一种与花生百仁重制造技术

本发明专利技术提供一种与花生百仁重

【技术实现步骤摘要】
一种与花生百仁重QTL qHKWA05连锁的INDEL分子标记及其应用


[0001]本专利技术涉及分子遗传育种
，具体涉及一种与花生百仁重
QTL qHKWA05
连锁的
INDEL
分子标记及其应用
。

技术介绍

[0002]花生是我国重要的油料和经济作物，花生籽仁富含蛋白和油脂，广泛应用于鲜食
、
榨油或食品加工
。
我国花生种植面积位居世界第一，但单位面积产量落后于美国和巴西等国家
。
花生籽仁大小与花生产量及其加工利用密切相关
。
[0003]将花生按百仁重
(100
粒饱满籽仁的重量
)
分为大粒
、
中粒
、
小粒三个品种类型
。
百仁重大于
80g
的为大粒花生，
50g
至
80g
的是中粒花生，小于
50g
的为小粒花生
。
目前花生籽仁重，籽仁大小分子标记较为匮乏，育种过程中对花生籽仁重的选择主要依赖表型观察，由于该性状为数量性状，受环境影响较大，而且必须收获后才能采集表型，鉴定周期较长，成本较高
。
[0004]花生栽培种是异源四倍体
(AABB)
，基因组较大，亚基因组相似性高，重复序列较多，栽培花生基因组公布之前，花生的分子标记开发多态性差，构建的遗传图谱分子标记少，籽仁重
、
籽仁大小
QTL
定位区间较大
。
花生栽培种参考基因组序列公布后，重测序挖掘出的
SNP/INDEL
标记使遗传连锁图谱密度大大提高，可有效缩小定位区间
。
利用
QTL
定位发掘
、
开发与百仁重紧密连锁的分子标记，应用于分子标记辅助选择育种，将极大提高花生产量性状的遗传改良效率
。

技术实现思路

[0005]为了解决现有技术的问题，本专利技术提供一种与花生百仁重
QTL qHKWA05
连锁的
INDEL
分子标记及其应用
。
[0006]为了实现上述目的，本专利技术所采用的技术方案是：
[0007]与花生百仁重
QTL qHKWA05
连锁的
INDEL
分子标记的核苷酸序列为
‘
ATGCATAATATTCCTCCATCT
’
(SEQ ID NO.1)
或
‘
A
’
。
[0008]其中，利用
PCR
方法进行
qHKWA05.INDEL
分子标记位点基因型鉴定，分子标记引物为：
[0009]正向引物
qHKWA05F
：
AAGGGAAAAATCGGATGTGA(SEQ ID NO.2)
[0010]反向引物
qHKWA05R
：
GGGTTTTCAGTTTTTGCTGCT(SEQ ID NO.3)。
[0011]PCR
反应体系共
20
μ
L
，其中，5×
buffer、4
μ
L
，
2.5mM
的
dNTP、1.6
μ
L
，
1.25U/
μ
L
的
GXL DNA
聚合酶
、0.4
μ
L
，
10
μ
M
的正向引物
、0.5
μ
L
，
10
μ
M
的反向引物
、0.5
μ
L
，
50ng/
μ
L
的基因组
DNA、3
μ
L,10
μ
L ddH2O
；
[0012]PCR
反应条件
:95℃
预变性
5min
；
95℃
变性
10s、56℃
退火
15s、68℃
延伸
45s、35
个循环；
68℃
延伸
7min。
[0013]本专利技术提出一种试剂盒，所述试剂盒包括如上所述的分子标记引物
。
[0014]本专利技术提供一种检测花生百仁重的方法，该方法包括如下步骤：
[0015](1)
提取待鉴定花生材料的
DNA
，通过
PCR
对
qHKWA05.INDEL
分子标记进行扩增测序鉴定；
[0016](2)
若鉴定分子标记为基因型“ATGCATAATATTCCTCCATCT”(SEQ ID NO.1)
，则待鉴定花生材料百仁重“<45g”；
[0017]若鉴定分子标记为基因型“A”，则待鉴定花生材料为百仁重“>85g”。
[0018]本专利技术提供的花生百仁重
QTL qHKWA05
连锁的
INDEL
分子标记在花生育种中的应用
。
[0019]本专利技术提供的花生百仁重
QTL qHKWA05
连锁的
INDEL
分子标记在花生自然群体基因分型中的应用
。
[0020]本专利技术提供的花生百仁重
QTL qHKWA05
连锁的
INDEL
分子标记在花生自然群体单倍型分析中的应用
。
[0021]本专利技术的积极有益效果：
[0022]本专利技术基于
318
份
RILs
的高密度
SNP
遗传图谱，结合三个环境下的百仁重表型数据，定位到位于
Arahy05
染色体的百仁重
QTL qHKWA05
，并开发了
INDEL
分子标记
qHKWA05.INDEL
，经过自然群体验证，准确率达
80
％以上
。
[0023]本专利技术定位到的
QTL
区间小，只需一对
PCR
引物即可区分花生籽仁大小，提高了检测效率，降低了检测成本，将该技术应用于花生籽仁性状的遗传改良，将有效提高杂交后代的籽仁重量和大小的选择准确性，降低育种成本，提高育种效率，有利于加快选育高产及加工专用型花生新品种的育种进程
。
附图说明
[0024]图
1.
花生百仁重
QTL qHKWA05
定位结果图；
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种与花生百仁重
QTL qHKWA05
连锁的
INDEL
分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列为
‘
ATGCATAATATTCCTCCATCT
’
或
‘
A
’
。2.
根据权利要求1所述的与花生百仁重
QTL qHKWA05
连锁的
INDEL
分子标记，其特征在于，利用
PCR
方法进行
qHKWA05.INDEL
分子标记位点基因型鉴定，分子标记引物为：正向引物
qHKWA05F
：
AAGGGAAAAATCGGATGTGA
；反向引物
qHKWA05R
：
GGGTTTTCAGTTTTTGCTGCT。3.
根据权利要求2所述的一种与花生百仁重
QTL qHKWA05
连锁的
INDEL
分子标记，其特征在于
,PCR
反应体系共
20
μ
L
，其中，5×
buffer、4
μ
L
，
2.5mM
的
dNTP、1.6
μ
L
，
1.25U/
μ
L
的
GXL DNA
聚合酶
、0.4
μ
L
，
10
μ
M
的正向引物
、0.5
μ
L
，
10
μ
M
的反向引物
、0.5
...

【专利技术属性】
技术研发人员：张新友，房元瑾，刘华，秦利，徐静，苗利娟，石磊，张忠信，孙子淇，齐飞艳，董文召，黄冰艳，
申请(专利权)人：河南省农业科学院，
类型：发明
国别省市：