System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种与湖羊尾脂重性状相关的分子标记及其检测方法技术_技高网
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一种与湖羊尾脂重性状相关的分子标记及其检测方法技术

技术编号:41059475 阅读:10 留言:0更新日期:2024-04-24 11:10
本发明专利技术提供了一种与湖羊尾脂重性状相关的分子标记及其检测方法。所述分子标记根据TUSC5基因序列设计引物,从湖羊血液中提取DNA,通过PCR扩增、DNA测序和序列分析,发现在扩增片段的第191位存在一个C/T多态性位点,进一步使用KASPar引物对778只湖羊的多态性位点进行检测和建立最小二乘模型,对基因型与尾脂重性状进行关联分析,发现该位点与湖羊的尾脂重呈显著相关。本发明专利技术的分子标记可用于选留TT基因型的个体进入核心群,以减少尾脂沉积,有助于提高经济效益。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子标记及其育种的,具体涉一种与湖羊尾脂重性状相关的分子标记及其检测方法


技术介绍

1、绵羊尾部脂肪属于白色脂肪,在极端恶劣的环境中能够通过消耗尾部脂肪来提供能力,起到“保命”作用(safdarian m,zamiri mj,hashemi m,noorolahi h.relationshipsof fat-tail dimensions with fat-tail weight and carcass characteristics atdifferent slaughter weights of torki-ghashghaii sheep.meat sci.2008nov;80(3):686-9.)。但是随着集约化舍饲养羊生产系统的完善和人们消费观念的改变,过多的尾部脂肪沉积将会影响饲料效率、肉质、动物的交配和正常运动等(wang x y,fang c,he h y,caoh,liu ll,jiang l,ma y h,liu w j.2021c.identification of key genes in sheepfat tail evolution based on rna-seq.gene,781.)。尾脂重是绵羊的重要经济性状,是衡量尾部脂肪沉积程度的直接指标,并且属中高等遗传力性状,受遗传控制且能够通过选择改良。同时分子标记辅助选择(marker-assisted selection,mas)被广泛应用于畜禽的选种选育工作中,因此筛选与绵羊尾脂重相关的分子标记,从遗传角度减少绵羊尾部脂肪沉积对提高养羊业经济效益具有重大意义。

2、肿瘤抑制候选基因5(tusc5,也称为脑内皮细胞衍生基因-1或bec-1)是一种在棕色脂肪组织(bat)转录组分析中发现的含有cd225结构域的抗冻基因,在脂肪细胞成熟中起着重要作用(oort pj et al.characterization of tusc5,an adipocyte gene co-expressed in peripheral neurons.mol cell endocrinol.2007sep 30;276(1-2):24-35.)。研究报道tusc5基因在鼠的脂肪组织中高度表达,可以增强脂肪细胞分化,脂肪酸摄取和脂滴中脂肪酸的储存,从而抑制异位脂质沉积并提高全身的胰岛素敏感性。(shibata,t,molecular cloning and characterization of rat brain endothelial cellderived gene-1(tumor suppressor candidate 5)expressing abundantly in adiposetissues.mol cell.endocrinol.263,38–45.),但是tusc5基因与湖羊的尾部脂肪沉积有没有关系,有何关系并不清楚,本专利技术以衡量尾部脂肪沉积的直接指标尾脂重为目标性状,通过pcr扩增、dna测序和序列分析,探讨其不同基因型与湖羊尾脂重性状的相关性,以期为减少绵羊尾部脂肪沉积提供一个新的分子标记。


技术实现思路

1、本专利技术的目的在于提供一种与湖羊尾脂重性状相关的分子标记、其检测方法和应用。本专利技术的分子标记是从湖羊tusc5基因中扩增得到,其具体核苷酸序列如seq id no.1所示。通过扩增湖羊tusc5基因的dna序列并测序,筛选tusc5基因的多态性位点,分析不同的基因型与湖羊尾脂重性状的相关性,并建立湖羊尾脂重性状相关的分子标记的检测方法,为减少尾部脂肪沉积,增加养羊业经济效益提供一个新的分子标记。

2、为实现上述目的,本专利技术采用以下的技术方案为:

3、一种与湖羊尾脂重性状相关的分子标记,该分子标记的核苷酸序列如seq idno.1所示,该序列的第191bp位的y示c或t,由于上述序列在第286位碱基处有一个c/t突变,从而导致了湖羊tusc5基因在该位点的c/t多态性。

4、seq id no.1:tgcccttcaaggtgatatccgaggggcaccgggaagccttg caccccctctcatcctcccgggccagctccaggcgggcgtcctccacagccaccacctcgtatgcccaggacggagaagttcccaaagattatctcatccttgccatcgcctcctgcttctgccccgtctggcccctcaacctcatgccyctcatcttttccatcatggtaagtgctgctcttcatcgctgggttggggctggttttggtcagcagccatgcttccctggcaggcaccagtcaccctacctagggtgttgagagaaaaactgggatcccggggggtggggaggggagactccccatcttagccggcctattactcccccttggagaggggtccagcgcccccggagcttcagtttcctgtcctccttcatctctgctcctggacatcacagcttgactttgcacacatccctgctgggaaggggatcccagagaggtgcccagagctaaatcctgcccagaaaggacagccagcttgggggtccggcctttgcaggggccgggggctttgtcgcaaggagtcattcctgagtggggctgtgaatcagcagagattgcagccaatatggggtctcagggccccgtgttctcaggaggggagccaggcatcacctccccaccccatccccagggcctcctgggtgttctaacagcttctggca

5、一种用于检测上述分子标记的pcr引物对,优选地,其包括核苷酸序列如seq idno.2所示的上游引物m-f和核苷酸序列如rseq id no.3所示的下游引物m-r。

6、一种用于检测上述分子标记的kaspar引物对,其包括如seq id no.4所示的正向引物a1、如seq id no.5所示的正向引物a2和如seq id no.6所示的反向引物c。

7、一种检测上述分子标记的试剂盒,所述试剂盒中包含了检测上述分子标记的pcr引物对或kaspar引物对。

8、一种检测上述分子标记的方法,具体检测方法包括如下步骤:

9、a)使用上述的pcr引物对、kaspar引物对或包含上述引物对的试剂盒,对湖羊基因组dna进行扩增;

10、b)对步骤a)获得的扩增产物的多态性位点进行鉴定。

11、其中,在步骤b)中,上述分型鉴定的方法包括但不限于直接测序法、探针法、基因芯片法、高分辨率溶解曲线法。

12、如上所述的方法,优选地,在步骤a)中,pcr引物对如seq id no.2和seq id no.3所示,在步骤b)中,基因分型鉴定采用直接测序法。

13、利用上述引物检测分本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种与湖羊尾脂重性状相关的分子标记,其特征在于,所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,该序列的第191bp位的Y表示C或T,该突变导致了湖羊TUSC5基因在该位点的C/T多态性。

2.用于检测权利要求1所述分子标记的PCR引物对,其特征在于,核苷酸序列如SEQ IDNO.2所示的上游引物M-F和核苷酸序列如RSEQ ID NO.3所示的下游引物M-R。

3.用于检测权利要求1所述分子标记的KASPar引物对,其特征在于,其包括如SEQ IDNO.4所示的正向引物A1、如SEQ ID NO.5所示的正向引物A2和如SEQ ID NO.6所示的反向引物C。

4.包含权利要求2所述PCR引物对或权利要求3所述KASPar引物对的检测试剂盒。

5.一种检测权利要求1所述分子标记的方法,其特征在于,其包括如下步骤:

6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,在步骤a)中,先以湖羊全血为样品提取基因组DNA,利用PCR引物对如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示的引物对提取的基因组DNA进行PCR扩增

7.如权利要求5所述的方法,其特征在于,在步骤a)中,

8.权利要求1所述与湖羊尾脂重性状相关的分子标记、权利要求2所述的PCR引物对、权利要求3所述的KASPar引物对或权利要求4所述的检测试剂盒或权利要求5-7中任一项所述方法在湖羊辅助育种中的应用。

9.如权利要求8所述的应用,其特征在于,所述应用为挑选出具有较低尾脂重性状的湖羊品种,当基因型为TT型时,其具有较低的尾脂重。

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【技术特征摘要】

1.一种与湖羊尾脂重性状相关的分子标记,其特征在于,所述分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示,该序列的第191bp位的y表示c或t,该突变导致了湖羊tusc5基因在该位点的c/t多态性。

2.用于检测权利要求1所述分子标记的pcr引物对,其特征在于,核苷酸序列如seq idno.2所示的上游引物m-f和核苷酸序列如rseq id no.3所示的下游引物m-r。

3.用于检测权利要求1所述分子标记的kaspar引物对,其特征在于,其包括如seq idno.4所示的正向引物a1、如seq id no.5所示的正向引物a2和如seq id no.6所示的反向引物c。

4.包含权利要求2所述pcr引物对或权利要求3所述kaspar引物对的检测试剂盒。

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【专利技术属性】
技术研发人员:王维民曹佩亮李发弟张小雪田慧彬张德印徐丹李晓龙马宗武韩坤潮何丽娟
申请(专利权)人:兰州大学
类型:发明
国别省市:

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