【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及序列筛选，尤其涉及一种序列筛选方法、装置、计算机设备及存储介质。
技术介绍
1、基于多重pcr(聚合酶链式反应)扩增技术的tngs(病原靶向测序)可以靶向富集样本中的待测样本中几十种至几百种已知病原微生物及其毒力和/或耐药基因进行检测。多重pcr扩增和基因测序都是比较成熟的技术平台，在tngs临床应用转换过程中，难点是在引物设计，针对病原体序列设计的引物的性能更是决定了病原检测的特异性与灵敏性。
2、目前已有许多针对tngs引物设计的研究，但是难以对病原微生物高同源性物种间的准确鉴定。
技术实现思路
1、基于此，有必要针对现有技术的无法对病原微生物高同源性物种间的准确鉴定技术问题，提出了一种序列筛选方法、装置、计算机设备及存储介质。
2、第一方面，提供了一种序列筛选方法，所述方法包括：
3、获取序列数据库以及病原微生物的基因组序列；
4、根据所述病原微生物的基因组序列进行切割，得到各个片段序列；
5、根据所述片段序列以及所述序列数据库进行比对，得到目标序列；
6、根据所述病原微生物的基因组序列以及所述目标序列进行筛选，得到引物设计序列。
7、第二方面，提供了一种序列筛选装置，所述装置包括：
8、获取模块，用于获取序列数据库以及病原微生物的基因组序列；
9、切割模块，用于根据所述病原微生物的基因组序列进行切割，得到各个片段序列；
10、比对模块，用于根
11、筛选模块，用于根据所述病原微生物的基因组序列以及所述目标序列进行筛选，得到引物设计序列。
12、第三方面，提供了一种计算机设备，包括存储器、处理器以及存储在所述存储器中并可在所述处理器上运行的计算机程序，所述处理器执行所述计算机程序时实现上述序列筛选方法的步骤。
13、第四方面，提供了一种计算机可读存储介质，所述计算机可读存储介质存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现上述序列筛选方法的步骤。
14、本专利技术提出的序列筛选方法，通过获取序列数据库以及病原微生物的基因组序列，接着根据所述病原微生物的基因组序列进行切割，得到各个片段序列，然后根据所述片段序列以及所述序列数据库进行比对，得到目标序列，而后根据所述病原微生物的基因组序列以及所述目标序列进行筛选，得到引物设计序列。能够对病原微生物的基因组序列以及所述目标序列进行筛选，得到可以对病原微生物高同源性物种间的准确鉴定的引物设计序列，提高了同源物种鉴定的敏感度。
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1.一种序列筛选方法，其特征在于，所述序列筛选方法包括：
2.根据权利要求1所述的序列筛选方法，其特征在于，所述获取序列数据库的步骤，包括：
3.根据权利要求1所述的序列筛选方法，其特征在于，所述根据所述片段序列以及所述序列数据库进行比对，得到目标序列的步骤，包括：
4.根据权利要求3所述的序列筛选方法，其特征在于，所述根据各个所述序列组合，确定所述目标序列的步骤，包括：
5.根据权利要求1所述的序列筛选方法，其特征在于，所述根据所述病原微生物的基因组序列以及所述目标序列进行筛选，得到引物设计序列的步骤，包括：
6.根据权利要求5所述的序列筛选方法，其特征在于，所述根据所述第三序列以及所述病原微生物的基因组序列进行筛选，得到所述引物设计序列的步骤，包括：
7.根据权利要求6所述的序列筛选方法，其特征在于，所述基于各个所述初始片段序列以及所述病原微生物的基因组序列进行筛选，得到所述引物设计序列的步骤，包括：
8.一种序列筛选装置，其特征在于，所述序列筛选装置包括：
9.一种计算机设备，包
10.一种计算机可读存储介质，所述计算机可读存储介质存储有计算机程序，其特征在于，所述计算机程序被处理器执行时实现如权利要求1至7任一项所述序列筛选方法的步骤。
...【技术特征摘要】
1.一种序列筛选方法，其特征在于，所述序列筛选方法包括：
2.根据权利要求1所述的序列筛选方法，其特征在于，所述获取序列数据库的步骤，包括：
3.根据权利要求1所述的序列筛选方法，其特征在于，所述根据所述片段序列以及所述序列数据库进行比对，得到目标序列的步骤，包括：
4.根据权利要求3所述的序列筛选方法，其特征在于，所述根据各个所述序列组合，确定所述目标序列的步骤，包括：
5.根据权利要求1所述的序列筛选方法，其特征在于，所述根据所述病原微生物的基因组序列以及所述目标序列进行筛选，得到引物设计序列的步骤，包括：
6.根据权利要求5所述的序列筛选方法，其特征在于，所述根据所述第三序列以及所述病原微生物的...
【专利技术属性】
技术研发人员：陆亚平，魏启浩，高翔，徐莎，程怡慧，李拼，李彬，何彬，
申请(专利权)人：国药武汉精准医疗科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
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