【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及农作物分子生物学，尤其涉及一种用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的snp标记及应用。
技术介绍
1、种子是农业的基本生产资料，优良品种的增产潜力容易受到种子纯度的影响。作为世界第三大粮食作物，玉米种子商品化程度很高。市场上玉米种子品种混杂，品种繁多，易混淆。因此，建立快速高效、低成本、高通量的种子纯度鉴定方法极为重要；同时，也有助于提高种子质量监测、保障玉米育种和种植业的健康发展。
2、传统的品种鉴定主要以表型鉴定为主，存在周期长、工作量大、准确度不高、易受环境影响等问题。随着分子生物学技术的发展，以snp为代表的分子标记具有不受环境影响、快速高效、共显性、通量高等优点。目前针对青早510玉米杂交种纯度鉴定的snp研究较少，有鉴于此，特提出本专利技术。
技术实现思路
1、为解决上述技术问题，本专利技术提供了一种用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的snp标记及应用，具有检测结果稳定、准确、快速、高效的优点，可高通量鉴定青早510玉米种子纯度。
2、具体的，本专利技术的技术方案如下：
3、第一方面，本专利技术提供了一种用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的snp标记，所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的snp标记选自以下（a）和/或（b）：（a）位于8号染色体上第132582645位，其脱氧核苷酸为t或c，编号zmsnp01；（b）位于4号染色体上第60975963位，其脱氧核苷酸为g或a，编号zmsnp02。
4、本专利技术基于
5、第二方面，本专利技术提供了所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的snp标记或特异性检测所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的snp标记的引物组合物在青早510玉米杂交种纯度鉴定中的应用。
6、第三方面，本专利技术提供了用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物，所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物包括zmsnp01-f、zmsnp01-h和zmsnp01-c；所述zmsnp01-f的核苷酸序列如seq id no.1所示；所述zmsnp01-h的核苷酸序列如seq idno.2所示；所述zmsnp01-c的核苷酸序列如seq id no.3所示。
7、本专利技术提供的snp标记zmsnp01可通过zmsnp01-f、zmsnp01-h和zmsnp01-c的引物组合物扩增得到。
8、第四方面，本专利技术提供了另一种用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物，所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物包括zmsnp02-f、zmsnp02-h和zmsnp02-c；所述zmsnp02-f的核苷酸序列如seq id no.4所示；所述zmsnp02-h的核苷酸序列如seq id no.5所示；所述zmsnp02-c的核苷酸序列如seq id no.6所示。
9、本专利技术提供的snp标记zmsnp02可通过zmsnp02-f、zmsnp02-h和zmsnp02-c的引物组合物扩增得到。
10、第五方面，本专利技术提供了用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的试剂、试剂盒或芯片，所述试剂、试剂盒或芯片包括前面所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物zmsnp01-f、zmsnp01-h和zmsnp01-c；或者包括前面所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物zmsnp02-f、zmsnp02-h和zmsnp02-c；或者包括zmsnp01-f、zmsnp01-h、zmsnp01-c、zmsnp02-f、zmsnp02-h和zmsnp02-c共6条引物。
11、本专利技术提供的各引物组合物可基于竞争性等位基因pcr(kompetitive allelespecific pcr，kasp)技术对所述snp标记进行鉴定，基于荧光检测进行基因分型，可在分子辅助育种、性状基因的精细定位以及种子资源鉴定中发挥重要作用。
12、第六方面，本专利技术提供了所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物或者所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的试剂、试剂盒或芯片在青早510玉米杂交种纯度鉴定中的应用。
13、第七方面，本专利技术提供了青早510玉米杂交种纯度鉴定方法，包括：以待测种子样品的dna为模板，采用所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物或者所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的试剂、试剂盒或芯片进行pcr扩增；根据扩增结果判断所述待测种子样品发育的单株是否为青早510。
14、优选地，根据扩增结果进行判断的方法选自以下（1）、（2）或（3）：
15、（1）采用所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物zmsnp01-f、zmsnp01-h和zmsnp01-c进行pcr扩增：若待测种子样品在zmsnp01的基因型为tc，判断其发育的单株为青早510；若待测种子样品在zmsnp01的基因型为tt，判断其为母本自交苗种子；若待测种子样品在zmsnp01的基因型为cc，判断其为混杂的父本种子或异型株；若待测种子样品在zmsnp01的基因型为其他基因型，判断其为异型株种子；
16、（2）采用所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物zmsnp02-f、zmsnp02-h和zmsnp02-c进行pcr扩增：若待测种子样品在zmsnp02的基因型为ct，判断其发育的单株为青早510；若待测种子样品在zmsnp02的基因型为cc，判断其为母本自交苗种子；若待测种子样品在zmsnp02的基因型为tt，判断其为混杂的父本种子或异型株；若待测种子样品在zmsnp02的基因型为其他基因型，判断其为异型株种子；
17、（3）采用所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物zmsnp01-f、zmsnp01-h和zmsnp01-c和所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物zmsnp02-f、zmsnp02-h和zmsnp02-c进行pcr扩增：若待测种子样品在zmsnp01和zmsnp02的基因型分别为tc和ct，判断其发育的单株为青早510；若待测种子样品在zmsnp01和zmsnp02的基因型分别为tt和cc，判断其为母本自交苗种子；若待测种子样品在zmsnp01和zmsnp02的基因型分别为cc和tt，判断其为混杂的父本种子或异型株；若待测种子样品在zmsnp01和zmsnp02的基因型为其他基因型，判断其为异型株种子。
18、上述第（3）种判断的方法应用本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的SNP标记，其特征在于，所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的SNP标记选自以下（a）和/或（b）：（a）位于8号染色体上第132582645位，其脱氧核苷酸为T或C；（b）位于4号染色体上第60975963位，其脱氧核苷酸为G或A。
2.权利要求1所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的SNP标记或特异性检测权利要求1所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的SNP标记的引物组合物在青早510玉米杂交种纯度鉴定中的应用。
3.用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物，其特征在于，所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物包括ZmSNP01-F、ZmSNP01-H和ZmSNP01-C；所述ZmSNP01-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；所述ZmSNP01-H的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；所述ZmSNP01-C的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
4.用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物，其特征在于，所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物包括ZmSNP02-
5.用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的试剂、试剂盒或芯片，其特征在于，所述试剂、试剂盒或芯片包括权利要求3所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物和/或权利要求4所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物。
6.权利要求3或4所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物或者权利要求5所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的试剂、试剂盒或芯片在青早510玉米杂交种纯度鉴定中的应用。
7.青早510玉米杂交种纯度鉴定方法，其特征在于，包括：以待测种子样品的DNA为模板，采用权利要求3或4所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物或者权利要求5所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的试剂、试剂盒或芯片进行PCR扩增；根据扩增结果判断所述待测种子样品发育的单株是否为青早510。
8.根据权利要求7所述青早510玉米杂交种纯度鉴定方法，其特征在于，根据扩增结果进行判断的方法选自以下（1）、（2）或（3）：
9.根据权利要求7或8所述青早510玉米杂交种纯度鉴定方法，其特征在于，在引物ZmSNP01-F和/或ZmSNP02-F的5’端添加一种荧光标签；在引物ZmSNP01-H和/或ZmSNP02-H的5’端添加另一种荧光标签；根据扩增产物释放的两种荧光的强度，判断待测种子样品的基因型。
10.权利要求1所述SNP标记或者权利要求3或4所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物或者权利要求5所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的试剂、试剂盒或芯片在构建玉米品种DNA指纹数据库、玉米种质资源遗传多样性分析、玉米分子标记辅助育种、玉米品种鉴定或制备玉米基因组芯片中的应用。
...【技术特征摘要】
1.用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的snp标记，其特征在于，所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的snp标记选自以下（a）和/或（b）：（a）位于8号染色体上第132582645位，其脱氧核苷酸为t或c；（b）位于4号染色体上第60975963位，其脱氧核苷酸为g或a。
2.权利要求1所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的snp标记或特异性检测权利要求1所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的snp标记的引物组合物在青早510玉米杂交种纯度鉴定中的应用。
3.用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物，其特征在于，所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物包括zmsnp01-f、zmsnp01-h和zmsnp01-c；所述zmsnp01-f的核苷酸序列如seq id no.1所示；所述zmsnp01-h的核苷酸序列如seq id no.2所示；所述zmsnp01-c的核苷酸序列如seq id no.3所示。
4.用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物，其特征在于，所述用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的引物组合物包括zmsnp02-f、zmsnp02-h和zmsnp02-c；所述zmsnp02-f的核苷酸序列如seq id no.4所示；所述zmsnp02-h的核苷酸序列如seq id no.5所示；所述zmsnp02-c的核苷酸序列如seq id no.6所示。
5.用于青早510玉米杂交种纯度鉴定的试剂、试剂盒或芯片，其特征在于，所述试剂、试剂盒或芯片包括权利要求3所述...
【专利技术属性】
技术研发人员：公维香，刘继强，郝晓东，廖诗莹，王淑华，
申请(专利权)人：北京康普森生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：
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