System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离DNA的试剂盒及其检测方法技术_技高网

一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离DNA的试剂盒及其检测方法技术

技术编号:40969016 阅读:15 留言:0更新日期:2024-04-18 20:50
本申请涉及疾病检测技术领域,具体公开了一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离DNA的试剂盒及其检测方法。一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离DNA的试剂盒,包括用于检测多房棘球绦虫DNA的两组U1snRNA基因和CYTB基因的引物、探针及人内源基因的内质控引物、探针。另外,本申请的检测方法包括以下步骤:S1、提取血浆样本中的总游离DNA;S2、以步骤S1中的总游离DNA为模板,使用预混PCR体系制备PCR扩增体系;S3、使用液滴生成仪制备油包水微滴体系;S4、微滴体系进行PCR扩增;S5、检测PCR扩增后液滴FAM通道和VIC通道的荧光强度,并进行数据分析,其具有准确度高,操作简便,敏感度高及成本低的优点。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及疾病检测,更具体地说,它涉及一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒及其检测方法。


技术介绍

1、棘球蚴病(echinococcosis)又称包虫病(hydatidosis)。该病不仅是传播最广泛的寄生虫病之一,也是公共卫生方面治疗和预防费用最高的疾病之一,呈地方性流行,是由棘球属的绦虫的幼虫寄生于人或动物机体组织所引发的传染病。采取早期诊断、早期治疗以及积极防治动物传染源的综合性防治措施,对控制包虫病对人类健康和畜牧业发展的影响十分重要。

2、包虫病的诊断目前主要依靠于b超、影像学检查和病理学检查等。因方法自身限制,易造成小病灶、非典型病灶的误诊和漏诊。因此,有必要建立一种快速、灵敏、准确度高的包虫检测方法。随着分子生物学技术的发展,近年来出现了一系列检测包虫病的新方法,如多重pcr检测法、粪抗原elisa法、粪dna检测方法等。elisa方法相对简便、快速,但对于微量或杂质较多的样品,其特异性和灵敏度较低。

3、目前在包虫病检测方面已开发了多种pcr检测方法,trachsel,d.等开发了一种多重pcr来区分多房棘球绦虫、细粒棘球绦虫和带绦虫的感染;shang等开发了多重pcr检测方法,用于3种棘球绦虫的特异性和敏感性检测。“液体活检”作为体外诊断的一个分支,是指一种非侵入式的体液测试。目前针对于血液、尿液、唾液等样本的细胞外游离dna的检测已经在疾病监控、胎儿产前检测及肿瘤靶向药物指导等相关领域应用。但循环游离dna的检测能否用于包虫病分型诊断仍是一个问题,2018年法国科学家检测了多房棘球蚴感染动物模型及泡型包虫病患者体内游离dna的中em的nd5和u1的表达情况,结果显示在沙鼠模型中nd5和u1广泛存在(8/9),而在人体的研究中仅22.58%(7/31)的患者体内能够检出上述基因。专利技术人发现通过高通量测序技术能够有效检出病人血浆中的包虫游离dna,灵敏度可达,特异性达。但是高通量测序存在成本高、技术难度大等问题,难以推广。


技术实现思路

1、本申请中u1snrna基因在genbank数据库中的基因编号为m73768.1;cytb基因在genbank数据库中的基因编号为ab461399.1。

2、为了提高检测结果的敏感度、准确度,降低成本,本申请提供一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒及其检测方法

3、本申请提供的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒及其检测方法采用如下的技术方案:

4、第一方面,本申请提供一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒,采用如下的技术方案:

5、一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒,包括用于检测多房棘球绦虫dna的两组u1snrna基因和cytb基因的引物、探针及人内源基因的内质控引物、探针,所述引物、探针的序列如下:

6、u1snrna基因上游引物u1snrna-f:5′-accacgtgagacagattgcat-3′,

7、u1snrna基因下游引物u1snrna-r:5′-cgaaatggccagaggtgaga-3′,

8、u1snrna基因探针u1snrna-p:5′-vic-ctgcagtgaaccacacagttgc-bhq1-3′;

9、cytb基因上游引物cytb-f:5′-accttggcgtcagatgtc-3′,

10、cytb基因下游引物cytb-r:5′-ccaaccaacggcaaactatc-3′,

11、cytb基因探针cytb-p:5′-fam-tgggctgccactgtccttacttca-bhq1-3′;

12、人内源基因上游引物rpolya-f:5′-tgaagccgtgcggaagg-3′,

13、人内源基因下游引物rpolya-r:5′-acaagagagccaagtgtcg-3′,

14、人内源基因探针rpolya-p1:

15、5′-fam-taccacgtcatctcctttgatggctcctat-bhq1-3′,

16、人内源基因探针rpolya-p2:

17、5′-vic-taccacgtcatctcctttgatggctcctat-bhq1-3′。

18、优选的,所述探针u1snrna-p序列的5′标记为vic报告荧光基团,3′端标记物为bhq1淬灭荧光基团;所述探针cytb序列的5′标记为fam报告荧光基团,3′端标记物为bhq1淬灭荧光基团。

19、优选的,所述探针rpolya-p1序列的5′标记为fam报告荧光基团,3′端标记物为bhq1淬灭荧光基团;所述探针rpolya-p2序列的5′标记为vic报告荧光基团,3′端标记物为bhq1淬灭荧光基团。

20、优选的,所述试剂盒还包括taq酶、dntps、mg2+、pcr反应缓冲体系中的一种或多种。

21、优选的,所述试剂盒还包括标准阳性模板。

22、优选的,所述试剂盒中引物终浓度为800nm,探针终浓度为100nm-400nm。

23、第二方面,本申请提供一种血浆中多房棘球绦虫游离dna的检测方法,采用如下的技术方案:

24、一种血浆中多房棘球绦虫游离dna的检测方法,包括以下步骤:

25、s1、提取血浆样本中的总游离dna;

26、s2、以步骤s1中的总游离dna为模板,使用预混pcr体系制备pcr扩增体系;

27、s3、使用液滴生成仪制备油包水微滴体系;

28、s4、微滴体系进行pcr扩增;

29、s5、使用液滴检测仪检测pcr扩增后液滴fam通道和vic通道的荧光强度,并使用机器自带软件进行数据分析,识别cytb基因、u1snrna基因和人内源基因阳性的液滴。

30、优选的,步骤s2中制备pcr扩增体系时反应引物终浓度为800nm,cytb基因探针终浓度为333nm,u1snrna基因探针终浓度为200nm,人内源基因探针1和人内源基因探针2终浓度均为100nm,预混液体积20μl,模板dna体积10μl。

31、优选的,步骤s4中进行pcr扩增时以u1snrna-f、u1snrna-r、cytb-f、cytb-r引物对为引物,以rpolya-f、rpolya-r对为质控引物,以u1snrna-p、cytb-p、rpolya-p1、rpolya-p2为探针进行pcr扩增反应,反应条件为:95℃预变性10min;95℃变性30s,60℃退火、延伸1min,共50个循环。

32、综上所述,本申请具有以下有益效果:

33、1、准确度高,本专利技术根据多房棘球绦虫病原体dna特异位点设计引物和探针,能够准确检测血浆中多房棘球绦虫游离dna。

34、2、操作简便,本专利技术将区分多房棘球蚴人源基本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离DNA的试剂盒,其特征在于,包括用于检测多房棘球绦虫DNA的两组U1snRNA基因和CYTB基因的引物、探针及人内源基因的内质控引物、探针,所述引物、探针的序列如下:

2.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离DNA的试剂盒,其特征在于,所述探针U1snRNA-P序列的5´标记为VIC报告荧光基团,3´端标记物为BHQ1淬灭荧光基团;所述探针CYTB-P序列的5´标记为FAM报告荧光基团,3´端标记物为BHQ1淬灭荧光基团。

3.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离DNA的试剂盒,其特征在于,所述探针RpolyA-P1序列的5´标记为FAM报告荧光基团,3´端标记物为BHQ1淬灭荧光基团;所述探针RpolyA-P2序列的5´标记为VIC报告荧光基团,3´端标记物为BHQ1淬灭荧光基团。

4.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离DNA的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括Taq酶、dNTPs、Mg2+、PCR反应缓冲体系中的一种或多种。

5.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离DNA的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括标准阳性模板。

6.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离DNA的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中引物终浓度为800nM,探针终浓度为100nM-400nM。

7.一种血浆中多房棘球绦虫游离DNA的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

8.根据权利要求7所述的一种血浆中多房棘球绦虫游离DNA的检测方法,其特征在于,步骤S2中制备PCR扩增体系时反应引物终浓度为800nM,CYTB基因探针终浓度为333nM,U1snRNA基因探针终浓度为200nM,人内源基因探针1和人内源基因探针2终浓度均为100nM,预混液体积20μL,模板DNA体积10μL。

9.根据权利要求7所述的一种血浆中多房棘球绦虫游离DNA的检测方法,其特征在于,步骤S4中进行PCR扩增时以U1snRNA-F、U1snRNA-R、CYTB-F、CYTB-R引物对为引物,以RpolyA-F、RpolyA-R对为质控引物,以U1snRNA-P、CYTB-P、RpolyA-P1、RpolyA-P2为探针进行PCR扩增反应,反应条件为:95℃预变性10min;95℃变性30s,60℃退火、延伸1min,共50个循环。

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【技术特征摘要】

1.一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒,其特征在于,包括用于检测多房棘球绦虫dna的两组u1snrna基因和cytb基因的引物、探针及人内源基因的内质控引物、探针,所述引物、探针的序列如下:

2.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒,其特征在于,所述探针u1snrna-p序列的5´标记为vic报告荧光基团,3´端标记物为bhq1淬灭荧光基团;所述探针cytb-p序列的5´标记为fam报告荧光基团,3´端标记物为bhq1淬灭荧光基团。

3.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒,其特征在于,所述探针rpolya-p1序列的5´标记为fam报告荧光基团,3´端标记物为bhq1淬灭荧光基团;所述探针rpolya-p2序列的5´标记为vic报告荧光基团,3´端标记物为bhq1淬灭荧光基团。

4.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括taq酶、dntps、mg2+、pcr反应缓冲体系中的一种或多种。

5.根据权利要求1所述的一种用于检测血浆中多房棘球绦虫游离dna的试剂盒,其特征在于...

【专利技术属性】
技术研发人员:马艳艳江源孙莉张灵强张耀刚张涛杨紫晗侯静
申请(专利权)人:青海大学附属医院
类型:发明
国别省市:

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