本发明专利技术属于分子遗传学技术领域，具体涉及一种与细毛羊净毛率相关的SNP位点及其应用。本发明专利技术所述的SNP分子标记位于国际绵羊参考基因组Oar_v4.0版本第1号染色体上第236304249个核苷酸位点A/T突变。本发明专利技术还提供了检测上述SNP位点的试剂在检测细毛羊净毛率性状或在细毛羊分子标记辅助育种中的应用，在细毛羊品种筛选、品种鉴定或分子标记辅助育种中都有巨大的应用价值；用于早期育种选择，缩短世代间隔，加速育种进程，节约了大量的育种成本，市场前景广阔。前景广阔。前景广阔。
【技术实现步骤摘要】
一种与细毛羊净毛率相关的SNP位点及其应用
[0001]本专利技术属于分子遗传学
，具体涉及一种与细毛羊净毛率相关的SNP位点及其应用。
技术介绍
[0002]羊毛是指覆盖在羊体表面的一层具有纺织价值的纤维，是皮肤的衍生物。羊毛是毛纺工业的主要精纺原料，主要用来加工服装面料。在细毛羊育种实践中，羊毛性状是重要的经济性状，直接影响羊毛生产的品质和数量，主要包括产毛量、平均纤维直径、断裂强度、净毛率等多个指标。其中净毛率是指纯净毛纤维在公定回潮率条件下的重量占原毛样重的百分数，是羊毛最重要的一项经济指标。影响细毛羊净毛率的因素较多，如品种、环境、营养水平、年龄、性别等均可影响羊毛净毛率，其中品种和环境因素是最主要的。
[0003]细毛羊以其生产优质羊毛而闻名，羊毛作为一种天然纤维，是用于服装和纺织品的重要农产品。其中，羊毛质量由纤维直径、纤维长度、净毛率、卷曲和油汗颜色决定。细毛羊的羊毛性状一直是人工选育的重点。在众多羊毛性状中，净毛率在羊毛流通领域中是羊毛交易计算重量与价格的重要依据，且在养羊业生产上测定和统计羊群与个体的产毛量时，都以净毛量为基础。因此净毛率直接影响羊毛经济价值。
[0004]本专利技术发现了一种影响细毛羊净毛率性状的SNP分子标记，位于国际绵羊基因组Oar_v4.0版本第1号染色体上第236304249位点的碱基处，所述SNP分子标记碱基为A时，基因型为AA；当所述SNP分子标记碱基为T时，基因型为AT；所述基因型AA的细毛羊净毛率显著大于基因型AT(P<0.05)。本专利技术通过对细毛羊净毛率性状相关的SNP位点进行检测，可用于育种早期选留，能够增加细毛羊净毛率的遗传进展，具有操作简单的优点，提高品种甄选的精确度，减少细毛羊净毛率优良性状的育种时间，降低育种成本，增加核心竞争。
技术实现思路
[0005]本专利技术提供了一种影响细毛羊净毛率性状的SNP分子标记，并通过检测所述SNP分子标记碱基类型，实现细毛羊的净毛率基因分型，所述SNP分子标记碱基为A时，基因型为AA；当所述SNP分子标记碱基为T时，基因型为AT；所述基因型AA的细毛羊净毛率显著大于基因型AT；通过优选该SNP分子标记的优势等位基因，能够增加细毛羊净毛率的遗传进展，具有操作简单的优点，提高品种甄选的精确度，减少细毛羊净毛率优良性状的育种时间，降低育种成本，增加核心竞争。具体包括以下内容：
[0006]第一方面，本专利技术提供了一种检测与细毛羊净毛率性状相关的SNP分子标记的试剂在检测细毛羊净毛率中的应用，所述SNP分子标记位于国际绵羊基因组Oar_v4.0版本第1号染色体上第236304249位点的碱基处；突变碱基为A或T。
[0007]优选地，所述SNP分子标记碱基为A时，基因型为AA；当所述SNP分子标记碱基为T时，基因型为AT；所述基因型AA的细毛羊净毛率显著大于基因型AT。
[0008]优选地，所述试剂包括用于扩增含有所述SNP分子标记的核苷酸序列的引物对。
[0009]优选地，所述引物对的序列为：
[0010]F：5
’‑
TAGAATAGTGGGACGTGAATA
‑3’
；
[0011]R：5
’‑
ACTTATTAGCATGGCAACTT
‑3’
。
[0012]优选地，实现检测细毛羊净毛率的方法包括：
[0013](1)提取细毛羊血液基因组DNA为模板DNA；
[0014](2)利用引物对，将步骤(1)获得的待测细毛羊血液的基因组DNA进行PCR扩增，获得PCR扩增产物；
[0015](3)将步骤(2)获得的PCR扩增产物纯化，进行基因分型检测，所述SNP分子标记碱基为A时，基因型为AA；当所述SNP分子标记碱基为T时，基因型为AT；其中，所述基因型AA的细毛羊净毛率显著大于基因型AT。
[0016]优选地，所述PCR扩增体系25μL：金牌Mix 22μL，上、下游引物各1μL，模板DNA1μL。
[0017]优选地，所述PCR扩增程序：98℃2min；98℃10s，60℃10s，72℃10s，共40个循环；72℃延伸2min。
[0018]第二方面，本专利技术提供了一种检测与细毛羊净毛率性状相关的SNP分子标记的试剂在细毛羊净毛率性状早期育种中的应用，所述SNP分子标记位于国际绵羊基因组Oar_v4.0版本第1号染色体上第236304249位点的碱基处；突变碱基为A或T。
[0019]优选地，所述SNP分子标记碱基为A时，基因型为AA；当所述SNP分子标记碱基为T时，基因型为AT；所述基因型AA的细毛羊净毛率显著大于基因型AT。
[0020]优选地，所述试剂包括用于扩增含有所述SNP分子标记的核苷酸序列的引物对。
[0021]优选地，所述引物对的序列为：
[0022]F：5
’‑
TAGAATAGTGGGACGTGAATA
‑3’
；
[0023]R：5
’‑
ACTTATTAGCATGGCAACTT
‑3’
。
[0024]优选地，实现细毛羊净毛率性状早期育种的方法包括：
[0025](1)提取细毛羊血液基因组DNA为模板DNA；
[0026](2)利用引物对，将步骤(1)获得的待测细毛羊血液的基因组DNA进行PCR扩增，获得PCR扩增产物；
[0027](3)将步骤(2)获得的PCR扩增产物纯化，进行基因分型检测，所述SNP分子标记碱基为A时，基因型为AA；当所述SNP分子标记碱基为T时，基因型为AT；其中，所述基因型AA的细毛羊净毛率显著大于基因型AT；选取基因型为AA的细毛羊个体进行细毛羊净毛率性状的早期育种。
[0028]优选地，所述PCR扩增体系25μL：金牌Mix 22μL，上、下游引物各1μL，模板DNA1μL。
[0029]优选地，所述PCR扩增程序：98℃2min；98℃10s，60℃10s，72℃10s，共40个循环；72℃延伸2min。
[0030]本专利技术的有益效果是：
①
本专利技术提供了一种影响细毛羊净毛率的SNP分子标记，所述的SNP分子标记位于国际绵羊基因组Oar_v4.0版本第1号染色体上第236304249位点的碱基处，突变碱基为A或T；所述SNP分子标记碱基为A时，基因型为AA，所述SNP分子标记碱基为T时，基因型为AT；AA基因型的细毛羊个体的净毛率显著高于AT基因型个体(P<0.05)；
②
通过对细毛羊净毛率相关的SNP位点进行检测，能够判断细毛羊的净毛率，为细毛羊分子标记辅助育种提供依据，可以加强细毛羊早期选择、提高选种准确性、缩短培育周期、加快培育
进程；
③
通过所述的特异性引物对，可建立高效准确的分子标记辅助选择育种技术，通过优选该SNP分子标记的优势等位基因，能够增加细毛羊净本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.检测与细毛羊净毛率性状相关的SNP分子标记的试剂在检测细毛羊净毛率中的应用，其特征在于，所述SNP分子标记位于国际绵羊基因组Oar_v4.0版本第1号染色体上第236304249位点的碱基处；突变碱基为A或T。2.检测与细毛羊净毛率性状相关的SNP分子标记的试剂在细毛羊净毛率性状早期育种中的应用，其特征在于，所述SNP分子标记位于国际绵羊基因组Oar_v4.0版本第1号染色体上第236304249位点的碱基处；突变碱基为A或T。3.如权利要求1或2所述的应用，其特征在于，所述SNP分子标记碱基为A时，基因型为AA；当所述SNP分子标记碱基为T时，基因型为AT；所述基因型AA的细毛羊净毛率显著大于基因型AT。4.如权利要求3所述的应用，其特征在于，所述试剂包括用于扩增含有所述SNP分子标记的核苷酸序列的引物对。5.如权利要求4所述的应用，其特征在于，所述引物对的序列为：F：5
’‑
TAGAATAGTGGGACGTGAATA
‑3’
；R：5
’‑
ACTTATTAGCATGGCAACTT
‑3’
。6.如权利要求5所述的应用，其特征在于，实现检测细毛羊净毛率的方法包括：(1)提取细毛羊血液基因组DNA为模...
【专利技术属性】
技术研发人员：郭婷婷，袁超，卢曾奎，岳耀敬，刘建斌，杨博辉，
申请(专利权)人：中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所，
类型：发明
国别省市：
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