一种条斑紫菜微卫星标记的筛选方法及其应用技术

技术编号:3893549 阅读:210 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术属于分子生物学DNA标记技术与应用领域,具体涉及一种条斑紫菜微卫星标记的筛选方法,及利用这些标记进行种质资源遗传多样性分析的方法,从而为条斑紫菜的遗传结构分析、种质资源保护及分子标记辅助育种奠定基础。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种条斑紫菜微卫星标记的筛选方法,包括以下步骤: (1)提取条斑紫菜丝状体基因组DNA,利用限制性内切酶Hae Ⅲ和Afa Ⅰ对基因组DNA进行酶切,电泳检测回收500-1500bp大小的片段;将所述的片段与5’端磷酸化的接头连接,以 上述连接产物为模板,以接头中的短链为引物,利用PCR方法进行富集; 所述的接头序列第一链为5’TAGTCCGAATTCAAGCAAGAGCACA3’,第二链为5’CTCTTGCTTGAATTCGGACTA3’; 所述的短链序列为 5’CTCTTGCTTGAATTCGGACTA3’; (2)利用生物素标记的(GA)↓[15]为探针与上述PCR富集产物进行杂交,在离心管内用平衡过的Streptavidin Magnesphere磁珠对上述杂交混合物进行吸附,吸附后 将离心管置于磁力架上,去除杂交液,对磁珠进行洗涤,洗脱未结合到磁珠上的DNA片段;将洗涤后的磁珠悬浮于TE溶液中,于94-96℃变性,使含有微卫星序列的DNA片段脱离磁珠,迅速收集上清,离心得到含有微卫星序列的DNA片段;以离心得到的DNA片段为模板,以上述接头中的短链为引物,通过PCR方法进行富集,构建含有微卫星序列的富集文库; (3)以含有15次GA重复的寡核苷酸序列为探针,采用菌落原位杂交的方法筛选阳性克隆;将菌落原位杂交获得的阳性克隆进行测序,筛选微卫星序列,对 含有重复单元的序列进行分析,设计引物序列,获得微卫星标记。...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:孔凡娜茅云翔杨惠王莉
申请(专利权)人:中国海洋大学
类型:发明
国别省市:95[中国|青岛]

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