【技术实现步骤摘要】
一种用于检测前列腺癌的组合物,试剂盒及其用途
[0001]本专利技术属于分子生物学检测领域,具体地,属于前列腺癌检测领域,更具体地,涉及前列腺癌基因标志物的甲基化水平的检测。
技术介绍
[0002]前列腺癌是男性泌尿生殖系统最常见的恶性肿瘤之一。GLOBOCAN 2020数据显示,2020年我国前列腺癌新发病例约11.5万,占男性全部恶性肿瘤的4.7%,死亡病例约5.1万,占恶性肿瘤相关死亡的2.8%,发病率和死亡率分别位居中国男性恶性肿瘤发病和死亡的第6位和第7位。前列腺癌的病因及发病机制十分复杂,病因学研究显示前列腺癌与遗传、年龄、外源性因素(如环境因素、饮食习惯)密切相关。前列腺癌患者生存时间与初诊时临床分期紧密相关,美国前列腺癌初诊病例为临床局限性约占76%,而我国前列腺癌初诊病例以临床中晚期居多,临床局限性病例仅30%,从而导致我国前列腺癌总体预后较差。2003年
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2015年间,我国前列腺癌年龄标化5年生存率从53.8%上升到66.4%,但与发达国家相比总体5年生存率仍有较大差异。美国监测、流行病学和最终结果数据库2010
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2016年数据显示,临床局限性前列腺癌患者在接受标准化治疗后5年生存率接近100%。因此,对高风险人群进行筛查,及时发现早期前列腺癌患者并给予规范化治疗,是改善我国前列腺癌患者预后的重要手段。
[0003]目前,前列腺癌筛查方法包括:直肠指检(DRE)、前列腺特异性抗原(PSA)的检测、经直肠超声(TRUS)和多参数磁共振检查(MP >‑
MRI)等检测方法的联合诊断。直肠直检(DRE)是早期检测前列腺癌的重要方法,简单、重复性好,然而很大程度上取决于医师的技能,因此不能作为前列腺癌的筛查手段。经超声引导前列腺活检是前列腺癌诊断的黄金标准,既可以获取前列腺组织样本,又可以做出病理诊断,但是具有侵入性,需要患者承受不适,同时可能伴随着感染等许多并发症,所以不适合常规筛查。近年来多参数磁共振检查在前列腺癌早筛可以提高临床有意义肿瘤的诊断,然而仍存在26%漏诊有临床意义的肿瘤,8%的患者的病灶大小被低估。目前临床上非侵入性前列腺癌检测技术是前列腺特异性抗原(PSA)的检测,PSA的变化反映了前列腺的功能,PSA水平异常升高(大于4ng/mL)是前列腺癌变的指标,PSA筛查前列腺癌的灵敏度和特异性分为57.43%和45.82%,并且存在诊断灰区(4~10ng/mL),无法区分癌和非癌,导致过度诊断而进行不必要的穿刺活检。因此,亟待开发有效的早筛检测技术,实现前列腺癌筛查无痛无创、经济便捷、精准高效。
[0004]近年来,基于PCR、NGS等分子诊断技术,液体活检不断发展和突破,已成为癌症精准早筛的有力武器。从标志物的信号丰度和信号强度来看,ctDNA甲基化是较为理想的检测标志物。研究表明,抑癌基因甲基化水平升高的现象通常发生在癌症初期,是肿瘤早期发展的标志性改变;而在人类基因组CpG岛中,60
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80%的胞嘧啶残基被甲基化修饰,DNA甲基化已成为癌症早筛中普遍而丰富的信号来源;此外,不同癌症类型有其独特的DNA甲基化模式,器官特异性强,可实现组织溯源。因此,ctDNA甲基化是国内外早筛企业采用的主流检测指标。
[0005]本领域亟需一种更有效的前列腺癌诊断产品,使得前列腺癌早期诊断兼具高灵敏度高特异性,且无创、快速。
技术实现思路
[0006]有鉴于此,本专利技术提供一种用于检测前列腺癌的组合物,所述组合物包括检测以下区域中的甲基化水平的检测试剂:
[0007]GSTP1基因中如SEQ ID NO:1所示的区域;
[0008]RASSF1A基因中如SEQ ID NO:2所示的区域;以及
[0009]PRKCB基因中如SEQ ID NO:3所示的区域。
[0010]GSTP1基因中如SEQ ID NO:1所示的区域、RASSF1A基因中如SEQ IDNO:2所示的区域,以及PRKCB基因中如SEQ ID NO:3所示的区域为各自基因区域的CpG岛的一段序列。
[0011]具体地,GSTP1(Genbank登录号:NG_012075.1)基因的SEQ ID NO:1区域如下所示:
[0012]TCGCTGCGCACACTTCGCTGCGGTCCTCTTCCTGCTGTCTGTTTACTCCCTAGGCCCCGCTGGGGACCTGGGAAAGAGGGAAAGGCTTCCCCGGCCAGCTGCGCGGCGACTCCGGGGACTCCAGGGCGCCCCTCTGCGGCCGACGCCCGGGGTGCAGCGGCCGCCGGGGCTGGGGCCGGCGGGAGTCCGCGGGACCCTCCAGAAGAGCGGCCGGCGCCGTGACTCAGCACTGGGGCGGAGCGGGGCGGGACCACCCTTATAAGGCTCGGAGGCCGCGAGGCCTTCGCTGGAGTTTCGCCGCCGCAGTCTTCGCCACCAGTGAGTACGCGCGGCCCGCGTCCCCGGGGATG;
[0013]RASSF1A(Genbank登录号:DQ444319.1)基因的SEQ ID NO:2区域如下所示:
[0014]GGCCCCACAGTCCCTGCACCCAGGTTTCCATTGCGCGGCTCTCCTCAGCTCCTTCCCGCCGCCCAGTCTGGATCCTGGGGGAGGCGCTGAAGTCGGGGCCCGCCCTGTGGCCCCGCCCGGCCCGCGCTTGCTAGCGCCCAAAGCCAGCGAAGCACGGGCCCAACCGGGCCATGTCGGGGGAGCCTGAGCTCATTGAGCTGCGGGAGCTGGCACCCGCTGGGCGCGCTGGGAAGGGCCGCACCCGGCTGGAGCGTGCCAACGCGCTGCGCATCGCGCGGGGCACCGCGTGCAACCCCACACGGCAGCTGGTCCCTGGCCGTGGCCACCGCTTCCAGCCCGCGGGGCCCGCC;
[0015]PRKCB(Genbank登录号:NG_029003.2)基因的SEQ ID NO:3区域如下所示:
[0016]TCGCTCCTCCCCTGGGCACATCTCCTGAACGCAGCCCCGGGGGCCGAGGACGGGGTGGGGTGGGGGGCGAGGCTCGGGTCCGACGACCCCGGGCTGCGGTCCCGGCGCTGCAGAGCTGCGGCTGTGCACGCTTAGCCGCGAGGCCCGCGGTAGCCCGGGCGCCGATATGTAAAGCAGCTGGCAGCGCTGGGCGGGGCCTGGGCGCGATGCAAATGAGGAGGGCGGGGCTGGCCCGGGGCTCCGCC
[0017]TCCCTCCCCCGCAGCTGGGGCCAGCGGTGCCAAGCGCAGCTGGACGAGC
[0018]GGCA本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种用于检测前列腺癌的组合物,其特征在于,所述组合物包括用于检测以下区域中至少两个的甲基化水平的检测试剂:GSTP1基因中如SEQ ID NO:1所示的区域;RASSF1A基因中如SEQ ID NO:2所示的区域;以及PRKCB基因中如SEQ ID NO:3所示的区域。2.根据权利要求1所述的组合物,其特征在于,所述检测试剂为扩增
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测序、芯片检测,或甲基化荧光定量PCR检测甲基化水平中所使用的检测试剂。3.根据权利要求2所述的组合物,其特征在于,所述检测试剂为核酸引物、测序Tag序列、甲基化芯片、核酸探针中的任意一种或多种。4.根据权利要求3所述的组合物,其特征在于,所述检测试剂为核酸引物和核酸探针。5.根据权利要求4所述的组合物,其特征在于,所...
【专利技术属性】
技术研发人员:刘丽亚,高堂杰,罗诗雅,吴康,戴立忠,
申请(专利权)人:圣湘生物科技股份有限公司,
类型:发明
国别省市:
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