【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物医药，特别涉及一种基于舌苔微生物蛋白筛查胃癌的方法。
技术介绍
1、早期胃癌经过标准化治疗后可以长期生存，但中晚期胃癌的预后不理想。因此，尽早诊断是胃癌治疗的关键。目前胃癌筛查方式主要有胃镜、影像学和血清学筛查，胃镜是最常用的胃癌检查方法之一，但需要专门的检查设备和医生，以及由于检查过程的不适感而引起人们的抵触，难以大规模应用于胃癌筛查。影像学检查阳性率地，且具有放射性。血清学筛查包括幽门螺旋杆菌抗体、胃蛋白酶原、胃泌素和常见肿瘤标志物等，属于有创检查。幽门螺旋杆菌抗体检测无法区分既往和当前感染，且与胃癌发生关联度不高；胃蛋白酶原检查灵敏度和特异度均不高，影响因素较多；胃泌素检查灵敏度较低，容易漏诊；肿瘤标记物检查特异性低，阳性率低。考虑到我国人口众多，迫切需要一种无创、准确、且易于推广的方法来识别胃癌高危人群。
2、舌诊是中医诊断的重要指标，通过观察舌苔厚度、颜色等指标来评估个体健康状况。舌苔是由丝状乳头分化的角化树与填充其间隙中的脱落上皮、唾液、细菌、食物残屑、渗出白细胞等共同组成，其中蕴含大量信息。排除饮食干扰后，舌苔成分大致分为人和微生物量大来源，主要包括在dna、rna和蛋白。此前的研究主要聚焦人或微生物的dna或rna以演技舌苔构成以及功能的变化，很少研究蛋白。蛋白是执行生物功能最重要的载体，因此舌苔蛋白是最有前景的疾病诊标志物本之一，具有广阔的应用潜力。
3、目前，针对舌苔的蛋白质组研究仍停留在蛋白组鉴定的方法开发，缺乏对于胃癌患者舌苔蛋白质组的全方位描述以及应用于胃癌诊断
4、换而言之，基于舌苔蛋白质组的胃癌筛查技术具有较大的发掘潜力。
技术实现思路
1、鉴于以上所述现有技术的缺点，本专利技术的目的在于提供一种基于舌苔微生物蛋白筛查胃癌的方法。
2、本专利技术的第一方面保护蛋白标志物在制备胃癌诊断产品的用途，所述蛋白标志物包括如表1中的任一个或多个。
3、本专利技术的第二方面保护检测如上文所述的蛋白标志物的物质在制备胃癌诊断产品或构建胃癌诊断模型中的用途。
4、本专利技术的第三方面保护一种胃癌诊断模型的构建方法，所述构建方法包括：
5、1)基于受试者样本中如上文所述的蛋白标志物的检测值构建样本数据集；
6、2)将所述样本数据集分割为测试集和训练集，使用机器学习方法学习所述训练集，得到所述的胃癌诊断模型。
7、本专利技术的第四方面保护一种胃癌的预测方法，包括如下步骤：
8、s101、获取待测者样本中如上文所述的蛋白标志物的检测值；
9、s102、应用如上文所述的构建方法得到的胃癌诊断模型对所述检测值进行分析，并输出诊断结果。
10、本专利技术的第五方面保护一种胃癌预测的装置，所述装置包括：
11、数据模块，用于获取待测者样本中蛋白标志物的检测值，所述蛋白标志物包含如上文所述的蛋白标志物；
12、预测模块，应用如上文所述的构建方法得到的胃癌诊断模型对所述检测值进行分析，并输出胃癌预测结果。
13、本专利技术的第六方面保护一种设备，包括处理器和存储器，所述存储器用于存储计算机程序，所述处理器用于执行所述存储器存储的计算机程序，以使所述设备执行如上文所述的预测方法或如上文所述的构建方法。
14、本专利技术的第七方面保护一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，所述程序被处理器执行时实现如上文所述的预测方法或如上文所述的构建方法。
15、与现有技术相比，本专利技术具有如下有益效果：
16、本申请基于pct-dia(data-independent acquisition，数据非依赖性采集)质谱检测舌苔样本中蛋白质表达，结合机器学习方法，从舌苔蛋白质表达层面对胃癌进行诊断。本专利技术通过分析舌苔蛋白质组学数据，筛选出50个微生物来源蛋白的组合，以这50个微生物来源蛋白为基础，结合随机梯度提升模型，从蛋白分子水平对胃癌进行鉴别，能够辅助临床医生进行决策，从而在一定程度上提升胃癌筛查效率。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.蛋白标志物在制备胃癌诊断产品的用途，所述蛋白标志物包括如下中的任一个或多个：
2.如权利要求1所述的用途，其特征在于，还包括以下特征中的一项或多项：
3.如权利要求2所述的用途，其特征在于，所述检测样本中的蛋白标志物为检测样本中蛋白标志物的有无或相对丰度或浓度。
4.检测如权利要求1-3任一项所述的蛋白标志物的物质在制备胃癌诊断产品或构建胃癌诊断模型中的用途。
5.如权利要求4所述的用途，其特征在于，所述产品为试剂盒、蛋白芯片或检测试剂。
6.一种胃癌诊断模型的构建方法，其特征在于，所述构建方法包括：
7.如权利要求6所述的构建方法，其特征在于，所述样本选自舌苔；
8.一种胃癌的预测方法，其特征在于，包括如下步骤：
9.一种胃癌预测的装置，其特征在于，所述装置包括：
10.一种设备，包括处理器和存储器，所述存储器用于存储计算机程序，其特征在于，所述处理器用于执行所述存储器存储的计算机程序，以使所述设备执行如权利要求8所述的预测方法或如权利要求6或7所述的构建方法。>
11.一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，其特征在于，所述程序被处理器执行时实现如权利要求8所述的预测方法或如权利要求6或7所述的构建方法。
...【技术特征摘要】
1.蛋白标志物在制备胃癌诊断产品的用途，所述蛋白标志物包括如下中的任一个或多个：
2.如权利要求1所述的用途，其特征在于，还包括以下特征中的一项或多项：
3.如权利要求2所述的用途，其特征在于，所述检测样本中的蛋白标志物为检测样本中蛋白标志物的有无或相对丰度或浓度。
4.检测如权利要求1-3任一项所述的蛋白标志物的物质在制备胃癌诊断产品或构建胃癌诊断模型中的用途。
5.如权利要求4所述的用途，其特征在于，所述产品为试剂盒、蛋白芯片或检测试剂。
6.一种胃癌诊断模型的构建方法，其特征在于，所述构建方法包括：
【专利技术属性】
技术研发人员：程向东，郭天南，陈佳辉，袁莉，
申请(专利权)人：浙江省肿瘤医院，
类型：发明
国别省市：
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