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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物医学领域,特别是涉及一种生物标志物检测方法。
技术介绍
1、生物标志物是必不可少的实体,自人类生物学的认识以来就一直存在着。生物标志物被指定为"可以客观地测量和评估的物质或活动,作为正常生物过程、致病过程或对治疗干预的药理反应的指标"。理想的生物标志物应该是可量化的、可靠的、在疾病状况下有相当高/低的表达、与结果进展相关、在不同性别和种族群体中可保持一致,并且具有成本效益。生物标志物包括蛋白质、信使核糖核酸(mrna)、外泌体、代谢物、循环dna和肿瘤细胞,可以从组织、血液和尿液中收集获得。对疾病相关的生物标志物进行微量检测和定量的能力,可以在早期阶段对相应的疾病进行诊断。因此,开发高选择性和高灵敏度的生物标志物的方法,成为疾病筛查、诊断、预后和治疗康复的准确方法并有很好的发展前景。近年来,生物标志物的检测已经取得了实质性的重大进展。基于crispr-cas12a的传感技术由于其高精确度和出色的功能化效率,在诊断应用方面有很大的潜力。原则上,非核酸目标必须通过生物传导元件转化为可识别的核酸信号,这些信号可以被crispr-cas吸收。
2、但是,目前,临床一些生物标志物检测方法用时较长、操作复杂、假阳性高,且其灵敏度对于大多人血清标志物不一定适用。
技术实现思路
1、(一)要解决的技术问题
2、为了解决现有技术的上述问题,本专利技术提供一种生物标志物的检测方法,以人体crp为代表,以免疫dna传感器技术为基础,利用特异性识别crp的免疫磁珠
3、(二)技术方案
4、为了达到上述目的,本专利技术采用的主要技术方案包括:
5、一种生物标志物的检测方法,包括如下步骤:
6、s1,设计得到适配体-引物探针;所述适配体-引物探针中包含rca反应引物序列;
7、s2,设计得到ts和nts,并利用所述ts和所述nts,设计得到p2-ts、p1-nts-a和nts-b;所述p2-ts、所述p1-nts-a和所述nts-b的核苷酸序列分别为:
8、p2-ts:
9、5’-cattatgtgctgccatatctacttcagaaaagccaccatc-3’;
10、p1-nts-a:5’-tagactgcctttt-3’;
11、nts-b:5’-ctgaagtagatatggcagcacataatg-3’;
12、s3,设计得到crrna,并利用cas12a酶识别所述crrna,得到cas12a-crrna复合物;
13、s4,设计得到环状dna;所述环状dna的核苷酸序列为:tgtcttcgccttcttgtttcctttccttgaaacttcttcctttctttcttt cgactaagcacc;
14、s5,设计得到荧光报告基因ssdna-fq探针,所述荧光报告基因ssdna-fq探针的核苷酸序列为:5’-tttattt-3’;
15、s6,利用抗体与磁珠进行偶联,制备得到免疫磁珠;
16、s7,利用所述免疫磁珠和所述适配体-引物探针,识别并捕获靶标物,得到三明治夹心复合物;
17、s8,构建rca-crispr反应体系,启动rca反应,获得具有若干个重复单链dna的长链ssdna;所述长链ssdna的核苷酸序列为:
18、3’-taacttaatgtggagtcggggatggtaataattatctgacggagtcg gtggtagtggaaacgataaattggagtcgcgaaggtcgaa-5’;
19、s9,通过所述长链ssdna与所述p2-ts、所述p1-nts-a和所述nts-b互补配对,得到邻近复合物,并通过所述cas12a-crrna复合物识别所述邻近复合物,使crispr-cas12a系统激活,得到基于crispr cas12a的dna免疫传感器;所述邻近复合物带有pam序列;
20、s10,利用所述dna免疫传感器,对人血清中的生物标志物进行检测,得到所述生物标志物的检测结果。
21、进一步地,所述s1,具体步骤包括:
22、s11,设计得到与所述靶标物高特异性结合的适配体序列;
23、s12,设计得到所述rca反应中的引物序列;
24、s13,通过将所述引物序列插在所述特异适配体序列之后,获得所述适配体-引物探针。
25、进一步地,所述s2,具体步骤包括:
26、s21,根据所述长链ssdna和所述crrna,设计得到所述p2-ts;所述p2-ts序列包含分别与所述长链ssdna和所述crrna互补的两段序列;
27、s22,根据所述长链ssdna和所述ts,利用所述nts设计得到p1-nts-a和nts-b;所述p1-nts-a包含分别与所述长链ssdna和所述ts互补的两段序列;所述nts-b包含与所述ts互补的一段序列;所述p1-nts-a和所述nts-b均带有不完整的pam序列。
28、进一步地,所述s6,具体步骤包括:
29、s61,将所述磁珠进行活化,得到活化磁珠;
30、s62,将所述活化磁珠与抗体进行偶联,得到免疫磁珠。所述抗体的浓度为0.1~2μg/ml。
31、进一步地,所述s7,具体步骤包括:
32、s71,将所述免疫磁珠和所述适配体-引物探针,用磷酸盐缓冲液进行稀释,获得免疫磁珠稀释液和适配体-引物探针稀释液;
33、s72,将人血清用所述磷酸盐缓冲液稀释80~120倍,获得人血清稀释液;
34、s73,分别将所述免疫磁珠稀释液、所述适配体-引物探针稀释液和所述人血清稀释液加入低吸附管内,混匀后孵育,并进行磁珠清洗,获得所述三明治夹心复合物。
35、进一步地,所述免疫磁珠浓度稀释液为0.1μg/ml~5μg/ml,所述适配体-引物探针稀释液浓度为5nm~100nm,所述孵育时间为10~90min。
36、进一步地,所述s8,具体步骤包括:
37、s81,将所述三明治夹心复合物、所述cas12a-crrna复合物和所述荧光报告器ssdna-fq在离心管中进行混合,然后向离心管中加入所述环状dna、脱氧核苷三磷酸、10×phi29 dna聚合酶缓冲溶液、所述p2-ts、所述p1-nts-a、所述nts-b和超纯水,最后迅速加入phi29 dna聚合酶,并快速混匀,得到所述rca-crispr反应体系;
38、s82,将所述rca-crispr反应体系低速离心后,放入孵育仪中,在37℃下孵育,进行rca反应,本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种生物标志物检测方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的生物标志物检测方法,其特征在于,所述S1,包括:
3.根据权利要求1所述的生物标志物检测方法,其特征在于,所述S2,包括:
4.根据权利要求1所述的生物标志物检测方法,其特征在于,所述S6,包括:
5.根据权利要求1所述的生物标志物检测方法,其特征在于,所述S7,包括:
6.根据权利要求5所述的生物标志物检测方法,其特征在于,所述免疫磁珠稀释液浓度为0.1μg/mL~5μg/mL,所述适配体-引物探针稀释液浓度为5nM~100nM,所述孵育时间为10~90min。
7.根据权利要求1所述的生物标志物检测方法,其特征在于,所述S8,包括:
8.根据权利要求7所述的生物标志物检测方法,其特征在于,所述Phi29DNA聚合酶的浓度为1U/mL~10000U/mL。
9.根据权利要求1所述的生物标志物检测方法,其特征在于,所述S9,包括:
10.根据权利要求1所述的生物标志物检测方法,其特征在于,所述S10,包
...【技术特征摘要】
1.一种生物标志物检测方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的生物标志物检测方法,其特征在于,所述s1,包括:
3.根据权利要求1所述的生物标志物检测方法,其特征在于,所述s2,包括:
4.根据权利要求1所述的生物标志物检测方法,其特征在于,所述s6,包括:
5.根据权利要求1所述的生物标志物检测方法,其特征在于,所述s7,包括:
6.根据权利要求5所述的生物标志物检测方法,其特征在于,所述免疫磁珠稀释液浓度为0.1μg/ml...
【专利技术属性】
技术研发人员:孙铁强,王天辉,王文,郭长江,姚站馨,王锋,虞立霞,
申请(专利权)人:军事科学院军事医学研究院环境医学与作业医学研究所,
类型:发明
国别省市:
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