【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物，特别是涉及一种基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析系统、方法、终端及云平台。
技术介绍
1、品种鉴定是指对人工选育出来的、具有一定形态特征和生产性状的群体进行评定的过程。在植物遗传育种及种苗繁育、宠物纯种培育等方面有着极其重要的作用。分子遗传标记以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是dna水平遗传多态性的直接反映。有以下优点：基因组变异极其丰富，分子标记的数量几乎是无限的；生物发育的不同阶段，不同组织的dna都可用于标记分析；检测手段简单、迅速。可以科学准确、高效快速地进行大规模品种鉴定。
2、但目前对于分子遗传标记的品种鉴定主要依托于软件(如geneclass2)，无法像脚本或软件包那样大规模、自动化地部署运行；软件最终结果是基于各个分子遗传标记位点的累积结果，没有详细展示各位点具体的作用以便从数据分析的角度进行位点筛选；而且软件结果大多是给出预测表格，没有具体美观的可视化结果进行清晰准确地展示。
技术实现思路
1、鉴于以上所述现有技术的缺点，本专利技术的目的在于提供一种基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析系统、方法、终端及云平台，用于解决以上现有技术问题。
2、为实现上述目的及其他相关目的，本专利技术提供一种基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析系统，所述系统包括：数据预处理模块，用于对纯种数据库与包含分子遗传标记数据的一或多个待测样本进行预处理；品种鉴定模块，连接所述数据预处理模块，用于基于由经过预处理后的纯种数据库构建
3、于本专利技术的一实施例中，所述数据预处理模块包括：格式转化单元，用于将纯种数据库以及各待测样本转换为品种鉴定所需的格式；零值处理单元，连接所述格式转化单元，用于针对品种鉴定的非零值需求，对转换格式后的纯种数据库以及待测样本中未出现基因型的零值赋值自定义的非负实数或符合设定正态分布的非负实数；未出现基因型处理单元，连接所述格式转化单元，用于对转换格式后的纯种数据库以及待测样本中低频未检出和/或未知的多态性基因型赋值自定义的非负实数或符合设定正态分布的非负实数。
4、于本专利技术的一实施例中，所述品种鉴定模块包括：建模单元，用于利用预处理后的纯种数据库构建品种预测模型；品种预测单元，连接所述建模单元，用于基于所述品种预测模型，根据预处理后的待测样本获得对应所述纯种数据库中各品种的预测概率值。
5、于本专利技术的一实施例中，所述可视化品种鉴定报告包括：各待测样本分别对应所述纯种数据库中各品种的预测概率值以及其可视化结果、各待测样本在各分子遗传标记位点在品种鉴定中分相对作用的量化结果及其可视化结果。
6、于本专利技术的一实施例中，还可根据所述可视化品种鉴定报告辅助筛选包含更少数目的分子遗传标记位点的位点组合。
7、为实现上述目的及其他相关目的，本专利技术提供一种基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析方法，所述方法包括：对纯种数据库与包含分子遗传标记数据的一或多个待测样本进行预处理；基于由经过预处理后的纯种数据库构建的品种预测模型，根据预处理后的各待测样本获得对应各所述待测样本的品种鉴定结果；基于获得的各品种鉴定结果生成可视化品种鉴定报告。
8、为实现上述目的及其他相关目的，本专利技术提供一种基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析终端，包括：一或多个存储器及一或多个处理器；所述一或多个存储器，用于存储计算机程序；所述一或多个处理器，连接所述存储器，用于运行所述计算机程序以执行所述基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析系统。
9、为实现上述目的及其他相关目的，本专利技术提供一种云平台，所述云平台包括：云平台计算系统，包括：所述基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析系统；web服务器，连接所述云平台计算系统，用于将待测样本文件传递给所述云平台计算系统，同时监听所述云平台计算系统的计算，并提供由所述云平台计算系统分析获得的可视化品种鉴定报告的下载链接，同时在前端页面交互式展示该可视化品种鉴定报告。
10、于本专利技术的一实施例中，所述web服务器包括：通信监听模块，用于与所述云平台计算系统通信并实时监听所述云平台计算系统的计算；文件上传模块，连接所述通信监听模块，用于将待测样本上传至所述云平台计算系统；链接提供模块，连接所述通信监听模块，用于在通过通信监听模块监听到所述云平台计算系统获得的可视化品种鉴定报告时，提供该可视化品种鉴定报告的下载链接；结果展示模块，连接所述通信监听模块，用于在通过通信监听模块监听到所述云平台计算系统获得的可视化品种鉴定报告后进行交互式展示。
11、如上所述，本专利技术是一种基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析系统、方法、终端及云平台，具有以下有益效果：本专利技术基于由经过预处理后的纯种数据库构建的品种预测模型，根据预处理后的各待测样本获得对应各所述待测样本的品种鉴定结果，并生成可视化品种鉴定报告。本专利技术通过分子遗传标记数据与纯种数据库文件，结合相应的算法设计，出具清晰明确、详尽如实、科学准确的品种鉴定结果报告。同时该报告还可详尽清晰地展示各个分子遗传标记位点在品种鉴定中的相对作用，对筛选分子遗传标记位点组合有一定的参考意义。
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1.一种基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析系统，其特征在于，所述系统包括：
2.根据权利要求1中所述的基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析系统，其特征在于，所述数据预处理模块包括：
3.根据权利要求1中所述的基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析系统，其特征在于，所述品种鉴定模块包括：
4.根据权利要求1中所述的基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析系统，其特征在于，所述可视化品种鉴定报告包括：各待测样本分别对应所述纯种数据库中各品种的预测概率值以及其可视化结果、各待测样本在各分子遗传标记位点在品种鉴定中分相对作用的量化结果及其可视化结果。
5.根据权利要求4中所述的基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析系统，其特征在于，还可根据所述可视化品种鉴定报告辅助筛选包含更少数目的分子遗传标记位点的位点组合。
6.一种基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析系统，其特征在于，所述方法包括：
7.一种基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析终端，其特征在于，包括：一或多个存储器及一或多个处理器；
8.一种云平台，其特征
9.根据权利要求8中所述的云平台，其特征在于，所述web服务器包括：
...【技术特征摘要】
1.一种基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析系统，其特征在于，所述系统包括：
2.根据权利要求1中所述的基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析系统，其特征在于，所述数据预处理模块包括：
3.根据权利要求1中所述的基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析系统，其特征在于，所述品种鉴定模块包括：
4.根据权利要求1中所述的基于分子遗传标记多样性的品种鉴定分析系统，其特征在于，所述可视化品种鉴定报告包括：各待测样本分别对应所述纯种数据库中各品种的预测概率值以及其可视化结果、各待测样本在各分子遗传标记位点在品种鉴定中...
【专利技术属性】
技术研发人员：产天龙，韩峻松，袁箐，徐祎春，李倩，
申请(专利权)人：上海生物芯片有限公司，
类型：发明
国别省市：
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