【技术实现步骤摘要】
一种用于检测人圆环病毒的LAMP引物组及试剂盒
[0001]本专利技术属于病毒检测
。
更具体地,涉及一种用于检测人圆环病毒的
LAMP
引物组及试剂盒
。
技术介绍
[0002]圆环病毒是一类无包膜的单链
DNA
病毒,具有圆形对称性,现已在多种宿主中被发现,包括鸟类
、
鱼类
、
昆虫和哺乳动物等
。
猪圆环病毒
(PCV)
是圆环病毒科已知的最小的病毒,尽管缺乏
PCV
从动物到人类的人畜共患传播的直接证据,但一些研究报告在人类样本中检测到了
PCV1
或
PCV2。
此外,
PCV3
已被证明能够感染非人类灵长类动物
。
这些发现表明了圆环病毒存在人畜共患传播的潜在风险,以及新型圆环病毒可能在人类中存在
。
现确也已发现了2种能感染人的新型圆环病毒
。
[0003]法国巴斯德研究所报告了一种能感染人类的新型圆环病毒,定名为人圆环病毒1型
(HCirV
‑1,后面简称为
HuCV
‑
1)。
另有研究人员检测到了与
PCV3
相关的病毒序列,并组装了一个完整的环状基因组
。
根据系统发育分析和遗传距离分析,证明该病毒可能代表一种新型人圆环病毒
(HuCV
‑
2)。 >[0004]人圆环病毒
(HuCV)
是对人类具有致病性的新型病毒,尚不能排除该病毒与肝炎的相关性,但目前仍未明确其传播方式
。
在感染仍无法解释时,能够确定一种新的病原体并开发相应的检测方法是至关重要的
。
即开发
HuCV
病毒感染的早期快速诊断试剂对由此感染导致的一些疾病的防治具有关键的作用
。
现有技术中虽已有针对人圆环病毒1型和2型的荧光定量
qPCR
的检测引物和方法,但基于荧光定量
PCR
检测需要昂贵的仪器,且
PCR
检测时间长,不利于推广应用
。
[0005]环介导等温扩增技术
(loop
‑
mediated isothermal amplification
,
LAMP)
具有操作简单
、
产物易检测
、
对仪器设备要求低等特点,利用水浴锅或恒温箱就能实现反应,且环介导等温扩增反应的结果可以通过肉眼判断,适合基层快速诊断
。
由于人圆环病毒的基因组序列短,仅有
2000nt
,在有限区段内想要设计获得可同时区分
HuCV
‑1和
HuCV
‑2的
LAMP
引物十分困难,目前也暂未开发出能够快速
、
准确的检测人圆环病毒的
LAMP
引物组及相应的检测试剂盒
。
技术实现思路
[0006]本专利技术针对现有检测人圆环病毒技术的不足,提供了一种用于检测人圆环病毒的
LAMP
引物组及试剂盒
。
[0007]本专利技术的第一个目的是提供一种用于检测人圆环病毒1型的
LAMP
引物组
。
[0008]本专利技术的第二个目的是提供一种用于检测人圆环病毒2型的
LAMP
引物组
。
[0009]本专利技术的第三个目的是提供一种用于检测人圆环病毒的
LAMP
引物组
。
[0010]本专利技术的第四个目的是提供上述检测人圆环病毒的
LAMP
引物组在制备人圆环病毒检测试剂或试剂盒中的应用
。
[0011]本专利技术的第五个目的是提供一种检测人圆环病毒的
LAMP
试剂盒
。
本专利技术上述目的通过以下技术方案实现:
[0012]本专利技术针对人圆环病毒1型
(HuCV
‑1,基因组登录号
GenBank
:
ON677309)
和人圆环病毒2型
(HuCV
‑2,基因组登录号
GenBank
:
ON226770)
的
CAP
基因序列,分别设计得到了可特异性检测
HuCV
‑1或
HuCV
‑2的
LAMP
引物组
。
此外,利用所述
LAMP
引物组,还可在单管反应中同时实现对
HuCV
‑1和
HuCV
‑2的检测
。
[0013]本专利技术提供了一种用于检测人圆环病毒1型的
LAMP
引物组,包括
SEQ ID NO:1
所示外侧引物
F3、SEQ ID NO:2
所示外侧引物
B3、SEQ ID NO:3
所示内侧引物
FIP、SEQ ID NO:4
所示内侧引物
BIP、SEQ ID NO:5
所示环引物
LF
和
SEQ ID NO:6
所示环引物
LB。
[0014]本专利技术还提供了一种用于检测人圆环病毒2型的
LAMP
引物组,包括
SEQ ID NO:7
所示外侧引物
F3、SEQ ID NO:8
所示外侧引物
B3、SEQ ID NO:9
所示内侧引物
FIP、SEQ ID NO:10
所示内侧引物
BIP
和
SEQ ID NO:11
所示环引物
LB
‑
3。
[0015]本专利技术还提供一种用于检测人圆环病毒的
LAMP
引物组,包括上述用于检测人圆环病毒1型和2型的
LAMP
引物组
。
[0016]具体地,
SEQ ID NO:5
所示环引物
LF
和
/
或
SEQ ID NO:11
所示环引物
LB
‑3的5’
端连有淬灭基团,3’
端连有荧光基团
。
[0017]可选地,荧光基团为
AMCA、Pacific Blue、Atto 425、BODIPY FL、FAM、Alexa Fluor 488、TET、JOE、Yakima Yellow、VIC、HEX、Quasar 570、Cy3、NED、TAMRA、ROX、Aqua Phluor593、Texas Red、Atto 590、Cy5、Quasar 本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.
一种用于检测人圆环病毒1型的
LAMP
引物组,其特征在于,包括
SEQ ID NO:1
所示外侧引物
F3、SEQ ID NO:2
所示外侧引物
B3、SEQ ID NO:3
所示内侧引物
FIP、SEQ ID NO:4
所示内侧引物
BIP、SEQ ID NO:5
所示环引物
LF
和
SEQ ID NO:6
所示环引物
LB。2.
一种用于检测人圆环病毒2型的
LAMP
引物组,其特征在于,包括
SEQ ID NO:7
所示外侧引物
F3、SEQ ID NO:8
所示外侧引物
B3、SEQ ID NO:9
所示内侧引物
FIP、SEQ ID NO:10
所示内侧引物
BIP
和
SEQ ID NO:11
所示环引物
LB
‑
3。3.
一种用于检测人圆环病毒的
LAMP
引物组,其特征在于,包括权利要求1和2所述
LAMP
引物组
。4.
根据权利要求1~3任一所述的
LAMP
引物组,其特征在于,
SEQ ID NO:5
所示环引物
LF
和
/
或
SEQ ID NO:11
所示环引物
LB
‑3的5’
端连有淬灭基团,3’
端连有荧光基团<...
【专利技术属性】
技术研发人员:张驰宇,徐爱娟,王建华,郭建林,
申请(专利权)人:河南师范大学,
类型:发明
国别省市:
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