【技术实现步骤摘要】
水稻镉吸收主效基因OsNramp5的SNP分子标记的应用以及检测方法
[0001]本申请属于植物分子育种
，尤其涉及一种水稻镉吸收主效基因
OsNramp5
的
SNP
分子标记的应用以及检测方法
。
技术介绍
[0002]稻米被镉污染，影响了粮食安全
。
培育低镉水稻品种则是最经济有效的应对手段
。
水稻
OsNramp5
基因编码的蛋白是水稻根部细胞参与二价阳离子的主要转运蛋白，主要吸收
Mn
2+
，
Cd
2+
，
Fe
2+
，同时负责这些离子从根部向地上部的运输
。
[0003]相关技术中，使用
Indel
分子标记检测，步骤繁琐且耗时长，对于大量检测具有局限性，而且对基因型辨别的精准度也不够
。
[0004]因此，建立一种新的基于
PCR
技术的基因分型方法来快速
、
准确地鉴定水稻镉低吸收突变体基因
OsNramp5
的基因型将有助于提高水稻低镉育种的效率
。
技术实现思路
[0005]本申请实施例提供一种水稻镉吸收主效基因
OsNramp5
的
SNP
分子标记的应用以及检测方法，旨在提供一种新的检测水稻低镉育种的分子标记位点
。
[0006]第一方面，本申请提供一种水稻
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.
一种水稻镉吸收主效基因
OsNramp5
的
SNP
分子标记在水稻育种或水稻种质资源改良中的应用，所述
SNP
分子标记位于水稻第7号染色体第
8878412bp
处，所述
SNP
分子标记的多态性为
C/T。2.
根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述
SNP
分子标记的多态性为
T。3.
根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述基因
OsNramp5
的编码区如
SEQ ID NO.1
所示
。4.
根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述
SNP
分子标记位于所述
SEQ ID NO.1
核苷酸序列自5’
端起第
132
位，其碱基为
C
或
T。5.
根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述水稻育种中的应用为鉴定镉低积累水稻品种
。6.
一种检测镉低积累水稻的方法，其特征在于，包括以下步骤：
(1)
提取待测水稻基因组
DNA
，以其为模板，利用引物组合进行
KASP
反应检测；所述
KASP
引物组合由两条特异性引物和一条通用引物组成，其核苷酸序列为：
1)
两条特异性引物：引物
X
：5’‑
GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGAGCCTGCATGGAAAAGGTTC
‑3’
；引物
Y
：5’‑
GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGAGCCTGCATGGAAAAGGTTT
‑3’
；
2)
一条通用引物：引物
C
：5’‑
ATCCAAGTAGGCTAAAGACACCAT
‑3’
；
(2)
检测扩增产物片段中所述基因
OsNramp5
的编码区序列自5’
端起第
132
位的碱基种类，若碱基种类为
T
，则待测水稻为镉低积累水稻，若碱基种...
【专利技术属性】
技术研发人员：杨远柱，周延彪，唐倩莹，赵新辉，常兰，唐晓丹，周群丰，
申请(专利权)人：湖南亚华种业科学研究院湖南隆平高科种业科学研究院有限公司，
类型：发明
国别省市：
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