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【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及用于分析目的的细胞实体的识别,更具体地,涉及使用提供激光发射的微粒和与这种细胞实体物理关联的寡核苷酸序列的这种识别。
技术介绍
1、细胞是所有生活形式的基本构建模块。从细胞的形状到分子含量、基因表达、功能到轨迹以及与其它细胞和周围环境的相互作用的理解是生命科学的基石。在细胞分析中已经有显著的进展。单细胞测序导致分析细胞从整体到单个细胞的范式转变。这种突破性成功促进了各种新技术的发展,这些新技术将成像与测序相结合,并将抗体与测序相结合,以便在分子、细胞和组织水平上进行多维分析。
2、细胞是动态实体,随时间变化并对环境做出反应。不幸的是,当前的单细胞测序技术,包括基于液滴的测序和原位测序,仅在体外分析的末期进行,因此不能容易地探测动态细胞过程。这些技术需要直接读出靶rna和靶dna,这些rna和dna要么存在于固定细胞的细胞质中,要么在细胞裂解后释放。
3、另一方面,光学显微镜可反复观察活细胞,并可用于测量细胞的时间变化、空间移动和行为。常规的荧光染料、蛋白质和纳米粒子提供有限的光学通道(<100)以跟踪单个细胞或细胞群并获得它们的原位动态信息。
4、基于激光发射粒子的新技术可以提供光谱特征,所述光谱特征可以用作细胞的光学条形码并且有希望能够实现数千至数百万细胞的大规模(>1000)光学跟踪和成像。然而,考虑到活细胞所施加的限制,例如可用于多路复用的荧光通道有限以及需要最小化对细胞的干扰,使用光学显微镜难以获得全面的分子信息。光学成像技术,包括转基因报告蛋白和原位杂交,迄
技术实现思路
1、根据本专利技术的一个实施方案,提供了对细胞实体进行唯一编码的细胞编码构建体。在该实施方案中,细胞编码构建体包括:激光粒子;以及结构编码的寡核苷酸,其中结构编码的寡核苷酸和激光粒子彼此具有物理关联,并且被配置成用于与细胞实体物理关联,并且还被配置成用于细胞实体的独特识别。
2、在相关的实施方案中,本专利技术进一步包括非易失性存储装置,所述非易失性存储装置编码有识别数据,所述识别数据表征结构编码的寡核苷酸和激光粒子以及他们的物理关联。
3、任选地,激光粒子和结构编码的寡核苷酸具有小于3μm的组合尺寸。任选地,细胞构建体与指定的细胞实体物理关联。还任选地,非易失性存储装置进一步用表征指定的细胞实体的生物数据编码。作为进一步的选择,生物数据是基因序列数据。作为进一步的选择,细胞构建体进一步包括被配置成将细胞构建体物理附着到细胞实体的接头。
4、在相关实施方案中,提供了对象群体,其中每个对象都是根据前面任一个描述的独特的细胞构建体。在相关的实施方案中,结构编码的寡核苷酸包括多个连接的序列片段。任选地,结构编码的寡核苷酸和激光粒子之间的物理关联可以被配置成用于解离。
5、在本专利技术的另一个实施方案中,提供了非易失性存储装置,所述非易失性存储装置编码有表征结构编码的寡核苷酸和与结构编码的寡核苷酸理关联的激光粒子的数据,并且对于每个标识符,提供有与相应的细胞实体有关的选自以下的信息:dna数据、rna数据、蛋白质数据、形态数据、位置数据、功能数据和行为数据。任选地,结构编码的寡核苷酸和激光粒子与细胞实体物理关联。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.细胞编码构建体,其对细胞实体进行唯一编码,所述细胞编码构建体包括:
2.根据权利要求1所述的细胞构建体,其进一步包括非易失性存储装置,所述非易失性存储装置编码有识别数据,所述识别数据表征所述结构编码的寡核苷酸和所述激光粒子以及他们的物理关联。
3.根据权利要求1所述的细胞构建体,其中所述激光粒子和所述结构编码的寡核苷酸具有小于3μm的组合尺寸。
4.根据权利要求1所述的细胞构建体,其中所述细胞构建体与指定的细胞实体物理关联。
5.根据权利要求2所述的细胞构建体,其中所述细胞构建体与指定的细胞实体物理关联,并且其中所述非易失性存储装置进一步编码有生物数据,所述生物数据表征所述指定的细胞实体。
6.根据权利要求5所述的细胞构建体,其中所述生物数据是基因序列数据。
7.根据权利要求4所述的细胞构建体,其中所述细胞构建体被配置成用于机器读出识别数据。
8.根据权利要求4所述的细胞构建体,其中组合的细胞构建体和指定的细胞实体被配置成用于机器读出与所述指定的细胞实体相关的数据。
9.根据权利要
10.根据权利要求1所述的细胞构建体,其中所述细胞构建体进一步包括接头,所述接头被配置成将所述细胞构建体物理附着到所述细胞实体。
11.对象群体,其中每个对象是独特的权利要求1所述的细胞构建体。
12.根据权利要求1所述的细胞构建体,其中所述结构编码的寡核苷酸包括多个连接的序列片段。
13.根据权利要求1所述的细胞构建体,其中所述结构编码的寡核苷酸和所述激光粒子之间的所述物理关联被配置成用于物理解离。
14.非易失性存储装置,其编码有表征一组细胞实体的数据,其中对于每个细胞实体,提供有表征结构编码的寡核苷酸和与所述结构编码的寡核苷酸物理关联的激光粒子的标识符,并且对于每个标识符,提供有与相应的细胞实体有关的选自以下的信息:DNA数据、RNA数据、蛋白质数据、形态数据、位置数据、功能数据和行为数据。
15.根据权利要求14所述的非易失性存储装置,其中所述结构编码的寡核苷酸和所述激光粒子与所述细胞实体物理关联。
...【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.细胞编码构建体,其对细胞实体进行唯一编码,所述细胞编码构建体包括:
2.根据权利要求1所述的细胞构建体,其进一步包括非易失性存储装置,所述非易失性存储装置编码有识别数据,所述识别数据表征所述结构编码的寡核苷酸和所述激光粒子以及他们的物理关联。
3.根据权利要求1所述的细胞构建体,其中所述激光粒子和所述结构编码的寡核苷酸具有小于3μm的组合尺寸。
4.根据权利要求1所述的细胞构建体,其中所述细胞构建体与指定的细胞实体物理关联。
5.根据权利要求2所述的细胞构建体,其中所述细胞构建体与指定的细胞实体物理关联,并且其中所述非易失性存储装置进一步编码有生物数据,所述生物数据表征所述指定的细胞实体。
6.根据权利要求5所述的细胞构建体,其中所述生物数据是基因序列数据。
7.根据权利要求4所述的细胞构建体,其中所述细胞构建体被配置成用于机器读出识别数据。
8.根据权利要求4所述的细胞构建体,其中组合的细胞构建体和指定的细胞实体被配置成用于机器读出与所述指定的细胞实体相关的数据。
9.根据权利要求8所述的细胞构建体,其中...
【专利技术属性】
技术研发人员:尹锡贤,吴越,尼古拉·马尔蒂诺,谢尔顿·J·J·夸克,
申请(专利权)人:莱斯创新公司,
类型:发明
国别省市:
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