生物标志物组合及其在预测和/或诊断结直肠癌中的应用制造技术

技术编号：40475502 阅读：17 留言：0更新日期：2024-02-26 19:11

本发明专利技术提供了一种构建结直肠癌预测模型的方法、结直肠癌预测模型、样本是否为结直肠癌的预测方法、用于预测结直肠癌的系统、生物标志物组合在制备预测和/或诊断结直肠癌的试剂盒中的应用、用于检测生物标志物组合的试剂、用于检测生物标志物组合的试剂在制备预测和/或诊断结直肠癌的试剂盒中的应用及一种生物标志物组合。所述生物标志物组合与结直肠癌存在较高的相关性，所述结直肠癌预测模型在检测结直肠癌方面具有较高的准确率、灵敏度和特异性。

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【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物信息学领域，具体涉及一种生物标志物组合及其在预测和/或诊断结直肠癌风险中的应用。

技术介绍

1、结直肠癌(colorectal cancer，crc)是全球第三大常见癌症，也是癌症死亡的第二大常见原因。研究结果表明，筛查可以降低人群的平均结直肠癌风险和结直肠癌死亡率。筛查方法包括无创性粪便潜血试验、粪便免疫化学试验、癌胚抗原试验和结肠镜检。然而，疾病进展缓慢且无症状的特点使得早期诊断具有挑战性，这严重减少了及时发现和干预疾病的机会。

2、因此，为了进一步提高结直肠癌患者的诊断率，有必要根据分子生物学特征来识别结直肠癌患者，发现并应用结直肠癌患者特征蛋白质。此外，在结直肠癌研究中，已经报道了可以根据生物标志物诊断结直肠癌患者。如基于dnah5基因的结肠癌诊断试剂盒(专利号cn104611446b)，斯钙素蛋白2在结肠癌的治疗和诊断中的应用(专利号cn104459151b)，尿液代谢物在区分结肠癌患者与健康人中的应用(专利号cn109884300b)。目前已涌现的多项研究性专利均是基于基因组，转录组和代谢组水平实现对结直肠癌的诊断。因此，从生物学功能的执行者蛋白质的层面深入解析是非常有必要的。

3、体液循环系统及其组成的动态性质反映了不同的生理或病理状态。血液中循环的蛋白质既可以是器官串扰的媒介，也可以是全身状态的标志物。近年来基于质谱的血浆蛋白质组学已成功应用于多种疾病诊断。而且，这些肿瘤标志物的研究往往是基于一定量的实验数据，所涉及的样本量都相对有限。因此，现有技术中缺乏通过收集大队列样

技术实现思路

1、针对现有技术中缺少应用于结直肠癌方面的生物标志物组合，或诊断/预测结直肠癌的技术方案的缺陷，本专利技术提供了一种生物标志物组合及其在诊断和/或预测结直肠癌风险中的应用。所述生物标志物组合至少包括col12a1、thbs2、s100a8和s100a9，此时可达到验证集中预测准确率为72.58％，诊断灵敏度71.79％，特异性均为73.91％；独立验证集中预测准确率为82.50％，诊断灵敏度93.75％，特异性均为75.00％。所述生物标志物组合至多可扩展至包括如本专利技术所述的745种蛋白质分子生物标志物，其预测准确率、诊断灵敏度和特异性均较高。

2、为解决上述技术问题，本专利技术提供的技术方案之一为：一种生物标志物组合在预测和/或诊断结直肠癌中的应用，所述生物标志物组合包括以下蛋白质：col12a1、thbs2、s100a8和s100a9。

3、在本专利技术一较佳实施方案中，所述生物标志物组合还包括mxra5。

4、在本专利技术一较佳实施方案中，所述生物标志物组合还包括以下一种或多种蛋白质：abr、ace、actn4、adamts13、adgre5、adh1a、adh1b、adh1c、adh5、adpgk、ago2、ak1、aldh9a1、aldob、alox5、amy1a、amy2b、anxa2p2、apobec3g、apobr、app、arhgap1、atad1、atp5pf、atp6ap1、bcap31、bgn、bloc1s4、bpgm、bub1b、c4bpb、cadm4、cald1、cd14、cdc37、cdh1、cdhr2、ceacam8、cela2a、cfhr4、cftr、chmp4a、cirbp、cnn2、cntrob、cog2、cog3、cpn1、cpt1a、crp、csnk2a1、ctnna1、ctsb、ctsl、dars1、dcps、dctpp1、ddt、decr1、dnm2、dnph1、dpysl2、eef1aknmt、eef1d、eif4a1、eif4a2、eif4a3、eloc、evpl、f9、faf2、fah、fam114a1、fam135a、fam83h、fbl、fbn2、fcgr3b、flii、flnb、fn1、fras1、fubp3、gale、get3、get4、gmps、gpi、grk2、grk3、gstk1、hba1、hbb、hbd、hbe1、hbg1、hbg2、hbz、hmgb1、hmgb2、hnrnph2、hnrnpm、hnrnpr、homer1、hrnr、hsd17b4、hspa13、hspd1、hspg2、ica1、igfbp3、inpp5k、itgb2、itpr3、kif5b、krt23、krt24、krt25、krt26、krt27、krt28、krt31、krt32、krt35、krt36、krt37、krt38、krt4、krt5、krt73、krt77、krt78、krt9、l2hgdh、ldha、lgals3bp、lima1、lmna、lyve1、macroh2a1、mark2、mat2b、mbnl1、mcm6、mettl18、mia3、minpp1、mrpl13、msl1、msn、mtrex、myl9、myo5a、naa35、ndufv2、neo1、nrp1、nsun2、numa1、nup205、p4hb、pank4、park7、pcbp1、pdcd6、pdzk1、pgm1、pigr、pip、plekho2、polr2a、ppm1f、prcc、prdx1、prep、prrt3、prss1、prss2、prss3、prss3p2、psma1、psmb10、ptar1、ptges2、ptpa、ptpn12、rab10、rack1、rpn1、rps23、rps27a、rrbp1、s100a4、saa1、saa2、sbf1、sbno1、sec24b、sec61a1、sell、serpina2、serpinb12、serpinb9、serpini1、shmt1、slc27a4、slc4a1、sod1、sptbn1、srsf1、srsf7、stambp、stat3、supt5h、swap70、syne3、tap1、tbc1d10c、tcp11l1、tgm3、tln2、tpd52l2、tpi1、tram1、tsta3、ttc37、ttr、tuba8、tubb3、tubb8、tubb8b、txndc12、tymp、uba5、uba52、ubb、ubc、ube2i、vps13c、vsig4、washc2a、washc2c、wdr7、xpo5、yap1、ywhab、znf512b、actn2、adarb1、add1、agps、aldh6a1、aldh7a1、ano1、ap3m1、aplp1、arhgap25、arl6、arl8a、brix1、bsg、c12orf10、c9orf64、calu、capn5、casp10、cnot3、col4a6、colec12、crym、cryz、csnk1a1、csnk1a1l、cyp1b1、dap3、dclk1、ddost、def6、dnajc13、dusp3、egflam、emc2、esyt2、fyn、gapvd1、gatm、gbp1、gfpt1、gid8、gins3、glod4、gmds、g本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种生物标志物组合在预测和/或诊断结直肠癌中的应用，其特征在于，所述生物标志物组合包括以下蛋白质：COL12A1、THBS2、S100A8和S100A9。

2.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述生物标志物组合还包括MXRA5。

3.如权利要求2所述的应用，其特征在于，所述生物标志物组合还包括以下一种或多种蛋白质：ABR、ACE、ACTN4、ADAMTS13、ADGRE5、ADH1A、ADH1B、ADH1C、ADH5、ADPGK、AGO2、AK1、ALDH9A1、ALDOB、ALOX5、AMY1A、AMY2B、ANXA2P2、APOBEC3G、APOBR、APP、ARHGAP1、ATAD1、ATP5PF、ATP6AP1、BCAP31、BGN、BLOC1S4、BPGM、BUB1B、C4BPB、CADM4、CALD1、CD14、CDC37、CDH1、CDHR2、CEACAM8、CELA2A、CFHR4、CFTR、CHMP4A、CIRBP、CNN2、CNTROB、COG2、COG3、CPN1、CPT1A、CRP、CSNK2A1、CTNNA1、CTSB、C...

【技术特征摘要】

1.一种生物标志物组合在预测和/或诊断结直肠癌中的应用，其特征在于，所述生物标志物组合包括以下蛋白质：col12a1、thbs2、s100a8和s100a9。

2.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述生物标志物组合还包括mxra5。

3.如权利要求2所述的应用，其特征在于，所述生物标志物组合还包括以下一种或多种蛋白质：abr、ace、actn4、adamts13、adgre5、adh1a、adh1b、adh1c、adh5、adpgk、ago2、ak1、aldh9a1、aldob、alox5、amy1a、amy2b、anxa2p2、apobec3g、apobr、app、arhgap1、atad1、atp5pf、atp6ap1、bcap31、bgn、bloc1s4、bpgm、bub1b、c4bpb、cadm4、cald1、cd14、cdc37、cdh1、cdhr2、ceacam8、cela2a、cfhr4、cftr、chmp4a、cirbp、cnn2、cntrob、cog2、cog3、cpn1、cpt1a、crp、csnk2a1、ctnna1、ctsb、ctsl、dars1、dcps、dctpp1、ddt、decr1、dnm2、dnph1、dpysl2、eef1aknmt、eef1d、eif4a1、eif4a2、eif4a3、eloc、evpl、f9、faf2、fah、fam114a1、fam135a、fam83h、fbl、fbn2、fcgr3b、flii、flnb、fn1、fras1、fubp3、gale、get3、get4、gmps、gpi、grk2、grk3、gstk1、hba1、hbb、hbd、hbe1、hbg1、hbg2、hbz、hmgb1、hmgb2、hnrnph2、hnrnpm、hnrnpr、homer1、hrnr、hsd17b4、hspa13、hspd1、hspg2、ica1、igfbp3、inpp5k、itgb2、itpr3、kif5b、krt23、krt24、krt25、krt26、krt27、krt28、krt31、krt32、krt35、krt36、krt37、krt38、krt4、krt5、krt73、krt77、krt78、krt9、l2hgdh、ldha、lgals3bp、lima1、lmna、lyve1、macroh2a1、mark2、mat2b、mbnl1、mcm6、mettl18、mia3、minpp1、mrpl13、msl1、msn、mtrex、myl9、myo5a、naa35、ndufv2、neo1、nrp1、nsun2、numa1、nup205、p4hb、pank4、park7、pcbp1、pdcd6、pdzk1、pgm1、pigr、pip、plekho2、polr2a、ppm1f、prcc、prdx1、prep、prrt3、prss1、prss2、prss3、prss3p2、psma1、psmb10、ptar1、ptges2、ptpa、ptpn12、rab10、rack1、rpn1、rps23、rps27a、rrbp1、s100a4、saa1、saa2、sbf1、sbno1、sec24b、sec61a1、sell、serpina2、serpinb12、serpinb9、serpini1、shmt1、slc27a4、slc4a1、sod1、sptbn1、srsf1、srsf7、stambp、stat3、supt5h、swap70、syne3、tap1、tbc1d10c、tcp11l1、tgm3、tln2、tpd52l2、tpi1、tram1、tsta3、ttc37、ttr、tuba8、tubb3、tubb8、tubb8b、txndc12、tymp、uba5、uba52、ubb、ubc、ube2i、vps13c、vsig4、washc2a、washc2c、wdr7、xpo5、yap1、ywhab、znf512b、actn2、adarb1、add1、agps、aldh6a1、aldh7a1、ano1、ap3m1、aplp1、arhgap25、arl6、arl8a、brix1、bsg、c12orf10、c9orf64、calu、capn5、casp10、cnot3、col4a6、colec12、crym、cryz、csnk1a1、csnk1a1l、cyp1b1、dap3、dclk1、ddost、def6、dnajc13、dusp3、egflam、emc2、esyt2、fyn、gapvd1、gatm、gbp1、gfpt1、gid8、gins3、glod4、gmds、gon7、h2ac21、hars1、hars2、herc4、hnrnpd、igbp1、immt、klk1、lgals1、lyn、mat1a、mat2a、mcm4、mfn1、mrpl2、mrps18b、mtm1、myl12b、myo1e、nadk2、nckap1、ndufb8、npc2、nudt16、p3h1、pabpc1、parvb、ppil3、ppp1r1b、prkab1、prkar1a、psmd5、ptprd、ptprf、rab6a、rbbp8nl、rbm17、rbmx、rpl17、rps25、samm50、shtn1、siae、slc12a7、slc4a2、snx1、snx12、srsf6、stard7、stmn1、stx8、syne1、thoc5、tnfrsf21、txnrd1、unc13d、usp34、usp9x、vps33a、vps4a、was、zcrb1、znf622、zw10、aip、arsl、bcar1、bet1、blm、cblb、cela3b、ckap4、cndp2、cog4、cpsf6、csnk2b、dock10、eif2ak3、exoc8、fstl1、g3bp1、gbf1、gipc3、got2、gtf3c1、hdhd3、igf1、iglv9-49、impad1、krt33a、krt34、l1cam、lgalsl、lrp6、lypd2、mpp3、mthfs、nbn、ncf1、ncf1b、ncf1c、npm3、nufip2、oxct1、pnkp、ppp5c、prkcd、pvr、rab19、reck、reg1a、reg1b、rimbp2、rpl13、rrad、samd9、sccpdh、scly、serpinb3、serpinb4、spats2l、tfap2a、tfap2b、tfap2e、tnks1bp1、ahnak2、asap2、atp12a、bclaf1、capza1、cnot7、coq5、ddx47、dglucy、dnaja1、eif2b5、hdlbp、hkdc1、igsf8、msln、mvb12a、myo18a、nlrx1、nr2c2ap、nxn、oga、orc3、pdzk1ip1、ppp2r2a、ppp2r2b、ppp2r2d、prph、ralgapa1、rarres1、scaf11、serpini2、sort1、strip1、trim47、ube2z、vps8、zfr、acaa1、alg1、ap3b1、apbb1、arap1、arpc5、atp9b、bin3、bysl、bzw2、cad、cd200、col7a1、cpxm2、crisp3、cst6、dbn1、dhps、dync1li2、gm2a、h1-1、h1-6、hnrnpa1l2、iglv4-69、kif13b、lactb、lamtor3、lgals9、mark3、mcu、memo1、miox、mmp14、mrpl17、mrps18a、ncapd2、ndufb4、nob1、pf4、pf4v1、phykpl、pkp2、prex1、prmt1、psme3、ranbp9、ripor1、rpa2、s100a12、sarm1、sdf2l1、sel1l、selenof、snrpd3、srp68、stard10、stk38l、stxbp2、sumf2、tbk1、tmem106b、tmem43、utp20、vipas39、vps28、xrcc4、abca8、arl3、b4gat1、casc4、cluh、exosc9、hspa6、hspa7、igfbp5、lgals3、mgam2、mzb1、rab5b、ube2n、yars1、aldh4a1、ank2、ap3m2、ass1、bckdk、glce、hbq1、hpd、ilk、mark4、ndufaf7、nipsnap1、ociad2、pcyt1b、pi4ka、plekha4、pold2、rbm10、rps24、tmco4、abhd12、agfg1、atg3、ccdc134、cilp、clca4、ddx39a、ddx50、fam120a、fam120b、hectd1、htra3、limch1、mrps36、nme7、pmm2、qpctl、rxra、rxrb、rxrg、sap30bp、srgap1、tmem230、wdfy3、zadh2、zfyve1、acad8、aurkb、coq3、cybb、etf1、farsb、fbxw11、lrmp、plxnb3、ppm1g、rbfox1、rbfox2、rbm12b、rer1、rhcg、rps19、s100a6、slc39a10、ube2v1、cast、clpx、cox15、ikbkg、macrod1、pak4、pigs、pip4k2a、pip4k2b、slfn11、kyat3、plrg1、vsig1、ahsp、gak、gnl3、papola、ap1m1、atad2、eif2a、gsdmb、kpna1、kpna5、kpna6、mmp7、pabpc1l、pelp1、ythdf3、aspn、cdc42ep5、fgfr1、fn3k、hnrnpa0、ndufa13、rpl5、tfeb、irf2bpl、poglut3、rasa1、acadsb、bbox1、sos1、patl1、pcdhga1、pcdhga10、pcdhga11、pcdhga12、pcdhga2、pcdhga3、pcdhga4、pcdhga5、pcdhga6、pcdhga7、pcdhga8、pcdhga9、pcdhgb1、pcdhgb2、pcdhgb3、pcdhgb4、pcdhgb5、pcdhgb6、pcdhgb7、pcdhgc3、pcdhgc4、pcdhgc5、dnajc5、impdh2、mars2、polr2c、rtkn、cyp2s1、efhd1、nedd4l、myl6b、ssrp1、mtmr2、pak5、specc1l、dync1i1、gimap8、rplp1、emc8、mycbp2、tpk1、cdh11、ube2nl、d2hgdh、faah、tmem87a、btk、ccdc12、cnpy2、nadk、psmg2、slit2、wdr45b、otud7b、wnt8b、cradd、retreg3、slc25a22、ccdc58、nol11、akt2、dhx57、iglon5、tsc22d4、cmas、cisd2、fkbp7、rel、nt5c、rnf31、lair1、lair2、pptc7、cntn4、arid3a、abi3、tmlhe、eif5a2、nck1、mknk1、tdrd7、guf1、plekhh3、mrpl40、casc3、pabpc5、ythdf1、ighv4-30-2、ighv4-31、arid3c、dnajb4、nos3、slc4a8、pno1、cep41和otud7a。

4.一种生物标志物组合，其特征在于，所述生物标志物组合包括以下蛋白质：col12a1、thbs2、s100a8和s100a9。

5.如权利要求4所述的生物标志物组合，其特征在于，所述生物标志物组合还包括mxra5。

6.如权利要求5所述的生物标志物组合，其特征在于，所述生物标志物组合还包括以下一种或多种蛋白质：abr、ace、actn4、adamts13、adgre5、adh1a、adh1b、adh1c、adh5、adpgk、ago2、ak1、aldh9a1、aldob、alox5、amy1a、amy2b、anxa2p2、apobec3g、apobr、app、arhgap1、atad1、atp5pf、atp6ap1、bcap31、bgn、bloc1s4、bpgm、bub1b、c4bpb、cadm4、cald1、cd14、cdc37、cdh1、cdhr2、ceacam8、cela2a、cfhr4、cftr、chmp4a、cirbp、cnn2、cntrob、cog2、cog3、cpn1、cpt1a、crp、csnk2a1、ctnna1、ctsb、ctsl、dars1、dcps、dctpp1、ddt、decr1、dnm2、dnph1、dpysl2、eef1aknmt、eef1d、eif4a1、eif4a2、eif4a3、eloc、evpl、f9、faf2、fah、fam114a1、fam135a、fam83h、fbl、fbn2、fcgr3b、flii、flnb、fn1、fras1、fubp3、gale、get3、get4、gmps、gpi、grk2、grk3、gstk1、hba1、hbb、hbd、hbe1、hbg1、hbg2、hbz、hmgb1、hmgb2、hnrnph2、hnrnpm、hnrnpr、homer1、hrnr、hsd17b...

【专利技术属性】
技术研发人员：李明珠，
申请(专利权)人：上海爱谱蒂康生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：

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