System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种高血压诊断标志物及其应用制造技术_技高网

一种高血压诊断标志物及其应用制造技术

技术编号:40101901 阅读:8 留言:0更新日期:2024-01-23 17:49
本发明专利技术涉及生物医学技术领域,尤其是涉及一种高血压诊断标志物及其应用,标志物为Bacteroides faecis。本发明专利技术通过测试受试者的样本中Bacteroides faecis肠道菌株的相对丰度分析收缩压SBP和舒张压DBP的斯皮尔曼相关系数,绘制线性回归曲线,采用ROC曲线和曲线下面积AUC评估受试者是否患有高血压。首次发现了新的与高血压相关的Bacteroides faecis肠道菌株,并将其作为标志物,用于制备诊断或辅助诊断高血压检测工具,为高血压诊断及早期预防提供了有效且可靠的手段,不仅有利于高血压的诊断与分型,而且提高了对高血压的临床病理的认识和理解,为未来高血压的治疗与防治提供了新思路。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物医学,尤其是涉及一种高血压诊断标志物及其应用


技术介绍

1、心血管疾病(cvd)是全球死亡和疾病负担的主要原因,而高血压是中国cvd最重要的且可预防的危险因素之一。众所周知,高血压的影响因素较多,其可能受遗传、环境、年龄以及生活方式等多种因素的影响。

2、近年来,越来越多的研究指出,高血压患者存在肠道菌群失调、肠道屏障功能受损,而恢复菌群和肠道屏障功能或能用于治疗高血压,这也为未来高血压的治疗与防治提供了新的思路。

3、既往研究发现,无论在动物模型还是高血压患者中,肠道菌群与高血压均密切相关。与wky对照鼠相比,自发性高血压大鼠shr微生物丰富度、多样性和均匀度均显著降低,此外厚壁菌门/拟杆菌门比值(f/b比值)增加。在angii构建的高血压动物模型中也发现了相似的结论,即微生物的丰富度降低,f/b比值增高。在高血压患者中,既往研究同样指出,其肠道菌群多样性降低,微生物组成发生变化,一些致病菌如变形杆菌proteobacteria,克雷伯氏菌klebsiella、沙门菌streptococcus等在高血压患者中富集;此外,在孕妇中,有研究指出丁酸盐产生菌属—臭杆菌属odoribacter的丰度与收缩压呈明显负相关。以上研究均提示肠道菌群与高血压的发生发展紧密相连。

4、然而,人体肠道菌群是一个完整的、高度调节的肠道微生态系统,包含着超过100万亿种微生物,其中是否某单一菌株可在高血压诊断及预测发面发挥作用目前尚不清楚。

5、其中,拟杆菌bacteroides隶属于属层级,与血压水平密切相关,其下分有多个种层级。既往有研究发现,拟杆菌属层级的bacteroides ovatus在高血压女性中明显富集。而bacteroides faecis为一种革兰氏阴性,严格厌氧,于2010年首次从人类粪便中分离到的一种新的菌种。既往研究提示,bacteroides faecis与一些精神类疾病具有高度正相关,即bacteroides faecis丰度每增加1个单位,多动症的风险增高9%。另一项使用西式或地中海饮食长期饲养雌性食蟹猴,进一步分析发现,西式饮食组可分为高prevotella copri型和低prevotella copri型两个亚组,发现高prevotella copri型猴子有早期肾功能障碍,而低prevotella copri型为一相对健康状态,而bacteroides faecis在高prevotellacopri型中富集。

6、然而,bacteroides faecis在高血压发生发展过程中的作用暂不明确,本专利技术旨在探索bacteroides faecis菌株在高血压患者表达丰度,探究其与血压的相关性,揭示肠道菌种bacteroides faecis在高血压诊断中的价值,对于高血压的诊断、治疗及远期防控都具有重要意义。


技术实现思路

1、本专利技术的目的在于提供一种高血压诊断标志物及其应用,通过将bacteroidesfaecis肠道菌株作为标志物制备诊断或辅助诊断高血压检测工具,为高血压诊断及早期预防提供了有效且可靠的手段,不仅有利于高血压的诊断与分型,而且提高了对高血压的临床病理的认识和理解,为未来高血压的治疗与防治提供了新思路。

2、第一方面,本专利技术提供一种高血压诊断标志物,所述标志物为bacteroidesfaecis。

3、本专利技术通过对高血压患者肠道菌群特异性筛选,首次发现了新的与高血压相关的肠道菌群分子bacteroides faecis肠道菌株,通过相关性分析发现,bacteroides faecis肠道菌株丰度与收缩压、舒张压均呈明显正相关;同时,roc分析结果表明,megasphaeramicronuciformis肠道菌对高血压有较好的诊断价值,auc可高达0.95以上。

4、因此,本专利技术提出将bacteroides faecis肠道菌株作为标志物,用于制备诊断或辅助诊断、预后评估、疾病监测高血压检测工具,为高血压诊断、早期预防和预后评估、健康监测提供了有效且可靠的手段,不仅有利于高血压的诊断与分型,而且提高了对高血压临床病理的认识和理解,为未来高血压的治疗与防治提供了新思路。

5、第二方面,本专利技术还提供了上述高血压诊断标志物在诊断高血压中的应用,通过测试受试者的样本中bacteroides faecis肠道菌株的相对丰度分析收缩压sbp和舒张压dbp的斯皮尔曼相关系数,绘制线性回归曲线,采用roc曲线和曲线下面积auc评估受试者是否患有高血压。

6、作为本技术方案优选地,因该菌株存在于肠道中,所以受试者的样本具体指受试者的粪便或肠道内容物。

7、作为本技术方案优选地,还包括肠道菌株bacteroides faecis作为标志物在制备诊断或辅助诊断高血压检测工具中的应用;

8、和/或肠道菌株bacteroides faecis作为标志物在制备预后评估高血压检测工具中的应用;

9、和/或肠道菌株bacteroides faecis作为标志物在制备监测高血压疾病进展检测工具中的应用。

10、作为本技术方案优选地,所述检测工具包括用于检测待测样品中bacteroidesfaecis菌株相对丰度的产品。

11、本专利技术在对bacteroides faecis菌株的相对丰度进行测试时,使用宏基因测序的方法,具体步骤如下:

12、1、利用天根生化科技有限公司dp328试剂盒进行粪便样品中细菌dna的提取,通过琼脂糖凝胶电泳分析基因组dna片段的完整性及纯度;利用qubit进行dna浓度的精准定量;

13、2、使用covaris超声波对质检合格的dna样品随机打断,进行dna文库构建;

14、文库构建完成后,通过agilent对文库的insert size进行检测,要求文库的有效浓度需在3nmol/l以上,库检合格后,于illumina novaseq 6000platform进行双端宏基因测序;

15、3、对测序后得到的原始数据进行质控,同时使用soap2进行宿主过滤处理,得到clean data;后通过soap denovo组装软件(版本2.04)进行组装分析;

16、4、利用metagenemark对scaftigs进行开放阅读框预测;使用cd-hit软件对上述开放阅读框的结果进行去冗余处理,得到非冗余的初始gene catalogue;使用soap2软件将各样本的clean data与初始gene catalogue进行比对,即得到unigenes;

17、5、通过diamond软件,将unigenes和ncbi的nr数据库进行比对;采用lca和megan软件的统计分类,将出现的第一个分支前的分类级别,作为该序列的物种注释情况;基于lca注释结果及基因丰度表,即可得到每个样本在不同分类层级中的丰度信息;

18、6、使用wi本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种高血压诊断标志物,其特征在于,所述标志物为Bacteroides faecis。

2.一种权利要求1所述高血压诊断标志物在诊断高血压中的应用,其特征在于,通过测试受试者的样本中Bacteroides faecis肠道菌株的相对丰度分析收缩压SBP和舒张压DBP的斯皮尔曼相关系数,绘制线性回归曲线,采用ROC曲线和曲线下面积AUC评估受试者是否患有高血压。

3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述受试者的样本为粪便或肠道内容物。

4.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,还包括肠道菌株Bacteroides faecis作为标志物在制备诊断或辅助诊断高血压检测工具中的应用;

5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述检测工具包括用于检测待测样品中Bacteroides faecis菌株相对丰度的产品。

6.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述检测工具还包括记载有如下判断标准的载体:待测样品中Bacteroides faecis菌株含量越高,发生高血压的风险越高。

7.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述检测工具还包括对待测样品DNA进行提取和对Bacteroides faecis菌株丰度进行测定所需的试剂。

8.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,还包括Bacteroides faecis菌株在高血压预防或治疗药物筛选中的应用。

9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,所述药物筛选包括通过判定药物对Bacteroides faecis菌株的靶向抑制程度,确定药物是否入选。

10.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述高血压为收缩压≥140mm Hg和/或舒张压≥90mm Hg。

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【技术特征摘要】

1.一种高血压诊断标志物,其特征在于,所述标志物为bacteroides faecis。

2.一种权利要求1所述高血压诊断标志物在诊断高血压中的应用,其特征在于,通过测试受试者的样本中bacteroides faecis肠道菌株的相对丰度分析收缩压sbp和舒张压dbp的斯皮尔曼相关系数,绘制线性回归曲线,采用roc曲线和曲线下面积auc评估受试者是否患有高血压。

3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述受试者的样本为粪便或肠道内容物。

4.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,还包括肠道菌株bacteroides faecis作为标志物在制备诊断或辅助诊断高血压检测工具中的应用;

5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述检测工具包括用于检测待测样品中bacteroides faecis菌株相对丰度的产品...

【专利技术属性】
技术研发人员:董莹李晶王攀陈牧雷钟久昌焦洁
申请(专利权)人:首都医科大学附属北京朝阳医院
类型:发明
国别省市:

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