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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物检测领域,涉及用于妊娠期糖尿病患病风险预测的遗传标志物或试剂盒。
技术介绍
1、妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,gdm)是一种在怀孕期间首次发生或被发现的糖代谢异常的情况,是一种常见的妊娠并发症。gdm在中国妇女中的发病率已高达24.24%。虽然gdm的症状通常在分娩后消退,但它会导致产妇及其子女的近远期健康损害,包括增加2型糖尿病和心血管疾病的风险等。
2、已有研究主要集中于孕早期羊水和血浆实时代谢标记物检测,和单位点或寡位点遗传易感检测。例如:检索中国专利数据库gdm相关数据,专利(201910383683.6)检测妊娠期糖尿病遗传易感性的试剂盒,涉及tcf7l2基因rs290487和mtnr1b基因rs10830963共2个snp位点,这两个位点来自我国孕妇人群回顾性研究,分别入组335、110例,相关研究是针对2个位点分别进行,单独产生结果,合并用于gdm遗传易感性真实世界的合并检测力、灵敏度未知。
3、目前用于检测妊娠期糖尿病患病风险的多基因snp标志物,如专利(cn 101967511a)等所述,相关多基因snp位点来自既往国内外科学文章结果总结,缺乏中国人群特有数据依据。
4、另有专利(cn 114236123 a)纳入16-20周孕妇样本,招募54例gdm样本和57例健康对照进行rna测序分析基因表达,得到5个mrna分子和6个lncrna分子标志物组合,该技术平台依赖于ngs高通量测序,成本较高,未在临床大规模实施,
技术实现思路
1、本专利技术的目的是针对现有技术的上述不足,提供用于妊娠期糖尿病患病风险预测的遗传标志物。
2、本专利技术的另一目的是提供检测所述遗传标志物或其组合的试剂的应用。
3、本专利技术的又一目的是提供一种妊娠期糖尿病患病风险预测试剂盒。
4、本专利技术的目的可通过以下技术方案实现:
5、用于妊娠期糖尿病患病风险预测的遗传标志物或其组合,其特征在于,所述遗传标志物选自以下人基因组snp位点中的任意一种:rs1393210449,rs4566357,rs13059843,rs147522534,rs10830962,rs11188519,rs3769644,rs11642441。
6、表1:gdm各相关基因snp多态性位点核酸序列表;
7、
8、
9、表2.根据snp位点和侧翼序列设计snp检测引物对
10、
11、检测所述的遗传标志物或其组合的试剂在制备妊娠期糖尿病患病风险预测试剂中的应用。
12、作为本专利技术的一种优选,检测所述的遗传标志物或其组合的试剂包括但不限于检测所述的遗传标志物或其组合的dna微阵列或芯片、特异性pcr引物和/或探针、靶向高通量测序试剂中的一种或多种。
13、作为本专利技术的进一步优选,检测rs1393210449的特异性pcr引物如seq id no.1/seq id no.2所示,检测rs4566357的特异性pcr引物如seq id no.3/seq id no.4所示,检测rs13059843的特异性pcr引物如seq id no.5/seq id no.6所示,检测rs147522534的特异性pcr引物如seq id no.7/seq id no.8所示,检测rs10830962的特异性pcr引物如seqid no.9/seq id no.10所示,检测rs11188519的特异性pcr引物如seq id no.11/seq idno.12所示,检测rs3769644的特异性pcr引物如seq id no.13/seq id no.14所示,检测rs11642441的特异性pcr引物如seq id no.15/seq id no.16所示。
14、一种妊娠期糖尿病患病风险预测试剂盒,包含检测所述的遗传标志物或其组合的试剂。所述试剂盒的检测样品包括全血、口腔脱落细胞、唾液、尿液、羊水中的一种或多种。
15、作为本专利技术的一种优选,所述的检测遗传标志物或其组合的试剂为包括但不限于检测所述的遗传标志物或其组合的dna微阵列或芯片、特异性pcr引物或探针、靶向高通量测序试剂中的一种或多种。
16、作为本专利技术的一种优选,检测所述的遗传标志物或其组合的试剂为检测所述snp位点的特异性pcr引物。
17、作为本专利技术的一种优选,检测rs1393210449的特异性pcr引物如seq id no.1/seqid no.2所示,检测rs4566357的特异性pcr引物如seq id no.3/seq id no.4所示,检测rs13059843的特异性pcr引物如seq id no.5/seq id no.6所示,检测rs147522534的特异性pcr引物如seq id no.7/seq id no.8所示,检测rs10830962的特异性pcr引物如seq idno.9/seq id no.10所示,检测rs11188519的特异性pcr引物如seq id no.11/seq idno.12所示,检测rs3769644的特异性pcr引物如seq id no.13/seq id no.14所示,检测rs11642441的特异性pcr引物如seq id no.15/seq id no.16所示。
18、与既往研究技术相比,本专利技术方案解决了以下问题:
19、本专利技术基于国家重点研发计划-基于内外暴露监测的环境和行为因素对胚胎发育与妊娠影响研究,建立的中国环境与遗传因素出生队列,在此基础上进行环境遗传交互作用对胚胎发育与妊娠影响的巢式病例对照研究,对影响胚胎发育与妊娠相关疾病的易感基因和环境遗传交互作用进行筛选识别,建立疾病风险综合预测模型。
20、本专利技术鉴别患有妊娠期糖尿病或相关疾病的风险是通过利用妊娠期糖尿病或相关疾病风险预测模型来实施的,所述预测模型是通过利用来源于已确诊患有妊娠期糖尿病或相关疾病孕妇和健康对照孕妇的生物样品中所述生物标志物组合,依据组间差异性p值和比值比(odds ratio,or),多种统计学方法综合计算。
21、有益效果:
22、遗传因素与gdm的病因学有关,但是系统研究遗传因素与gdm之间的联系的报道十分有限,目前gwas catalog数据库收录的gdm全基因组关联研究报道仅6项。本专利技术研究通过多地域人群队列基因组学研究确定中国人群中gdm在遗传层面的风险因素和机制。对1728例合格的测序数据对应的临床信息进行严格筛选(gdm组:临床诊断仅为gdm,无子痫、甲减等其他妊娠相关疾病;对照组:临床诊断无任何妊娠相关疾病),共获得1610例数据,包括733例g本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.用于妊娠期糖尿病患病风险预测的遗传标志物或其组合,其特征在于,所述遗传标志物选自以下人基因组SNP位点中的任意一种:rs1393210449,rs4566357,rs13059843,rs147522534,rs10830962,rs11188519,rs3769644,rs11642441。
2.检测权利要求1所述的遗传标志物或其组合的试剂在制备妊娠期糖尿病患病风险预测试剂中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于检测权利要求1所述的遗传标志物或其组合的试剂包括但不限于检测权利要求1所述的遗传标志物或其组合的DNA微阵列或芯片、特异性PCR引物或探针、靶向高通量测序试剂中的一种或多种。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于检测rs1393210449的特异性PCR引物如SEQID NO.1/SEQ ID NO.2所示,检测rs4566357的特异性PCR引物如SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4所示,检测rs13059843的特异性PCR引物如SEQ IDNO.5/SEQ ID NO.6所示,检测rs1475225
5.一种妊娠期糖尿病患病风险预测试剂盒,其特征在于包含检测权利要求1所述的遗传标志物或其组合的试剂。
6.根据权利要求5所述的妊娠期糖尿病患病风险预测试剂盒,其特征在于所述的检测权利要求1所述的遗传标志物或其组合的试剂为包括但不限于检测权利要求1所述的遗传标志物或其组合的DNA微阵列或芯片、特异性PCR引物或探针、靶向高通量测序试剂中的一种或多种。
7.根据权利要求5或6所述的试剂盒,其特征在于所述的检测权利要求1所述的遗传标志物或其组合的试剂为检测所述SNP位点的特异性PCR引物。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于检测rs1393210449的特异性PCR引物如SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2所示,检测rs4566357的特异性PCR引物如SEQ ID NO.3/SEQ IDNO.4所示,检测rs13059843的特异性PCR引物如SEQ IDNO.5/SEQ ID NO.6所示,检测rs147522534的特异性PCR引物如SEQ ID NO.7/SEQ IDNO.8所示,检测rs10830962的特异性PCR引物如SEQ ID NO.9/SEQ ID NO.10所示,检测rs11188519的特异性PCR引物如SEQ IDNO.11/SEQ ID NO.12所示,检测rs3769644的特异性PCR引物如SEQ ID NO.13/SEQ IDNO.14所示,检测rs11642441的特异性PCR引物如SEQ ID NO.15/SEQ ID NO.16所示。
9.根据权利要求8所述的试剂盒,其特征在于所述的试剂盒还包括Taq酶、dNTP混合液、MgCl2溶液、PCR反应缓冲液和去离子水。
...【技术特征摘要】
1.用于妊娠期糖尿病患病风险预测的遗传标志物或其组合,其特征在于,所述遗传标志物选自以下人基因组snp位点中的任意一种:rs1393210449,rs4566357,rs13059843,rs147522534,rs10830962,rs11188519,rs3769644,rs11642441。
2.检测权利要求1所述的遗传标志物或其组合的试剂在制备妊娠期糖尿病患病风险预测试剂中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于检测权利要求1所述的遗传标志物或其组合的试剂包括但不限于检测权利要求1所述的遗传标志物或其组合的dna微阵列或芯片、特异性pcr引物或探针、靶向高通量测序试剂中的一种或多种。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于检测rs1393210449的特异性pcr引物如seqid no.1/seq id no.2所示,检测rs4566357的特异性pcr引物如seq id no.3/seq id no.4所示,检测rs13059843的特异性pcr引物如seq idno.5/seq id no.6所示,检测rs147522534的特异性pcr引物如seq id no.7/seq id no.8所示,检测rs10830962的特异性pcr引物如seq id no.9/seq id no.10所示,检测rs11188519的特异性pcr引物如seq idno.11/seq id no.12所示,检测rs3769644的特异性pcr引物如seq id no.13/seq idno.14所示,检测rs11642441的特异性pcr引物如seq id no.15/seq id no.16所示。
5.一...
【专利技术属性】
技术研发人员:商学军,赵世刚,郭婷,孙怡,刘朋飞,
申请(专利权)人:中国人民解放军东部战区总医院,
类型:发明
国别省市:
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