【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
技术介绍
技术实现思路
1、在某些方面，本文公开了包含一个或多个以下特征的核酸填充序列：没有cpg岛和具有不超过四个相同身份的连续核碱基；其中该核酸填充序列不包括长度大于20个氨基酸的可读框。在一些实施方案中，核酸填充序列不具有cpg岛。在一些实施方案中，核酸填充序列具有不超过四个相同身份的连续核碱基。在一些实施方案中，核酸填充序列包含约40％至约50％的gc含量。在一些实施方案中，核酸填充序列不包含限制酶切割位点。在一些实施方案中，核酸填充序列具有约100个核碱基至约5000个核碱基的长度。在一些实施方案中，核酸填充序列具有约2200个核碱基至约2300个核碱基的长度。在一些实施方案中，核酸填充序列具有约3000个核碱基至约3100个核碱基的长度。在一些实施方案中，核酸填充序列具有约300个核碱基至约400个核碱基的长度。
2、在一些实施方案中，核酸填充序列包含与seq id no：7、8或11的至少100个连续碱基具有约或至少约80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的序列。在某些方面，本文公开了核酸填充序列，其包含与seq id no：7的至少100个连续碱基具有约或至少约80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的序列。在某些方面
3、在一些实施方案中，本文公开了包含本文公开的aav质粒和包含病毒复制(rep)基因和/或病毒衣壳(cap)基因的包装质粒的组合物。在一些实施方案中，包装质粒包含rep基因。在一些实施方案中，rep基因编码rep78、rep68、rep52和rep40。在一些实施方案中，包装质粒包含cap基因。在一些实施方案中，cap基因编码vp 1、vp2和vp3。在一些实施方案中，cap基因包含与seq id no：21、seq id no：22、seq id no：23、seq id no：24、seq id no：25、seq id no：26、seq id no：27、seq id no：28、seq id no：29、seq id no：30或seq idno：31至少约70％、75％、80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种核酸填充序列，其包含一个或多个以下特征：没有CpG岛，和具有不超过四个相同身份的连续核碱基；其中所述核酸填充序列不包括长度大于20个氨基酸的可读框。
2.根据权利要求1所述的核酸填充序列，其不具有CpG岛。
3.根据权利要求1或权利要求2所述的核酸填充序列，其具有不超过四个相同身份的连续核碱基。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的核酸填充序列，其包含约40％至约50％的GC含量。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列不包含限制酶切割位点。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列具有约100个核碱基至约5000个核碱基的长度。
7.根据权利要求6所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列具有约2200个核碱基至约2300个核碱基的长度。
8.根据权利要求6所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列具有约3000个核碱基至约3100个核碱基的长度。
9.根据权利要求6所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列具有约300
10.根据权利要求1-6中任一项所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列包含与SEQ ID NO：7、8或11的至少100个连续碱基具有约或至少约80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的序列。
11.一种核酸填充序列，其包含与SEQ ID NO：7的至少100个连续碱基具有约或至少约80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的序列。
12.一种核酸填充序列，其包含与SEQ ID NO：8的至少100个连续碱基具有约或至少约80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的序列。
13.一种核酸填充序列，其包含与SEQ ID NO：11的至少100个连续碱基具有约或至少约80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的序列。
14.根据权利要求11-13中任一项所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列不包含CpG岛。
15.根据权利要求11-14中任一项所述的核酸序列，其中所述核酸填充序列包含不超过四个相同身份的连续核碱基。
16.根据权利要求11-15中任一项所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列包含约40％至约50％的GC含量。
17.根据权利要求11-16中任一项所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列不包含限制酶切割位点。
18.根据权利要求11-17中任一项所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列具有约100至约5000个核碱基的长度。
19.一种腺相关病毒(AAV)质粒，其包含根据权利要求1-18中任一项所述的核酸填充序列。
20.根据权利要求19所述的AAV质粒，其中所述AAV质粒包含表达盒，所述表达盒包含位于两个反向末端重复(ITR)序列之间的异源序列。
21.根据权利要求20所述的AAV质粒，其中所述AAV质粒包含长度为约2000至约8000个核碱基的骨架。
22.根据权利要求21所述的AAV质粒，其中所述AAV质粒包含长度为约5500至约6000个核碱基的骨架。
23.根据权利要求20-22所述的AAV质粒，其中所述表达盒具有约3000至约6000个核碱基的长度。
24.根据权利要求23所述的AAV质粒，其中所述表达盒具有约4000个核碱基至约5000个核碱基的长度。
25.根据权利要求20-24中任一项所述的AAV质粒，其中所述异源序列编码治疗性肽。
26.根据权利要求25所述的AAV质粒，其中所述治疗性肽选自GUCY2D、MYO7A、RS1、CNBG3、ADAMTS10、ABCA4和共济蛋白。
27.根据权利要求19-26中任一项所述的AAV质粒，其包含抗生素抗性基因。
28.根据权利要求26所述的AAV质粒，其中所述抗生素抗性基因包含卡那霉素抗性基因。
29.根据权利要求19-...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种核酸填充序列，其包含一个或多个以下特征：没有cpg岛，和具有不超过四个相同身份的连续核碱基；其中所述核酸填充序列不包括长度大于20个氨基酸的可读框。
2.根据权利要求1所述的核酸填充序列，其不具有cpg岛。
3.根据权利要求1或权利要求2所述的核酸填充序列，其具有不超过四个相同身份的连续核碱基。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的核酸填充序列，其包含约40％至约50％的gc含量。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列不包含限制酶切割位点。
6.根据权利要求1-5中任一项所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列具有约100个核碱基至约5000个核碱基的长度。
7.根据权利要求6所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列具有约2200个核碱基至约2300个核碱基的长度。
8.根据权利要求6所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列具有约3000个核碱基至约3100个核碱基的长度。
9.根据权利要求6所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列具有约300个核碱基至约400个核碱基的长度。
10.根据权利要求1-6中任一项所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列包含与seq id no：7、8或11的至少100个连续碱基具有约或至少约80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的序列。
11.一种核酸填充序列，其包含与seq id no：7的至少100个连续碱基具有约或至少约80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的序列。
12.一种核酸填充序列，其包含与seq id no：8的至少100个连续碱基具有约或至少约80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的序列。
13.一种核酸填充序列，其包含与seq id no：11的至少100个连续碱基具有约或至少约80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的序列。
14.根据权利要求11-13中任一项所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列不包含cpg岛。
15.根据权利要求11-14中任一项所述的核酸序列，其中所述核酸填充序列包含不超过四个相同身份的连续核碱基。
16.根据权利要求11-15中任一项所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列包含约40％至约50％的gc含量。
17.根据权利要求11-16中任一项所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列不包含限制酶切割位点。
18.根据权利要求11-17中任一项所述的核酸填充序列，其中所述核酸填充序列具有约100至约5000个核碱基的长度。
19.一种腺相关病毒(aav)质粒，其包含根据权利要求1-18中任一项所述的核酸填充序列。
20.根据权利要求19所述的aav质粒，其中所述aav质粒包含表达盒，所述表达盒包含位于两个反向末端重复(itr)序列之间的异源序列。
21.根据权利要求20所述的aav质粒，其中所述aav质粒包含长度为约2000至约8000个核碱基的骨架。
22.根据权利要求21所述的aav质粒，其中所述aav质粒包含长度为约5500至约6000个核碱基的骨架。
23.根据权利要求20-22所述的aav质粒，其中所述表达盒具有约3000至约6000个核碱基的长度。
24.根据权利要求23所述的aav质粒，其中所述表达盒具有约4000个核碱基至约5000个核碱基的长度。
25.根据权利要求20-24中任一项所述的aav质粒，其中所述异源序列编码治疗性肽。
26.根据权利要求25所述的aav质粒，其中所述治疗性肽选自gucy2d、myo7a、rs1、cnbg3、adamts10、abca4和共济蛋白。
27.根据权利要求19-26中任一项所述的aav质粒，其包含抗生素抗性基因。
28.根据权利要求26所述的aav质粒，其中所述抗生素抗性基因包含卡那霉素抗性基因。
29.根据权利要求19-26中任一项所述的aav质粒，其中所述aav质粒不包含抗生素抗性基因。
30.根据权利要求19-29中任一项所述的aav质粒，其中所述aav质粒不包含氨苄青霉素抗生素抗性基因。
31.根据权利要求19-30中任一项所述的aav质粒，其中所述itr衍生自aav血清型1、aav血清型2、aav血清型3、aav血清型4、aav血清型5、aav血清型6、aav血清型7、aav血清型8、aav血清型9、aav血清型10或aav449.5(e531d)。
32.根据权利要求19-31中任一项所述的aav质粒，其进一步包含启动子。
33.根据权利要求19-32中任一项所述的aav质粒，其进一步包含剪接供体/剪接受体序列。
34.根据权利要求19-33中任一项所述的aav质粒，其进一步包含wpre序列。
35.根据权利要求20-34中任一项所述的aav质粒，其中所述核酸填充序列位于所述表达盒的外部。
36.根据权利要求20-35中任一项所述的aav质粒，其包含复制起点。
37.根据权利要求36所述的aav质粒，其中所述核酸填充序列位于所述复制起点的3’。
38.根据权利要求36或权利要求37所述的aav质粒，其中所述核酸填充序列位于所述复制起点与itr之间。
39.根据权利要求38所述的aav质粒，其中所述核酸填充序列被定位成使得所述itr距离所述复制起点约1000至约4000个核碱基。
40.根据权利要求35-39中任一项所述的aav质粒，其中所述核酸填充序列包含第一填充序列和第二填充序列。
41.根据权利要求40所述的aav质粒，其中所述第一填充序列具有约3000至约3500个核碱基的长度。
42.根据权利要求40所述的aav质粒，其中所述第一填充序列包含与seq id n...
【专利技术属性】
技术研发人员：克里斯托弗·科兹洛夫斯基，
申请(专利权)人：阿特赛纳治疗公司，
类型：发明
国别省市：
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