一种染色体22q11.2区微缺失、微重复的测定方法技术

技术编号:3881978 阅读:1199 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术属于生物工程领域,公开了一种染色体22q11.2区微缺失、微重复的测定方法。该方法的步骤包括:抽提基因组DNA;进行多重荧光定量PCR复合扩增,复合扩增体系中包括了5个STR标记:D22S873,22D_5_1,22D_4_5,2D_4_4,22D_4_3和一个内参G6PDH;取PCR扩增产物变性使双链产物转化为可为毛细管电泳分析的单链,采用毛细管电泳对上述变性产物进行产物长度和产物量分析;采用量比值分析的方法和/或采用峰的位置及数量分析的方法判断是否为正常、微缺失或微重复。该方法可提高检测的可靠性,缩短检测时间,降低检测成本,便于临床大规模使用。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种染色体22q11.2区微缺失、微重复的测定方法,其特征在于该方法包括下列步骤: a.抽提基因组DNA; b.多重荧光定量PCR复合扩增:复合扩增体系中包括了5个STR标记:D22S873,22D_5_1,22D_4_5,22 D_4_4,22D_4_3和一个内参G6PDH;进行PCR扩增; c.取PCR扩增产物变性使双链产物转化为可为毛细管电泳分析的单链,采用毛细管电泳对上述变性产物进行产物长度和产物量分析; d.结果分析: 1)根据下列公式计 算量比值: 量比值=被检测者STR位点峰面积/其内参的峰面积/正常对照STR位点峰面/其内参的峰面积 量比值0.7~1.3为正常二倍体个体; 量比值小于0.7为存在微缺失的个体; 量比值大于1.3为存在微重复的个体;  和/或 2)根据峰的位置和数量进行判断,微缺失为在相应位置缺少峰;微重复有三种情形:相应位置出现峰高等于或接近1∶1∶1的三个峰、出现峰高等于或接近2∶1的二个峰、出现峰高等于或接近1∶2的二个峰; 其中: D22 S873的上游引物序列为SEQ ID NO.1,下游引物序列为SEQ ID NO.2; 22D_5_1的上游引物序列为SEQ ID NO.3,下游引物序列为SEQ ID NO.4; 22D_4_5的上游引物序列为SEQ ID N O.5,下游引物序列为SEQ ID NO.6; 22D_4_4的上游引物序列为SEQ ID NO.7,下游引物序列为SEQ ID NO.8; 22D_4_3的上游引物序列为SEQ ID NO.9,下游引物序列为SEQ ID NO .10; G6PDH的上游引物序列为SEQ ID NO.11,下游引物序列为SEQ ID NO.12。...

【技术特征摘要】
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【专利技术属性】
技术研发人员:许争峰易龙
申请(专利权)人:南京市妇幼保健院
类型:发明
国别省市:84[中国|南京]

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