【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物医药领域，具体涉及nrde2基因在肝癌个性化治疗中的应用。
技术介绍
1、原发性肝细胞肝癌(hepatocellular cancer，hcc，以下简称肝癌)是常见的恶性肿瘤之一。流行病学和实验研究表明，肝癌属于多因素复杂疾病，是环境因素和遗传因素共同作用的结果。传统的基于候选基因的病例-对照关联研究以及近年来兴起的全基因组关联研究(genome-wide association study,gwas)陆续发现了若干与肝癌显著相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，snp)，证实了肝癌的发生存在遗传病因，即存在肝癌的易感基因。肝癌易感基因的鉴定以及易感基因分子机制的解析，将为肝癌的个性化临床诊治提供理论依据，达到提高肝癌治疗效果的目的。
2、目前肿瘤治疗已进入分子靶向治疗的新时代。分子靶向抗肿瘤药物可选择性抑制与肿瘤生长和增殖相关的信号通路，从而发挥抗肿瘤效应，具有疗效显著、对正常组织毒副作用小且耐受性好等优点，为肝癌临床诊断、治疗和预后提供了崭新的方法和手段。其中，parp(poly adp-ribose polymerase)抑制剂药物是一类新型的用于肿瘤治疗的靶向药物。多种parp抑制剂药物获得美国食品药品监督管理局(food and drug administration，fda)批准用于乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌的治疗。parp抑制剂通过靶向抑制parp1/2，导致细胞dna单链断裂修复能力丧失，从而在同源重组修复缺陷的肿瘤细胞中产生合成致死效应(
3、近年来，随着高通量测序技术的发展，系统鉴定与复杂疾病相关的低频遗传变异(次要等位频率小于5％)已成为可能。基于低频变异的遗传关联研究，研究人员已成功定位了多种复杂疾病的易感基因。例如，研究人员通过全外显子组测序技术，开展了息肉样脉络膜血管病变的遗传关联分析，成功发现了fgd6基因上的一个低频错义突变与该疾病的发生显著相关。brca2基因上的低频变异被发现与胰腺癌的发生风险显著相关。然而，截止目前，尚没有基于高通量测序技术鉴定与肝癌相关的低频遗传变异的研究报道。
技术实现思路
1、本专利技术所要解决的技术问题是如何对肝癌患者进行预后预测和/或如何预测肝癌患者是否受益于辅助治疗。
2、为解决上述技术问题，本专利技术首先提供了检测标志物的物质在制备产品中的应用。
3、本专利技术提供的检测标志物的物质在制备产品中的应用，所述产品可用于预测肝癌患者通过parp抑制剂治疗的获益性或用于预测肝癌细胞对parp抑制剂的敏感性，所述标志物为核rnai缺陷-2(nuclear rnai defective-2)蛋白，简称nrde2蛋白。所述nrde2蛋白的氨基酸序列可为seq id no.2。
4、上述应用中，所述物质可为用于检测nrde2蛋白表达量的系统。
5、所述系统可为产品。所述用于检测nrde2蛋白表达量的系统可包括通过定量pcr反应检测所述nrde2蛋白表达量所需的试剂、试剂盒和仪器。具体来说，检测所述nrde2蛋白表达量的系统可为检测所述nrde2蛋白表达量的引物和进行定量pcr反应所需要的其它试剂和仪器，也可仅为检测所述nrde2蛋白表达量的引物。所述用于检测nrde2蛋白表达量的系统也可包括通过免疫组织化学染色方法检测所述nrde2蛋白表达量的试剂和/或仪器，如所述nrde2蛋白的单克隆抗体或多克隆抗体。
6、上述应用中，所述parp抑制剂可为奥拉帕尼。
7、实验证明，nrde2蛋白表达量低的肝癌患者通过parp抑制剂治疗后获益的可能性大于nrde2蛋白表达量高的肝癌患者。nrde2蛋白表达量低的肝癌细胞对parp抑制剂敏感性高于nrde2蛋白表达量高的肝癌细胞。
8、本专利技术还提供了检测编码nrde2蛋白的基因是否发生变异的物质在制备产品中的应用。
9、本专利技术提供的检测编码nrde2蛋白的基因是否发生变异的物质在制备产品中的应用中，所述产品可用于预测肝癌患者通过parp抑制剂治疗的获益性或用于预测肝癌细胞对parp抑制剂的敏感性，所述标志物为nrde2蛋白。
10、上述应用中，所述检测编码nrde2蛋白的基因是否发生变异的物质可为检测所述编码nrde2蛋白的基因的序列(序列表中序列1)的第1130位的核苷酸是否突变的物质。
11、所述nrde2蛋白的基因的核苷酸序列可为序列表中序列1。
12、上述应用中，所述parp抑制剂可为奥拉帕尼。
13、所述物质可为通过下述至少一种方法确定nrde2基因第1130位的核苷酸变异(rs199890497的多态性或基因型)所需的试剂和/或仪器：dna测序、限制性酶切片段长度多态性、单链构象多态性、变性高效液相色谱和snp芯片。其中，snp芯片包括基于核酸杂交反应的芯片、基于单碱基延伸反应的芯片、基于等位基因特异性引物延伸反应的芯片、基于“一步法”反应的芯片、基于引物连接反应的芯片、基于限制性内切酶反应的芯片、基于蛋白dna结合反应的芯片，及基于荧光分子dna结合反应的芯片。
14、用于预测肝癌患者通过parp抑制剂治疗的获益性的装置也属于本专利技术的保护范围。
15、本专利技术用于预测肝癌患者通过parp抑制剂治疗的获益性的装置包括蛋白质表达量数据处理模块。
16、所述蛋白质表达量数据处理模块可用于将来自待预测肝癌患者的nrde2蛋白表达量转换为获益分值，根据所述获益分值预测所述待预测肝癌患者通过parp抑制剂治疗的获益性。
17、本专利技术还提供了用于预测肝癌细胞对parp抑制剂的敏感性的装置。
18、本专利技术提供的用于预测肝癌细胞对parp抑制剂的敏感性的装置，所述装置包括蛋白质表达量数据处理模块，所述蛋白质表达量数据处理模块可用于将来自待预测肝癌细胞的nrde2蛋白表达量转换为敏感性分值，根据所述敏感性分值预测所述待预测肝癌细胞对parp抑制剂的敏感性。
19、为了发掘肝癌相关的低频遗传变异，专利技术人开展了基于高通量测序技术的全基因组遗传关联研究。专利技术人纳入了来自中国南方地区的348例肝癌病例(病例组)和1749例对照个体(对照组)的高通量测序数据，基于“基因载荷”分析策略，发现nrde2基因上的低频变异在病例组中的频率(27/348)显著高于对照组(44/1,749)(p＝1.04×10-5；fisher精确检验)。nrde2基因上的低频变异包括rs199890497等。
20、使用药品监管信息系统(pharmaceutical regulatory information system，prism)数据库，通过分析发现nrde2蛋白表达水平与细胞对parp抑制剂(如奥拉帕尼)的敏感性呈显著的负相关性。在肝癌细胞系hepg2和huh-7细胞中发现，敲低nrde2将导本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.检测标志物的物质在制备产品中的应用，其特征在于：所述产品用于预测肝癌患者通过PARP抑制剂治疗的获益性或用于预测肝癌细胞对PARP抑制剂的敏感性，所述标志物为NRDE2蛋白。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述物质为用于检测NRDE2蛋白表达量的系统。
3.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于：所述PARP抑制剂为奥拉帕尼。
4.检测NRDE2蛋白的基因是否发生变异的物质在制备产品中的应用，其特征在于：所述产品用于预测肝癌患者通过PARP抑制剂治疗的获益性或用于预测肝癌细胞对PARP抑制剂的敏感性，所述标志物为NRDE2蛋白。
5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于：所述检测NRDE2蛋白的编码基因是否发生变异的物质为检测所述NRDE2蛋白的基因的序列1的第1130位核苷酸突变的物质。
6.根据权利要求4或5所述的应用，其特征在于：所述PARP抑制剂为奥拉帕尼。
7.用于预测肝癌患者通过PARP抑制剂治疗的获益性的装置，其特征在于：所述装置包括蛋白质表达量数据处理模块，所述蛋白质表达量数
8.用于预测肝癌细胞对PARP抑制剂的敏感性的装置，其特征在于：所述装置包括蛋白质表达量数据处理模块，所述蛋白质表达量数据处理模块用于将来自待预测肝癌细胞的NRDE2蛋白表达量转换为敏感性分值，根据所述敏感性分值预测所述待预测肝癌细胞对PARP抑制剂的敏感性。
...【技术特征摘要】
1.检测标志物的物质在制备产品中的应用，其特征在于：所述产品用于预测肝癌患者通过parp抑制剂治疗的获益性或用于预测肝癌细胞对parp抑制剂的敏感性，所述标志物为nrde2蛋白。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述物质为用于检测nrde2蛋白表达量的系统。
3.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于：所述parp抑制剂为奥拉帕尼。
4.检测nrde2蛋白的基因是否发生变异的物质在制备产品中的应用，其特征在于：所述产品用于预测肝癌患者通过parp抑制剂治疗的获益性或用于预测肝癌细胞对parp抑制剂的敏感性，所述标志物为nrde2蛋白。
5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于：所述检测nrde2蛋白的编码基因是否发生变异的物质为检测所述n...
【专利技术属性】
技术研发人员：周钢桥，李元丰，王亚会，刘信燚，
申请(专利权)人：中国人民解放军军事科学院军事医学研究院，
类型：发明
国别省市：
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