System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种与泥蚶血细胞数目相关的SNP位点及其在亲本选育中的应用制造技术_技高网

一种与泥蚶血细胞数目相关的SNP位点及其在亲本选育中的应用制造技术

技术编号:41422036 阅读:2 留言:0更新日期:2024-05-28 20:22
本发明专利技术提供一种与泥蚶血细胞数目相关的SNP位点标记及其应用,所述的与泥蚶血细胞数目相关的SNP位点位于序列为SEQ ID NO:1的Cbfa2t3的基因的第301位,其碱基为A或T。本发明专利技术还提供一种筛选高血细胞数目的泥蚶亲本的方法,所述的方法是通过检测所述的SNP标记基因型来筛选高血细胞数目的亲本。本发明专利技术筛选获得的SNP标记能够作为选育的分子标记来使用,从而降低泥蚶高血细胞数目亲本筛选的盲目性,以便快速获得泥蚶血细胞数目多、血色性状佳且遗传稳定的个体,用于生产繁育。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于遗传育种,具体涉及一种与泥蚶血细胞数目相关的snp位点及其在亲本选育中的应用。


技术介绍

1、泥蚶(tegillarca granosa)生长于潮间带的滩涂中,是我国东南沿海的主要养殖经济贝类。众所周知,血液是维系动物所有生命活动和生理功能的关键要素,几乎所有的脊椎动物都需依靠血液中的红细胞作为媒介运载氧气,维持机体的正常生理功能。而泥蚶是较为罕见的血液中含有红细胞的海洋无脊椎动物类群,故又被称作“血蚶”。血细胞是贝类抵御外来病原生物侵袭的主要“屏障”,而红细胞又是泥蚶等蚶科贝类血液中的主要细胞,占血细胞比例高达90%以上。红细胞在蚶科贝类中不仅作为运输氧气的载体而存在,还发挥着一定的免疫功能。红血是衡量泥蚶是否健康的重要可视指标,通常血细胞(红细胞)数目多的泥蚶血色更充盈鲜亮,生理状态越好,也越受市场欢迎。因此,培育高血细胞数目的泥蚶新品种具有重要的经济价值,是未来泥蚶育种的重要方向。对其他模式动物的研究结果表明,包括血细胞数目在内的红血性状会受到遗传因素影响。而随着基因组学和分子生物学技术的迅猛发展,贝类(包括泥蚶)育种研究正逐渐实现由传统的选择育种与杂交育种向以基因组信息为基础的分子育种的重要转变。其中,单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphism,snp)标记因其广泛分布于基因区以及可高通量检测等的优势,成为了新一代遗传育种研究首选的分子遗传标记。若能将此标记与经济性状相关联,即可实现dna水平的选择育种。与传统育种方法相比,snp遗传标记育种不仅能大大减少人为因素的影响,还能减少育种的时间成本,提高育种效率。


技术实现思路

1、本专利技术的目的在于提供一种与泥蚶血细胞数目(total hemocyte count,thc)相关的snp位点标记及其应用。

2、本专利技术首先提供一种与泥蚶血细胞数目相关的snp位点,所述的snp位点位于序列为seq id no:1的cbfa2t3的基因的第301位,其碱基为a或t。

3、aaaaaaaaaattaaaaaaaaaaaaataaaaataaaaagaaaaaagaaaaaaattagccatcacaaacttctagcagattactatatttatctaacatagtcaaactttgtcttaaaccaccggcttttaaagatctaacctaatttcttctgtttggtaacagtatataaagagtattccttttataaaccccctagggggaccatgtggacaagttggtctttgatactttataactgtttacaccgaatggttaaactatctgtcacagaagaatattatcatttaacatttatgaatwaaaatatcccctcttgttaaacaccctatcaccataaggacaaaactcctgagagtttcaaaattatggcttgaacattgccatttcaagtcactgttaatattggtccaatcacattcttcctgaacaaaacaaatgttcatcagtgtgctggttcaacaggtctactttcacctggtgtactagacctagaggctgttgaacgtggtgtagatgccacagaattagttggactaggaacagtggctgggggactagatgttccctctgtaggagctgccactgtggctgcaacaggtt(seq id no:1)。

4、本专利技术还提供所述的snp位点的一种用途,是作为筛选富含血细胞的泥蚶亲本的分子标记的应用;

5、本专利技术再一个方面提供用于检测上述snp位点,再采用一代测序确定样品中snp的基因型所需的引物对,其一种具体的核苷酸序列信息如下:

6、cbfa2t3-f:5′-atgtggacaagttggtctttgatac-3′(seq id no:2)、

7、cbfa2t3-r:5′-gtccaactaattctgtggcatctac-3′(seq id no:3);

8、本专利技术再提供一种可检测以上snp位点的试剂盒,所述的试剂盒中包含有上述的引物对,

9、本专利技术还提供一种筛选高血细胞数目泥蚶亲本的方法,所述的方法是通过检测所述的snp标记基因型来筛选高血细胞数目的亲本;

10、所述的基因型,为a/t的杂合基因型。

11、本专利技术筛选获得的snp标记能够作为选育的分子标记来使用,从而降低泥蚶高血细胞数目亲本筛选的盲目性,以便快速获得泥蚶血细胞数目多、血色性状佳且遗传稳定的个体,用于生产繁育。

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【技术保护点】

1.一种与泥蚶血细胞数目相关的SNP位点,其特征在于,所述的SNP位点位于序列为SEQID NO:1的核酸片段的第301位,其碱基为A或T。

2.权利要求1所述的SNP位点作为用于筛选富含血细胞的泥蚶亲本的分子标记中的应用。

3.一种引物对,其特征在于,所述的引物对用于检测权利要求1所述的SNP位点。

4.如权利要求3所述的引物对,其特征在于,所述的引物对,其序列为SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3。

5.一种检测权利要求1所述的SNP位点的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒中包含有权利要求3或4所述的引物对。

6.一种筛选高血细胞数目的泥蚶亲本的方法,其特征在于,所述的方法是通过检测权利要求1所述的SNP位点的基因型来筛选高血细胞数目的亲本。

7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,所述的基因型为A/T的杂合基因型。

【技术特征摘要】

1.一种与泥蚶血细胞数目相关的snp位点,其特征在于,所述的snp位点位于序列为seqid no:1的核酸片段的第301位,其碱基为a或t。

2.权利要求1所述的snp位点作为用于筛选富含血细胞的泥蚶亲本的分子标记中的应用。

3.一种引物对,其特征在于,所述的引物对用于检测权利要求1所述的snp位点。

4.如权利要求3所述的引物对,其特征在于,所述的引物对,其序列为s...

【专利技术属性】
技术研发人员:贺歆廖雨姗包永波
申请(专利权)人:浙江万里学院宁海海洋生物种业研究院
类型:发明
国别省市:

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