鉴别新型冠状病毒制造技术

本发明专利技术提供了鉴别新型冠状病毒

【技术实现步骤摘要】
鉴别新型冠状病毒Omicron株BA.4亚系的引物和探针组合物、试剂盒和应用


[0001]本专利技术是关于鉴别新型冠状病毒
Omicron
株
BA.4
亚系的引物
、
探针及其应用，更具体地说是关于针对新型冠状病毒
Omicron
株
BA.4
亚系
ORF1a
基因
Δ
141
‑
143
突变位点的引物
、
探针
、
试剂盒和检测方法，属于分子生物学检测

。

技术介绍

[0002]由新型冠状病毒
(SARS
‑
CoV
‑
2)
引起的新型冠状病毒感染
(COVID
‑
19)
严重危害了全球公共卫生安全和人民的生命健康
。
新冠病毒的基因组与其它病毒相比极易发生突变，导致该病毒的传播能力和致病性增强，并且降低现有疫苗的保护效果
。Omicron
变异株出现后，成为全球主要流行毒株，被
WHO
评为第五种“关切变异株”(Variants of Concern
，
VOC)。
该毒株在短短一年多的时间内发生了多次变异，据
CoVariants
网站统计，目前已有
11
种亚系，分别是
BA.1、BA.2、BA.3、BA.4、BA.5、BA.2.12.1、BA.2.75、BQ.1、XBB、XBB.1.5、XBB.1.16。
对新冠流行毒株的密切监测有利于疫情的精准防控
。
自疫情以来，我们致力于开发能够快速
、
准确鉴别新冠流行毒株的方法，目前已经成功开发了鉴别
BA.1
亚系
(
专利号
CN114561497B)
和
BA.3
亚系
(
专利号
CN114592097B)
的方法
。
本专利技术主要为一种快速
、
准确鉴别
BA.4
亚系的
qPCR
方法
。

技术实现思路

[0003]本专利技术的一个目的在于提供两种用于鉴别新型冠状病毒
Omicron
株
BA.4
亚系的引物探针组合
。
[0004]本专利技术的另一目的在于提供一种用于鉴别新型冠状病毒
Omicron
株
BA.4
亚系的试剂盒
。
[0005]本专利技术的另一目的在于提供所述引物
、
探针或试剂盒用于鉴别新型冠状病毒
Omicron
株
BA.4
亚系的相关应用
。
[0006]本专利技术提供的第一种鉴别新型冠状病毒
Omicron
株
BA.4
亚系的引物和探针的组合物，其包括如
SEQ ID NO.1
所示序列的上游引物，如
SEQ ID NO.2
所示序列的下游引物，如
SEQ ID NO.3
所示序列的探针：5’‑ꢀ
TAAGAACGGTAATAAAGGAGCTG
ꢀ‑3’
(SEQ ID NO.1)
；5’‑ꢀ
GAAAATCTTCATAAGGATCAGTGC
ꢀ‑3’ꢀ
(SEQ ID NO.2)
；5’‑ꢀ
CCGATCTAGACTTAGGC
ꢀ‑3’ꢀ
(SEQ ID NO.3)。
[0007]本专利技术提供的第二种鉴别新型冠状病毒
Omicron
株
BA.4
亚系的引物和探针的组合物，其包括如
SEQ ID NO.4
所示序列的上游引物，如
SEQ ID NO.5
所示序列的下游引物，如
SEQ ID NO.6
所示序列的探针：5’‑ꢀ
GAACGGTAATAAAGGAGCTGGTG
ꢀ‑3’
(SEQ ID NO.4)
；5’‑ꢀ
GAAAATCTTCATAAGGATCAGTGCC
ꢀ‑3’ꢀ
(SEQ ID NO.5)
；
5
’‑ꢀ
GCCGATCTAGACTTAGGCG
ꢀ‑3’ꢀ
(SEQ ID NO.6)。
[0008]根据本专利技术的具体实施方式，所述探针可以是经荧光基团修饰的，所述修饰包括：探针序列5’
端碱基采用荧光报告基团修饰，同时探针序列3’
端碱基采用荧光淬灭基团修饰
。
[0009]另一方面，本专利技术还提供了两种鉴别新型冠状病毒
Omicron
株
BA.4
亚系的试剂盒，其包含：本专利技术所述的第一种引物和探针的组合物，和
/
或本专利技术所述的第二种引物和探针的组合物
。
[0010]根据本专利技术的具体实施方式，本专利技术的试剂盒，其中还包括
PCR
反应试剂和
/
或反应缓冲液
。
[0011]根据本专利技术的具体实施方式，本专利技术的试剂盒，其中还包括阳性质控品；优选地，所述阳性质控品包括新型冠状病毒
Omicron
株
BA.4
亚系
ORF1a
基因部分序列的标准质粒模板
。
[0012]另一方面，本专利技术还提供了所述的两种引物和探针的组合物或所述的试剂盒在体外鉴别样品中是否存在新型冠状病毒
Omicron
株
BA.4
亚系的非诊断目的应用
。
即，本专利技术还提供了两种体外鉴别样品中是否存在新型冠状病毒
Omicron
株
BA.4
亚系的方法
。
[0013]根据本专利技术的具体实施方式，本专利技术的应用中，通过
PCR
反应鉴别样品中是否存在新型冠状病毒
Omicron
株
BA.4
亚系，所述引物中每一条在
PCR
反应体系中的终浓度为1‑
10
μ
M
，所述探针在
PCR
反应体系中的终浓度为1‑
10
μ
M。
[0014]根据本专利技术的具体实施方式，本专利技术的应用中，所述
PCR
可以为单重
PCR、
多重
PCR、
数字
PCR
或
RT
‑
PCR。
[0015]在本专利技术的一些具体实施方式中，本专利技术的应用中，所述
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1. 一种鉴别新型冠状病毒
Omicron
株
BA.4
亚系的引物和探针的组合物，其特征在于，所述引物包括
SEQ ID NO.1
所示序列的上游引物和
SEQ ID NO.2
所示序列的下游引物，所述探针包括
SEQ ID NO.3
所示序列的探针：
SEQ ID NO.1
：5’‑ꢀ
TAAGAACGGTAATAAAGGAGCTG
ꢀ‑3’
；
SEQ ID NO.2
：5’‑ꢀ
GAAAATCTTCATAAGGATCAGTGC
ꢀ‑3’
；
SEQ ID NO.3
：5’‑ꢀ
CCGATCTAGACTTAGGC
ꢀ‑3’
。2. 一种鉴别新型冠状病毒
Omicron
株
BA.4
亚系的引物和探针的组合物，其特征在于，所述引物包括
SEQ ID NO.4
所示序列的上游引物和
SEQ ID NO.5
所示序列的下游引物，所述探针包括
SEQ ID NO.6
所示序列的探针：
SEQ ID NO.4
：5’‑ꢀ
GAACGGTAATAAAGGAGCTGGTG
ꢀ‑3’
；
SEQ ID NO.5
：5’‑ꢀ
GAAAATCTTCATAAGGATCAGTGCC
ꢀ‑3’
；
SEQ ID NO.6
：5’‑ꢀ
GCCGATCTAGACTTAGGCG
ꢀ‑3’
。3.
根据权利要求1或2所述的组合物，其特征在于，所述探针是经荧光基团修饰的，所述修饰包括：探针序列5’
端碱基采用荧光报告基团修饰，同时探针序列3’
端碱基采用荧光淬灭基团修饰
。4.
一种鉴别新型冠状病毒
Omicron
株
BA.4
亚系的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含：权利要求1所述的引物和探针的组合物
。5.

【专利技术属性】
技术研发人员：张云涛，王展慧，赵玉秀，张晓楠，郭彦岑，何振玉，贺瑶，
申请(专利权)人：北京生物制品研究所有限责任公司，
类型：发明
国别省市：