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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物,具体涉及影响长白猪背膘厚的snp分子标记的应用。
技术介绍
1、长白猪原产丹麦,目前共有英系、法系、比利时系、新丹系等四种不同的品系。长白猪生产性能高,遗传性稳定,一般配合力好,杂交效果显著,生产中被广泛用作杂交的父本。通过不同形式的杂交后,可以得到不同选育目标的理想后代,再通过育种过程达到选育本土瘦肉型猪的目的。
2、全基因组关联分析(gwas)基于单核苷酸多样性(snp)间的连锁不平衡来鉴别影响表型和基因之间关系,可以有效挖掘与主选性状相关的分子标记,并应用于分子标记辅助选择(mas)、全基因组选择(gs)来实现目标性状的早期选择。相比传统育种方法,mas和gs选育使性状相关等位基因快速纯和,不但加快了选育效率和遗传选择进展,也可在配套系创制中避免商品代性状分离,更高效地选育出性状优良的畜禽品种。
3、猪背膘厚,即可以用于说明猪的瘦肉率的脂肪。背膘厚度的数值越大说明猪的瘦肉率就越低,相反则越高。在规模化养猪过程中,母猪繁殖性能是衡量养猪生产经济效益的重要指标之一,营养因素又是影响母猪繁殖性能的重要因素之一,其中膘情是反映母猪体况的一个重要指标,它反映的是母猪在不同生理阶段的营养状况和体能储备。母猪不同繁殖阶段的膘情对其繁殖性能以及哺乳期的泌乳性能有很大的影响,而后备母猪在配种时的膘情、不同妊娠阶段的膘情以及断奶后何种膘情下配种等问题一直是养猪生产过程中的难题。背膘厚因易于测量,常作为反映母猪膘情的重要指标。尽管研究者针对背膘厚与母猪繁殖性能做了大量的研究,但仍然没有一个适用于不同品
技术实现思路
1、基于此,本专利技术提供影响长白猪背膘厚的snp分子标记的应用,至少解决现有技术中的一个问题。
2、本专利技术之一提供了一种与长白猪背膘厚相关的snp分子标记,所述snp分子标记包括如下snp分子标记中的至少一种:
3、第一种,含有所述snp分子标记的核苷酸序列如seq id no. 1所示,所述snp分子标记位于seq id no. 1上从5’端起的第300位点,对应于11.1版本国际猪基因组的3号染色体上的从5’端起的第668222位点,为g或t;
4、第二种,含有所述snp分子标记的核苷酸序列如seq id no. 2所示,所述snp分子标记位于seq id no. 2上从5’端起的第300位点,对应于11.1版本国际猪基因组的3号染色体上的从5’端起的第684615位点,为a或g。
5、seq id no. 1所示序列为:
6、caaaagccaggagacacgatacagaagtcagggtgggaagccccgcaggcaacaacctgcctactacccttccaaggtccccagggctttagcctggatggcgcgggaccccacgactcggccaaggctgctgggaccagcttcccgtgtcctctggacagagcgggcccggccagcacggccagcctcctgcacgccgcaggccggcaaggtgagcgcagggatggcgagctcccggcaggaaccctctttacaaggatcagactcggtttctgggaacaaagtcccgagtctgcagcktgctacccctcagaaccaggcgccgctcacaggctgtgcacgctggcctgtccctgggcggacaggaggagcaaagccaggccagggctctggggagcgcccccacaggtgacacggaggggggcacaggcagagccccaggaatgcacggccaaagcaggaggcagagtacacaccccctccccagctcgcagcagggagggggcaccagaggcccagggcacggcgtccaccggcagcgcccctagtcgtgcgggtcagcgtccaggacaagcctgtgcctgcaacgagcggggctga,其中k为g或t。
7、seq id no. 2所示序列为:
8、ggtgggaaggggcccggctgctttctggggcagggagaggagggcacccacccccaggccctaggatgccatttagagaagcaacgtgctgcccagcctttcaggccccggctgtgcaccagagccaagtcttggcggccgagcagtcgtcctagtgcatgtgacagaactgtgctgcttcctcctgaaacctcccatcgagccatttccctttgatgactgctggctcctcaactctctaaggctaaagcctcttgcataactgggctgccccaggctgcatctgtccacagggtctcrcgggcctagggccccaaaataccacccaggcatcagagcagagtggctccttgcgaaggccacctctcgagcagcagagggacagggtgaaatgggccaggggtcctctgtgtccccagcacgtccaccctgcgtcccccttcctctcatacatgcggacaggagggcggagggcacccgggaggttcccggttttcattccagcggaggaagcaagggttcccgttagagcagatgcaatgagtaaaaacaaccgctggttcctcccctggaaagaaccagaggcgggaaaagatgggt,其中r为a或g。
9、所述snp分子标记位于长白猪c7orf50基因上,是长白猪背膘厚的影响因素。对于(i),当两条染色体上seq id no. 1所示序列中所述snp分子标记分别为t、t时,称为tt基因型,tt基因型长白猪背膘厚度大;当两条染色体上seq id no. 1所示序列中所述snp分子标记分别为t、g时,称为tg基因型,tg基因型长白猪背膘厚度介于gg基因型和tt基因型长白猪背膘厚之间;当两条染色体上seq id no. 1所示序列中所述snp分子标记分别为g、g时,称为gg基因型,gg基因型长白猪背膘厚度小。对于(ii),当两条染色体上seq id no. 2所示序列中所述snp分子标记分别为a、a时,称为aa基因型,aa基因型长白猪背膘厚度大;当两条染色体上seq id no. 2所示序列中所述snp分子标记分别为a、g时,称为ag基因型,ag基因型长白猪背膘厚度介于aa基因型和gg基因型长白猪背膘厚之间;当两条染色体上seq id no.2所示序列中所述snp分子标记分别为g、g时,称为gg基因型,gg基因型长白猪背膘厚度小。
10、本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种与长白猪背膘厚相关的SNP分子标记在确定长白猪背膘厚中的应用,其特征在于,所述SNP分子标记包括如下SNP分子标记中的至少一种:
2.一种确定长白猪背膘厚的方法,其特征在于,包括:确定所述长白猪的SNP分子标记,并根据所述SNP分子标记确定长白猪背膘厚性状:
3.一种长白猪的遗传改良的方法,其特征在于,包括:确定长白猪核心群中的种猪的SNP分子标记,并根据所述SNP分子标记做出相应的选择:
4.根据权利要求3所述的长白猪的遗传改良的方法,其特征在于,根据所述SNP分子标记做出相应的选择:
5.一种改善猪生长性状的长白猪新品系建立的方法,其特征在于,包括:根据长白猪的SNP分子标记做出相应的选择:
6.根据权利要求5所述的改善猪生长性状的长白猪新品系建立的方法,其特征在于,根据长白猪的SNP分子标记做出相应的选择:
7.根据权利要求5所述的改善猪生长性状的长白猪新品系建立的方法,其特征在于,利用转基因的方法或基因编辑的方法进行突变。
8.根据权利要求5所述的改善猪生长性状的长白猪新品系建立的
...【技术特征摘要】
1.一种与长白猪背膘厚相关的snp分子标记在确定长白猪背膘厚中的应用,其特征在于,所述snp分子标记包括如下snp分子标记中的至少一种:
2.一种确定长白猪背膘厚的方法,其特征在于,包括:确定所述长白猪的snp分子标记,并根据所述snp分子标记确定长白猪背膘厚性状:
3.一种长白猪的遗传改良的方法,其特征在于,包括:确定长白猪核心群中的种猪的snp分子标记,并根据所述snp分子标记做出相应的选择:
4.根据权利要求3所述的长白猪的遗传改良的方法,其特征在于,根据所述snp分子标记做出相应的选...
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