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使用寡核苷酸缀合的抗体的多重蛋白质组学分析制造技术

技术编号:41089154 阅读:21 留言:0更新日期:2024-04-25 13:50
附接至寡核苷酸的抗体可以与细胞的蛋白质结合。这些寡核苷酸可以被释放并且被附接至固体支持物的固体支持物寡核苷酸捕获。检测寡核苷酸可以与捕获的寡核苷酸杂交,形成固体支持物寡核苷酸‑捕获的寡核苷酸‑检测寡核苷酸的夹心。检测寡核苷酸及其结合的捕获的寡核苷酸可以通过例如检测寡核苷酸上的第二可检测部分(例如,染料)的荧光强度来定量。定量的蛋白质的身份可以通过例如具有固体支持物寡核苷酸‑捕获的寡核苷酸‑检测寡核苷酸的夹心的固体支持物上的第一可检测部分(例如,染料)的荧光强度来确定。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】


技术介绍


技术实现思路

【技术保护点】

1.一种细胞组分定量的方法,包括:

2.一种细胞组分定量的方法,包括:

3.根据权利要求1-2中任一项所述的方法,其中确定所述多于一个样品中的每一个的所述细胞组分中的每一种的身份和量包括:

4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法,其中检测所述一个或更多个第一可检测部分和所述一个或更多个第二可检测部分的存在和/或量包括:

5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法,其中所述第一可检测部分和/或所述第二可检测部分中的一个或更多个包括光学部分、发光部分、电化学活性部分、纳米颗粒或其组合。

6.根据权利要求1-5中任一项所述的方法,其中所述发光部分包括化学发光部分、电致发光部分、光致发光部分或其组合。

7.根据权利要求1-6中任一项所述的方法,其中所述光致发光部分包括荧光部分、磷光部分或其组合。

8.根据权利要求1-7中任一项所述的方法,其中所述荧光部分包括荧光染料。

9.根据权利要求1-8中任一项所述的方法,其中所述纳米颗粒包括量子点。

10.根据权利要求1-9中任一项所述的方法,所述方法包括进行反应以使所述可检测部分的前体转化为所述可检测部分。

11.根据权利要求1-10中任一项所述的方法,所述方法还包括:

12.根据权利要求1-11中任一项所述的方法,其中所述仪器包括流式细胞仪。

13.根据权利要求1-12中任一项所述的方法,其中所述流式细胞仪包括常规流式细胞仪、光谱流式细胞仪、高光谱流式细胞仪、成像流式细胞仪或其任何组合。

14.根据权利要求1-13中任一项所述的方法,其中使多于一个样品中的每一个的一个或更多个细胞与多于一种细胞组分结合试剂接触包括:

15.根据权利要求1-14中任一项所述的方法,其中使多于一个样品中的每一个的一个或更多个细胞与多于一种细胞组分结合试剂接触包括:

16.根据权利要求1-15中任一项所述的方法,其中提供来自多于一个样品中的每一个并且具有与多于一种细胞组分结合试剂中的细胞组分结合试剂结合的细胞组分的一个或更多个细胞包括:

17.根据权利要求1-16中任一项所述的方法,其中在使多于一个样品中的每一个的一个或更多个细胞与多于一种细胞组分结合试剂接触之前,将所述多于一个样品划分至多于一个分区,其中所述多于一个分区中的分区包含所述多于一个样品中的单个样品。

18.根据权利要求1-17中任一项所述的方法,其中所述分区是孔或液滴。

19.根据权利要求1-18中任一项所述的方法,其中所述多于一个分区包含孔阵列的孔,其中所述孔阵列包含至少约10个至100个孔。

20.根据权利要求1-19中任一项所述的方法,其中所述仪器包括荧光显微镜。

21.根据权利要求1-20中任一项所述的方法,其中所述仪器包括成像系统。

22.根据权利要求1-21中任一项所述的方法,其中测量每一个第一固体支持物的每一个可检测部分的发射包括对所述多于一个分区进行成像。

23.根据权利要求1-22中任一项所述的方法,其中所述多于一个分区被顺序地成像。

24.根据权利要求1-23中任一项所述的方法,其中所述多于一个分区被同时成像。

25.根据权利要求1-24中任一项所述的方法,其中成像包括显微术、共焦显微术、时差成像显微术、荧光显微术、多光子显微术、定量相位显微术、表面增强拉曼光谱、摄像、手动视觉分析、自动视觉分析或其任何组合。

26.根据权利要求1-25中任一项所述的方法,其中检测所述多于一个固体支持物中的每一个的所述一个或更多个第一可检测部分和所述一个或更多个第二可检测部分包括:

27.根据权利要求1-26中任一项所述的方法,其中位于每个分区中的所述多于一个固体支持物的所述一个或更多个第一可检测部分是预定的,其中所述预定的一个或更多个第一可检测部分对于每个分区是不同的,并且其中检测所述多于一个固体支持物中的每一个的所述一个或更多个第一可检测部分和所述一个或更多个第二可检测部分包括:

28.根据权利要求1-27中任一项所述的方法,还包括汇集来自所述多于一个分区中的每一个分区的所述固体支持物,任选地所述汇集使用磁场来进行。

29.根据权利要求1-28中任一项所述的方法,其中使与所述多于一个固体支持物结合的所述试剂寡核苷酸与所述检测寡核苷酸接触包括:使与所述多于一个固体支持物结合的所述试剂寡核苷酸与两个或更多个检测寡核苷酸接触,每个检测寡核苷酸与一个或更多个第二可检测部分关联,任选地其中所述两个或更多个检测寡核苷酸与...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种细胞组分定量的方法,包括:

2.一种细胞组分定量的方法,包括:

3.根据权利要求1-2中任一项所述的方法,其中确定所述多于一个样品中的每一个的所述细胞组分中的每一种的身份和量包括:

4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法,其中检测所述一个或更多个第一可检测部分和所述一个或更多个第二可检测部分的存在和/或量包括:

5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法,其中所述第一可检测部分和/或所述第二可检测部分中的一个或更多个包括光学部分、发光部分、电化学活性部分、纳米颗粒或其组合。

6.根据权利要求1-5中任一项所述的方法,其中所述发光部分包括化学发光部分、电致发光部分、光致发光部分或其组合。

7.根据权利要求1-6中任一项所述的方法,其中所述光致发光部分包括荧光部分、磷光部分或其组合。

8.根据权利要求1-7中任一项所述的方法,其中所述荧光部分包括荧光染料。

9.根据权利要求1-8中任一项所述的方法,其中所述纳米颗粒包括量子点。

10.根据权利要求1-9中任一项所述的方法,所述方法包括进行反应以使所述可检测部分的前体转化为所述可检测部分。

11.根据权利要求1-10中任一项所述的方法,所述方法还包括:

12.根据权利要求1-11中任一项所述的方法,其中所述仪器包括流式细胞仪。

13.根据权利要求1-12中任一项所述的方法,其中所述流式细胞仪包括常规流式细胞仪、光谱流式细胞仪、高光谱流式细胞仪、成像流式细胞仪或其任何组合。

14.根据权利要求1-13中任一项所述的方法,其中使多于一个样品中的每一个的一个或更多个细胞与多于一种细胞组分结合试剂接触包括:

15.根据权利要求1-14中任一项所述的方法,其中使多于一个样品中的每一个的一个或更多个细胞与多于一种细胞组分结合试剂接触包括:

16.根据权利要求1-15中任一项所述的方法,其中提供来自多于一个样品中的每一个并且具有与多于一种细胞组分结合试剂中的细胞组分结合试剂结合的细胞组分的一个或更多个细胞包括:

17.根据权利要求1-16中任一项所述的方法,其中在使多于一个样品中的每一个的一个或更多个细胞与多于一种细胞组分结合试剂接触之前,将所述多于一个样品划分至多于一个分区,其中所述多于一个分区中的分区包含所述多于一个样品中的单个样品。

18.根据权利要求1-17中任一项所述的方法,其中所述分区是孔或液滴。

19.根据权利要求1-18中任一项所述的方法,其中所述多于一个分区包含孔阵列的孔,其中所述孔阵列包含至少约10个至100个孔。

20.根据权利要求1-19中任一项所述的方法,其中所述仪器包括荧光显微镜。

21.根据权利要求1-20中任一项所述的方法,其中所述仪器包括成像系统。

22.根据权利要求1-21中任一项所述的方法,其中测量每一个第一固体支持物的每一个可检测部分的发射包括对所述多于一个分区进行成像。

23.根据权利要求1-22中任一项所述的方法,其中所述多于一个分区被顺序地成像。

24.根据权利要求1-23中任一项所述的方法,其中所述多于一个分区被同时成像。

25.根据权利要求1-24中任一项所述的方法,其中成像包括显微术、共焦显微术、时差成像显微术、荧光显微术、多光子显微术、定量相位显微术、表面增强拉曼光谱、摄像、手动视觉分析、自动视觉分析或其任何组合。

26.根据权利要求1-25中任一项所述的方法,其中检测所述多于一个固体支持物中的每一个的所述一个或更多个第一可检测部分和所述一个或更多个第二可检测部分包括:

27.根据权利要求1-26中任一项所述的方法,其中位于每个分区中的所述多于一个固体支持物的所述一个或更多个第一可检测部分是预定的,其中所述预定的一个或更多个第一可检测部分对于每个分区是不同的,并且其中检测所述多于一个固体支持物中的每一个的所述一个或更多个第一可检测部分和所述一个或更多个第二可检测部分包括:

28.根据权利要求1-27中任一项所述的方法,还包括汇集来自所述多于一个分区中的每一个分区的所述固体支持物,任选地所述汇集使用磁场来进行。

29.根据权利要求1-28中任一项所述的方法,其中使与所述多于一个固体支持物结合的所述试剂寡核苷酸与所述检测寡核苷酸接触包括:使与所述多于一个固体支持物结合的所述试剂寡核苷酸与两个或更多个检测寡核苷酸接触,每个检测寡核苷酸与一个或更多个第二可检测部分关联,任选地其中所述两个或更多个检测寡核苷酸与相同的第二可检测部分关联,任选地其中所述两个或更多个检测寡核苷酸与不同的第二可检测部分关联,任选地其中所述两个或更多个检测寡核苷酸包含相同的结合序列,和/或任选地其中所述两个或更多个检测寡核苷酸包含不同的结合序列。

30.根据权利要求1-29中任一项所述的方法,其中所述多于一个固体支持物中的每一个与两个不同的第一可检测部分关联,并且其中所述多于一个固体支持物中的两个固体支持物包含不同类型和/或量的所述两个不同的第一可检测部分。

31.根据权利要求1-30中任一项所述的方法,包括从起始群体中分离一个或更多个感兴趣的群体以获得所述多于一个样品,其中所述样品中的每一个是感兴趣的群体,任选地,所述多于一个样品中的两个或更多个样品包括表型不同的感兴趣的群体。

32.根据权利要求1-31中任一项所述的方法,其中从起始群体中分离一个或更多个感兴趣的群体包括流式细胞术,任选地,其中所述流式细胞术包括荧光激活细胞分选(facs)。

33.根据权利要求1-32中任一项所述的方法,其中提供所述细胞包括:使所述多于一个样品中的每一个的细胞与所述多于一种细胞组分结合试剂接触,以获得具有与所述细胞组分结合试剂结合的细胞组分的细胞。

34.根据权利要求1-33中任一项所述的方法,其中提供所述细胞包括:去除未与所述细胞结合的所述多于一种细胞组分结合试剂中的细胞组分结合试剂,以获得具有与所述细胞组分结合试剂结合的细胞组分的细胞,任选地,其中去除未与所述细胞结合的所述细胞组分结合试剂包括用洗涤缓冲液洗涤所述细胞。

35.根据权利要求1-34中任一项所述的方法,包括在使所述多于一个样品中的每一个的细胞与所述多于一种细胞组分结合试剂接触之前透化和/或固定所述细胞。

36.根据权利要求1-35中任一项所述的方法,其中所述多于一种细胞组分结合试剂中的两种能够与两种不同的细胞组分结合,和/或其中所述多于一种细胞组分结合试剂中的两种能够与细胞组分的两个不同区域结合。

37.根据权利要求1-36中任一项所述的方法,包括:从所述样品中分离所述一个或更多个细胞,任选地,其中分离所述一个或更多个细胞包括使用流式细胞术从所述样品中分离所述一个或更多个细胞,任选地,其中所述流式细胞术包括荧光激活细胞分选(facs)。

38.根据权利要求1-37中任一项所述的方法,包括:在使所述试剂寡核苷酸与所述多于一个固体支持物接触之前,裂解所述细胞。

39.根据权利要求1-38中任一项所述的方法,包括:在使所述试剂寡核苷酸与所述多于一个固体支持物接触之前,将所述试剂寡核苷酸从与所述样品的细胞的细胞组分或来自所述样品的细胞的细胞组分结合或预先结合的所述细胞组分结合试剂解离,任选地,其中解离所述试剂寡核苷酸包括:通过uv光裂解、化学处理、热处理、酶处理或其组合,将所述试剂寡核苷酸从与所述样品的细胞的细胞组分或来自所述样品的细胞的细胞组分结合或预先结合的所述细胞组分结合试剂分离。

40.根据权利要求1-39中任一项所述的方法,其中所述细胞组分包括蛋白质、脂质、糖类或其组合,和/或其中所述细胞组分包括细胞外细胞组分、细胞表面细胞组分、细胞内细胞组分或其组合。

41.根据权利要求1-40中任一项所述的方法,其中所述多于一种细胞组分结合试剂包括蛋白质、抗体、适配体、四聚体、蛋白质支架或其组合,任选地,其中所述适配体和所述试剂寡核苷酸是单个多核苷酸。

42.根据权利要求1-41中任一项所述的方法,其中所述多于一种细胞组分结合试剂包括至少10种细胞组分结合试剂。

43.根据权利要求1-42中任一项所述的方法,其中所述试剂寡核苷酸与所述细胞组分结合试剂附接、可释放地附接、共价附接、非共价附接和/或缀合。

44.根据权利要求1-43中任一项所述的方法,其中所述试剂寡核苷酸通过uv光可裂解基团和/或化学不稳定基团与所述细胞组分关联。

45.根据权利要求1-44中任一项所述的方法,其中所述试剂寡核苷酸通过接头与所述细胞组分关联,任选地其中所述接头包含碳链,任选地其中所述碳链包含2-30个碳,任选地其中所述碳链包含12个碳,并且任选地其中所述接头包含5’氨基修饰物c12(5ammc12)或其衍生物。

46.根据权利要求1-45中任一项所述的方法,其中所述试剂寡核苷酸的长度是10个至500个核苷酸,其中所述试剂特异性序列的长度是5个至495个核苷酸,和/或其中所述检测序列的长度是5个至495个核苷酸。

47.根据权利要求1...

【专利技术属性】
技术研发人员:亚当·托马斯·赖特乔迪·马丁宋慧媛萨玛莎·瓦德雷乌
申请(专利权)人:贝克顿迪金森公司
类型:发明
国别省市:

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