【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及一种与玉米耐盐碱相关的分子标记及其应用，特别涉及一种基于基因 zmarg开发的与玉米耐盐碱相关的分子标记及其在玉米种质资源耐盐碱性筛选的应用。本专利技术属于作物育种。
技术介绍
1、盐碱胁迫是影响玉米生长发育的重要非生物逆境因子之一，严重影响产量。挖掘耐盐碱相关基因和优异种质资源，对于培育耐盐碱玉米品种至关重要。
2、目前已发现的耐盐碱相关基因主要包括脯氨酸合成相关基因、甜菜碱合成相关基因、糖醇合成相关基因、保护酶相关基因、 lea基因以及转录因子等类型。
3、已有报道表明精氨酸酶在水稻、拟南芥、棉花等植物中过表达能显著提高耐盐能力，在高产和抗逆转基因育种中具有较大的潜力和研究价值。如水稻中的精氨酸酶 osarg在过表达时可以有效提高水稻的每株粒数，拟南芥中的精氨酸酶 argah1和 argah2，其代谢影响拟南芥与灰霉菌（botrytiscinerea）的互作，精氨酸酶在棉花中过表达可以显著增加棉花纤维长度，精氨酸酶在番茄中被受伤和茉莉酸处理诱导表达，与非生物胁迫应答反应相关在下。在玉米中盐碱胁迫相关的精氨酸酶相关报道不多。
4、本专利技术专利技术人所在课题组前期克隆了受盐碱胁迫诱导表达的 zmarg，包含五个内含子，六个外显子。将该基因的全长cd
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提供一种基于基因 zmarg开发的与玉米耐盐碱相关的分子标记及其应用。
2、为了达到上述目的，本专利技术采用了以下技术手段：
3、本专利技术的一种基于基因 zmarg开发的与玉米耐盐碱性相关的caps分子标记，所述的分子标记命名为dncaps363，所述的分子标记是使用caps引物对，以玉米基因组为模板通过pcr扩增后得到的片段，全长319bp，其中第227个碱基为snp位点，高感敏感性材料为c，能被bsssi-v2限制性内切酶切为两个片段；中高耐性材料则为a，不能被bsssi-v2限制性内切酶切开，所述的caps引物对的序列如下所示：
4、上游引物：5’ tggtcacaactcatcctttt 3’；
5、下游引物：5’ ctatgcatgcttacctcct 3’。
6、 zmarg获得所述的基于基因 zmarg开发的与玉米耐盐碱相关的caps分子标记的引物对也在本专利技术的保护范围之内，所述的引物对序列如下所示：
7、上游引物：5’ tggtcacaactcatcctttt 3’；
8、下游引物：5’ ctatgcatgcttacctcct 3’。
9、进一步的，本专利技术还提出了所述的基于基因 zmarg开发的与玉米耐盐碱相关的caps分子标记在玉米耐盐碱性分子标记辅助育种中的用途。以及所述的引物对在玉米耐盐碱性分子标记辅助育种中的用途。
10、更进一步的，本专利技术还提出了一种获得耐盐碱玉米自交系的方法，包括以下步骤：以玉米自交系的基因组总dna为模板，使用所述的引物对进行pcr扩增，pcr扩增产物回收后用bsssi-v2限制性内切酶切，高感敏感性材料能被bsssi-v2限制性内切酶切为94bp和225bp的两个片段；中高耐性材料不能被bsssi-v2限制性内切酶切开。
11、相较于现有技术，本专利技术的有益效果是：
12、本专利技术通过在不同的玉米自交系中分析受盐碱胁迫诱导表达的基因 zmarg编码区的序列变异，与自交系的耐盐碱性进行关联分析，挖掘关联位点进而开发出了分子标记dncaps363用于标记辅助选择，在盐碱敏感的自交系的鉴别中检测效率平均是88.2％，本专利技术的提出为获得耐盐碱玉米自交系提供了新的技术手段。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种基于基因ZmArg开发的与玉米耐盐碱性相关的CAPS分子标记，其特征在于，所述的分子标记命名为DNCAPS363，所述的分子标记是使用CAPS引物对，以玉米基因组为模板通过PCR扩增后得到的片段，全长319bp，其中第227个碱基为snp位点，高感敏感性材料为C，能被BssSI-v2限制性内切酶切为两个片段；中高耐性材料则为A，不能被BssSI-v2限制性内切酶切开，所述的CAPS引物对的序列如下所示：
2.权利要求1所述的CAPS分子标记在玉米耐盐碱性分子标记辅助育种中的用途。
3.用于扩增权利要求1所述的CAPS分子标记的引物对，其特征在于，所述的引物对的序列如下所示：
4.权利要求3所述的引物对在玉米耐盐碱性分子标记辅助育种中的用途。
5.一种获得耐盐碱玉米自交系的方法，其特征在于，包括以下步骤：以玉米自交系的基因组总DNA为模板，使用权利要求3所述的引物对进行PCR扩增，PCR扩增产物回收后用BssSI-v2限制性内切酶切，高感敏感性材料能被BssSI-v2限制性内切酶切为94bp和225bp的两个片段；中高耐性材料
...【技术特征摘要】
1.一种基于基因zmarg开发的与玉米耐盐碱性相关的caps分子标记，其特征在于，所述的分子标记命名为dncaps363，所述的分子标记是使用caps引物对，以玉米基因组为模板通过pcr扩增后得到的片段，全长319bp，其中第227个碱基为snp位点，高感敏感性材料为c，能被bsssi-v2限制性内切酶切为两个片段；中高耐性材料则为a，不能被bsssi-v2限制性内切酶切开，所述的caps引物对的序列如下所示：
2.权利要求1所述的caps分子标记在玉米耐盐碱性分子标记辅助育种中的用途。
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【专利技术属性】
技术研发人员：邸宏，宋永峰，李春翔，曹梦娜，周润宇，王振华，周羽，曾兴，董玲，
申请(专利权)人：东北农业大学，
类型：发明
国别省市：
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