用于检测HLA-B*15:11等位基因的探针引物组、试剂盒及应用制造技术

本发明专利技术实施例公开了用于检测HLA

【技术实现步骤摘要】
用于检测HLA
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B*15:11等位基因的探针引物组、试剂盒及应用


[0001]本专利技术属于基因诊断
，具体涉及用于检测HLA
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B*15:11等位基因的探针引物组、试剂盒及应用。

技术介绍

[0002]人类白细胞抗原(human leukocyte antigen，HLA)，是编码人类的主要组织相容性复合体(MHC)的基因，HLA基因位于6号染色体的短臂上(6p21.31)，包括一系列紧密连锁的基因座，由360万个碱基对组成，是目前已知的人类染色体中基因密度最高，也是多态性最为丰富的区域，HLA基因包含I类、II类和Ⅲ类HLA基因，其中I类HLA基因包括HLA
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A，HLA
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B和HLA
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C，与多种药物的药效和毒副作用相关，对HLA基因进行分型可以让医生根据基因型选择治疗药物，提高药物的有效性，避免不良反应的发生。
[0003]卡马西平是一种常见的精神类药物，临床适应症为癫痫和三叉神经痛。较其他抗癫痫药物而言，卡马西平耐受性良好，常见嗜睡、疲劳、低钠血症等药物不良反应，这些不良反应一般与药物的药理作用相关，成剂量相关性；目前已有多项研究表明卡马西平所致的皮肤不良反应SJS/TEN与HLA
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B基因型密切相关。CPIC指南指出，除常见的携带HLA
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B*15:02等位基因患者之外，在东亚、东南亚人群中携带HLA
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B*15:08、HLA
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B*15:11和HLAB*15:21等位基因的患者发生危及生命的皮肤不良事件SJS/TEN的风险显著增加，建议仔细权衡服用卡马西平所带来的SJS/TEN的风险和治疗收益，选择替代治疗方案。根据中华骨髓库统计的中国人群常见及确认HLA等位基因表(CWD表，2.2版本)的统计结果显示，HLA
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B*15:11在中国人中的人群频率为1.83％，CWD等位基因分类为C(Common alleles)，即常见等位基因，在中国人群与卡马西平所致的皮肤严重不良反应SJS/TEN相关的HLA
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B基因多态性中，仅次于HLA
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B*15:02等位基因(中国人群频率3.58％)，因此对中国人群进行HLA
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B*15:11基因检测对指导卡马西平的合理用药具有重要意义。
[0004]目前，常用的HLA
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B基因分型方法有限制性片段长度多态性分析PCR
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RFP、序列特异性寡核苷酸探针PCR
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SSO、序列特异性引物PCR技术PCR
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SSP等。对于复杂的HLA等位基因来说，PCR
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RFP技术尚不能检出所有的HLA等位基因；PCR
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SSO不具有集成化的优点，而且洗脱条件比较繁琐，耗时较长，难以标准化和自动化；PCR
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SSP也具有操作耗时长和特异性较差的缺点。世界卫生组织推荐的HLA
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B基因分型方法是以PCR为基础的直接测序法PCR
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SBT方法，此方法是最准确可靠HLA
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B基因分型方法，具有分辨率高，可大规模进行，精确度高的优势，并且能直接发现新的等位基因，但是，直接测序法存在操作繁琐、耗时长、成本高昂的缺点，另外，测序结果容易出现重叠峰，不利于结果的判读，这与现代医学检验所要求的“快速、简便”的理念相悖。

技术实现思路

[0005]有鉴于此，一方面，一些实施例公开了用于检测HLA
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B*15:11等位基因的探针引物组，包括：特异性引物组及特异性探针，和内标基因引物组及内标探针；
[0006]其中，特异性引物组及特异性探针包括：
[0007]HLA
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B*15:11
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F上游引物，其碱基序列如SEQ ID NO：001所示；
[0008]HLA
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B*15:11
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R下游引物，其碱基序列如SEQ ID NO：002所示；
[0009]HLA
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B*15:11
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Probe特异性探针，其碱基序列如SEQ ID NO：003所示；
[0010]内标基因引物组及内标探针包括：
[0011]TUBB
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F上游引物，其碱基序列如SEQ ID NO：004所示；
[0012]TUBB
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R下游引物，其碱基序列如SEQ ID NO：005所示；
[0013]TUBB
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probe内标探针，其碱基序列如SEQ ID NO：006所示。
[0014]另一方面，一些实施例公开了用于检测HLA
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B*15:11等位基因的试剂，包括用于检测HLA
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B*15:11等位基因的探针引物组。
[0015]再一方面，一些实施例公开了用于检测HLA
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B*15:11等位基因的试剂盒，包括用于检测HLA
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B*15:11等位基因的探针引物组，或用于检测HLA
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B*15:11等位基因的试剂。
[0016]一些实施例公开的用于检测HLA
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B*15:11等位基因的试剂盒，还包括扩增试剂。
[0017]再一方面，一些实施例公开了用于检测HLA
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B*15:11等位基因的探针引物组在检测HLA
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B*15:11等位基因中应用。
[0018]一些实施例公开的用于检测HLA
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B*15:11等位基因的探针引物组在检测HLA
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B*15:11等位基因中的应用，利用探针引物组对待测样品进行PCR扩增。
[0019]一些实施例公开了用于检测HLA
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B*15:11等位基因的试剂在检测HLA
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B*15:11等位基因中的应用。
[0020]一些实施例公开的用于检测HLA
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B*15:11等位基因的试剂在检测HLA
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B*15:11等位基因中的应用，利用试剂对待测样品进行PCR扩增。
[0021]一些实施例公开了用于检测HLA
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B*15:11等位基因的试剂盒在检测HLA
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B*15:11等位基因中的应用。
[0022]一些实施例公开的用于检测HLA
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B*15:11等位基因的试剂盒在检测HLA
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B*15:11等位基因中的应用，利用试剂盒对待测样品进行PCR扩增。
[0023]一些实施例公开的用于检测HLA
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B*15:11等位基因的试剂盒在检测HLA
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B*15:1本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.用于检测HLA
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B*15:11等位基因的探针引物组，其特征在于，包括：特异性引物组及特异性探针，和内标基因引物组及内标探针；其中，所示特异性引物组及特异性探针包括：HLA
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B*15:11
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F上游引物，其碱基序列如SEQ ID NO：001所示；HLA
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B*15:11
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R下游引物，其碱基序列如SEQ ID NO：002所示；HLA
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B*15:11
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Probe特异性探针，其碱基序列如SEQ ID NO：003所示；所述内标基因引物组及内标探针包括：TUBB
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F上游引物，其碱基序列如SEQ ID NO：004所示；TUBB
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R下游引物，其碱基序列如SEQ ID NO：005所示；TUBB
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probe内标探针，其碱基序列如SEQ ID NO：006所示。2.用于检测HLA
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B*15:11等位基因的试剂，其特征在于，包括权利要求1所述的探针引物组。3.用于检测HLA
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B*15:11等位基因的试剂盒，其特征在于，包括权利要求1所述的探针引物组，或权利要求2所述的试剂。4.根据权利要求3所述的用于检测HLA
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B*15:11...

【专利技术属性】
技术研发人员：郭建成，占闽宁，史健翔，尚文俊，冯帅升，朱丹丹，王丙顺，张静，李英英，薛滨雨，
申请(专利权)人：河南申友医学检验所有限公司，
类型：发明
国别省市：