甘蓝型油菜油菜早花性状的分子标记及其获得方法和应用技术

本发明专利技术公开了一种甘蓝型油菜早花性状的分子标记及其获得方法和应用。通过田间花期调查鉴定出油菜早花材料EMS诱变的突变体ebm，构建其与晚花来源材料中双9号的F2分离群体，采用混池重测序(BSA

【技术实现步骤摘要】
甘蓝型油菜油菜早花性状的分子标记及其获得方法和应用


[0001]本专利技术涉及分子生物学
，具体涉及一种甘蓝型油菜早花性状的分子标记及其获得方法和应用。

技术介绍

[0002]单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism，SNP)广泛存在动植物的基因组中，是单个核苷酸的变异导致的DNA序列多态性，包括单碱基的转换、颠换、插入和缺失，是继微卫星标记之后的新一代分子标记。与微卫星标记相比，SNP分布密度大，数量众多，多态性丰富；突变率低，稳定性和准确性高；不需检测片段长度，只需检测“有或无”确定多态性，从而易于实现自动化筛选。SNP标记具有如下应用：(1)可用于基因与疾病的关联研究，定位疾病的靶基因；(2)可用于动植物育种关键基因的筛选，通过比较不同表型的遗传差异，筛选抗逆高产等关键SNP；(3)可用于物种间进化关系的推算、物种内亲缘关系的鉴定，在医学、农学、林学方面，具有很好的应用潜力。
[0003]最佳开花时间对作物生产和植物生命周期起着至关重要的作用。早熟品种抑制营养生长，对蔬菜产量影响较大。相反，晚开花或抑制开花不仅会降低种子产量，而且也会为轮作增加剩余有害生物量。因此，了解开花时间的调控机制对作物育种的优化至关重要。在模式植物拟南芥中，开花调控的分子基础已得到广泛研究。开花时间主要由自主、光周期、春化诱导和信号转导等四个主要途径的遗传因子介导。到目前为止，大量参与开花调控的关键基因被克隆，如FLOWERING LOCUS T(FT)、FLOWERING LOCUS C(FLC)和CONSTANS(CO)等。
[0004]油菜(Brassica napus L.,2n＝38,AACC)是全球重要的种植多年的油料作物。开花时间是潜在产量形成的一个重要决定因素，因此适宜的开花时间是油菜育种的一个主要目标。目前基于双亲本作图群体的QTL定位研究表明，A2、A3、C1、C2、C3、C5和C9染色体上携带FT、FLC、VIN3、CO、Phytochrome A、FY、LFY、AP1、TFL1和TFL2等候选同源基因。这些基因大多与春化、光周期、自主途径和花分生组织分化有关。这些研究表明，开花性状极其复杂，由位于不同染色体上的多个位点控制。然而，对油菜开花候选基因特征的了解以及与开花基因相关联的分子标记的开发还十分有限，分子标记的分布密集程度决定了基因定位的区域的大小，因此目前亟需开发与开花相关联的分子标记用于开花基因的基因定位。

技术实现思路

[0005]针对现有技术中的缺陷，本专利技术提出了一种油菜早花材料的鉴定及早花基因的初定位和分子标记开发的应用。本专利技术通过田间花期调查鉴定出油菜早花材料EMS诱变突变体ebm，构建其与晚花来源材料中双9号的F2分离群体，采用混池重测序(BSA
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seq)技术，对早花基因进行初定位，在此区间筛选出能用于早花性状筛选和基因定位的SNP分子标记。
[0006]本专利技术提供一种甘蓝型油菜早花的分子标记，所述分子标记包括SNP标记1、SNP标记2、SNP标记3、SNP标记4、SNP标记5、SNP标记6、SNP标记7、SNP标记8、SNP标记9、SNP标记10、
SNP标记11中的至少一种；
[0007]所述SNP标记1～11均位于油菜的染色体A2上；
[0008]所述SNP标记1为碱基A或G，所述SNP标记1位于核酸的第364位，所述核酸具有SEQ ID NO.1所示核苷酸序列；
[0009]所述SNP标记2为碱基T或C，所述SNP标记2位于核酸的第200位，所述核酸具有SEQ ID NO.2所示核苷酸序列；
[0010]所述SNP标记3为碱基T或A，所述SNP标记3位于核酸的第152位，所述核酸具有SEQ ID NO.3所示核苷酸序列；
[0011]所述SNP标记4为碱基G或T，所述SNP标记4位于核酸的第261位，所述核酸具有SEQ ID NO.4所示核苷酸序列；
[0012]所述SNP标记5为碱基A或G，所述SNP标记5位于核酸的第262位，所述核酸具有SEQ ID NO.5所示核苷酸序列；
[0013]所述SNP标记6为碱基G或A，所述SNP标记6位于核酸的第493位，所述核酸具有SEQ ID NO.6所示核苷酸序列；
[0014]所述SNP标记7为碱基G或C，所述SNP标记7位于核酸的第256位，所述核酸具有SEQ ID NO.7所示核苷酸序列；
[0015]所述SNP标记8为碱基A或C，所述SNP标记8位于核酸的第153位，所述核酸具有SEQ ID NO.8所示核苷酸序列；
[0016]所述SNP标记9为碱基A或G，所述SNP标记9位于核酸的第362位，所述核酸具有SEQ ID NO.9所示核苷酸序列；
[0017]所述SNP标记10为碱基G或A，所述SNP标记10位于核酸的第413位，所述核酸具有SEQ ID NO.10所示核苷酸序列；
[0018]所述SNP标记11为碱基A或G，所述SNP标记11位于核酸的第284位，所述核酸具有SEQ ID NO.11所示核苷酸序列。
[0019]本专利技术还提供用于检测所述SNP分子标记1～11的引物对。
[0020]进一步的，所述引物对的序列为：
[0021][0022][0023]所述引物对ES
‑
1用于扩增SEQ ID NO.1所示核苷酸序列；
[0024]所述引物对ES
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2用于扩增SEQ ID NO.2所示核苷酸序列；
[0025]所述引物对ES
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3用于扩增SEQ ID NO.3所示核苷酸序列；
[0026]所述引物对ES
‑
4用于扩增SEQ ID NO.4所示核苷酸序列；
[0027]所述引物对ES
‑
5用于扩增SEQ ID NO.5所示核苷酸序列；
[0028]所述引物对ES
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7用于扩增SEQ ID NO.6所示核苷酸序列；
[0029]所述引物对ES
‑
10用于扩增SEQ ID NO.7所示核苷酸序列；
[0030]所述引物对ES
‑
12用于扩增SEQ ID NO.8所示核苷酸序列；
[0031]所述引物对ES
‑
20用于扩增SEQ ID NO.9所示核苷酸序列；
[0032]所述引物对ES
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40用于扩增SEQ ID NO.10所示核苷酸序列；
[0033]所述引物对ES
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47用于扩增SEQ ID NO.11所示核苷酸序列。
[0034]本专利技术还提供所述的油菜早花的分子标记的获得方法，包括如下步骤：
[0035](1)筛选油菜早花品种；
[0036](2)将步骤(1)筛选到的早花油菜品种与其原始来源的晚花品种杂交，获得F2群体；
[003本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种甘蓝型油菜早花的分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记包括SNP标记1、SNP标记2、SNP标记3、SNP标记4、SNP标记5、SNP标记6、SNP标记7、SNP标记8、SNP标记9、SNP标记10、SNP标记11中的至少一种；所述SNP标记1～11均位于油菜的染色体A2上；所述SNP标记1为碱基A或G，所述SNP标记1位于核酸的第364位，所述核酸具有SEQ ID NO.1所示核苷酸序列；所述SNP标记2为碱基T或C，所述SNP标记2位于核酸的第200位，所述核酸具有SEQ ID NO.2所示核苷酸序列；所述SNP标记3为碱基T或A，所述SNP标记3位于核酸的第152位，所述核酸具有SEQ ID NO.3所示核苷酸序列；所述SNP标记4为碱基G或T，所述SNP标记4位于核酸的第261位，所述核酸具有SEQ ID NO.4所示核苷酸序列；所述SNP标记5为碱基A或G，所述SNP标记5位于核酸的第262位，所述核酸具有SEQ ID NO.5所示核苷酸序列；所述SNP标记6为碱基G或A，所述SNP标记6位于核酸的第493位，所述核酸具有SEQ ID NO.6所示核苷酸序列；所述SNP标记7为碱基G或C，所述SNP标记7位于核酸的第256位，所述核酸具有SEQ ID NO.7所示核苷酸序列；所述SNP标记8为碱基A或C，所述SNP标记8位于核酸的第153位，所述核酸具有SEQ ID NO.8所示核苷酸序列；所述SNP标记9为碱基A或G，所述SNP标记9位于核酸的第362位，所述核酸具有SEQ ID NO.9所示核苷酸序列；所述SNP标记10为碱基G或A，所述SNP标记10位于核酸的第413位，所述核酸具有SEQ ID NO.10所示核苷酸序列；所述SNP标记11为碱基A或G，所述SNP标记11位于核酸的第284位，所述核酸具有SEQ ID NO.11所示核苷酸序列。2.用于检测权利要求1所述SNP分子标记1～11的引物对。3.根据权利要求2所述的引物对，其特征在于，所述引物对的序列为：
所述引物对ES
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1用于扩增SEQ ID NO.1所示核苷酸序列；所述引物对ES
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2用于扩增SEQ ID NO.2所示核苷酸序列；所述引物对ES
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3用于扩增SEQ ID NO.3所示核苷酸序列；所述引物对ES
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4用于扩增SEQ ID NO.4所示核苷酸序列；...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵传纪，杨黎，刘胜毅，刘立江，程晓晖，黄军艳，刘越英，
申请(专利权)人：中国农业科学院油料作物研究所，
类型：发明
国别省市：