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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于植物分子生物学,具体涉及香青兰内参基因及其引物与应用。
技术介绍
1、香青兰(dracoephalam moidavical l.)是唇形科青兰属一年生草本植物。分布于我国内蒙古自治区、青海省、新疆维吾尔自治区、陕西省北部以及俄罗斯、欧洲、克什米尔地区等地,多生于干燥山地、山谷、河滩处,喜光、耐干旱,适应性强。香青兰是蒙古族与维吾尔族习用药材,是极具开发潜力和民族特色的天然药用植物。以全草入药,味辛、苦、性凉,有清肺解表、晾干止血的功效,用于喉痛、痢疾、吐血等症状。现代医学研究表明,香青兰含有的挥发油、萜类、黄酮类、氨基酸、微量元素等,具有心血管舒张、抗炎、降血脂、防治哮喘等作用。除了作为草药外,香青兰还是制备柠檬香系香料的重要原料,是重要的香料植物。香青兰全株尤其是花中可蒸馏获得挥发油,其挥发油中含有大量挥发性萜类化合物,例如柠檬醛、香叶醇、肉桂醇,具有花香,清香,果香香韵,香气持久稳定,可调配食用、日用等多种类型香精。香青兰多生于干燥山谷、河滩,具有较强的抗旱性,是研究植物抗旱分子机制以及研究分子生态学的优良材料。香青兰是种极具开发潜力的资源植物,目前已对其展开药用、保健、工业等多种用途的开发研究;而对香青兰抗逆性研究还较为罕见,尤其对其抗旱性分子机制研究尚未见报道,关于香青兰的遗传背景与基因研究仍处空白阶段。
2、实时荧光定量pcr技术(qrt-pcr)是检测基因表达的重要方法之一。因其具有灵敏度高、可靠性强、操作简便等优势被广泛用于分子生物学研究中。然而正因为qrt-pcr灵敏性高,其结果的准确
技术实现思路
1、本专利技术要解决的技术问题是香青兰中暂无针对性内参基因。
2、本专利技术的技术方案是香青兰内参基因,所述内参基因为18s rrna、his4、hsp70、28s rrna、arf、cac、ef1α、samdc、gapdh、eif4α、tub或actin中的至少一个;其核苷酸序列分别如seq id no.29~40所示。
3、本专利技术还提供了所述内参基因的扩增引物,所述扩增引物为扩增18s rrna、actin、his4、hsp70、28s rrna、arf、cac、ef1α、samdc、gapdh、eif4α或tub的引物对中的至少一对:扩增18s rrna的引物对如seq id no.1和seq id no.2所示;扩增actin的引物对如seq id no.3和seq id no.4所示;扩增his4的引物对如seq id no.5和seq id no.6所示;扩增hsp70的引物对如seq id no.7和seq idno.8所示;扩增28s rrna的引物对如seq idno.9和seq id no.10所示;扩增arf的引物对如seq idno.11和seq id no.12所示;扩增cac的引物对如seq id no.13和seq id no.14所示;扩增ef1α的引物对如seq id no.15和seqid no.16所示;扩增samdc的引物对如seq id no.17和seq id no.18所示;扩增gapdh的引物对如seq id no.19和seq id no.20所示;扩增eif4α的引物对如seq id no.21和seq idno.22所示;扩增tub的引物对如seq id no.23和seq id no.24所示。
4、本专利技术还提供了所述内参基因和/或所述扩增引物在计算香青兰各组织目标基因表达量中的应用。
5、具体的,所述应用为计算胁迫条件下香青兰各组织目标基因表达量。
6、特别的,所述胁迫为干旱处理。
7、进一步的,所述干旱处理时的目标基因为nox或hpac1。
8、优选的,所述nox的核苷酸序列如seq id no.41。
9、优选的,所述hpac1的核苷酸序列如seq id no.42。
10、本专利技术还提供了一种计算香青兰各组织目标基因表达量的方法,包括如下步骤:
11、a、提取香青兰组织rna,反转录获得cdna;
12、b、以权利要求1所述内参基因进行qrt-pcr;计算目标基因表达量。
13、具体的,所述内参基因为18s rrna、his4、hsp70、28s rrna、arf、cac、ef1α、samdc、gapdh、eif4α、tub或actin中的至少一个。
14、特别的,所述内参基因的扩增引物为扩增18s rrna、actin、his4、hsp70、28srrna、arf、cac、ef1α、samdc、gapdh、eif4α或tub的引物对中的至少一对:扩增18s rrna的引物对如seq id no.1和seq id no.2所示;扩增actin的引物对如seq id no.3和seq idno.4所示;扩增his4的引物对如seq id no.5和seq id no.6所示;扩增hsp70的引物对如seq id no.7和seq id no.8所示;扩增28srrna的引物对如seq id no.9和seq id no.10所示;扩增arf的引物对如seq id no.11和seq id no.12所示;扩增cac的引物对如seq idno.13和seq id no.14所示;扩增ef1α的引物对如seq id no.15和seq id no.16所示;扩增samdc的引物对如seq id no.17和seq id no.18所示;扩增gapdh的引物对如seq id no.19和seq id no.20所示;扩增eif4α的引物对如seq id no.21和seq id no.22所示;扩增tub的引物对如seq id no.23和seq id no.24所示。
15、其中,步骤b中rt-pcr的扩增体系为:模板cdna 1μl,上游引物(10μmol/l)1μl,下游引物(10μmol/l)1μl,2×rapid taq master mix 7μl,ddh2o 10μl,共计20μl。
16、具体的,步骤b中rt-pcr的扩增程序为:95℃预变本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.香青兰内参基因,其特征在于:所述内参基因为18S rRNA、HIS4、HSP70、28S rRNA、ARF、CAC、EF1α、SAMDC、GAPDH、eIF4α、TUB或ACTIN中的至少一个;其核苷酸序列分别如SEQID No.29~40所示。
2.权利要求1所述内参基因的扩增引物,其特征在于:所述扩增引物为扩增18S rRNA、ACTIN、HIS4、HSP70、28S rRNA、ARF、CAC、EF1α、SAMDC、GAPDH、eIF4α或TUB的引物对中的至少一对:扩增18S rRNA的引物对如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示;扩增ACTIN的引物对如SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示;扩增HIS4的引物对如SEQ ID No.5和SEQ ID No.6所示;扩增HSP70的引物对如SEQ ID No.7和SEQ ID No.8所示;扩增28S rRNA的引物对如SEQ IDNo.9和SEQ ID No.10所示;扩增ARF的引物对如SEQ ID No.11和SEQ ID No.12所示;扩增CAC的引物对如SEQ ID N
3.权利要求1所述内参基因和/或权利要求2所述扩增引物在计算香青兰各组织目标基因表达量中的应用。
4.根据权利要求3所述应用,其特征在于:所述应用为计算胁迫条件下香青兰各组织目标基因表达量。
5.根据权利要求4所述应用,其特征在于:所述胁迫为干旱处理。
6.根据权利要求5所述应用,其特征在于:所述干旱处理时的目标基因为NOX或HPAC1。
7.根据权利要求4所述应用,其特征在于:所述NOX的核苷酸序列如SEQ ID No.41;所述HPAC1的核苷酸序列如SEQ ID No.42。
8.一种计算香青兰各组织目标基因表达量的方法,其特征在于:包括如下步骤:
9.根据权利要求8所述方法,其特征在于:步骤b中RT-PCR的扩增体系为:模板cDNA 1μL,上游引物(10μmol/L)1μL,下游引物(10μmol/L)1μL,2×Rapid Taq Master Mix 7μL,ddH2O 10μL,共计20μL。
10.根据权利要求8所述方法,其特征在于:步骤b中RT-PCR的扩增程序为:95℃预变性2min,95℃变性30s,60℃退火30s,72℃延伸15s,循环30次;最终延伸72℃延伸5min,4℃保存。
...【技术特征摘要】
1.香青兰内参基因,其特征在于:所述内参基因为18s rrna、his4、hsp70、28s rrna、arf、cac、ef1α、samdc、gapdh、eif4α、tub或actin中的至少一个;其核苷酸序列分别如seqid no.29~40所示。
2.权利要求1所述内参基因的扩增引物,其特征在于:所述扩增引物为扩增18s rrna、actin、his4、hsp70、28s rrna、arf、cac、ef1α、samdc、gapdh、eif4α或tub的引物对中的至少一对:扩增18s rrna的引物对如seq id no.1和seq id no.2所示;扩增actin的引物对如seq id no.3和seq id no.4所示;扩增his4的引物对如seq id no.5和seq id no.6所示;扩增hsp70的引物对如seq id no.7和seq id no.8所示;扩增28s rrna的引物对如seq idno.9和seq id no.10所示;扩增arf的引物对如seq id no.11和seq id no.12所示;扩增cac的引物对如seq id no.13和seq id no.14所示;扩增ef1α的引物对如seq id no.15和seq id no.16所示;扩增samdc的引物对如seq id no.17和seq id no.18所示;扩增gapdh的引物对如seq id no.19和seq id no.20所示;扩...
【专利技术属性】
技术研发人员:陈尘,李莎莎,鬲晓敏,寻路路,卜洁,
申请(专利权)人:陕西省西安植物园陕西省植物研究所,
类型:发明
国别省市:
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