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【技术实现步骤摘要】
本申请涉及疾病检测,更具体地说,它涉及一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒及其检测方法。
技术介绍
1、棘球蚴病(echinococcosis)又称包虫病(hydatidosis)。该病不仅是传播最广泛的寄生虫病之一,也是公共卫生方面治疗和预防费用最高的疾病之一,呈地方性流行,是由棘球属的绦虫的幼虫寄生于人或动物机体组织所引发的传染病。采取早期诊断、早期治疗以及积极防治动物传染源的综合性防治措施,对控制包虫病对人类健康和畜牧业发展的影响十分重要。
2、包虫病的诊断目前主要依靠于b超、影像学检查和病理学检查等。因方法自身限制,易造成小病灶、非典型病灶的误诊和漏诊。因此,有必要建立一种快速、灵敏、准确度高的包虫检测方法。随着分子生物学技术的发展,近年来出现了一系列检测包虫病的新方法,如多重pcr检测法、粪抗原elisa法、粪dna检测方法等。elisa方法相对简便、快速,但对于微量或杂质较多的样品,其特异性和灵敏度较低。
3、目前在包虫病检测方面已开发了多种pcr检测方法,trachsel,d.等开发了一种多重pcr来区分多房棘球绦虫、细粒棘球绦虫和带绦虫的感染;shang等开发了多重pcr检测方法,用于3种棘球绦虫的特异性和敏感性检测。“液体活检”作为体外诊断的一个分支,是指一种非侵入式的体液测试。目前针对于血液、尿液、唾液等样本的细胞外游离dna的检测已经在疾病监控、胎儿产前检测及肿瘤靶向药物指导等相关领域应用。但循环游离dna的检测能否用于包虫病分型诊断仍是一个问题,2018年法国科学家检测
技术实现思路
1、本申请中u1snrna基因在genbank数据库中的基因编号为m73768.1;cytb基因在genbank数据库中的基因编号为ab461399.1。
2、为了提高检测结果的敏感度、准确度,降低成本,本申请提供一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒及其检测方法
3、本申请提供的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒及其检测方法采用如下的技术方案:
4、第一方面,本申请提供一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒,采用如下的技术方案:
5、一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒,包括用于检测多房棘球绦虫dna的两组u1snrna基因和cytb基因的引物、探针及人内源基因的内质控引物、探针,所述引物、探针的序列如下:
6、u1snrna基因上游引物u1snrna-f:5′-accacgtgagacagattgcat-3′,
7、u1snrna基因下游引物u1snrna-r:5′-cgaaatggccagaggtgaga-3′,
8、u1snrna基因探针u1snrna-p:5′-vic-ctgcagtgaaccacacagttgc-bhq1-3′;
9、cytb基因上游引物cytb-f:5′-accttggcgtcagatgtc-3′,
10、cytb基因下游引物cytb-r:5′-ccaaccaacggcaaactatc-3′,
11、cytb基因探针cytb-p:5′-fam-tgggctgccactgtccttacttca-bhq1-3′;
12、人内源基因上游引物rpolya-f:5′-tgaagccgtgcggaagg-3′,
13、人内源基因下游引物rpolya-r:5′-acaagagagccaagtgtcg-3′,
14、人内源基因探针rpolya-p1:
15、5′-fam-taccacgtcatctcctttgatggctcctat-bhq1-3′,
16、人内源基因探针rpolya-p2:
17、5′-vic-taccacgtcatctcctttgatggctcctat-bhq1-3′。
18、优选的,所述探针u1snrna-p序列的5′标记为vic报告荧光基团,3′端标记物为bhq1淬灭荧光基团;所述探针cytb序列的5′标记为fam报告荧光基团,3′端标记物为bhq1淬灭荧光基团。
19、优选的,所述探针rpolya-p1序列的5′标记为fam报告荧光基团,3′端标记物为bhq1淬灭荧光基团;所述探针rpolya-p2序列的5′标记为vic报告荧光基团,3′端标记物为bhq1淬灭荧光基团。
20、优选的,所述试剂盒还包括taq酶、dntps、mg2+、pcr反应缓冲体系中的一种或多种。
21、优选的,所述试剂盒还包括标准阳性模板。
22、优选的,所述试剂盒中引物终浓度为800nm,探针终浓度为100nm-400nm。
23、第二方面,本申请提供一种血浆中多房棘球绦虫游离dna的检测方法,采用如下的技术方案:
24、一种血浆中多房棘球绦虫游离dna的检测方法,包括以下步骤:
25、s1、提取血浆样本中的总游离dna;
26、s2、以步骤s1中的总游离dna为模板,使用预混pcr体系制备pcr扩增体系;
27、s3、使用液滴生成仪制备油包水微滴体系;
28、s4、微滴体系进行pcr扩增;
29、s5、使用液滴检测仪检测pcr扩增后液滴fam通道和vic通道的荧光强度,并使用机器自带软件进行数据分析,识别cytb基因、u1snrna基因和人内源基因阳性的液滴。
30、优选的,步骤s2中制备pcr扩增体系时反应引物终浓度为800nm,cytb基因探针终浓度为333nm,u1snrna基因探针终浓度为200nm,人内源基因探针1和人内源基因探针2终浓度均为100nm,预混液体积20μl,模板dna体积10μl。
31、优选的,步骤s4中进行pcr扩增时以u1snrna-f、u1snrna-r、cytb-f、cytb-r引物对为引物,以rpolya-f、rpolya-r对为质控引物,以u1snrna-p、cytb-p、rpolya-p1、rpolya-p2为探针进行pcr扩增反应,反应条件为:95℃预变性10min;95℃变性30s,60℃退火、延伸1min,共50个循环。
32、综上所述,本申请具有以下有益效果:
33、1、准确度高,本专利技术根据多房棘球绦虫病原体dna特异位点设计引物和探针,能够准确检测血浆中多房棘球绦虫游离dna。
34、2、操作简便,本专利技术将区分多房棘球蚴人源基本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离DNA的试剂盒,其特征在于,包括用于检测多房棘球绦虫DNA的两组U1snRNA基因和CYTB基因的引物、探针及人内源基因的内质控引物、探针,所述引物、探针的序列如下:
2.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离DNA的试剂盒,其特征在于,所述探针U1snRNA-P序列的5´标记为VIC报告荧光基团,3´端标记物为BHQ1淬灭荧光基团;所述探针CYTB-P序列的5´标记为FAM报告荧光基团,3´端标记物为BHQ1淬灭荧光基团。
3.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离DNA的试剂盒,其特征在于,所述探针RpolyA-P1序列的5´标记为FAM报告荧光基团,3´端标记物为BHQ1淬灭荧光基团;所述探针RpolyA-P2序列的5´标记为VIC报告荧光基团,3´端标记物为BHQ1淬灭荧光基团。
4.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离DNA的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括Taq酶、dNTPs、Mg2+、PCR反应缓冲体系中的一种或多种。
5.根据
6.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离DNA的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中引物终浓度为800nM,探针终浓度为100nM-400nM。
7.一种血浆中多房棘球绦虫游离DNA的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
8.根据权利要求7所述的一种血浆中多房棘球绦虫游离DNA的检测方法,其特征在于,步骤S2中制备PCR扩增体系时反应引物终浓度为800nM,CYTB基因探针终浓度为333nM,U1snRNA基因探针终浓度为200nM,人内源基因探针1和人内源基因探针2终浓度均为100nM,预混液体积20μL,模板DNA体积10μL。
9.根据权利要求7所述的一种血浆中多房棘球绦虫游离DNA的检测方法,其特征在于,步骤S4中进行PCR扩增时以U1snRNA-F、U1snRNA-R、CYTB-F、CYTB-R引物对为引物,以RpolyA-F、RpolyA-R对为质控引物,以U1snRNA-P、CYTB-P、RpolyA-P1、RpolyA-P2为探针进行PCR扩增反应,反应条件为:95℃预变性10min;95℃变性30s,60℃退火、延伸1min,共50个循环。
...【技术特征摘要】
1.一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒,其特征在于,包括用于检测多房棘球绦虫dna的两组u1snrna基因和cytb基因的引物、探针及人内源基因的内质控引物、探针,所述引物、探针的序列如下:
2.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒,其特征在于,所述探针u1snrna-p序列的5´标记为vic报告荧光基团,3´端标记物为bhq1淬灭荧光基团;所述探针cytb-p序列的5´标记为fam报告荧光基团,3´端标记物为bhq1淬灭荧光基团。
3.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒,其特征在于,所述探针rpolya-p1序列的5´标记为fam报告荧光基团,3´端标记物为bhq1淬灭荧光基团;所述探针rpolya-p2序列的5´标记为vic报告荧光基团,3´端标记物为bhq1淬灭荧光基团。
4.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括taq酶、dntps、mg2+、pcr反应缓冲体系中的一种或多种。
5.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒,其特征在于...
【专利技术属性】
技术研发人员:马艳艳,江源,孙莉,张灵强,张耀刚,张涛,杨紫晗,侯静,
申请(专利权)人:青海大学附属医院,
类型:发明
国别省市:
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