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【技术实现步骤摘要】
本公开涉及生物科学,具体涉及心血管系统细胞特异性的甲基化标志物及其应用。
技术介绍
1、心血管疾病(cardiovascular disease,cvd)是世界范围内主要的死亡原因之一,中国cvd患病率也处于持续上升阶段。但是,心血管疾病起病隐匿,由心血管微小损伤发展至重大疾病的时间长。如果能在早期发现进而进行有效干预,可以有效降低心血管疾病的发病率和死亡率。
2、现有的诊断方式主要依赖临床实验室检查、电生理和影像学检查,其中实验室检查对于心肌损伤的生物标志物肌钙蛋白应用最为广泛。但是,目前的实验室检查对于早期出现的细微心脏和心肌损伤不够敏感,并且检测窗口期长,对于诊断近期发生再次心梗的检测效果差。对于健康人群的心脏相关检查,最广泛运用的是电生理检查心电图,其他影像学检查如心脏核素、心脏彩超、冠脉造影等,更多应用于发病后的诊断和干预指导,对于早期心血管损伤的发现难以起到作用。对于早期出现的血管损伤,如微循环障碍、冠脉阻塞乃至严重的动脉粥样硬化,血液检查相关项如小密低密度脂蛋白等,只能作为医生辅助判断的依据,无法用于确诊,冠脉造影等影像学检查普及程度低,并且因为辐射等因素,需根据患者实际情况判断是否可以接受检查,且因此依从性较低。综上所述,目前临床上缺乏无创、灵敏、简单有效的早期检测方法,对心脏和血管的早期损伤进行筛查和诊断。
技术实现思路
1、为了解决现有技术中存在的上述技术问题之一,本公开提供了一种确定目的细胞(例如心血管系统细胞)游离dna的量的方法,以及心血管系统
2、根据本公开的一个方面,提供了一种心血管系统细胞特异性的甲基化标志物,其包括以下基因中的一个或多个:snx18(分选链接蛋白18)、dkk2(dickkopfwnt信号通路抑制因子2)、capza2(肌动蛋白帽蛋白亚基α2)、hadhb(羟酰辅酶a脱氢酶三功能多酶复合物亚基β)、popdc2(popeye域含蛋白2)、mybpc3(肌球蛋白结合蛋白c3)、cpt1a(肉碱棕榈酰转移酶1a)、ppp1r12b(蛋白磷酸酶1调节亚基12b)、wwox(含ww域的氧化还原酶)、thbs2(血小板反应蛋白2)、trappc9(运输蛋白颗粒复合体亚基9)、zfhx3(锌指同源盒3)、atp5pf(atp合酶外周茎亚基f6)、ldb2(lim域绑定2)、tp73(肿瘤蛋白p73)、asb1(含锚蛋白重复和socs盒1)、cdh10(钙黏蛋白10)、rrn3p2(rrn3假基因2)、chst8(碳水化合物磺基转移酶8)、mn1(mn1原癌基因,转录调节因子)、lbh(wnt信号通路的lbh调节因子)、fat1(fat非典型钙粘蛋白1)、neurl1b(神经化e3泛素蛋白连接酶1b)和gpr20(g蛋白偶联受体20)。
3、在一些实施方式中,所述心血管系统细胞选自心血管内皮细胞、心肌细胞、心成纤维细胞、主动脉平滑肌细胞和冠脉平滑肌细胞中的一种或多种。
4、在一些实施方式中,所述心血管内皮细胞为主动脉内皮细胞。
5、在一些实施方式中,所述心血管内皮细胞的甲基化标志物包括snx18、dkk2和capza2基因中的一个或多个。
6、在一些实施方式中,所述心血管内皮细胞的甲基化标志物包括表1中示出的甲基化标志物中的一个或多个。
7、在一些实施方式中,所述心血管内皮细胞的甲基化标志物包括以下中的一个或多个:chr.4:107954673-107954764,chr.4:107952879-107954509,chr.4:107946386-107946446,chr.4:107951915-107952499,chr.5:53815239-53815306,chr.5:53815069-53815199,chr.4:107947770-107947898,chr.5:53814690-53814899,chr.4:107945781-107945920,chr.4:107950014-107950803,chr.5:53817963-53818480,chr.7:116504873-116505520,chr.7:116484444-116484611,chr.5:53817266-53817387。
8、在一些实施方式中,所述心肌细胞的甲基化标志物包括hadhb、popdc2、mybpc3、cpt1a和ppp1r12b基因中的一个或多个。
9、在一些实施方式中,所述心肌细胞的甲基化标志物包括表2中示出的甲基化标志物中的一个或多个。
10、在一些实施方式中,所述心肌细胞的甲基化标志物包括以下中的一个或多个:chr.2:26500986-26501297,chr.2:26501519-26501647,chr.3:119364175-119364406,chr.11:47370034-47370230,chr.11:47370283-47370443,chr.11:68550315-68550776,chr.11:68550868-68551337,chr.1:202439040-202439257,chr.1:202443536-202443816,chr.1:202450232-202450481,chr.1:202455671-202456071。
11、在一些实施方式中,所述心成纤维细胞的甲基化标志物包括wwox、thbs2、trappc9、zfhx3、atp5pf和ldb2基因中的一个或多个。
12、在一些实施方式中,所述心成纤维细胞的甲基化标志物包括表3中示出的甲基化标志物中的一个或多个。
13、在一些实施方式中,所述心成纤维细胞的甲基化标志物包括以下中的一个或多个:chr.16:78667692-78667766,chr.16:79173770-79174091,chr.16:79174152-79174283,chr.6:169567777-169567966,chr.8:140847540-140847722,chr.16:72939959-72940108,chr.21:27223171-27223269,chr.4:17083666-17084168。
14、在一些实施方式中,所述主动脉血管平滑肌细胞的甲基化标志物包括tp73、asb1、cdh10、rrn3p2、chst8和mn1基因中的一个或多个。
15、在一些实施方式中,所述主动脉血管平滑肌细胞的甲基化标志物包括表4中示出的甲基化标志物中的一个或多个。
16、在一些实施方式中,所述主动脉血管平滑肌细胞的甲基化标志物包括以下中的一个或多个:chr.1:3570914-3570964,chr.2:本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种心血管系统细胞特异性的甲基化标志物,其特征在于,所述甲基化标志物包括以下基因中的一个或多个:SNX18、DKK2、CAPZA2、HADHB、POPDC2、MYBPC3、CPT1A、PPP1R12B、WWOX、THBS2、TRAPPC9、ZFHX3、ATP5PF、LDB2、TP73、ASB1、CDH10、RRN3P2、CHST8、MN1、LBH、FAT1、NEURL1B和GPR20。
2.根据权利要求1所述的甲基化标志物,其特征在于,所述心血管系统细胞选自心血管内皮细胞、心肌细胞、心成纤维细胞、主动脉平滑肌细胞和冠脉平滑肌细胞中的一种或多种;优选地,所述心血管内皮细胞包括主动脉内皮细胞。
3.根据权利要求2所述的甲基化标志物,其特征在于,
4.根据权利要求1所述的甲基化标志物,其特征在于,所述甲基化标志物包括以下中的一个或多个:
5.一种试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括检测权利要求1至4中任一项所述的甲基化标志物中的探针或引物。
6.检测权利要求1至4中任一项所述的甲基化标志物在制备用于检测受试者的心血管系统细胞
7.根据权利要求6所述用途,其特征在于,所述试剂盒检测样本中的所述甲基化标志物。
8.根据权利要求6所述用途,其特征在于,所述样本是来自受试者的血液样本、血浆样本或全血样本,
9.根据权利要求6所述用途,其特征在于,所述甲基化标志物用于检测所述受试者的所述样本中心血管系统细胞来源的循环游离DNA。
10.根据权利要求6所述用途,其特征在于,所述甲基化标志物用于检测受试者的心血管系统细胞损伤。
...【技术特征摘要】
1.一种心血管系统细胞特异性的甲基化标志物,其特征在于,所述甲基化标志物包括以下基因中的一个或多个:snx18、dkk2、capza2、hadhb、popdc2、mybpc3、cpt1a、ppp1r12b、wwox、thbs2、trappc9、zfhx3、atp5pf、ldb2、tp73、asb1、cdh10、rrn3p2、chst8、mn1、lbh、fat1、neurl1b和gpr20。
2.根据权利要求1所述的甲基化标志物,其特征在于,所述心血管系统细胞选自心血管内皮细胞、心肌细胞、心成纤维细胞、主动脉平滑肌细胞和冠脉平滑肌细胞中的一种或多种;优选地,所述心血管内皮细胞包括主动脉内皮细胞。
3.根据权利要求2所述的甲基化标志物,其特征在于,
4.根据权利要求1所述的甲基化标志物,...
【专利技术属性】
技术研发人员:曾秋红,李俊,黄毅,易鑫,
申请(专利权)人:深圳吉因加医学检验实验室,
类型:发明
国别省市:
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