传标
3、黄颡鱼胰岛素样生长因子1a受体(igf1ra)基因为gh/igf1轴的核心基因，是胰岛素样生长因子(igf1)的下游受体，全长96549bp，位于13号染色体。根据黄颡鱼胰岛素样生长因子1a受体(igf1ra)基因开发与生长性状相关的微卫星分子标记，对利用分子标记辅助育种的方式对黄颡鱼生长性状选育具有重要意义。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供一种黄颡鱼生长性状相关的微卫星分子标记及其应用，以解决上述现有技术存在的问题，利用本专利技术开发的扩增引物检测黄颡鱼生长性状相关的微卫星位点基因型，可实现利用分子标记辅助育种对黄颡鱼生长性状进行选育。
2、为实现上述目的，本专利技术提供了如下方案：
3、本专利技术提供一种与黄颡鱼生长性状相关的微卫星片段，所述微卫星片段的重复序列为(ttctc)n，n的取值范围为6～13之间的任意整数；
4、所述微卫星片段包括下表所示的等位基因：
5、
6、所述生长性状包括全长、体长、体重、体高、头长、尾柄长和尾柄高。
7、本专利技术还提供一种扩增所述微卫星片段的引物对，所述引物对包括核苷酸序列如seq id no.17所示的上游引物和核苷酸序列如seq id no.18所示的下游引物。
8、本专利技术还提供一种含有所述引物对的试剂盒。
9、本专利技术还提供所述的引物对或所述的试剂盒在检测黄颡鱼生长性状中的应用。
10、本专利技术还提供一种检测黄颡鱼生长性状的方法，包括以下步骤：
11、提取待测黄颡鱼样本dna；
12、以待测黄颡鱼样本dna为模板，利用所述的引物对进行pcr扩增，对扩增产物进行基因分型，根据基因分型结果判断待测黄颡鱼的生长性状；
13、基因分型结果为cf基因型的黄颡鱼，各生长性状均显著高于ef基因型的黄颡鱼；体长显著高于fg基因型的黄颡鱼和ff基因型的黄颡鱼；全长显著高于bh基因型的黄颡鱼和ff基因型的黄颡鱼；
14、基因分型结果为cf基因型、df基因型和fg基因型的黄颡鱼，尾柄高显著高于ff基因型的黄颡鱼；
15、所述生长性状包括全长、体长、体重、体高、头长、尾柄长和尾柄高。
16、进一步地，所述pcr扩增的反应体系为dna 1μl，2×taq pcr mix(北京天根生化有限公司)10μl，上下游引物各0.5μl，ddh2o补齐至20μl；
17、所述pcr扩增的反应条件为94℃预变性4min，94℃变性30s，退火30s，72℃延伸30s，循环35次，72℃延伸5min。
18、本专利技术还提供所述的引物对或所述的试剂盒在筛选优良生长性状的黄颡鱼中的应用。
19、本专利技术还提供一种筛选优良生长性状的黄颡鱼的方法，包括以下步骤：
20、提取待测黄颡鱼样本dna；
21、以待测黄颡鱼样本dna为模板，利用所述的引物对进行pcr扩增，对扩增产物进行基因分型；
22、若基因分型结果为cf基因型，则待测黄颡鱼为具备优良生长性状的个体；
23、所述生长性状包括全长、体长、体重、体高、头长、尾柄长和尾柄高。
24、进一步地，所述pcr扩增的反应体系为dna 1μl，2×taq pcr mix(北京天根生化有限公司)10μl，上下游引物各0.5μl，ddh2o补齐至20μl；
25、所述pcr扩增的反应条件为94℃预变性4min，94℃变性30s，退火30s，72℃延伸30s，循环35次，72℃延伸5min。
26、本专利技术还提供所述的引物对或所述的试剂盒在对黄颡鱼生长性状进行分子标记辅助选育中的应用。
27、本专利技术公开了以下技术效果：
28、本专利技术在黄颡鱼胰岛素样生长因子1a受体(igf1ra)基因上找到1个微卫星片段，所述微卫星片段的重复序列为(ttctc)n，n的取值范围为6～13之间的任意整数，同时筛选出了一对用于扩增上述微卫星片段的引物对，对候选黄颡鱼群体的遗传多样性和主要生长性状的关联情况进行了分析，找到对生长性状有利的优势基因型。
29、本专利技术用上述筛选出的引物对扩增样本，能特异的扩增出微卫星片段，这些本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种与黄颡鱼生长性状相关的微卫星片段，其特征在于，所述微卫星片段的重复序列为(TTCTC)n，n的取值范围为6～13之间的任意整数；所述微卫星片段包括下表所示的等位基因：
2.一种扩增权利要求1所述微卫星片段的引物对，其特征在于，所述引物对包括核苷酸序列如SEQ ID NO.17所示的上游引物和核苷酸序列如SEQ ID NO.18所示的下游引物。
3.一种含有权利要求2所述引物对的试剂盒。
4.权利要求2所述的引物对或权利要求3所述的试剂盒在检测黄颡鱼生长性状中的应用。
5.一种检测黄颡鱼生长性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：
6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述PCR扩增的反应体系为DNA 1μL，2×Taq PCR Mix(北京天根生化有限公司)10μL，上下游引物各0.5μL，ddH2O补齐至20μL；
7.权利要求2所述的引物对或权利要求3所述的试剂盒在筛选优良生长性状的黄颡鱼中的应用。
8.一种筛选优良生长性状的黄颡鱼的方法，其特征在于，包括以下步骤：
9.
10.权利要求2所述的引物对或权利要求3所述的试剂盒在对黄颡鱼生长性状进行分子标记辅助选育中的应用。
...【技术特征摘要】
1.一种与黄颡鱼生长性状相关的微卫星片段，其特征在于，所述微卫星片段的重复序列为(ttctc)n，n的取值范围为6～13之间的任意整数；所述微卫星片段包括下表所示的等位基因：
2.一种扩增权利要求1所述微卫星片段的引物对，其特征在于，所述引物对包括核苷酸序列如seq id no.17所示的上游引物和核苷酸序列如seq id no.18所示的下游引物。
3.一种含有权利要求2所述引物对的试剂盒。
4.权利要求2所述的引物对或权利要求3所述的试剂盒在检测黄颡鱼生长性状中的应用。
5.一种检测黄颡鱼生长性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：
6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述p...
【专利技术属性】
技术研发人员：刘乙，覃川杰，龚全，颉江，周闯，李庆阳，周俊宏，谢守军，胥天琪，聂启，
申请(专利权)人：内江师范学院，
类型：发明
国别省市：
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