一种利用15个单核苷酸遗传标记鉴定和牛与西门塔尔/安格斯的方法技术

本发明专利技术公开了一种利用15个单核苷酸遗传标记鉴定和牛品种的方法。本发明专利技术利用对遗传分化指数(Fixation index，F

【技术实现步骤摘要】
一种利用15个单核苷酸遗传标记鉴定和牛与西门塔尔/安格斯的方法


[0001]本专利技术涉及和牛的分子标记辅助鉴别，具体涉及在DNA水平上检测与和牛品种特有的SNP标记，以及利用15个单核苷酸遗传标记(SNP标记)鉴定和牛。

技术介绍

[0002]单核苷酸多态(SNP，single nucleotide polymorphism)是同一物种不同个体基因组DNA的等位序列上单个核苷酸存在差别的现象。相同长度的单链DNA因其顺序不同或单个碱基差异，所形成的构象就会不同。SNP是生物体基因组中存在最为广泛的一类变异，它是由于单个核苷酸的插入、缺失、转换和颠换而引起的。
[0003]某些SNP的存在导致个体基因组相应基因位点保留了品种相关的变异。这些变异实在和牛品种基因组中所特有的，在西门塔尔/安格斯的不存在变异或者变异频率很低，综合利用多个此类SNP变异，能够鉴别和牛与西门塔尔/安格斯牛。
[0004]和牛是一种源自日本的牛品种，也被称为和种牛(Wagy
ū
)或和肉牛。它们以其卓越的肉质和高度理想化的大理石花纹而闻名，这使得和牛被认为是世界上最优质的牛肉之一。和牛是相对昂贵的牛肉品种，由于其稀有性、独特的风味和高度饲养标准而倍受珍视。它被广泛认为是奢侈美食，受到许多人的追捧。由于和牛肉的珍贵特性，在肉牛饲养和牛肉销售过程中出现了以次充好，以杂交牛冒充纯种和牛，以其他牛肉冒充和牛肉的行为。

技术实现思路

[0005]本专利技术的目的在于提供一种利用15个单核苷酸遗传标记鉴定和牛与西门塔尔/安格斯的方法。
[0006]为达到上述目的，本专利技术采用了以下技术方案：
[0007]一种利用15个单核苷酸遗传标记鉴定和牛与西门塔尔/安格斯的方法，该鉴定和牛的方法包括以下步骤：
[0008]从血液或者组织种提取候选个体的基因组DNA，对候选基因组区域的单核苷酸突变位点进行检测，若检测出该个体在与权利7所述的15个SNP突变的突变情况一致，则该个体为和牛。
[0009]优选的，所述候选基因组区域包括1
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138479600，2
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38598973，22
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30800047，28
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30070456，29
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14340841。
[0010]优选的，所述黄牛参考基因组为ARS
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UCD1.2(NCBI版本号为GCF_000003205.7)。
[0011]优选的，所述突变具体情况为，1
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138479600为A>G，2
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71883427为G>C，3
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5220068为T>A，18
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30800047为A>T，28
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30070456为G>C，29
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14340841为G>A。
[0012]优选的，检测出该个体在与权利7所述的15个SNP突变的突变情况一致，则该个体为和牛。
[0013]一种鉴定和牛与西门塔尔/安格斯牛的试剂盒，该试剂盒包括用于检测定位上述候选单核苷酸突变位点的试剂,所述试剂包括对待测突变位点及其附近区域进行PCR扩增的试剂或对扩增片段进行测序的试剂，所述单核苷酸突变位点包括位于黄牛参考基因组包括1
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138479600，2
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71883427，3
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30800047，28
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14340841。
[0014]一种牛基因组单核苷酸多态性的检测方法，包括以下步骤：
[0015]以黄牛基因组DNA为模板，采用PCR扩增候选SNP所在区域，然后鉴定上述15个SNP位点的基因型。
[0016]上述15个单核苷酸多态性的检测方法在和牛分子鉴定中的应用。
[0017]黄牛参考基因组1
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138479600，2
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14340841位置在黄牛分子鉴定中的应用。
[0018]优选的，在所述突变具体情况为，1
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种利用15个单核苷酸遗传标记鉴定和牛与西门塔尔/安格斯的方法，其特征在于：该鉴定和牛的方法包括以下步骤：对候选个体的基因组区域的单核苷酸突变位点进行检测，若检测出该个体在所述候选基因组区域中15个SNP均为突变型，则将所述个体的品种确定为和牛。2.根据权利要求1所述一种利用16个单核苷酸遗传标记鉴定和牛与西门塔尔/安格斯的方法，其特征在于：所述候选基因组SNP染色体位置为1，2，3，5，8，10，17，18，19，20，21，22，24，28，29。3.根据权利要求1所述一种利用15个单核苷酸遗传标记鉴定和牛与西门塔尔/安格斯的方法，其特征在于：所述黄牛参考基因组为ARS
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UCD1.2。4.根据权利要求1所述一种利用15个单核苷酸遗传标记鉴定和牛与西门塔尔/安格斯的方法，其特征在于：所述位点的突变情况为1
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30070456为G&gt;C，29
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14340841为G&gt;A。5.根据权利要求1所述一种利用15个单核苷酸遗传标记鉴定和牛与西门塔尔/安格斯的方法，其特征在于：鉴别群体为和牛区别于西门塔尔，和牛区别于安格斯。6.根据权利要求1所述一种利用15个单核苷酸遗传标记鉴定和牛与西门塔尔/安格斯的方法，其特征在于：所述鉴定和牛的方法还包括以下步骤：对以下与所述位点进行突变等位基因检测：1
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【专利技术属性】
技术研发人员：成海建，夏小婷，胡鑫，游伟，谢良佳，闫先峰，赵桂省，王彦，王玉燕，宋恩亮，姜富贵，
申请(专利权)人：山东省农业科学院畜牧兽医研究所，
类型：发明
国别省市：