【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及分子生物学遗传育种领域，具体涉及一种用于鉴别菌根高效共生水稻的分子标记及通用型扩增引物和应用。
技术介绍
1、pcr(聚合酶链式反应)是一种常用的分子标记鉴定技术，广泛应用于育种领域。其原理是使用引物对dna特定区段进行多轮扩增，从而产生大量复制，以此检测特定的基因或序列变异，这一方法可以用于追踪目标性状的遗传规律从而辅助育种过程，大大提高育种效率。例如，pcr分子标记可用于筛选特定基因型或性状，例如抗病性、耐旱性等，并可用于建立分子遗传图谱或进行遗传多样性分析。pcr的方法包括以下步骤：首先，将dna模板与引物、dntps和聚合酶混合，并进行数轮循环反应，使dna序列逐渐扩增。然后，利用凝胶电泳等技术对扩增产物进行检测和分离，以确定目标dna序列的存在和大小。
2、东乡野生稻来源的oscerk1dy基因可以大幅提高水稻的菌根共生能力，达到减肥增产的效果。但目前为止在培育菌根高效共生水稻的过程中缺乏简单有效的分子标记来辅助育种过程，已有的分子标记或者应用范围有局限，或者在使用时需要限制性内切酶处理，如cn112980936a所述，当使用提供的引物扩增完成后，还需要对pcr反应产物用限制性内切酶rsaⅰ消化，37℃中酶切1h，对电泳结果进行鉴定才可以获知鉴定结果，而扩增后还需要经酶切后再电泳才可以获得结果，使得鉴定过程繁琐且鉴定周期长，影响育种的进度。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供一种用于鉴别菌根高效共生水稻的分子标记及通用型扩增引物和应用，该分
2、为了达到上述目的，本专利技术提供了一种用于鉴别菌根高效共生水稻的分子标记，该分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示，该分子标记可用于鉴定菌根高效共生水稻，当该水稻oscerk1dy基因atg位点的上游1611bp处存在该分子标记序列的插入，表明该水稻为菌根高效共生水稻；若不含该分子标记的插入，则为非菌根高效共生水稻。
3、本专利技术提供的分子标记可用于鉴定菌根高效共生水稻中。
4、本专利技术还提供了一种鉴定上述分子标记的扩增引物，该扩增引物的核苷酸序列分别如seq id no.4和seq id no.5所示，该扩增引物可用于鉴定菌根高效共生水稻。具体为通过该扩增引物对待测水稻的基因组dna进行扩增，当扩增产物为97bp的条带或97bp和89bp共有的两条条带，则表明该待测水稻为菌根高效共生水稻；当扩增产物为只含有89bp的条带，则表明该水稻为非菌根高效共生水稻。
5、优选地，上述扩增引物的扩增条件具体如下：
6、其扩增体系为10μl，包括：1.0μl的10×buffer，1.0μl的2mm dntp，各1μl的10μm引物f、r，1u的taq dna聚合酶和1.0μl的基因组dna，剩余体积用ddh2o补充；
7、其pcr反应程序为：94℃预变性5min；94℃变性30sec、58℃退火30sec、72℃延伸6sec，共32个循环；72℃延伸5min。
8、本专利技术还提供了一种用于鉴别菌根高效共生水稻的试剂盒，该试剂盒包含核苷酸序列分别如seq id no.4和seq id no.5所示的扩增引物。
9、本专利技术提供的试剂盒可用于水稻育种、水稻种质资源鉴定、水稻纯度鉴定等，通过试剂盒中的扩增引物对待测水稻的基因组进行pcr扩增，通过扩增结果即可实现上述目的。
10、本专利技术的用于鉴别菌根高效共生水稻的分子标记及扩增引物，解决了菌根高效共生水稻的快速鉴定问题，具有以下优点：
11、本专利技术提供了一种与菌根高效共生水稻基因oscerk1dy紧密连锁的分子标记，通过该分子标记的有无即可判断该待测水稻是否为菌根高效共生水稻。
12、本专利技术提供了一种扩增引物，通过该扩增引物的电泳结果即可判定该水稻是否为菌根高效共生水稻，不需要辅助酶切或测序等过程，步骤简单，成本低，提高了鉴定效率，具有较强的实用性。
13、本专利技术提供的分子标记和扩增引物适用于多种水稻资源，不仅包含籼型水稻和粳型水稻，适用品种范围广，通用性强。
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1.一种用于鉴别菌根高效共生水稻的分子标记，其特征在于，该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
2.如权利要求1所述的分子标记在鉴定菌根高效共生水稻中的应用。
3.鉴定如权利要求1所述的分子标记的扩增引物，其特征在于，所述扩增引物的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示。
4.如权利要求3所述的扩增引物在鉴别菌根高效共生水稻中的应用。
5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述扩增引物的PCR反应程序为：94℃预变性5min；94℃变性30sec、58℃退火30sec、72℃延伸6sec，共32个循环；72℃延伸5min。
6.一种用于鉴别菌根高效共生水稻的试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒包含核苷酸序列分别如SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示的扩增引物。
7.如权利要求6所述的试剂盒在以下任意一项中的应用；
【技术特征摘要】
1.一种用于鉴别菌根高效共生水稻的分子标记，其特征在于，该分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示。
2.如权利要求1所述的分子标记在鉴定菌根高效共生水稻中的应用。
3.鉴定如权利要求1所述的分子标记的扩增引物，其特征在于，所述扩增引物的核苷酸序列分别如seq id no.4和seq id no.5所示。
4.如权利要求3所述的扩增引物在鉴别菌根高效共生水稻中的应用。
【专利技术属性】
技术研发人员：李峥，汤国平，黄仁良，杨宙，朱珊，韩瑞才，何颖，沈林军，陈丽妹，傅金红，沈显华，
申请(专利权)人：江西省农业科学院水稻研究所，
类型：发明
国别省市：
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