用于烟草晚花多叶表型位点制造技术

本申请公开了一种用于烟草晚花多叶表型位点

【技术实现步骤摘要】
用于烟草晚花多叶表型位点lot辅助选择的分子标记及其应用


[0001]本专利技术属于分子生物
，具体涉及一种用于烟草晚花多叶表型位点
lot
辅助选择的分子标记及其应用
。

技术介绍

[0002]叶片是最基本的植物器官，是主要的光合作用场所，是绿色植物产量形成的主要器官
。
叶片的大小
、
数目等特性是叶用经济作物产量和质量的重要决定因素，解析叶片的形成和发育对于提升叶用经济作物的产量和品质具有重要作用，也是叶用经济作物进行精准可控生产的前提条件
。
[0003]烟草是以叶片为收获目标的经济作物，单株叶片数是烤烟产量性状的主要指标，通过对不同叶片数表现的品种间研究表明叶数与产量的相关性为极显著的正相关
。
叶片数也是烟草产量构成因素中受遗传特性影响最大的因素，广义遗传力可达
72
％以上，其遗传改良成效最为显著
。
[0004]加强叶片数目的分子遗传基础研究，有助于培育具有产量优势的叶用经济作物新品种
。
[0005]分子标记辅助选择育种建立在
QTL
作图和基因定位的研究基础上，选用与目标基因紧密连锁的分子标记，筛选具有特定基因型的后代个体，并结合常规育种方法选育优良品种
。
其中，与遗传位点紧密连锁的分子标记是辅助育种的核心
。
[0006]然而，现有技术中缺乏与烟叶叶片数相关
QTL/
基因紧密连锁的分子标记，无法采用该方法对烟叶叶片数量性状进行高效育种筛选
。

技术实现思路

[0007]本申请提供了一种用于烟草晚花多叶表型调控位点
lot
辅助选择的分子标记及其应用，用于实现对
lot
位点辅助选择育种利用
。
[0008]本申请提供了一种烟草晚花多叶表型位点
lot
，该位点为烟草品种“云烟
97”自然突变产生，
lot
位点定位区间位于烟草基因组
LG16
染色体的第
11,931,971
位至第
12,959,737
位之间的物理区段，该区段内含有不表达的
NtFT5
基因
。
[0009]本申请获取上述烟草晚花多叶表型位点
lot
后，能将其用于对具有晚花多叶表型的烟草植株的选育中，提高目标表型生物材料的选育效率
。
[0010]优选地，所述烟草基因组的版本为烟草品种
‘
Beinhart1000
‑1’
的基因组
v1.0。
[0011]本申请的另一方面提高了一种烟草晚花多叶表型位点
lot
在选育晚花多叶表型烟草中的应用
。
[0012]本申请的另一方面还提供了一种检测所述的一种烟草晚花多叶表型调控位点
lot
的
SSR
标记，包括：标记
SR14398
和标记
SR14348
；
[0013]扩增所述标记
SR14398
的上下游引物分别如
SEQ ID NO:3
和
SEQ ID NO:4
；
[0014]扩增所述标记
SR14348
的上下游引物分别如
SEQ ID NO:9
和
SEQ ID NO:10。
[0015]标记
SR14398
和标记
SR14348
均为烟草晚花多叶表型调控位点
lot
的侧翼标记
(Flanking markers)
，二者分别位于烟草晚花多叶表型调控位点
lot
的左侧和右侧
(
按染色体物理位置从小到大方向
)。
本领域公知，靶标座位某一侧的侧翼标记与靶标座位的遗传距离为
5cM
时，该标记检测靶标座位的可靠性为
95
％；靶标座位某一侧的侧翼标记与靶标位点的遗传距离为
4cM
时，该标记检测靶标位点的可靠性为
96
％；靶标座位两侧的侧翼标记与靶标座位的遗传距离均
≤5cM
时，该两侧的标记检测靶标座位的可靠性为
99.6
％
。
因标记
SR14398
和标记
SR14348
与烟草晚花多叶表型调控位点
lot
的遗传距离均小于
5cM
，若检测结果能够同时检出标记
SR14398
和标记
SR14348
，则说明待测材料中烟草晚花多叶表型调控位点
lot
存在的可能性或准确率至少在
95
％以上
。
[0016]所述的一种检测烟草晚花多叶表型调控位点
lot
的
SSR
标记，还包括：标记
SR14385
和标记
SR14375
；
[0017]扩增所述标记
SR14385
的上下游引物分别如
SEQ ID NO:5
和
SEQ ID NO:6
；
[0018]扩增所述标记
SR14375
的上下游引物分别如
SEQ ID NO:7
和
SEQ ID NO:8。
[0019]标记
SR14385
位于烟草晚花多叶表型调控位点
lot
的中间位置，虽然该标记与靶标座位
lot
连锁最紧密，但因其不属于功能标记，单独用该标记扩增待测材料无法可靠鉴别靶标位点
。
标记
SR14375
位于烟草晚花多叶表型调控位点
lot
置信区间内
NtFT5
基因的序列区段，虽然该标记与
NtFT5
基因连锁最紧密，但因其为显性标记，单独用该标记扩增待测材料无法可靠鉴别靶标位点的杂合基因型
。
在没有可靠功能标记的情况下，一般是需要两侧的侧翼标记来卡住靶标位点的位置；对于二维线性染色体需要两点来确定靶标所在的中间范围的准确性，两侧的侧翼标记与
lot
供体亲本变异
97
的带型一样，则可认为中间所携带的染色体片段与多叶材料变异
97
一样，即待测携带了靶标座位
lot
，因此需要将
SR14385、
标记
SR14375
与标记
SR14398、
标记
SR14348
联用，如果待测材料出现多态性与变异
97
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种烟草晚花多叶表型位点
lot
，其特征在于，该位点为突变产生，
lot
位点定位区间位于烟草基因组
LG16
染色体的第
11,931,971
位至第
12,959,737
位之间的物理区段，该区段内含有不表达的
NtFT5
基因，如
SEQ ID NO:13
所示
。2.
根据权利要求1所述的一种烟草晚花多叶表型位点
lot
，其特征在于，所述烟草基因组的版本为烟草品种
‘
Beinhart1000
‑1’
的基因组
v1.0。3.
如权利要求1或2所述的一种烟草晚花多叶表型位点
lot
在选育晚花多叶表型烟草中的应用
。4.
如权利要求1或2所述的一种烟草晚花多叶表型位点
lot
来源于烟草品种“云烟
97”的自然突变体“变异
97”。5.
一种用于烟草晚花多叶表型位点
lot
辅助选择分子标记，其特征在于，如权利要求1或2所述突变位点
lot
的紧密连锁
SSR
分子标记为：
SR14398
，扩增所述标记
SR14398
的上下游引物分别如
SEQ ID NO:3
和
SEQ ID NO:4
；
SR14348
，扩增所述标记
SR14348
的上下游引物分别如
SEQ ID NO:9
和
SEQ ID NO:10
；
SR14165
，扩增所述标记
SR14165
的上下游引物分别如
SEQ ID NO:1
和
SEQ ID NO:2
；
SR14385
，扩增所述标记
SR14385
的上下游引物分别如
SEQ ID NO:5
和
SEQ ID NO:6
；
SR14375
，扩增所述标记
SR14375
的上下游引物分别如
SEQ ID NO:7
和
SEQ ID NO:8HSR4014
，扩增所述标记
HSR4014
的上下游引物分别如
SEQ ID NO:11
和
...

【专利技术属性】
技术研发人员：冯智宇，吴兴富，童治军，焦芳婵，黄昌军，陈学军，肖炳光，李永平，
申请(专利权)人：云南省烟草农业科学研究院，
类型：发明
国别省市：