用于检测绵羊布鲁氏菌病抗性的制造技术

本发明专利技术涉及分子标记辅助育种技术领域，具体涉及用于检测绵羊布鲁氏菌病抗性的

【技术实现步骤摘要】
用于检测绵羊布鲁氏菌病抗性的SNP分子标记及其检测引物和应用


[0001]本专利技术涉及分子标记辅助育种
，尤其涉及用于检测绵羊布鲁氏菌病抗性的
SNP
分子标记及其检测引物和应用
。

技术介绍

[0002]布鲁氏杆菌病（
brucellosis
）简称布病，是由布鲁氏菌引起的人畜共患性全身传染病，其临床症状包括波浪热
、
关节炎和繁殖障碍（公畜睾丸炎和附睾炎，母畜流产和不孕）等
。
布鲁氏菌具有免疫逃避和隐性感染的特性，其中羊种布鲁氏菌的毒力和感染性最强，不仅对绵羊养殖业造成巨大经济损失，还成为公共卫生的重大安全隐患
。
在宿主动物绵羊中挖掘与抗布鲁氏菌病性状相关的分子标记，并应用于辅助绵羊的抗病育种，不仅能从根本上切断布鲁氏菌病的传播途径，还能减轻因抗生素滥用而造成的环境污染和药物残留危害
。
因此挖掘绵羊的抗布鲁氏菌病相关分子标记具有重要意义
。

技术实现思路

[0003]本专利技术提供用于检测绵羊布鲁氏菌病抗性的
SNP
分子标记及其检测引物和应用
。
[0004]本专利技术通过在不同品种绵羊中进行全基因组关联分析，发现了绵羊基因组中与布鲁氏菌病抗性性状相关的
SNP
分子标记，通过大样本量的绵羊群体验证，证明该
SNP
分子标记与绵羊布鲁氏菌病抗性性状存在显著相关性，可用于检测绵羊对布鲁氏菌病的抗性高低
。
为便于检测，本专利技术还开发了用于检测该
SNP
分子标记的引物组合
。
[0005]基于上述发现，本专利技术提供以下技术方案：第一方面，本专利技术提供与绵羊布鲁氏菌病抗性相关的
SNP
分子标记，所述
SNP
分子标记含有如
SEQ ID NO.1
所示序列第
101
位的多态性为
G/A
的核苷酸序列
。
[0006]以上所述的
SNP
分子标记的多态性位点位于版本号为
Oar_v1.0
，
2017
年
11
月的绵羊参考基因组的第3号染色体第
35698759
位，多态性为
G/A。
[0007]上述
SNP
分子标记与绵羊对布鲁氏菌病的抗性高低存在显著相关性，能够针对不同品种绵羊较为准确地鉴定其对布鲁氏菌病的抗性，用于绵羊抗布鲁氏菌病的分子标记辅助育种和品种改良，提高分子育种效率
。
[0008]基于上述版本号为
Oar_v1.0
，
2017
年
11
月的绵羊参考基因组的第3号染色体第
35698759
位的多态性位点，为便于检测，本专利技术针对该多态性位点的上下游序列开发了
SNP
分子标记序列片段以及用于扩增该
SNP
分子标记的引物
。
结合该多态性位点的上下游序列，本专利技术获得了
SEQ ID NO.1
所示序列
。
本领域技术人员可以理解的是，基于上述
SNP
位点及其上下游序列可开发不同长度的序列片段作为
SNP
分子标记，因此
SEQ ID NO.1
所示序列并不构成对本专利技术的
SNP
分子标记的限制，只要包含版本号为
Oar_v1.0
，
2017
年
11
月的绵羊参考基因组的第3号染色体第
35698759
位的多态性位点的序列片段均在本专利技术的
SNP
分子标记的保护范围内
。
[0009]在本专利技术的一些实施方式中，所述
SNP
分子标记的核苷酸序列如
SEQ ID NO.1
所示，多态性位点位于如
SEQ ID NO.1
所示序列的第
101
位，多态性为
G/A。
[0010]SEQ ID NO.1
：
TGTTTTGCTTTCTCTTTCCTTCCATCTTTTCTTGCCCAGGTCACCCAGCTAAGGAATGGCCAAATCAGCTGGGACTCTGCCCTTTCGCTGGAGCTGGGGARAGAAGGTCCCTAGGAGGTAGGGACCAGCCCCTCAGCCTTATCCCTCCCCTTCTCTGCCAGGTCCTGGGGAGTCCGAGAAGATCCAGCAGCTGGAAGAGCA。
其中，
R
为
SNP
分子标记的多态性位点，
R=G
或
A。
[0011]在本专利技术的一些实施方式中，以上所述的
SNP
分子标记为以绵羊基因组为模板
、
由序列如
SEQ ID NO.2
‑4所示的引物扩增得到
。
[0012]以上所述的
SNP
分子标记的多态性位点的基因型为
GG
或
AA
，对应于布鲁氏菌病高抗性，基因型为
GA
，对应于布鲁氏菌病低抗性
。
[0013]上述
SNP
分子标记中，相较“GA”杂合基因型，“GG”纯合基因型和“AA”纯合基因型的绵羊具有更强的布鲁氏菌病抗性
。
[0014]第二方面，本专利技术提供一种引物组合，所述引物组合用于扩增以上所述的与绵羊布鲁氏菌病抗性相关的
SNP
分子标记
。
[0015]根据以上提供的
SNP
分子标记的多态性位点所在基因组的位置及其上下游序列，本领域技术人员可以开发用于扩增该
SNP
分子标记的各种类型的引物
。
[0016]上述引物可以为任何能够用于检测
SNP
分子标记基因型的引物
。
[0017]优选地，所述引物组合包括序列如
SEQ ID NO.2
‑4所示的引物，其中序列如
SEQ ID NO.2
‑3所示的引物为正向引物，序列如
SEQ ID NO.4
所示的引物为反向通用引物
。
[0018]SEQ ID NO.2
：5’‑
CCTACCTCCTAGGGACCTTCTT
‑3’
；
SEQ ID NO.3
：5’‑
CTACCTCCTAGGGACCTTCTC
‑3’
；
SEQ ID NO.4
：5’‑ꢀ
TCACCCAGCTAAGGAATGGCCAAAT
ꢀ‑3’
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
与绵羊布鲁氏菌病抗性相关的
SNP
分子标记，其特征在于，所述
SNP
分子标记含有如
SEQ ID NO.1
所示序列第
101
位的多态性为
G/A
的核苷酸序列
。2.
根据权利要求1所述的与绵羊布鲁氏菌病抗性相关的
SNP
分子标记，其特征在于，所述
SNP
分子标记的核苷酸序列如
SEQ ID NO.1
所示，多态性位点位于如
SEQ ID NO.1
所示序列的第
101
位，多态性为
G/A。3.
根据权利要求1所述的与绵羊布鲁氏菌病抗性相关的
SNP
分子标记，其特征在于，所述
SNP
分子标记为以绵羊基因组为模板
、
由序列如
SEQ ID NO.2
‑4所示的引物扩增得到
。4.
根据权利要求
1~3
任一项所述的与绵羊布鲁氏菌病抗性相关的
SNP
分子标记，其特征在于，所述
SNP
分子标记的多态性位点的基因型为
GG
或
AA
，对应于布鲁氏菌病高抗性，基因型为
GA
，对应于布鲁氏菌病低抗性
。5.
引物组合，其特征在于，所述引物组合用于扩增权利要求
1~4
任一项所述的与绵羊布鲁氏菌病抗性相关的
SNP
分子标记
。6.
根据权利要求5所述的引物组合，其特征在于，所述引物组合包括序列如
SEQ ID NO.2
‑4所示的引物，其中序列如
SEQ ID NO.2
‑3所示的引物为正向引物，序列如
SEQ ID NO.4
所示的引物为反向通用引物
。7.

【专利技术属性】
技术研发人员：武上杰，何晓红，马月辉，蒋琳，
申请(专利权)人：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，
类型：发明
国别省市：