System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 玉米甜味相关SNP位点及其应用制造技术_技高网

玉米甜味相关SNP位点及其应用制造技术

技术编号:39938400 阅读:15 留言:0更新日期:2024-01-08 22:22
本发明专利技术公开了玉米甜味相关SNP位点并进行了应用开发,基于选定SNP位点的基因信息开发分子标记,在分子育种早期检测玉米植株基因组内甜度相关SNP的基因型,由此进行玉米品种的选育;所述甜度相关SNP包括ZmSNP_chr3.13位点和/或ZmSNP_chr3.16位点;所述ZmSNP_chr3.13位点的核苷酸种类为C或T;所述ZmSNP_chr3.16位点的核苷酸种类为G或A。本发明专利技术能够通过新玉米甜味基因位点的开发以提高玉米高甜品种的选育效率。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及分子生物,尤其涉及玉米甜味相关snp位点及其应用。


技术介绍

1、玉米(zea mays)是全球产量最大的作物,也是我国产量最大的粮食品种。甜玉米是玉米的一个品种,有丰富的营养、甜、鲜、脆、嫩的特色而深受各阶层消费者青睐,具有减肥、降血压降血脂、增加记忆力、明目等功效。因此,选育甜味玉米是玉米育种的重要方向。

2、通过分子标记辅助选择技术进行育种是提高玉米育种效率的有效途径,通过利用分子标记在植物发育初期在基因水平对植株进行定向选择,弥补了传统育种中出现的诸多弊端(尹祥佳,李晶,王雅琳,等.snp标记在玉米分子育种中的应用[j].中国种业,2021(4):4.)。目前,玉米甜味基因研究较少,如shrunken2(索海翠.甜玉米甜度基因shrunken2序列分析及分子标记研究[d].中山大学,2016.)。

3、由此可见,开发新的玉米甜味基因既为深入研究玉米甜味机理提供理论基础,又为高甜玉米品种选育提供了技术支撑,是当下亟需研究的一个重要技术课题。


技术实现思路

1、本专利技术要解决的技术问题是开发新的玉米甜味相关snp位点并探索其在玉米育种当中的应用。

2、为解决上述技术问题,本专利技术所采取的技术方案如下。

3、一种试剂盒,该试剂盒中至少包含玉米基因组模板dna,dntp,缓冲液,尤其包含用于检测/区分玉米甜度相关单核苷酸多态性位点zmsnp_chr3.13的基因型的引物。

4、作为本专利技术的一种优选技术方案,所述玉米甜度相关单核苷酸多态性位点zmsnp_chr3.13对应于序列表中seq id no.1的第101位核苷酸,其碱基为c或t;当所述zmsnp_chr3.13位点的基因型为c/c纯合时,相较其他基因型玉米具有更高的甜度。

5、作为本专利技术的一种优选技术方案,所述引物包含:具有seq id no.3所示核苷酸序列的前引物1、具有seq id no.4所示核苷酸序列的前引物2、具有seq id no.5所示核苷酸序列的后引物。

6、上述试剂盒的用途,在玉米育种早期基于分子标记辅助选择mas技术用于辅助区分和/或辅助鉴定待测玉米的甜度和/或待测玉米的甜味物质含量。

7、一种试剂盒,该试剂盒中至少包含玉米基因组模板dna,dntp,缓冲液,尤其包含用于检测/区分玉米甜度相关单核苷酸多态性位点zmsnp_chr3.16的基因型的引物。

8、作为本专利技术的一种优选技术方案,所述玉米甜度相关单核苷酸多态性位点zmsnp_chr3.16对应于序列表中seq id no.2的第101位核苷酸,其碱基为g或a;当所述zmsnp_chr3.13位点的基因型为g/g纯合时,相较其他基因型玉米具有更高的甜度。

9、作为本专利技术的一种优选技术方案,所述引物包含:具有seq id no.6所示核苷酸序列的前引物1、具有seq id no.7所示核苷酸序列的前引物2、具有seq id no.8所示核苷酸序列的后引物。

10、上述试剂盒的用途,在玉米育种早期基于分子标记辅助选择mas技术用于辅助区分和/或辅助鉴定待测玉米的甜度和/或待测玉米的甜味物质含量。

11、控制玉米中甜味物质含量和/或控制玉米甜度的分子育种方法,基于选定snp位点的基因信息开发分子标记,在分子育种早期检测玉米植株基因组内甜度相关snp的基因型,由此进行玉米品种的选育;所述甜度相关snp包括zmsnp_chr3.13位点和/或zmsnp_chr3.16位点;所述zmsnp_chr3.13位点的核苷酸种类为c或t,为序列表中seq id no.1的第101位核苷酸;所述zmsnp_chr3.16位点的核苷酸种类为g或a,为序列表中seq id no.2的第101位核苷酸;当所述zmsnp_chr3.13位点的基因型为c/c纯合时,和/或所述zmsnp_chr3.13位点的基因型为g/g纯合时,相较其他基因型玉米具有更高的甜度。

12、引物对组合,包括由seq id no.3、seq id no.4、seq id no.5组成的引物对,和/或由seq id no.6、seq id no.7、seq id no.8组成的引物对;两组引物对单独或组合用于玉米甜度相关snp基因型的检测或辅助检测,或者用于玉米甜度表型的鉴定或辅助鉴定。

13、采用上述技术方案所产生的有益效果在于:本专利技术通过新玉米甜味基因位点的开发以提高玉米高甜品种的选育效率。本专利技术利用玉米甜味差异材料制备定位群体,挖掘与甜味相关的基因位点,该位点可用于商业化玉米甜味分子育种;例如基于分子标记辅助选择mas技术,可在育种早期进行分子标记辅助选择,淘汰甜味低的玉米单株,降低育种成本,加快高甜玉米品种选育的进程。

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【技术保护点】

1.一种试剂盒,该试剂盒中至少包含玉米基因组模板DNA,dNTP,缓冲液,尤其包含用于检测/区分玉米甜度相关单核苷酸多态性位点ZmSNP_chr3.13的基因型的引物。

2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:所述玉米甜度相关单核苷酸多态性位点ZmSNP_chr3.13对应于序列表中SEQ ID No.1的第101位核苷酸,其碱基为C或T;当所述ZmSNP_chr3.13位点的基因型为C/C纯合时,相较其他基因型玉米具有更高的甜度。

3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:所述引物包含:具有SEQ ID NO.3所示核苷酸序列的前引物1、具有SEQ ID NO.4所示核苷酸序列的前引物2、具有SEQ ID NO.5所示核苷酸序列的后引物。

4.权利要求1或2或3所述的试剂盒的用途,其特征在于:在玉米育种早期基于分子标记辅助选择MAS技术用于辅助区分和/或辅助鉴定待测玉米的甜度和/或待测玉米的甜味物质含量。

5.一种试剂盒,该试剂盒中至少包含玉米基因组模板DNA,dNTP,缓冲液,尤其包含用于检测/区分玉米甜度相关单核苷酸多态性位点ZmSNP_chr3.16的基因型的引物。

6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于:所述玉米甜度相关单核苷酸多态性位点ZmSNP_chr3.16对应于序列表中SEQ ID No.2的第101位核苷酸,其碱基为G或A;当所述ZmSNP_chr3.13位点的基因型为G/G纯合时,相较其他基因型玉米具有更高的甜度。

7.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于:所述引物包含:具有SEQ ID NO.6所示核苷酸序列的前引物1、具有SEQ ID NO.7所示核苷酸序列的前引物2、具有SEQ ID NO.8所示核苷酸序列的后引物。

8.权利要求5或6或7所述的试剂盒的用途,其特征在于:在玉米育种早期基于分子标记辅助选择MAS技术用于辅助区分和/或辅助鉴定待测玉米的甜度和/或待测玉米的甜味物质含量。

9.控制玉米中甜味物质含量和/或控制玉米甜度的分子育种方法,其特征在于:基于选定SNP位点的基因信息开发分子标记,在分子育种早期检测玉米植株基因组内甜度相关SNP的基因型,由此进行玉米品种的选育;所述甜度相关SNP包括ZmSNP_chr3.13位点和/或ZmSNP_chr3.16位点;所述ZmSNP_chr3.13位点的核苷酸种类为C或T,为序列表中SEQ IDNo.1的第101位核苷酸;所述ZmSNP_chr3.16位点的核苷酸种类为G或A,为序列表中SEQ IDNo.2的第101位核苷酸;当所述ZmSNP_chr3.13位点的基因型为C/C纯合时,和/或所述ZmSNP_chr3.13位点的基因型为G/G纯合时,相较其他基因型玉米具有更高的甜度。

10.引物对组合,包括由SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5组成的引物对,和/或由SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.8组成的引物对;两组引物对单独或组合用于玉米甜度相关SNP基因型的检测或辅助检测,或者用于玉米甜度表型的鉴定或辅助鉴定。

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【技术特征摘要】

1.一种试剂盒,该试剂盒中至少包含玉米基因组模板dna,dntp,缓冲液,尤其包含用于检测/区分玉米甜度相关单核苷酸多态性位点zmsnp_chr3.13的基因型的引物。

2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:所述玉米甜度相关单核苷酸多态性位点zmsnp_chr3.13对应于序列表中seq id no.1的第101位核苷酸,其碱基为c或t;当所述zmsnp_chr3.13位点的基因型为c/c纯合时,相较其他基因型玉米具有更高的甜度。

3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于:所述引物包含:具有seq id no.3所示核苷酸序列的前引物1、具有seq id no.4所示核苷酸序列的前引物2、具有seq id no.5所示核苷酸序列的后引物。

4.权利要求1或2或3所述的试剂盒的用途,其特征在于:在玉米育种早期基于分子标记辅助选择mas技术用于辅助区分和/或辅助鉴定待测玉米的甜度和/或待测玉米的甜味物质含量。

5.一种试剂盒,该试剂盒中至少包含玉米基因组模板dna,dntp,缓冲液,尤其包含用于检测/区分玉米甜度相关单核苷酸多态性位点zmsnp_chr3.16的基因型的引物。

6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于:所述玉米甜度相关单核苷酸多态性位点zmsnp_chr3.16对应于序列表中seq id no.2的第101位核苷酸,其碱基为g或a;当所述zmsnp_chr3.13位点的基因型为g/g纯合时,相较其他基因型玉米具有更高的甜度。

7.根据权利要求5所述...

【专利技术属性】
技术研发人员:穆春华刘霞冷冰莹姚国旗闫振伟张发军杨菲曹冰杨君成
申请(专利权)人:山东省农业科学院
类型:发明
国别省市:

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