System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种用于椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲的快速鉴定方法技术_技高网

一种用于椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲的快速鉴定方法技术

技术编号:41295160 阅读:7 留言:0更新日期:2024-05-13 14:44
本发明专利技术公开了一种用于椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲的快速鉴定方法,属于分子生物技术领域,针对椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲三种形态比较相似且危害棕榈科植物的食叶甲虫提供了一套快速鉴定的专用引物及其使用方法。本发明专利技术设计的三对特异性引物不仅可以用来分别鉴定椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲,使之能准确而快速地鉴别这三种食叶甲虫,而且将这三对特异性引物混合在一起,分别以椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲的基因组DNA为模板进行PCR反应,也能鉴定出三种不同的食叶甲虫。该操作简便快捷,具有广泛的适用性。因此,本发明专利技术为椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲的防治与检疫提供了重要的方法。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及分子生物,特别涉及一种用于椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲的快速鉴定方法


技术介绍

1、棕榈科植物是热带自然生态系统的标志性组分,亦是热区重要的经济作物,具有维持生态系统稳定和促进农民增收的作用。椰心叶甲brontispa longissimi(gestro)、水椰八角铁甲octodonta nipae(maulik)和海枣异胸潜甲javeta pallida(baly)是棕榈科植物椰子、槟榔和中东海枣等作物上的重要外来入侵害虫,取食后可造成叶片皱缩和卷曲等,受害嫩梢慢慢干枯,严重时甚至导致整株植物枯萎死亡。

2、椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲因具有许多相同的寄主,且生态位比较接近,目前鉴别这三种食叶甲虫主要是依据体形大小、触角形态及构造、前胸背板、鞘翅和生殖器等特征来区分,这种传统的分类方法专业性太强,耗时耗力,很难对食叶甲虫的幼虫或残缺个体进行鉴别。近年来分子生物学技术发展迅速,基于pcr技术的分子鉴定为物种的快速鉴别提供了新的手段,弥补了传统形态鉴定的诸多不足。而且,利用分子标记鉴定物种已有不少的尝试,如吴明月等(瓜果上主要实蝇类害虫pcr-rflp分子鉴定技术的建立及应用[j],应用昆虫学报,2021)利用pcr-rflp分子鉴定技术完成了瓜果上主要实蝇类害虫的快速鉴定和识别;2020年黄振等(应用ss-pcr技术设计种特异性引物快速鉴定瓜实蝇[j],安徽农业科学,2020)应用ss-pcr技术设计种特异性引物快速鉴定瓜实蝇。pcr技术以基因组dna为依据,具有检测周期短和不受靶标物种的形态、性状等方面影响的优点,非常适合食叶甲虫等一些危险性害虫未成熟虫态的快速检疫鉴定。本文通过对椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲基因序列的分析,设计并筛选出了能特异性扩增三种食叶甲虫基因片段的引物,完成了对三种食叶甲虫的pcr快速准确鉴定。


技术实现思路

1、针对现有技术的上述缺陷,本专利技术提出一种用于椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲,以解决上述
技术介绍
提出的问题。

2、为达到上述目的,本专利技术提供如下技术方案:

3、一种用于椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲的快速鉴定方法,包括以下步骤:

4、(1)提取椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲的基因组总dna,将基因组总dna的浓度稀释到0.05~0.4μg/ml,得样品dna;

5、(2)利用its1通用引物对步骤(1)所得到的样品dna进行pcr扩增和测序,得its序列;

6、(3)根据步骤(2)所得的its序列设计出三对特异性引物:bl-f/gt-r、on-f/gt-r和jp-f/gt-r;

7、(4)pcr扩增:用特异性引物bl-f/gt-r、on-f/gt-r、jp-f/gt-r中的一种或几种对食叶甲虫样品dna进行pcr扩增,得到pcr产物反应液;

8、bl-f核苷酸序列seq id no.1:gcatcgccgtctcaagaa;

9、gt-r核苷酸序列seq id no.2:caaggtttccgtaggtga;

10、on-f核苷酸序列seq id no.3:gcgttcaactaatgtacc;

11、gt-r核苷酸序列seq id no.2:caaggtttccgtaggtga;

12、jp-f核苷酸序列seq id no.4:atgtgtgtgttgttcggtc;

13、gt-r核苷酸序列seq id no.2:caaggtttccgtaggtga;

14、(5)将步骤(4)所得的pcr产物反应液进行电泳分析:取上述pcr产物反应液5μl与1μl载样缓冲液混合,用1.2%的琼脂糖进行电泳,eb染色,用凝胶成像系统进行拍摄检测;

15、(6)根据电泳显示的pcr扩增片段的大小来判断棕榈食叶甲虫种类,若有明显清晰的628bp的条带,则可判断为是椰心叶甲,若条带为954bp的为水椰八角铁甲,若条带为222bp的则为海枣异胸潜甲。

16、优选地,基因组总dna的浓度稀释到0.1μg/ml,即得样品dna。

17、优选地,步骤(1)中提取椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲的基因组总dna采用酚氯仿方法提取,具体步骤为:

18、s1、取单头椰心叶甲、水椰八角铁甲和/或海枣异胸潜甲成虫置于1.5ml的离心管中,分别用75%、50%乙醇和纯水梯度洗脱,每个梯度脱水时间为5~10min;

19、s2、洗脱完成后在离心管中加入300μl的dna提取缓冲液(50mmol/ltris-hcl,1mmol/ledta,20mmol/lnacl,1%sds,ph8.0),用0.2ml的pcr管底部作为匀浆器将其充分研磨,再加入300μl的dna提取缓冲液冲洗匀浆器,得匀浆液;

20、s3、将匀浆液用微量移液器移入新的1.5ml离心管,在管中加入10μl蛋白酶k(20mg/ml),用封口带将离心管封口,放入56℃摇床中5h;

21、s4、加入等体积的tris饱和酚500μl,摇匀10min后在温度为4℃、转速12000r/min条件下离心7min;

22、s5、吸取上清液到新的离心管,加入等体积的tris饱和酚、氯仿和异戊醇混合液(体积比为25:24:1)450μl,摇匀10min后在温度为4℃、转速12000r/min条件下离心7min;

23、s6、吸取上清液到新的离心管,加入等体积的氯仿和异戊醇混合液(体积比为24:1)400μl,在温度为4℃、转速12000r/min条件下离心7min;

24、s7、吸取上清液到新的离心管,加入上清液体积2.5倍经过-20℃冷冻的100%酒精,在-20℃过夜,在温度为4℃、转速12000r/min条件下离心7min;

25、s8、弃上清液,留白色沉淀(dna),加入400μl的经过-20℃冷冻的75%酒精,吹打溶解三次,即可得基因组总dna。

26、优选地,步骤(2)中利用its1通用引物对样品dna进行pcr扩增步骤为:采用internal transcribed spacer regions 1(its1)通用引物进行pcr扩增,pcr反应体系为25μl,其中,样品dna2μl,2×green taq mix酶预混液为12.5μl,its1通用上游引物和下游引物各0.5μl,超纯水9.5μl。扩增程序:94℃预变性5min;40个循环:94℃30s,50℃45s,72℃60s;最后72℃延伸5min。扩增反应在abi-9700pcr基因扩增仪上运行。取5μlpcr扩增产物在1.2%琼脂糖(amresco)凝胶上以90v电泳(bio-rad powerpac basic)分离45min,然后以geldoc universal hoodⅱ型凝胶成像系统(bio-rad laboratories)分析本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲的快速鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的一种用于椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲快速鉴定方法,其特征在于,所述样品DNA的浓度稀释到0.05~0.4μg/ml。

3.根据权利要求1所述的一种用于椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲快速鉴定方法,其特征在于,所述样品DNA的浓度稀释到0.1μg/ml。

4.根据权利要求1所述的一种用于椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲快速鉴定方法,其特征在于,步骤(1)中每20μL PCR反应体系含有:2×Green Taq Mix酶预混液10μL,样品DNA 1.0μL,特异性引物BL-F/GT-R、ON-F/GT-R和/或JP-F/GT-R的上、下游引物各0.5μL,余量为超纯水。

5.根据权利要求1所述的一种用于椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲快速鉴定方法,其特征在于,步骤(1)中PCR扩增条件为:在95℃预变性3min;按以下条件进行38个循环,95℃30s,54℃30s,72℃60s,循环结束后在72℃保持延伸5min,得PCR产物反应液。

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【技术特征摘要】

1.一种用于椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲的快速鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的一种用于椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲快速鉴定方法,其特征在于,所述样品dna的浓度稀释到0.05~0.4μg/ml。

3.根据权利要求1所述的一种用于椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲快速鉴定方法,其特征在于,所述样品dna的浓度稀释到0.1μg/ml。

4.根据权利要求1所述的一种用于椰心叶甲、水椰八角铁甲和海枣异胸潜甲快速鉴定方法,其特征在于,步...

【专利技术属性】
技术研发人员:马光昌温海波彭正强唐超王树昌金涛龚治卓武强
申请(专利权)人:中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
类型:发明
国别省市:

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