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【技术实现步骤摘要】
本专利技术专利涉及分子生物学,具体而言,涉及一种地枫皮叶片基因组dna提取方法。
技术介绍
1、地枫皮(illicium difengpi k.i.b.&k.i.m.ex b.n.chang)系五味子科(schisandraceae)八角属(illicium)多年生常绿灌木,为喀斯特特有植物,主要生长在石山山顶的裸岩及半裸岩山上,被历版《中国药典》收载的经典壮药,具祛风除湿,行气止痛等功效。地枫皮野生资源薀藏量很小,多以隔离的小种群形式存在。目前,该物种正处于濒危状态,《国家重点保护野生植物名录》(2021版)(https://www.forestry.gov.cn/main/3954/20210908/163949170374051.html)和《中国植物红皮书》将其列为国家二级重点保护植物。采用分子标记技术对地枫皮进行遗传变异、遗传结构和种群动态分析,可为地枫皮的保护和合理利用提供指导,但由于地枫皮生境的特殊性,使其叶片中富含多糖、蛋白质、莽草酸、维生素等次生代谢物,严重影响了地枫皮基因组dna提取的效果。
2、基因组dna的提取是分子生物学研究的基础,常用的基因组dna提取方法有:ctab法、sds法、试剂盒等。采用上述几种方法提取地枫皮dna时,由于次生代谢物与dna结合成粘稠的胶状物,致使dna提取和检测时分离困难、上样困难、电泳困难。凝胶电泳检测显示dna得率很低,电泳带明显变暗或者无法检测到可以分辨的条带(如图1~图3所示)。
3、为此,本专利技术旨在提供一种地枫皮叶片基因组dna提
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于解决
技术介绍
中提出的技术问题,提供一种地枫皮叶片基因组dna提取方法。
2、本专利技术的目的通过以下技术方案实现:
3、一种地枫皮叶片基因组dna提取方法,其特征在于,所述方法具体包括以下步骤:
4、s1、取0.3-1.0g成熟叶片,用液氮充分研磨成粉末后,装入-20℃预冷的离心管中;
5、s2、加入山梨醇洗涤缓冲液,填充至约3/4容量,充分混匀,于12000rpm常温离心5min,弃上清液;
6、s3、加入65℃预热的4%sds提取液5ml,充分混匀,置于65℃恒温水浴箱中0.5~1h,每隔5min上下颠倒混匀,水浴后常温冷却5min;
7、s4、加入5mol/l乙酸钠溶液2ml,摇匀,冰水浴10min,于12000rpm常温离心10min,取上清液转移至2ml离心管中;
8、s5、加入等体积的氯仿/异戊醇混合液进行抽提,充分混匀,于12000rpm常温离心10min,取上清液移至2ml离心管中;
9、s6、加入等体积-20℃预冷的异丙醇,轻轻混匀,置于-20℃冰箱2h或者过夜沉淀,即dna沉淀;
10、s7、用枪头或者铂丝挑出dna沉淀至2ml离心管中;
11、s8、加入1ml的75%乙醇洗涤dna,于12000r/min低温离心2min,弃上清液,洗涤两次后将离心管开盖晾干;
12、s9、加入400μl te缓冲液溶解dna,并加入2μl rna酶于37℃消化30min;
13、s10、加入等体积的氯仿/异戊醇混合液进行抽提,颠倒混匀,于12000rpm常温离心10min,取上清液转移至2ml离心管中;
14、s11、加入2倍体积-20℃预冷的无水乙醇,轻轻混匀,于12000r/min低温离心10min,弃上清液;
15、s12、加入1ml的75%乙醇洗涤dna,于12000r/min低温离心2min,弃上清液,洗涤两次后将离心管开盖晾干,加入200μl已灭菌的超纯水溶解dna沉淀,置于-20℃冰箱中保存。
16、进一步的,在s7步骤之后,若dna呈现果冻状,则还包括以下步骤:
17、a、加入600μl 1mol/l nacl溶解dna,于12000r/min常温离心10min,取上清转移至2ml离心管中;
18、b、加入2倍体积预冷的无水乙醇,轻轻混匀,置于-20℃冰箱2h或过夜沉淀;于12000rpm低温离心10min,弃上清液。
19、进一步的,所述山梨醇洗涤缓冲液的成分为:0.005mol/l edta、0.1mol/ltris-hcl、1%pvp40(w/v)、0.35mol/l山梨醇、1%β-巯基乙醇。
20、进一步的,所述4%sds提取液的成分为:0.05mol/l edta、0.1mol/ltris-hcl、0.5mol/lnacl,4%sds(w/v)、4%pvp40(w/v)、3%β-巯基乙醇。
21、进一步的,所述te缓冲液的成分为:1mol/l tris-hcl和0.5mol/l edta。
22、进一步的,步骤s7中,若无法挑出dna,则使用12000rpm低温离心10min以获得dna沉淀,转移至2ml离心管中。
23、进一步的,若步骤s2中的上清液高度浑浊或粘稠,则重复一次步骤s2。
24、本专利技术解决技术问题的难度及意义在于:
25、由于地枫皮生境的特殊性,使其叶片中富含多糖、蛋白质、莽草酸、维生素等次生代谢物,严重影响了地枫皮基因组dna提取的效果。目前,采用现有技术中常用的基因组dna提取方法提取地枫皮dna时,由于次生代谢物与dna结合成粘稠的胶状物,致使dna提取和检测时分离困难、上样困难、电泳困难;此外,凝胶电泳检测显示dna得率很低,电泳带明显变暗或者无法检测到可以分辨的条带。为此,本专利技术提供的一种地枫皮叶片基因组dna提取方法,对于得到地枫皮基因组dna的质量以及其能够满足后续实验要求方面具备重要的进步意义。
26、综上所述,与现有技术相比,本专利技术具备以下有益效果:
27、1、本专利技术的方法中,采用成熟叶片为提取材料,对提取材料的要求宽松,可以在植物生长的任何时候取材,并且获得的基因组dna能够满足后续实验要求;
28、2、本专利技术的方法中,在sds提取液裂解前,采用山梨醇洗涤缓冲液反复预处理液氮研磨的叶片组织样,且前后共处理2次,能够大量除去干扰dna分离的次生代谢产物;
29、3、本专利技术的方法对传统sds法进行了改良,在4%sds提取液加入4%pvp,再经抽提和离心,可分离到高质量的地枫皮基因组dna,能够满足分子生物学研究的要求,且经检测,采用本专利技术方法得到的地枫皮基因组dna质量高。
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1.一种地枫皮叶片基因组DNA提取方法,其特征在于,所述方法具体包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的一种地枫皮叶片基因组DNA提取方法,其特征在于,在S7步骤之后,若DNA呈现果冻状,则还包括以下步骤:
3.根据权利要求1所述的一种地枫皮叶片基因组DNA提取方法,其特征在于,所述山梨醇洗涤缓冲液的成分为:0.005mol/L EDTA、0.1mol/L Tris-HCl、1%PVP40(w/v)、0.35mol/L山梨醇、1%β-巯基乙醇。
4.根据权利要求1所述的一种地枫皮叶片基因组DNA提取方法,其特征在于,所述4%SDS提取液的成分为:0.05mol/L EDTA、0.1mol/L Tris-HCl、0.5mol/LNaCl,4%SDS(w/v)、4%PVP40(w/v)、3%β-巯基乙醇。
5.根据权利要求1所述的一种地枫皮叶片基因组DNA提取方法,其特征在于,所述TE缓冲液的成分为:1mol/L Tris-HCl和0.5mol/L EDTA。
6.根据权利要求1所述的一种地枫皮叶片基因组DNA提取方法,其特
7.根据权利要求1所述的一种地枫皮叶片基因组DNA提取方法,其特征在于,若步骤S2中的上清液高度浑浊或粘稠,则重复一次步骤S2。
...【技术特征摘要】
1.一种地枫皮叶片基因组dna提取方法,其特征在于,所述方法具体包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的一种地枫皮叶片基因组dna提取方法,其特征在于,在s7步骤之后,若dna呈现果冻状,则还包括以下步骤:
3.根据权利要求1所述的一种地枫皮叶片基因组dna提取方法,其特征在于,所述山梨醇洗涤缓冲液的成分为:0.005mol/l edta、0.1mol/l tris-hcl、1%pvp40(w/v)、0.35mol/l山梨醇、1%β-巯基乙醇。
4.根据权利要求1所述的一种地枫皮叶片基因组dna提取方法,其特征在于,所述4%sds提取液的成分为:0.05mol/l edta、0.1mo...
【专利技术属性】
技术研发人员:张秀姣,甘翔,黄夕洋,杨小丽,李虹,王雨坤,王满莲,唐辉,
申请(专利权)人:广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所,
类型:发明
国别省市:
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