本发明专利技术公开了一种甘蓝型油菜早花基因Bnft.a02及其应用。属于分子育种技术领域。本发明专利技术用快周期油菜亲本和中双11杂交产生的F2群体,采用BSA法定位了快周期甘蓝型油菜的开花基因。本发明专利技术设计出了两对功能基因引物,在选育快周期材料时具有更准确、更高效、更经济的特点。的特点。的特点。
【技术实现步骤摘要】
一种甘蓝型油菜早花基因Bnft.a02及其应用
[0001]本专利技术涉及分子育种
,更具体的说是涉及一种甘蓝型油菜早花基因Bnft.a02及其应用。
技术介绍
[0002]甘蓝型油菜是重要的植物油和高蛋白饲用饼粕的来源。由于世界人口快速增长导致对食用油和饲料的需求亦在快速增长,这样使油料作物的高产、高品质育种显得更为重要。但传统育种耗时长,不能满足要求。高通量测序技术、分子设计育种技术应运而生,这些现代分子技术可以加速育种进程。但在芸苔属中,由于传统油菜本身的特点,如生育期过长、株型高大、转化效率低等原因,影响了油菜功能基因的挖掘与功能验证,导致油菜分子育种研究进展较慢。
[0003]另一方面,在生产实践中,我国西北青藏高原的高寒山区长期种植白菜型油菜,品质达不到双低标准(低芥酸、低硫苷),产量也极低。因此,我们提出用极早熟甘蓝型油菜取代这种白菜型油菜的想法。
[0004]在上述理论研究需求和生产实践需求的双重动力驱使下,我们成功首创了快周期甘蓝型油菜(一种生育期仅约60天的极早熟甘蓝型油菜),并为创制方法取得了专利(专利号ZL201910500867.6)。在这个专利中,我们选取亲本显蕾期作为技术指标,依靠这一指标,后续我们又选育出了一批快周期油菜。但从根本上讲,显蕾期是一种田间形态指标,易受环境效应影响,而且其中的分子机理并不清楚,从经验上讲效率也没有分子标记特别是功能基因标记的效率高。因此,有必要进一步研究快周期油菜极早花的分子机理,克隆其开花相关的功能基因并开发功能基因标记,从而更好的为高效选育快周期油菜服务。
[0005]至于开花期,采用不同的材料,不同研究人员定位、克隆出的开花基因不尽相同,其中主效基因包括BnFLC.A2(杨光圣等专利CN106834303A,2017;)、BnFT(王晶博士学位论文,2009;代书桃博士学位论文,2015)等。从这些研究中发现,同一基因,在不同材料或同一材料的不同染色体上的序列、功能都可能不同。例如,王晶等利用宁油7号和Tapidor为研究材料,克隆了BnFT基因分布在A2、A7和C6上的6个拷贝,其中BnFT.A2是新发现的促进春性背景宁油7号开花的FT等位基因。2021年,余华胜等也用极早花材料“迎春1号”锁定1个BnFLC基因及其上游10个调控基因。
[0006]综上,如何提供一种油菜开花相关的功能基因并开发功能基因标记是本领域技术人员亟需解决的问题。
技术实现思路
[0007]有鉴于此,本专利技术提供了一种甘蓝型油菜早花基因Bnft.a02及其应用。
[0008]本专利技术在前期专利技术专利(专利号ZL201910500867.6)的基础上,用快周期油菜亲本和中双11杂交产生的F2群体,采用BSA法定位了快周期甘蓝型油菜的开花基因,发现主效QTL区间锁定的Bnft.a02基因是引起快周期甘蓝型油菜极早开花的主要原因。对双亲中该
基因的比较测序发现,与中双11相比,快周期油菜Bnft.a02内含子区有3个明显改变:其中第一个内含子包括15bp突变和12bp缺失,第二个内含子有288bp缺失;而外显子区则有1bp突变,导致异亮氨酸突变为亮氨酸。表达分析证实,在快周期油菜亲本中该等位基因确实较早强效表达,根据缺失位点设计的两对标记,在F2群体子代能很好的鉴定出早花表型。对两个内含子的突变位点进行了分析,推断很可能是FLC基因调控结合位点motif的改变导致FLC基因不再能抑制FT基因的表达,从而导致极早花表型。这些试验还证明,与以前王晶、代书桃等人克隆的BnFT.A2基因相比,该Bnft.a02不仅序列存在较显著的变异,而且在功能上确实是能引起更早花表型,是新的等位基因。
[0009]为了实现上述目的,本专利技术采用如下技术方案:
[0010]一种甘蓝型油菜早花基因Bnft.a02,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示(下划线部分为外显子序列)。
[0011]ATGTCTTTAAGTAATAGAGATCCTCTTGTGGTAGGGAGAGTTGTAGGAGACGTTCTTGAATGTTTCACAAGATCAATCGATCTAAGGGTTACTTATGGCCAAAGAGAGGTGACAAATGGGTTGGATCTAAGGCCTTCTCAAGTTCTCAACAAGCCAAGAGTTGAGATTGGTGGAGAAGACCTAAGGAACTTCTATACTTTGGTTCTTACATTTAAACTCTCTTTTGTCTCATCTCTTCTTCATTTCTTCATTATTCGTCTTCTACTATAACTTGGCCATGCAGACCCATAAGGAGGCCTTAAGATAATATTTCCTTTGTTCTATTTTCTTACGATTTATTGGTTTAACTTCTAGATACCCATGTTAAGAAGTATTTCTTTTTCACTTTTTACCATAAAGTATTATACCCATGAATCATTTCATCAAATACCAAACTAAATGTAAACAAGTTTTTGTTTTTATTAGAACAAACAATTTTATATTCTTTCGCAATTATTATTATTTGTTTGTCTCTTATCTAAATCCCAGATGACTTTTTGCAAACTCATTCTTTTATTTTGGGTAAGAATCTTGGTTTTTTCTTTGTTCCTCCAAAAAATTAGATTGTATCTTTGTTTCTTTTTAATTCTTCGATGCTTTTAAAAAGGCAAAAAAATAATATCTGGGTTCGAATATGCAAAATAATAATAATAAAGAAACTCAATGGTCAtTCACACAAATATATAAtGTTCATTTTATTATCTCTATTGTATGACTGTTTGAATCGGTATATTCAAGTCAGTCTTGTAAATACTCTGCTATACAAGACATATAGCTAGGACCTACCTTTTTCTATTTATCTTTCTTCTTCTTCCTTTTTTGTGTTATCTCGTTTCTCAAACTTCAAAAAGTAACTTCTGCTTTCTTGATAAGTTTGAGAATGATAATCTTATATTTTCATTCTTCTTCGTCTTATTTGTAACGGATTTTAGTGTTCATGGGTTTAATGTAGGTTATGGTGGATCCAGATGTTCCAAGTCCTAGCAATCCTCACCTCCGAGAATATCTTCACTGGTTTGTGCACTAATTCACCTCTTTTATTCAAGTTTTTTTTATCCACAAACATGTTTGCTTTAGTTAGATATAAATATATACACTGAACCACACATGCAACATGATATGTATATCAGTTGGAGACTTTGAAATTTTGTAAATCAGTTATAACAAAAGTCAAACATCTTCCGTTTAGTAGACCAGAACATGTACAATCAGGTTTAAGAAAGCGTTTTATCACTTTTTCTTCTAACAAGTCCCATACACCAAGGAT本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种甘蓝型油菜早花基因Bnft.a02,其特征在于,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。2.如权利要求1所述的甘蓝型油菜早花基因Bnft.a02编码的蛋白,其特征在于,其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。3.一种用于检测甘蓝型油菜开花早晚的引物组,其特征在于,所述引物组包括FT
‑
F
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ef、FT682
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R、FT1883
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F、FT2681
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R,其核苷酸序列如下:FT
‑
F
‑
ef:ATTTGTTTGTCTCTTATCTAAATCC,SEQ ID NO.3;FT682
‑
R:GCATCGAAGAATTAAAAAGAAACAAAG,SEQ ID NO.4;FT1883
‑
F:GAAGAGAACTATCTCTGCACAG,SEQ ID NO.5;FT2681
‑
R:TACGAGCAC...
【专利技术属性】
技术研发人员:范志雄,柯丽萍,邱丹,李继强,许兴旺,孟冬林,
申请(专利权)人:珠海市农腾乐油植物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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